馬偕紀念醫院 2010 PGY訓練課程 實證醫學訓練 第一階段 產生問題及文獻搜尋 馬偕紀念醫院 實證醫學工作小組 2010~2011 方靜如‧劉淑容 第三節 文獻搜尋 2/62 文獻搜尋(實際操作,20分鐘) 請根據您剛才寫出的PICO,選擇您最想 解決的問題,在馬偕紀念醫院圖書館提供 的資源下,找一篇最值得閱讀的文章。 3/62 第四節 認識文獻的等級及資料庫 4/62 證據等級 證據力強 設計嚴謹 偏差少 並非所有臨床問 題都可找到最高 等級文獻,但應 盡可能使用等級 高的證據來源 證據力弱 設計薄弱 偏差多 Level 1a 1b 1c 2a 2b 2c 3a 3b 4 5 Therapy/Prevention, Aetiology/Harm Meta-Analysis Systematic review Systematic reviewof ofRCTs RCTs++Meta-Analysis Randomized controlled Randomized controlledtrial trial (RCT) (RCT) ‘All-or-none’ Systematic review of cohort studies Cohort study Cohort studyororpoor poorRCT RCT ‘Outcomes’ research ; Ecological studies Systematic review of case-control studies Case-control study Case-control study Case series Case series Expert opinion without explicit critical appraisal, or based on physiology, bench research or "first principles" 表濃縮自: Oxford Centre for EBM Levels of Evidence(第1版) http://www.cebm.net/index.aspx?o=1047 5/62 第2版亦於 2010.6上線: http://www.cebm.net/index.aspx?o=5653 Randomized Controlled Trial (RCT) 隨機對照試驗 鏈黴素 安慰劑 有病 沒病 有病 沒病 結核病人 有介入‧有對照‧有隨機 SUNY Downstate EBM Tutorial: http://library.downstate.edu/EBM2/research.htm , http://www.dartmouth.edu/~biomed/services.htmld/EBP_docs/types_of_studies_downstate.pdf 6/62 Cohort Study 世代研究 一群界定 清楚的人 抽菸者 非抽菸者 肺癌 無肺癌 檢驗有(或無) 暴露在某種 介入的子群 組之間差異 肺癌 無肺癌 觀察性研究方法。大多是前瞻性,也有少數是回溯性。 SUNY Downstate EBM Tutorial: http://library.downstate.edu/EBM2/research.htm , http://www.dartmouth.edu/~biomed/services.htmld/EBP_docs/types_of_studies_downstate.pdf 7/62 Case Control Study 病例對照研究 癌症病人 抽菸者 非抽菸者 抽菸者 非抽菸者 非癌症病人 SUNY Downstate EBM Tutorial: http://library.downstate.edu/EBM2/research.htm , http://www.dartmouth.edu/~biomed/services.htmld/EBP_docs/types_of_studies_downstate.pdf 8/62 Case Series and Case Report 病例系列與病例報告 SUNY Downstate EBM Tutorial: http://library.downstate.edu/EBM2/research.htm , http://www.dartmouth.edu/~biomed/services.htmld/EBP_docs/types_of_studies_downstate.pdf 9/62 Systematic Review + Meta-Analysis 系統性評論 + 統合分析 (通常是RCT) 提出一個特定的臨床問題 Systematic Review 執行完整文獻搜尋 排除不適用的研究 評析設計良好且適用的研究 基於systematic review 將個別研究數據進行統計學量化分析 歸結臨床應用上的可行建議 歸結出一個證據力更強的結論 Unsystematic narrative “review”: 1. 2. 3. 4. 5. 混合個人意見和證據,而證據搜集也常岀自reviewer個人的選擇 SUNY Downstate EBM Tutorial: http://library.downstate.edu/EBM2/research.htm , http://www.dartmouth.edu/~biomed/services.htmld/EBP_docs/types_of_studies_downstate.pdf 10/62 搜尋實證障礙 不知道怎麼定義關鍵字 資源太多,不知道從何下手 PICO, plus 同義字, MeSH Terms FIRST: Filtered Resources (EBM Databases) PLUS: Unfiltered Resources (Medline) 不熟悉搜尋方式 只找到/看到片面現象(B),而非貼近事實(A) (Information bias) 11/62 資料庫的選擇與使用 http://library.mmh.org.tw/EBMR.htm http://library.mmh.org.tw 無法遠端 Free Free 資源金字塔 14/62 5S EBM Resources 愈上層 • 資訊精萃 • 簡單的關鍵字 • 省時搜尋與評讀 • 快速支援決策 • 由下層積累 1.systems 2.summaries Filtered Resources 愈下層 • 文獻雜多 • 完整的關鍵字 • 費時搜尋與評讀 • 注重檢索技巧 • 資訊新穎 (非關證據強弱!) 