Viruses & Bacteria tutorial Biology X Presentation by syamsul huda What are Viruses • Virus adalah partikel non-selular terdiri dari bahan genetik dan protein yang dapat menyerang sel hidup. virus Merupakan organisme peralihan antara mahluk hidup dan benda mati,sebab: Mempunyai ciri2 mhluk hidup (dapat berkembang biak) dan juga ciri2 benda mati (dapat di kristalkan). media yang biasa di gunakan untuk perkembang biakan virus adalah embrio telur ayam. T4 Bacteriophage Sejarah perkembangan Antonio van leeuwenhoek (1632-1723)=> menemukan mikroskop sederhana. A.meyer (1882) => menemukan adanya penyakit pada tembakau yang menulari tumbuhan lain. D.ivanowsky (=> mengulangi percobaan meyer dengan penyaring bakteri. M.beijerink (1897) => menemukan fakta bahwa virus dapat berkembang biak pada media yang di tumpanginya dan tidak mati jika di masukan dalam alkohol. Wendell stanley (1935)=> berhasil mengkristalkan tubuh virus pada tembakau -> TMV (tobacco mozaic virus). Ciri-ciri virus: Tidak di miliki oleh organisme lain. Hanya dapat berkembang biak pada sel-sel organisme hidup lainnya (hidupnya menumpang). Bersifat parasit obligat. Tidak dapat bergerak ataupun malakukan aktivitas metabolisme sendiri. Tidak dapat membelah diri. Bukan termasuk sel. Escherichia Coli Bacterium E. coli adalah bakteri. sel kasar,tidak termasuk virus karena virus adalah protein kontainer dengan core DNA atau RNA core Herpes Virus E. Coli and the Bacteriophage What it looks like in real life The Structure Of a Virus Virus terdiri dari inti asam nukleat Inti asam nukleat dikelilingi oleh selubung protein yang disebut kapsid. Inti nukleat tsb adalah salah satu dari DNA atau RNA. Pada virus terdapat nukleo kapsid yaitu asam nukleat yang di selibungi kapsid. Ada dua macam nukleo kapsid: a. Nukleo kapsid telanjang => TMV, adenovirus dan virus kutil. b. Nukleo kapsid yang di selubungi membran pembungkus.=> virus influenza dan virus herpes. Mengapa virus tidak termasuk sel? Struktur virus: Aseluler, berukuran mikron (berkisar 20300)mikron=>pengamatan dg mikroskop pembesarannya 50.000 x. Hanya terdapat satu macam asam nukleat (DNA/RNA) Bentuk bervariasi-> oval, memanjang, silindris berbentuk huruf T dan kotak. Tubuh terdiri atas ->kepala, kapsid, isi tubuh dan serabut ekor. => Kepala Berisi asam nukleat, bagian luar di selubungi kapsid. Kapsid selubung yg berupa protein yang melapisi kepala atau ekor virus. satu unit protein yang menyusun kapsid di sebut kapsomer. => Isi tubuh Biasa di sebut virion -> bahn genetik, yakni asam nukleat (DNA/RNA). Di lihat dari kandungan isi di bedakan mjd -> virus DNA dan Virus RNA. Ekor terdapat alat penancap. berupa tabung tersumbat dan di lengkapi benang/serabut. Perkembang biakan virus Menginfeksi organisme lain. Pada bakteri: Secara litik maupun secara lisogenik. @ litik -> virus akan menghancurkan sel induk setelah bereproduksi. @ lisogenik -> tidak menghancurkan sel induk, virus berintegrasi dengan DNA bakteri. Pada tumbuhan atau hewan sama halnya pada bakteri. Infeksi secara litik Di bagi menjadi 3 fase: 1. Fase adsorpsi dan infeksi. 2. sintesis 3. Fase replikasi. 4. Fase pembebasan virus fag-fag baru / fase lisis. Infeksi secara lisogenik Di bagi menjadi 3 fase: 1. Fase adsorpsi 2. Fase penggabungan. 3. Fase pembelahan. Cycle of Lytic and Lysogenic Peranan virus dalam kehidupan manusia. ► Virus dapat di golongkan menjadi virus yang menguntungkan dan virus yang merugikan. ► Virus yang menguntungkan ini berguna bagi manusia dalam pembuatan vaksin. Metode baku untuk memproduksi vaksin: a. b. Menunmbuhkan virus di dalam tubuh hewan yang cocok atau di dalam sel yang di tumbuhkan di laboratorium. Virus di matikan atau di lemahkan sebelum diinjeksikan kedalam tubuh manusia Contoh virus yang menyebabkan penyakit pada tumbuhan: Tobacco mozaic virus: menyebabkan bercak kuning pada daun tumbuhan seperti tembakau, kacang2an, tomat, kentang dan beberapa jenis labu. Virus TYMV : daun menggulung pada tembakau, kapas dan lobak. Penyakit pada manusia yg di sebabkan virus: 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. Influenza Campak. Cacar air. Hepaitis. Gondong. Aids Polio ebola 9. Herpes simplex. 