LAS PROTEINAS Introducción ¿Sabías que? Un gen es una molécula de información biológica que se transmite de padres a hijos. Algunos genes codifican proteínas, otros fabrican moléculas que van a regular la síntesis de otras proteínas, otros codifican la forma del cromosoma. Cada persona lleva en sí misma el tesoro genético que dará en herencia a sus futuras generaciones familiares. “Los genes, son segmentos de ADN, que corresponden a la unidad de la herencia, segregación, mutación y recombinación en los seres vivos”. Nuestra herencia genética no sólo determina el color del pelo o la forma de la cara, sino que, además contiene información que configura la personalidad. La genética del comportamiento intenta descubrir cuáles son los genes que influyen en la conducta de las personas. Agustino Gregorio Mendel 1865: sus trabajos realizados en plantas de arvejas le permitieron establecer que los caracteres heredados están determinados por unidades de la herencia, que se encuentran en cada célula y que transmiten a los hijos a través de los gametos. Mendel llamo a estas unidades “factores de la herencia”, y corresponden a lo que hoy conocemos como genes. De esta manera, nació la genética. ¿Dónde se encuentran los genes? El hecho de que los cromosomas homólogos se separen durante la meiosis, al igual que los genes, llevó a pensar que las moléculas de la herencia se encontraban en los cromosomas. El análisis bioquímico de los cromosomas, a mediados del siglo XX, permitió identificar a un tipo de molécula, el ADN (ácido desoxirribonucleico), como responsable de la transmisión de la herencia en los seres vivos. Así, cada una de las propiedades establecidas para los genes se pudo detectar en la molécula de ADN y, además, se pudo conocer la función bioquímica de la mayoría de los genes: la síntesis de proteínas. 1 ¿Qué es el fenotipo? Si observas detenidamente a tu compañero (a), ¿Qué fenotipo puedes distinguir? Seguramente concentraste tu atención en algunos rasgos visibles, tales como la forma y el color de algunas estructuras corporales (ojos, cabello, piel,etc). Todos esos rasgos que puedes observar químicamente están conformados porproteínas. Las proteínas: fenotipo a nivel bioquímico. Los fenotipos pueden ser analizados a escala microscópica o macroscópica. Por lo tanto, cualquier molécula puede ser considerada un fenotipo, siempre y cuando seael resultado de la interacción del genotipo y el ambiente, esta interacción hoy en día se conoce como epigenética. Las proteínas son el resultado directo de la expresión de los genes en las células y, además, son las responsables de la aparición de muchos otros fenotipos a nivel microscópico. Por ejemplo, el que tu pelo sea liso, ondulado o crespo, depende del ambiente y del tipo de proteínas que se fabrican, a partir de la información genética que contienen. Entonces…. ¿Cuál es el papel de los genes en la síntesis de proteínas? A través de la alimentación incorporamos diversas proteínas presentes en los tejidos de otros seres vivos. Estas proteínas son digeridas hasta aminoácidos, los que son incorporados a nuestras células a través del sistema circulatorio. Los aminoácidos son la materia prima para sintetizar nuevas proteínas. ¿Qué son las proteínas?: Las cuyos monómeros Lasproteínas proteínasson sonpolímeros polímeros cuyos monómeros Corresponden En la .naturaleza corresponden a los a aminoácidos. los aminoácidos En la Existen solo 20 aminoácidos producidos por los naturaleza, existen veinte aminoácidos Los seres vivos, y a partir de ellos se originan determinados genéticamente, a partir de estos los se Miles de proteínas posee el ser y que originan los miles que de proteínas quehumano posee el ser Son aproximadamente mil. humano y que son, 30 aproximadamente treinta Estas proteínas difieren entreentre si, tanto en las mil. Estas proteínas difieren sí, tanto en las Propiedades estructurales como en la función propiedades estructurales como en la función que la célula. que desempeñan desempeñan,dentro dentroo ofuera fueradede la célula. Así diferencia entre dos proteínas se debe a las Así,lalas diferencias entre dos proteínas se deben Diferencias en elen tipo que que las las alas diferencias el de tipoaminoácidos de aminoácidos Forman secuencia en forman yy alalorden ordeny(secuencia) enque queestos estossese Encuentran encuentran. Átomos de hidrogeno grupo carboxilo grupo amino carbono Central. grupo carbonilo. Estructura de un aminoácido, unidad básica funcional de las proteínas. ¿QUÉ SON LOS AMINOÁCIDOS? La estructura de los aminoácidos está conformada por un átomo de carbono en el centro (carbono central) unido, a través de enlaces, a un grupo amino ( NH 2 ), a un grupo carboxilo (COOH), a un átomo de hidrógeno (H), y a un grupo radical (R), cuya constitución varía entre los veinte diferentes aminoácidos. 