Supplementary Information – S1 Test ID Methods used during testing Units PQL* NH4+ APHA Method 4500 – NH3 H μg NH3-N.L-1 2 NOx APHA Method 4500 – NO3 F (Modified) μg NOx-N.L-1 1 DIP APHA Method 4500 – P F μg PO4-P.L 1 TDN APHA Method 4500 - NO3 F (Modified) + (Autoclave Persulfate Digestion) μg N-N.L-1 80 TDP APHA Method 4500 – P F + (Autoclave Persulfate Digestion μg P-P.L -1 -1 3 Supplementary Information – S2 Trt 2 vs 4 sources 2 sourcesa vs b Mix (Trt) Biomass Biomass x Trt Biomass x 2 vs 4 sources Biomass x 2 sourcesa vs b Biomass x Mix (Trt) Residual (a) Gross Primary Production (b) Net Primary Production df 2 1 1 3 1 2 1 1 3 45 df 2 1 1 1 3 2 1 1 3 45 MS 0.52 1.02 0.02 0.15 0.05 0.09 0.01 0.18 0.11 0.13 p-F 3.45 8.35 0.12 0.82 0.41 0.85 0.09 3.08 0.60 0.69 P 0.16 < 0.05 0.75 0.48 0.53 0.53 0.78 0.21 0.63 (c) Average oxygen flux Trt 2 vs 4 sources 2 sourcesa vs b Mix (Trt) Biomass Biomass x Trt Biomass x 2 vs 4 sources Biomass x 2 sourcesa vs b Biomass x Mix (Trt) Residual df 2 1 1 3 1 2 1 1 3 46 MS 0.68 1.35 0.01 0.25 0.01 0.10 0.07 0.14 0.26 0.37 p-F 2.74 6.62 0.11 0.67 0.05 0.38 0.27 0.39 0.71 P 0.21 < 0.05 0.77 0.57 0.87 0.67 0.62 0.60 0.53 MS 0.54 1.07 0.01 0.01 0.10 0.09 0.02 0.17 0.11 0.21 p-F 5.31 12.01 0.07 0.11 0.47 0.83 0.16 1.90 0.53 P 0.08 < 0.05 0.83 0.74 0.69 0.52 0.73 0.32 0.66 (d) Community Respiration df MS p-F P 2 0.71 2.40 0.23 1 0.63 1.39 0.28 1 0.73 1.95 0.31 3 0.29 0.30 0.83 1 0.78 2.27 0.25 2 0.88 2.62 0.21 1 0.42 0.69 0.45 1 1.29 2.57 0.26 3 0.33 0.34 0.79 46 0.98 Supplementary Information – S3 (a) NH4+ Trt 2 vs 4 sources 2 sourcesa vs b Mix (Trt) Biomass Biomass x Trt Biomass x 2 vs 4 sources Biomass x 2 sourcesa vs b Biomass x Mix (Trt) Residual df 2 1 1 3 1 2 1 1 3 60 Dark flux MS p-F 1.15 0.48 0.67 0.30 1.63 2537.40 2.40 10.18 0.34 0.48 0.33 0.47 0.27 0.43 0.39 0.50 0.71 2.99 0.24 P 0.69 0.63 < 0.01 < 0.01 0.55 0.67 0.54 0.56 0.04 Light flux MS 0.39 0.07 0.71 1.17 0.96 0.12 < 0.01 0.25 0.38 0.28 p-F 0.33 0.07 0.95 4.10 2.51 0.32 < 0.01 0.50 1.35 P < 0.05 0.06 0.12 0.08 0.57 0.69 0.72 0.52 0.22 Light flux MS 3.27 5.97 0.57 0.08 0.26 0.07 0.06 0.07 0.06 0.14 p-F 43.08 29.78 56.20 0.56 4.13 1.05 0.92 0.82 0.47 P 0.74 0.79 0.44 < 0.05 0.23 0.74 0.99 0.57 0.30 Net flux MS p-F 0.84 0.31 0.80 0.35 0.89 8.76 2.74 14.02 0.58 1.20 0.39 0.80 0.64 1.58 0.14 0.60 0.49 2.49 0.20 P 0.75 0.59 0.09 < 0.01 0.38 0.51 0.27 0.52 0.07 P < 0.01 < 0.01 < 0.01 0.63 0.15 0.46 0.42 0.45 0.70 Net flux MS p-F 3.08 28.81 5.20 16.20 0.96 41.32 0.11 0.98 0.14 1.43 0.04 0.41 0.00 0.04 0.08 0.61 0.10 0.90 0.11 P < 0.05 < 0.05 < 0.05 0.42 0.32 0.69 0.85 0.52 0.45 (b) NOX Trt 2 vs 4 sources 2 sourcesa vs b Mix (Trt) Biomass Biomass x Trt Biomass x 2 vs 4 sources Biomass x 2 sourcesa vs b Biomass x Mix (Trt) Residual df 2 1 1 3 1 2 1 1 3 60 Dark flux MS 3.29 4.64 