10. papilloma. 11. SARS (severe acute respiratory syndrome). 12. rabies Penyakit pada hewan yang di sebabkan virus: 1. 2. 3. 4. polyoma,menyebabkan tumor pada hewan. Adenovirus:penyebab tumor pada hewan tertentu. Rhabdovirus : penyebab rabies. Retrovirusm, eks HIV Prinsip rekayasa genetika terhadap dalam pembuatan vaksin 1. 2. 3. 4. Mengisolasi gen-gen yang menyebabkan penyakit. Menyisipkan gen tersebut ke tubuh organisme yang kurang patogen. Mengkultur organisme hasil rekayasa, sehingga menghasilkan antigen dalam jumlah banyak. Mengekstraksi antigen sebagai vaksin. Monera Moneres => tunggal. Semua mikroorganisme prokaryotik termasuk kingdom monera. Monera bersel tunggal -> bakteri. Sel panjang seperti benang -> ganggang biru (cyanophyta) eks:oscillatoria Bacteria Prokaryotes Cells that do not have a nucleus Exist almost every where on earth Grow in numbers so great you can see them with the unaided eye Are placed in either the Eubacteria or the Archebacteria Kingdoms Make up the smaller of the two kingdoms Bakteri Bakterion => batang kecil. Namun meskipun demikian, tidak semua bakteri berbentuk batang. Bentuk bakteri: basil (batang), coccus (bulat), spirillum (spiral). Bentuk atau koloni di pengaruhi oleh: arah pembelahan,umur dan nutrisi. Terdapat dimana-mana sekitar kita. Baccilus/basil(batang) 1. 2. 3. Basil tunggal =>salmonella typhi (penyebab penyakit tifus). Diplobasil. Streptobasil => bacillus anthracis (penyebab penyakit anthrax) Coccus (bulat) 1. 2. 3. 4. 5. 6. Monokokus,eks:neiseria gonorhoe,penyebab kencing nanah. Diplokokus,eks: D.pnemumoniae, penyebab radang paru-paru. Tetrakokus. Sarkina. Streptokokus. Stafilokokus. Spirillum (spiral) 1. 2. 3. spiral,eks: spirillum. Vibrio,eks: vibrio cholerae. Spiroseta. Ciri-ciri bakteri. a. Mikroorganisme, lebar (0,5-1)mikron. Panjang sekitar 10 mikron. Diameter 0,1 0,2 mikron b. Hidup di berbagai linkungan. c. Dinding sel tersusun atas mukopolisakarida dan peptidoglikan. d. Ada yang memiliki flagellum. e. Mempumyai spora. Struktur tubuh bakteri Kapsul. Flagella. Dinding sel. Membran sel. Mesosom. Lembaran fotosintesis (bakteri autotrof). Sitoplasma. DNA. Plasmid Endospora. Flagella Reproduksi bakteri. aseksual -> pembelahan biner. Paraseksual -> pemindahan materi tidak menghasilkan zigot. Ada tiga macam: transformasi, konjugasi, transduksi. Jenis-jenis bakteri Bakteri dapat di golongkan menurut: a. Cara memperoleh makanan. b. Kebutuhan oksigen. c. Peranannya terhadap kehidupan manusia. d. Susunan dinding sel. Cara memperoleh makanan. a. autotrof: -> foto autotrof. -> kemo autotrof. b. Heterotrof: -> saprofit. -> parasit. -> patogen. -> apatogen. Kebutuhan oksigen untuk menghasilkan energi Bakteri aerobik: membutuhkan udara untuk hidup/menghasilkan energi. Eks: nitrosomonas -> memecah amonia (NH3) menjadi Nitrit (HNO3). Bakteri anaerobik. Eks: bakteri asam susu -> mengubah gula menjadi asam susu. clostridium tetani -> penyebab tetanus. Menurut peranannya bagi kehidupan Bakteri yang menguntungkan. - E.coli Rhizobium Azotobacter L.cassei Acetobactera xylinum. Acetobacter - S.griceus - S.bulgaricus - Pseduomonas denitrificans Bakteri yang merugikan Mycobacterium tuberculosis -> menyebabkan penyakit TBC. M.leprae -> menyebabkan penyakit lepra. Treponema pallidum -> sifilis. Menurut susunan dinding sel Gram positif Gram negatif Cellular Walls