2 Las propiedades químicas y físicas de los diferentes aminoácidos dependen del grupo radical que poseen. De esta manera, existen aminoácidos cargados negativamente (electronegativos), aminoácidos aromáticos, aminoácidos hidrofílicos (presentan afinidad con el agua) y aminoácidos hidrofóbicos (no pueden disolverse en agua). La estructura y función de una proteína depende, por lo tanto, de las propiedades físicas y químicas de los cientos o miles de aminoácidos que la forman, y del orden en que se encuentran a lo largo de la molécula. A la secuencia lineal de aminoácidos presente en una proteína se le denomina estructura primaria de la proteína. Clasificación de los 20 aminoácidos que sintetizan los seres vivos. La forma para nombrar (nomenclatura) los distintos aminoácidos son a través de códigos, que puede ser de tres letras (generalmente las tres s primeras letras del nombre) o bien solo un código de una lletra, tal cual como arece a en el siguiente cuadro en la sección símbolo. Para datosbio informáticos generalmente se usa solo una letra. Aminoácidos hidrofóbicos Símbolo. Glicina (Gly). Alanita (Ala) Valina (Val) Leucina (Leu) Metionina (Met) Isoleucina (lle) G A V L M I Aminoácidos hidrofílicos Serina (Ser) Treonina (Thr) Cisteína (Cys) Prolina (Pro) Asparragina(Asn) Glutamina (Gln) S T C P N Q Aminoácidos aromáticos Fenilanina(Phe) Tirosina (Tyr) Triptófano(Trp) F Y W Aminoácidos cargados positiv amente Lisina (Lys) Arginina (Arg) Histidina (His) K R H Aminoácidos cargados negativamente Aspartato (Asp) Glutamato (Glu) D E RELACIÓN ENTRE ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DE LAS PROTEÍNAS: Si observas detenidamente la forma de tus manos, orejas o tus ojos, te darás cuenta de que cada una de estas estructuras parece estar diseñada para cumplir las funciones que realiza. De la misma manera, si observamos diferentes tipos celulares, encontraremos relaciones evidentes entre la forma y la función biológica que desempeñan. ¿Sucede lo mismo a nivel de proteína? ¿Qué relación existe entre la forma y la función de las proteínas? La estructura tridimensional de una proteína corresponde a la forma que esta adquiere en el espacio. Dentro de la gran variedad de proteínas, existen diferentes estructuras tridimensionales: algunas proteínas presentan forma globular, algo así como una madeja desordenada; otras son fibrilares (alargadas); otras presentan 3 forma de barril; otras son helicoidales. Sin embargo, en la mayoría encontramos una mezcla de diferentes formas. Si analizamos la forma de diferentes proteínas, nos daremos cuenta de que la estructura está asociada con la función celular que cumplen. La actina, por ejemplo, es una proteína presente en casi todas nuestras células, y su función es formar parte del esqueleto celular. Su forma es fibrilar, lo que le permite extenderse desde un punto a otro de la célula. Algunas proteínas están formadas por una sola molécula, mientras que otras están formadas por dos o más moléculas, unidas a través de enlaces químicos. A una proteína formada por una sola molécula se le denomina proteína monomérica, mientras que a aquellas que están formadas por más de una molécula se les denomina proteínas diméricas (dos moléculas), proteínas triméricas (tres moléculas), etc. NIVELES DE ORGANIZACIÓN PROTEICA Estructura Primaria: es la secuencia de aminoácidos unidos por enlaces peptídico. El orden de colocación de estos aminoácidos viene determinado genéticamente, es decir, está escrito en el material hereditario. La estructura primaria es importante porque determina la conformación tridimensional específica de la proteína, necesaria para su función. Además, como es la traducción lineal de la secuencia de nucleótidos de los ácidos nucleótidos, proporciona información sobre la contribución genética para la síntesis de proteínas. Estructura Secundaria: Es la forma en que la cadena lineal de aminoácidos puede plegarse, formando una hélice (alfa hélice) o bien como lámina plegada (beta plegada). Está condicionada por las interacciones entre las cadenas laterales de