流式细胞术在周期与凋亡 检测中的应用 中山医学院药理学教研室 黄奕俊 2011.11 本次培训讲座已录制视频,需要观看视频 的各位老师和同学可带移动硬盘到科技楼 北810房(原房号为北806房)拷贝视频 。 科研仪器管理中心 流式细胞术的应用 Cell surface receptors Cell DNA Cytokines Activation HIV Apoptosis Immune function Cell signaling Organ transplantation Stem cell Autoimmune Cell adhesion Cell viability Intracellular receptors Intracellular signal transduction Dendritic cells Leukemia Lymphoma Quantitative cell fluorescence 0 5000 10000 15000 细胞DNA流式分析原理 某些荧光染料( PI、 EB、HOs、DAPI、 7-AAD、AO等)与细胞内DNA碱基结合,在 特定波长激光激发下发射出荧光,荧光强度与 DNA含量成正比。流式细胞仪通过测定细胞的 荧光强度推算出细胞的DNA含量。 Our bullets —Dyes Preparation protocol 取对数生长期细胞,胰酶适度消化,800rpm离心 15 min。 PBS洗2次,加0.5mL PBS吹匀,务必吹散。 用5mL注射器将细胞吸起,打入5mL 70%(预冷)乙醇中,4℃固定 过夜(可长至4周)。 取0.2mL(100万细胞/mL),加入含RNaseA(50µg/mL)和PI (65µg/mL)的染色液0.4mL,室温避光染色60min。 用300目(孔径40~50微米)尼龙网过滤,上机检测。 细胞周期: G0/G1(diploidy)→S→G2/M(tetraploidy) 各期细胞分布(比例)的变化提示 细胞DNA含量和增值特性的变化。 300 225 150 0 75 Counts DNA Analysis 0 200 400 2N 600 800 4N PI Fluorescence 1000 DNA index(D.I.): (G0)G1s / (G0)G1n s = sample cells,n = control cells indicating the degree of DNA content abnormality 300 225 DNA index 1.21 150 Aneuploid peak 0 75 Counts DNA Analysis 0 200 400 600 PI Fluorescence 800 1000 周期细分(cell cycle compartments): G0 (G1Q)→G1T→G1A→G1B→S→G2/M Proliferative fraction: = S-phase fraction = SPF 相比目测确定水平门方式,利用去叠合 程序(Deconvolution program)拟合DNA histogram是更为客观和准确的做法: MultiCycle for BC machines ModFit for BD machines C1 C1+DrugA C1+DrugB C2+Ir+DrugB 使用去叠合程序进行拟合计算, 理想的计数低限为200个细胞/通道, 一般计数不少于5万个细胞。 要注意的问题: 单独SPF数据不能完全正确反映增殖速率, 应结合增值曲线或BrdU等数据联合分析。 为什么? 最可靠的细胞增殖测定方法依次是: 1… 2… 3…SPF测定+ BrdU/EdU掺入测定 其它一些周期相关的DNA含量测定应用: mutation detected by the widening of G0/G1 Detecting mitotic cells 细胞凋亡的检测 凋亡(apoptosis)是指在形态学上发生封闭性内 部降解的一种主动的细胞死亡过程,由于其发生发展 的严格有序性、受调性和精巧性,故在功能学上又被 称为程序性细胞死亡(programmed cell death),是 机体细胞在一定条件下激活某种自杀机制,按照一定 的调控方式进行的自我清除。 细胞凋亡提出的本质是要区别于细胞坏 死,而且其概念最初是来自它们形态学上的 差异,因此判断细胞死亡形式的首要标准是 细胞的形态学(morphological)变化而非 包括FCM指标在内的其它指标。 Apoptosis Decision Tree Apoptotic Sample Cells Cell Extracts Flow* Flow* Microscopy ELISA Tissue Sections IHC* Western Blot* / Immunoprecipitation Spectrofluorometry Gene Expression M bp 200 100 What can FCM do in apoptosis detection? Plasma Membrane: light scatter, Annexin-V, permeability Cytoplasm: Caspase activation, Redox status Cytoplasmic organelles: Mitochondrial membrane potential, lysosomes Nucleus: DNA content, DNA fragmentation, sensitivity to denaturation Apoptotic Sample Cells Microscopy Flow Unfixed Fixed Loss of membrane asymmetry: Annexin V* Mitochondrial membrane potential: MitoScreen (JC-1)* Caspase inhibitors: FAM-VAD-FMK Cleaved markers: Active Caspase-3*, Cleaved PARP* TUNEL / DNA fragmentation: APO-Direct / BRDU 凋亡:DNA loss→subG1(apoptotic peak) 提示凋亡细胞的出现 要注意的问题: 以PI单染法进行凋亡细胞定量是最经济的方法,但 其漏检和错检率都很高。