Chemical nature of a cell wall can be determined by Gram Staining By finding out what color the cell produces when it is gram stained you can figure out the type of carbohydrates in the cell wall Monera ganggang hijau-biru(cyanophyta) Habitat Biasa di temukan di tempat lembab misalnya tanah, batu, tembok, sawah, paarit dan di laut. Dapat hidup bersimbiosis dengan organisme lain. misalnya: Gloeocapsa dan nostoc bersimbiosis dengan ganggang membentuk lumut kerak (lichen). Anabaena bersimbiosis dengan lumut hati, paku air, cyad dan angiospermae untuk memfiksasi nitrogen. Biasa di katakan sebagai organisme perintis. Ciri-ciri Tidak mempunyai membran inti. Mempunyai klorofil. Dinding sel terletak di antara plasmalema dan selubung lendir. Yang berkoloni dengan bentuk filament memiliki heterosista dan spora istirahat. Uniseluler, koloni, atau filament. Uniseluler chroococcus. hidup di dasar kolam atau tembok yang basah. Tubuh di selubungi lendir. Reproduksi dg cara pembelahan biner. 2. gloeocapsa. hidup di permukaan batu, hingga menyebabkan batu tersebut licin. Tubuh di lapisi lendir. 1. Berkoloni Polycystis. ganggang ini terdiri atas sel-selberbentuk bola yang bergerombol, berbentuk seperti anggur. Merismopedia. Nostoc. Micricystis. Filament oscillatoria. berbentuk benang,tersusun atas sel-sel pipih dan rapat. Tidak di selubungi lendir. 2. nostoc. tersusun atas sel-sel yang berbentuk bola. Memiliki akinet. 3. anabaena. tersusun atas sel berbentuk bola. Memiliki akinet dan heterokista. 1. Struktur sel a. b. c. d. e. Selubung lendir. Dinding sel. Membran sel. Sitoplasma. DNA Reproduksi 3 cara: a. Pembelahan sel. karena termasuk golongan prokaryotik maka ia melakukan pembelahan biner. eks :gloeocapsa. b. Fragmentasi. terjadi pada ganggang bentuk filament. eks: plektonema boryanum. c. spora Terjadi pada kondisi ekstrem, misalnya kurang air. dinding akan menebal dan ukuran sel akan membesar. bentukan -> akinet. Setelah kondisi normal, maka spora akan tumbuh menjadi ganggang yang baru. eks -> pada nostoc. Peranan bagi manusia Menguntungkan: dapat di jadikan pupuk nitrogen. dapat di jadikan bahan makanan yang mengandung banyak protein. Merugikan: sebagian ganggang air dapat mengeluarkan racun, sehingga akan meracuni organisme lain yang meminumnya. Autotrophs Make their own energy Using Solar energy Eg. Cyanobacteria Chemotrophs Make own Energy Using Chemical energy Eg. Archaebacteria Heterotrophs Obtain food By eating Eg. E-coli Bacteria Respiration Obligate Anaerobes Facultative Anaerobes Obligate Aerobes Live without Oxygen Can live with or without oxygen Cannot live without oxygen. Bacteria Reproduction Binary Fission Conjugation Spore Formation Cellular organism copies it’s genetic information then splits into two identical daughter cells Conjugation A type of Bacteria Sex Two organism swap genetic information, that contains the information such as a resistance to penicillin Spore Formation: Endospore A type of dormant cell Exhibit no signs of life Highly resistant to environmental stresses such as: -High temperatures -Irradiation -Strong acids -Disinfectants Endospores are formed by vegetative cells in response to environmental signals that indicate a limiting factor for vegetative growth, such as exhaustion of an essential nutrient. Symbiosis Close relationship between to species in which at least one species benefits from the other Live together for LIFE Parasitism Bacteria exploit the host cell, injuring them Eg. Mychobacterium tuberculosis Mutualism Symbiosis in which two of the species live together in such a way that both benefit from the relationship Eg. E-coli Nitrogen Fixations Process by which nitrogen in the atmosphere is converted into a form that can be used by living things THE END