aminoácidos y por las posibilidades de rotación alrededor de los enlaces. Estructura terciaria: Resulta del plegamiento en el espacio de la exclusivamente por hélice alfa, por lámina beta y combinaciones entre ambas. En los dos primeros tipos se forman proteínas fibrosas (muy resistentes e insolubles en agua), realizan funciones estructurales como miosina del músculo, el colágeno y la elastina del tejido conectivo. La combinación de hélices alfa y láminas beta origina proteínas globulares. la asociación de varias cadenas polipeptídicas o subunidades; se dice que presentan estructuras cuaternarias, refiriéndose a la disposición espacial de las cadenas polipeptídicas para formar una proteína de mayor complejidad. Se suelen mantener unidos por enlaces químicos débiles (interacciones hidrofóbicas o fuerzas de van der Waals). 4 Funciones de las proteínas Toda actividad celular que te puedas imaginar es llevada a cabo por proteínas, por esa misma razón se indica que son los bloques básicos de construcción de todo ser vivo. Esas funciones se pueden agrupar en categorías tales como: - Estructural - Enzimática - Hormonal - Transporte - Reserva - Homeostática - Neurotransmisora - Defensiva o inmunológica - Movimiento y contracción Clasificación según su función: A- Proteínas Estructurales; contribuyen a las propiedades físicas de las células o los organismos. Ejemplo de este tipo de proteínas son los microtúbulos, la queratina del pelo y las uñas, y el colágeno que otorga resistencia a los huesos, la piel y los vasos sanguíneos. B- Enzimas; Son proteínas con actividad catalítica, es decir, que facilitan la ocurrencia de reacciones químicas, en las que uno o mas sustratos son convertidos en uno o más productos. Las enzimas intervienen en casi todas las reacciones químicas que ocurren en nuestras células. Concepto clave: “Aminoácidos”; son unidades moleculares básicas, a partir de las cuales se sintetizan las proteínas. Clasificación según células que la producen: - Proteínas tejido-específicas y proteínas constitutivas: Si bien todas las células de nuestro cuerpo poseen los mismos genes (la misma información genética), la expresión de estos genes puede variar. Es así como existen proteínas presentes en un solo tipo de tejido, mientras que otras se encuentran en todas las células. La regulación de la expresión de los genes en los tejidos está dirigida por complejos mecanismos de señales químicas, que activan o inactivan la expresión de los genes, dependiendo de la célula y el tejido en que se encuentren. Proteínas tejido- específicas: Son proteínas “exclusivas” de determinados tipos de tejido y se caracteriza por presentar funciones altamente especializadas, propias de la estructura que las produce. Por ejemplo, la melanina es producida por células de la piel, a la que otorga la coloración. A los genes que contienen la información para producir proteínas tejido-específicas se les denomina genes tejido- específico. Aunque estos genes se expresan sólo en determinados tipos celulares, estos genes se encuentran en todas las células. Entonces te hago la pregunta ¿de que depende la expresión de estos genes? La expresión de estos genes depende solamente de señales químicas que activan o inactivan la síntesis de proteínas. Por ejemplo, la presencia de sustancias u 5 organismos extraños en nuestro organismo, llamados antígenos, determinada la producción de anticuerpos. Esto se debe a que los antígenos desencadenan, en ciertos glóbulos blancos (linfocitos B), la expresión de los genes que contienen la información para producir anticuerpos. Algunas proteínas que seguramente has escuchado hablar de ellas en los niveles anteriores. Proteínas Tipos celulares en las que se encuentran Función Vasopresina Neuronas (hipotálamo) Hormona que aumenta la presión sanguínea Hemoglobina Eritrocitos (sangre) Transporta oxigeno por la sangre Lipasa pancreática Células acinares (páncreas) Participa en la digestión de lípidos en intestino delgado Colágeno Fibroblastos (piel) Da resistencia a huesos y piel Inmunoglobulina Linfocitos (sangre) Participa en la respuesta inmune Glucagón Estimula el aumento de glucosa en la sangre DATOS: Célula a del páncreas La rodopsina es una proteína de membrana tejidoparticipa en la traducción de las señales visuales en los conos de la retina. Concepto Clave: “Anticuerpos”; proteínas facilitando su eliminación. ¿QUE SON LAS PROTEÍNAS CONSTITUTIVAS?: Estas proteínas son producidas en