連結個別病歷的臨床知識與支援決策系統 整合證據提供特定臨床問題之概述與建議 UpToDate BMJ Clinical Evidence FirstConsult ACP PIER 3.synopses 對單篇研究或回顧性文獻作摘要與評述 ACP Journal Club, Evidence-Based Medicine (PubMed, Ovid Medline) 4.syntheses 特定臨床問題的系統性評論文獻 Cochrane Database of Systematic Reviews Database of Abstracts of Reviews of Effects (PubMed, Ovid Medline): Systematic Reviews Unfiltered Resources 5.studies 原始文獻 (PubMed, Ovid Medline, CINAHL, EMBASE Cochrane CENTRAL, Google Scholar CEPS中文電子期刊, 中文期刊篇目索引) Model from: Haynes, R. B. (2006). Of studies, syntheses, synopses, summaries, and systems: the "5S" 15/62 evolution of information services for evidence-based health care decisions. ACP Journal Club, 145(3), A8. PICO檢索示範 P Patient/Problem I Intervention C Comparison O Outcomes Type 一位胃食道逆流的患者 使用proton pump inhibitor 與不使用藥物治療 是否能改善聲音沙啞 □Diagnosis □Therapy □Prognosis □Harm □Etiology 16/62 PICO檢索示範 – 關鍵字 (初級班) P Patient/Problem I Intervention C Comparison O Outcomes Type gastroesophageal reflux PPI non-drug therapies OR placebos OR… hoarseness □Diagnosis □Therapy □Prognosis □Harm □Etiology 17/62 UpToDate: Search • 輸入疾病、症狀、藥物、程序 • 輸入單字(hoarseness)、縮寫(PPI)、片語 (gastroesophageal reflux )、字頭(gastro)、詞或句子 • 不要輸入布林邏輯: AND、OR gastroesophageal reflux PPI hoarseness 18/62 UpToDate: Result 大綱 內文 部份會提供推薦與證據等級 19/62 Clinical Evidence: Search (英式拼法) GERD 到符合關鍵字的段落 到Topic主頁 20/62 Clinical Evidence: Result 表列各種介入的益害: 有益.可能有益.未知療效.益害參半.可能有害.有害 21/62 Clinical Evidence: Result 22/62 Clinical Evidence: GRADE Table 0: 所有/大多 研究顯示一 致結果 4: RCT / SR of RCT 0: 品質沒問題 (blind, follow up…) 基於 OR/RR/HR顯 示的效果大小 0: 族群 與結果 具廣泛 類推性 Type of evidence: 4 = RCT; 2 = Observational Consistency: similarity of results across studies Directness: generalisability of population or outcomes Effect size: based on relative risk or odds ratio 23/62 資訊檢索概念 單字 vs. 片語 (PubMed使用會關閉自動比對MeSH功能, 適合在非MeSH Term使用) intensive care vs. “intensive care” 病人服藥遵從性行為 vs. “病人服藥遵從性行為 ” 切截字 (PubMed使用會關閉自動比對MeSH功能, 適合在非MeSH Term使用) therap* : therapy , therapeutic , therapeutics convention*: convention, conventional 同義字 廣狹義詞 布林邏輯 檢索欄位 自由詞彙 vs. 控制詞彙 24/62 單字 vs. “片語” (Google範例) 同義字 inhibitor inhibitors 廣狹義字 單複數 esophageal reflux gastro-oesophageal reflux 英美拼法 廣義字 資訊檢索概念 GERD 全名縮寫 gastroesophageal reflux 狹義字 lymph node removal lymphadenectomy 同義異形字 lymph nodes excision lymph nodes dissection 住院病人 住院病患 雙腿截肢 下肢截肢 膝下截肢 (用MeSH可避免大部分困擾) 26/62 布林邏輯: AND 營養 地瓜 地 瓜 營 養 AND 28/62 布林邏輯: OR 地瓜 蕃藷 蕃 薯 地 瓜 OR 29/62 布林邏輯: NOT 地瓜 地 瓜 種 植 NOT 30/62 布林邏輯: 運算規則 1. 營養 AND 地瓜 OR 蕃薯 2. 地瓜 OR 蕃薯 AND 營養 3. (地瓜 OR 蕃薯) AND 營養 營 養 地 瓜 蕃 薯 31/62 布林邏輯: 運算規則 由左至右進行運算 營養 AND 地瓜 OR 蕃薯 (X) 營 養 地瓜 OR 蕃薯AND 營養 地 瓜 (O) 蕃 薯 加括弧先運算 營養 AND (地瓜 OR 蕃薯) 4 x ( 2 + 3 ) (O) = 營養 AND 地瓜 OR 營養 AND 蕃薯 4 x 2 + 4 x 3 32/62 檢索欄位 篇名 Title 作者關鍵字 Keyword 摘要 Abstract 控制詞彙 MeSH Term 全文 Full Text 所有欄位 All Fields 影響檢索結果的相關性 ! 