1.94 0.30 0.07 0.07 0.02 0.12 0.17 0.11 p-F 11.11 6.57 8.14 2.59 0.42 0.41 0.15 0.61 1.51 Supplementary Information – S4 (a) DON Trt 2 vs 4 sources 2 sourcesa vs b Mix (Trt) Biomass Biomass x Trt Biomass x 2 vs 4 sources Biomass x 2 sourcesa vs b Biomass x Mix (Trt) Residual df 2 1 1 3 1 2 1 1 3 60 Dark flux MS 0.20 0.38 0.01 1.31 < 0.01 1.13 2.22 0.04 0.68 0.40 p-F 0.15 0.39 0.02 3.29 < 0.01 1.65 4.27 0.10 1.72 P 0.85 0.54 0.90 < 0.05 0.99 0.34 0.10 0.78 0.18 Light flux MS 0.81 0.01 1.62 0.32 1.00 0.52 0.07 0.97 0.08 0.29 p-F 0.26 0.37 12.35 5.68 0.33 0.33 0.43 0.27 2.73 P 0.80 0.58 0.07 < 0.01 0.60 0.73 0.56 0.66 0.06 Light flux MS 1.69 3.39 < 0.01 1.09 1.12 0.03 0.06 < 0.01 0.43 0.32 p-F 2.52 0.01 3.42 1.12 12.02 6.28 0.24 9.08 0.29 p-F 1.56 4.14 < 0.01 3.41 2.64 0.07 0.19 < 0.01 1.33 P 0.23 0.93 0.21 0.37 < 0.05 0.08 0.64 0.09 0.84 Net flux MS 0.65 0.12 1.18 0.75 1.00 0.34 0.14 0.53 0.24 0.28 p-F 0.87 0.14 1.76 2.72 4.26 1.42 0.44 6.82 0.85 P 0.51 0.70 0.32 0.06 0.13 0.38 0.55 0.11 0.48 P 0.35 0.11 0.96 < 0.05 0.20 0.94 0.65 0.99 0.28 Net flux MS 1.07 2.03 0.12 1.53 0.29 0.16 0.32 < 0.01 0.53 0.28 p-F 0.70 1.73 0.69 5.39 0.55 0.31 0.81 0.01 1.86 P 0.54 0.25 0.50 < 0.01 0.47 0.78 0.38 0.95 0.15 (b) DIN Trt 2 vs 4 sources 2 sourcesa vs b Mix (Trt) Biomass Biomass x Trt Biomass x 2 vs 4 sources Biomass x 2 sourcesa vs b Biomass x Mix (Trt) Residual df 2 1 1 3 1 2 1 1 3 60 Dark flux MS 0.37 0.43 0.32 1.45 0.23 0.23 0.25 0.21 0.70 0.25 Supplementary Information – S5 (a) DOP Trt 2 vs 4 sources 2 sourcesa vs b Mix (Trt) Biomass Biomass x Trt Biomass x 2 vs 4 sources Biomass x 2 sourcesa vs b Biomass x Mix (Trt) Residual df 2 1 1 3 1 2 1 1 3 60 Dark flux MS 0.22 0.44 < 0.01 0.14 0.17 0.06 0.10 0.02 0.12 0.05 p-F 1.63 4.31 0.02 2.60 1.49 0.53 1.07 0.19 2.23 P 0.33 0.12 0.92 0.07 0.30 0.63 0.33 0.72 0.10 Light flux MS 0.34 0.04 0.64 0.14 0.13 0.08 0.02 0.14 0.11 0.06 p-F 2.07 4.95 0.16 6.88 3.94 2.76 3.43 1.45 0.45 P 0.29 0.09 0.73 < 0.01 0.15 0.22 0.15 0.36 0.71 Light flux MS 0.28 0.29 0.26 0.08 0.05 0.06 0.05 0.07 0.09 0.06 p-F 2.38 0.16 3.10 2.27 1.13 0.74 0.19 0.94 1.79 p-F 3.32 2.27 2.17 1.50 0.52 0.67 0.58 0.84 1.67 P 0.22 0.71 0.22 0.10 0.34 0.55 0.71 0.42 0.16 Net flux MS 0.13 0.09 0.16 0.07 0.21 0.08 0.08 0.09 0.15 0.05 p-F 1.97 1.05 6.57 1.37 1.37 0.55 0.57 0.49 3.18 P 0.30 0.40 0.13 0.26 0.36 0.63 0.49 0.55 < 0.05 P 0.17 0.21 0.26 0.21 0.52 0.58 0.46 0.49 0.18 Net flux MS 0.36 0.70 0.02 0.09 0.06 0.06 0.08 0.05 0.02 0.04 p-F 3.92 9.34 0.23 2.49 2.61 2.85 2.72 1.65 0.59 P 0.14 < 0.05 0.69 0.07 0.20 0.20 0.16 0.35 0.61 (b) DIP Trt 2 vs 4 sources 2 sourcesa vs b Mix (Trt) Biomass Biomass x Trt Biomass x 2 vs 4 sources Biomass x 2 sourcesa vs b Biomass x Mix (Trt) Residual df 2 1 1 3 1 2 1 1 3 60 Dark flux MS 0.47 0.89 0.04 0.23 0.06 0.04 0.06 0.02 0.01 0.03