todas las células de un organismo y corresponden a proteínas esenciales para la vida celular. Por lo tanto, la ausencia de una de estas Proteínas puede afectar importantes procesos celulares. En general, estas proteínas participan en importantes reacciones metabólicas, como el ciclo de Krebs, la cadena respiratoria, la síntesis de aminoácidos; y están presentes en estructuras celulares como las proteínas del citoesqueleto, en las proteínas constituyentes de los cromosomas, etcétera. A los genes que contienen la información para producir este tipo de proteínas se les denomina genes constitutivos, y una alteración en ellos podría provocar un efecto perjudicial en importantes funciones orgánicas. La respiración celular, por ejemplo, es un proceso presente en todas las células de nuestro organismo. Este proceso está regulado por muchas enzimas y depende, además, de muchas proteínas estructurales. Por lo tanto, la respiración celular requiere de la información de muchos genes que contienen la información para producir proteínas. Los genes que participan en el proceso de respiración celular corresponden entonces a genes constitutivos. 6 DATOS: La tubulina es una proteína constitutiva. Una de sus funciones es permitir la separación de las cromáticas hermanas durante la mitosis de casi todas las células. PROPIEDADES DE LAS PROTEÍNAS: Cada proteína presenta propiedades físico- químicas derivadas de su composición aminoácido y su conformación. Son propiedadesde todas las proteínas. La especificidad y la desnaturalización. La primera relacionada aque las proteínas cumplen funciones únicas en el organismo. Las proteínas no son simplemente polímeros al azar de longitud variable. Cada tipo de moléculas proteica posee una composición química específica, (composición cualitativa en aminoácidos), una secuencia ordenada y única de estos aminoácidos, y un determinado peso molecular. FACTORES QUE DETERMINAN LA FORMA DE LAS PROTEÍNAS: La forma de una proteína está determinada, principalmente por dos factores; la estructura primaria (determinada genéticamente) y las condiciones físicas y químicas del ambiente celular. La estructura primaria, es decir, el tipo y secuencia de aminoácidos, constituye una especie de código que determina la forma de las proteínas. Esto se debe al hecho de los aminoácidos, constituye una especie de código que determina la forma de las proteínas ya que los aminoácidos pueden presentar interacciones de atracción o repulsión entre sí, dentro de la proteína. Estas interacciones dependen de la naturaleza química de los grupos radicales y de la distancia que existe entre los aminoácidos. Por lo tanto, una molécula de proteína no se encuentra extendida de manera laxa, sino que las interacciones entre sus aminoácidos producen el plegamiento de la estructura proteica. Las atracciones y repulsiones eléctricas entre aminoácidos cargados, así como también la formación de enlaces químicos entre otros aminoácidos, produce que la proteína adquiera una forma tridimensional en el espacio. La forma de una proteína está determinada también por factores químicos y físicos presentes en el ambiente celular y extracelular, como temperatura, acidez, carga eléctrica, los que pueden favorecer o limitar las interacciones entre los aminoácidos de una misma proteína. Por ejemplo, cuando una persona decide cambiar su pelo liso por ondulado, el peluquero, luego de ondular mecánicamente el cabello, aplica diversos compuestos que favorecen la formación de enlaces químicos entre distintos aminoácidos de las moléculas de queratina, lo que permite estabilizar la forma ondulada por un tiempo definido. La exposición de las proteínas a condiciones físicas o químicas extremas, pueden conducir a la modificación irreversible de las estructuras proteicas, fenómeno denominado desnaturación de las proteínas. Por ejemplo, al cocer un huevo, la elevada temperatura produce un cambio irreversible en las interacciones entre los aminoácidos y, junto con ello, un cambio en la forma y función de la albúmina, principal proteína presente en la clara del huevo. ACTIVIDAD 1. Organice una lista de vocabulario académico con su respectivo significado. 2. Sintetice los siguientes aspectos: a. Concepto de las proteínas b. Concepto de los aminoácidos c. Relación entre estructura y función de las proteínas d. Niveles de organización proteica e. Funciones de las proteínas f. Factores que determinan la forma de las proteínas. 9 10