33/62 檢索欄位: 哪一篇文章相關性高? (糖尿病) 34/62 檢索欄位: 哪一篇文章相關性低? (roselle洛神花 ) 35/62 authors articles translation 系 使 Gastroesophageal Reflux 統 控制詞彙派 用 自由詞彙派 控 Controlled Free Text 者 制 要 Vocabulary 使 Standard 設 用 法 Medical Subject Headings 較大型或精緻的書目資料庫 者 和 和 通常同時有這兩種機制 作 作 者 Gastroesophageal Reflux 者 心 用 意 語 相 一 通 致 user GERD queries database Medline translation 自由詞彙 vs. 控制詞彙 自由詞彙 (Free Text) (Controlled Vocabulary) 例: 中文期刊論文資料庫、Google 檢索時系統比對原始文章的篇名、摘 要作者等欄位 搜尋過程上較簡單 適用控制詞彙未提供的概念 控制詞彙 vs. 新名詞: Severe Acute Respiratory Syndrome於2003始為MeSH 例: Medline: MeSH、CINAHL Headings 原 理 檢索時系統將關鍵字比對控制詞彙表 後做查詢 (文獻事前經索引程序) 解決同義字問題 可彈性檢索廣/狹義詞 可調整精確率與回收率 優 點 形容語: repeated fine-needle aspiration => repeat* 要儘可能列舉同義詞 => (intensive OR tight OR strict) AND glycemic control 語義容易模糊 => Roselle vs Roselle 可能要列舉狹義詞 缺 點 要”習慣”’才會用 新概念不適用 用語容易受限不彈性 PubMed: General Search (預設介面) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?holding=itwmmhlib&tool=itwmmhlib&myncbishare=itwmmhlib 進階查詢介面 輸入關鍵字、布林邏輯、檢索編號 醫學主題標題表 臨床最佳化篩選 38/62 PubMed: Advance Search (進階介面) 系統轉譯關鍵字細節 輸入關鍵字、布林邏輯、檢索編號 指定欄位檢索 點#數字 彈跳選項 檢索歷史(保留8hr) 看此筆檢索結果 39/62 PubMed: Details 系統的最終的檢索策略 [MeSH Terms]: 醫學主題標題詞 [TIAB]: Title篇名與Abstract摘要 [Text Word]: 所有文字欄位,含Title、Abstract 、MeSH terms、Publication Types、Substance Names、 Personal Name [All Fileds]: 所有欄位 系統的轉譯過程 控制詞彙 自由詞彙 使用者輸入關鍵字 40/62 PubMed: Search (初級班) gastroesophageal reflux AND PPI AND hoarseness 41/62 PubMed / Ovid Medicine: 檢索技巧 使用 MeSH Term與列舉同義字 彈性組合 P I C O 透過線索修正關鍵字 最佳化篩選 Clinical Queries 指定期刊 ACP J Club Cochrane Reviews… 限制條件 Limits 限定欄位 [major] OR [title] (調整相關性密技) 42/62 PubMed: 使用MeSH 與列舉同義字 P Patient/Proble m I Intervention C Comparison O Outcomes Type gastroesophageal reflux OR GERD OR esophageal reflux OR gastro-esophageal reflux OR gastrooesophageal reflux PPI OR PPIs OR proton pump inhibitor OR proton pumps non-drug therapies OR placebos OR… hoarseness □Diagnosis □Therapy □Prognosis □Harm □Etiology • 紅線底線字表示為MeSH Term,底線字表示可轉譯為MeSH Term • 關鍵字加了切截字元* 或 ”雙引號” 即停用自動比對MeSH功能 43/62 PubMed: 使用MeSH 1. 避免使用縮寫 2. 檢查Details 3. 參考已知書目的MeSH Terms 4. 查詢MeSH Database確認用語 44/62 PubMed: 彈性組合 P I C O Demo: P gastroesophageal reflux OR GERD OR GORD OR esophageal reflux OR gastro-esophageal reflux OR gastro-oesophageal reflux 輸入P關鍵字 45/62 Demo PPI OR PPIs OR proton pump inhibitor OR proton pumps 輸入I 關鍵字 46/62 Demo hoarseness 輸入O 關鍵字 47/62 Demo #2 AND #3 AND #4 開始組合檢索 48/62 PubMed: 彈性組合 P I C O IO PI PIO O I P 避免某個面向檢索結果很低,影響整體檢索結果 檢索結果低時,易修正檢索策略 方便後續彈性組合檢索 PICO何重要? 取決臨床問題特性、檢索者目的和時間、文獻需求質量 49/62 PubMed: 透過線索修正關鍵詞 找到一篇文章甲:摘要中提到 hoarseness是GERD的atypical symptom 文章乙: 篇名與摘要: 都未提到hoarseness 只有atypical manifestations 文章乙: 內文: 有提及hoarseness (關鍵詞不一定會表現在篇名與摘要) Search #2 AND #3 AND (#4 OR atypical) =165篇 Search #2 AND #3 AND #4 = 72篇 50/62 PubMed: 透過線索修正關鍵詞 研究設計 年齡層 參考關鍵書目的MeSH 來修正關鍵詞,如 "proton pumps" 研究設計 性別 主題 主題 51/62 PubMed: 指定期刊ACP, Cochrane 輸入關鍵字或#號碼 即自動將檢索策略帶入此區塊 按鈕Search/Preview #6 AND (“ACP journal club”[Journal] OR "Cochrane database of systematic reviews (Online)"[Journal]) 輸入刊名關鍵字 acp... ACP