Population (un groupe d’individus de la même espèce qui se reproduisent entre eux et qui vivent au même endroit en même temps) Pourquoi estimer l’abondance et la densité? • Pour des questions fondamentales en écologie • Pour des raisons de gestion Estimation de l’abondance et de la densité • Dénombrement direct • Échantillonnage Organismes sessiles : quadrats ou transects Organismes mobiles : capture-marquage-recapture Densité • La moyenne (μ) ± 3 écart-types (σ) incorpore 99,7 % des données La moyenne (μ) ± 2 écart-types (σ) incorpore 95 % des données La moyenne (μ) ± 1 écart-type (σ) incorpore 68 % des données AIRE: Quadrat = 25 cm2 Aire totale = 2500 cm2 (il y a 100 quadrats) • Densité individus / quadrat = 12, 9, 14, 1, 7 Densité moyenne = = (12+ 9 + 14 + 1 + 7) / 5 = 8,6 (8,6 ind./quad.) / (25 cm2/quad.) = 0,344 ind./cm2 Densité moyenne = 0,344 ind./cm2 donc Abondance = 0,344 ind./cm2 x 2500 cm2 = 860 ind Capture-marquage-recapture-Applications • Estimer la taille de la population Suivi de population dans un contexte de conservation Déterminer la relation entre la productivité et la densité • Estimation de la survie par classe d’âge ou de taille (ou d’autre traits) • Modèles de croissance qui lient taille et âge • Simple : deux sessions de capture et marquage de groupe Lincoln - Petersen et Schnabel pour estimer N pour des populations fermées (pas de B, D, I, E) • Plus complexe : plusieurs sessions de capture et marquage individuel Jolly - Seber pour estimer N, la croissance de la population, ϕ, recrutement, etc. pour des populations ouvertes (permet B, D, I, E) . • Population fermée (pas d’émigration (E) ou d’immigration (I); pas de naissances (B) ou de mortalités (D)) • Les marques ne sont pas perdues entre les sessions de capture • Tous les individus ont la même probabilité de capture (pas d’attrait ou d’aversion pour les trappes, les marques n’affectent pas la probabilité de capture, etc.) N = Estimation de la taille totale de la population Jolly – Seber M = Nombre d’individus capturés et marqués lors de la première session de capture C = Nombre total d’individus capturés lors de la seconde session de capture R = Nombre d’individus capturés à la 1ère session qui ont été recapturés à la 2ème Intuitivement, comment estimer ϕ par exemple 0 : indique que l’individu n'a pas été capturée pendant cette session d’échantillonnage 1 : indique que l’individu a été capturée pendant cette session d’échantillonnage Variance (E(x2))-E2(x)/n)/n-1 0 : indique que l’individu n'a pas été capturée pendant cette session d’échantillonnage 1 : indique que l’individu a été capturée pendant cette session d’échantillonnage