journal club 按鈕Add to… 選取AND 指定欄位 繼續以OR加入其他期刊直到完成 52/62 EBM評論文章 原始研究 53/62 ACP J Club: 濃縮10頁原始研究為1頁EBM評論 結果 結論 原始研究 臨床問題 評論 研究方法 參考書目 PubMed: 最佳化篩選Clinical Queries #8 或#6 臨床面向 文獻量 99 6 Filter citations to a specific clinical study category and scope. These search filters were developed by Haynes RB et al. Filter citations for systematic reviews, metaanalyses, reviews of clinical trials, evidence-based medicine, consensus development conferences, and guidelines. See related sources. 55/62 Clinical Queries using Research Methodology Filters Category therapy diagnosis etiology prognosis clinical prediction guides Optimized For Sensitive Specific PubMed Equivalent sensitive/ broad 99% 70% ((clinical[Title/Abstract] AND trial[Title/Abstract]) OR clinical trials[MeSH Terms] OR clinical trial[Publication Type] OR random*[Title/Abstract] OR random allocation[MeSH Terms] OR therapeutic use[MeSH Subheading]) specific/ narrow 93% 97% (randomized controlled trial[Publication Type] OR (randomized[Title/Abstract] AND controlled[Title/Abstract] AND trial[Title/Abstract])) sensitive/ broad 98% 74% (sensitiv*[Title/Abstract] OR sensitivity and specificity[MeSH Terms] OR diagnos*[Title/Abstract] OR diagnosis[MeSH:noexp] OR diagnostic * [MeSH:noexp] OR diagnosis,differential[MeSH:noexp] OR diagnosis[Subheading:noexp]) specific/ narrow 64% 98% (specificity[Title/Abstract]) sensitive/ broad 93% 63% (risk*[Title/Abstract] OR risk*[MeSH:noexp] OR risk *[MeSH:noexp] OR cohort studies[MeSH Terms] OR group*[Text Word]) specific/ narrow 51% 95% ((relative[Title/Abstract] AND risk*[Title/Abstract]) OR (relative risk[Text Word]) OR risks[Text Word] OR cohort studies[MeSH:noexp] OR (cohort[Title/Abstract] AND stud*[Title/Abstract])) sensitive/ broad 90% 80% (incidence[MeSH:noexp] OR mortality[MeSH Terms] OR follow up studies[MeSH:noexp] OR prognos*[Text Word] OR predict*[Text Word] OR course*[Text Word]) specific/ narrow 52% 94% (prognos*[Title/Abstract] OR (first[Title/Abstract] AND episode[Title/Abstract]) OR cohort[Title/Abstract]) sensitive/ broad 96% 79% (predict*[tiab] OR predictive value of tests[mh] OR scor*[tiab] OR observ*[tiab] OR observer variation[mh]) specific/ narrow 54% 99% (validation[tiab] OR validate[tiab]) 謹慎: 使用Limits後, In process 、supplied by publisher、非Medline 的文獻,將被排除~ 因為此 機制是針對已被Medline做過索引程序的書目所設計 PubMed: Limits #8 勿與Type of Article併用 57/62 PubMed: 限定欄位[major] OR [title] GERD[majr] OR GERD[ti] OR gastroesophageal reflux[ti] (調整相關性密技) 高 低 58/62 PubMed: Search Strategy (中級班) Limits Clinical Queries 指定期刊 修正關鍵字 IO PI PIO 使用MeSH / 同義字 彈性組合 O I P 初級PICO(快速法) 59/62 PubMed: Filter your results http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?holding=itwmmhlib&tool=itwmmhlib&myncbishare=itwmmhlib 60/62 再次文獻搜尋(實際操作,30分鐘) 請重新搜尋電腦,找 尋具有最佳證據的 一 篇文獻,來回答您的 問題。 請根據今天上課的內 容,完成實證醫學學 習單並繳回。 61/62 謝謝您的參與! 請記得完成並繳回 你(妳)的實證醫學學習單,謝謝! 實証醫學工作小組 敬上