漏检主要发生在S期和G2/M期 的凋亡细胞,这些细胞即使有DNA含量降低,但其存有 的DNA含量仍不低于二倍体细胞,因而不会出现subG1。 错检的原因主要是细胞碎片和小颗粒也表现出低荧光。 C3+DrugC 这是啥? 要注意的问题: 单细胞悬液的准备容易引起subG1假阳 性和假阴性,容易引起细胞粘连。考虑降 低胰酶的浓度,注意分散细胞时操作的柔 和性,注意全程上清液的收集。 AnnexinⅤ磷脂结合蛋白作为探针识别 细胞膜表面磷脂酰丝氨酸(PS) ß-TG不同时间(0、6、12、18、24h)诱导HL-60细胞凋亡 Q:同样是PI染色,subG1(AP)和AV-PI 检测有什么不同?为什么? 线粒体膜电位(mitochondrial transmembrane potential,MTP) 被认为是多数凋亡模型中胞内发生 的早期重要事件 Mitocapture、JC-1,聚集在MTP正常的 线粒体膜上形成polymer,被488nm光激发后 发出橙色荧光。当MTP丢失时染料分子从线 粒体膜上解离下来,以monomer游离于胞浆, 被488nm光激发后发出绿色荧光。 A: PMN + medium alone (3 h) B: PMN + medium alone (6 h) E: PMN +ONO-AE-248(3 h) F: PMN +ONO-AE-248(6 h) C: PMN + medium alone (9 h) G: PMN +ONO-AE-248(9 h) D: PMN + medium alone (18 h) H: PMN +ONO-AE-248(18 h) MTP是电势能指标,必须是细胞在活性 状态下被染色→不能固定细胞→表抗可同标, 内抗不能同标。 细胞核内DNA断裂标记分析(TUNEL法,ISNT法) 细胞凋亡过程中细胞核内的DNA出现断裂,断裂点暴露出DNA 分子的残端,用末端转移酶(TdT)或者缺口连接酶都可以标记上 可以识别的化学物质。标记DAN断裂的3’—羧基末端,常采用由 DNA聚合酶I催化的原位缺口转移(in situ nick translation,ISNT) 或用TdT介导的dUTP原位缺口末端标记(terminal deoxynucleotidyl transferase mediated dUTP nick end labeling,TUNEL)技术。 ISNT和TUNEI法均可进行间接或直接标记。 直接法:标记物常为异硫氰酸荧光素FITC—dUTP。 间接法:标记物通常是生物素化脱氧三磷酸尿苷(biotin—dUTP)或 地高辛Dig—dUTP等;间接标记还需链霉亲合素 FITC或抗Dig— FITC,使标记反应倍增,其灵敏度较高,但比直接标记复杂。 注意:TUNEL法不能区分DNA断端的性质, 因此无法单独鉴别坏死和凋亡 APO2.7是一种分子量为38Kda的线粒 体膜蛋白,仅表达在凋亡细胞的线粒体膜 表面,2.7A6A3单抗能与之识别,是细胞凋 亡的早期信号。用经Digitonin透膜的细胞 与APO2.7的单抗反应后FCM检测,就可反 应细胞凋亡的状态。 细胞凋亡分子检测 效应蛋白的活性和降解:Western Blot、FCM 信号通路蛋白磷酸化水平:Western Blot、FCM 信号通路蛋白激酶活性: Co-IP+Western Blot、FCM? 蛋白编码基因表达水平:Northern Blot、RT-PCR FCM analysis of proteins Cells: Intracellular staining of proteins or in combination with surface markers Cell lysates:Cytometric Bead Array(CBA) JC-1 Staining in Control and Apoptotic Cells Jurkat T Cells Mouse Thymocytes Control JC-1 (Fl-2) Control R1 R1 R1 R2 R2 R2 Staurosporine Camptothecin Fas mAb R1 R1 R1 R2 R2 R2 JC-1 (Fl-1) Comparison of Active Caspase-3 and JC-1 JC-1 95% 5% 40% 64% 36% PE (Fl-2) JC-1 (Fl-1) Jurkat T cells JC-1 (Fl-2) 1% Cell Count Camptothecin 4 µM, 4 h Control Active Caspase-3 Caspase-Signaling & Mitochondrial Depolarization 1% JC-1 95% 5% 38% 40% 64% 36% PE (Fl-2) Jurkat T cells JC-1 (Fl-1) JC-1 (Fl-2) 1% Cell Count Camptothecin 4 µM, 4 h Control Active Caspase-3 Cleaved PARP Why and how can FCM replace or complement western blotting? ——BD phosflow direct-conjugated Antibodies ——BD CBA • Quantification • Multi-parameters analysis • Quickness & convenience Stanford Technology:11 Color Example Perez & Nolan, Nature Biotechnology, 2002:20, 155-162 Active Caspase-3 CBA Protocol Analysis of Active Caspase-3 in Jurkat T Cells 104 103 Control Camptothecin Active Caspase-3 Standard Curve 102 CBA 10 1 1 10 102 Cell Count Protein (ng) Control Camptothecin 103 104 Control Camptothecin 32 kDa 17 kDa Active Caspase-3–PE Pro/Active Caspase-3 pAb Classical Flow Cytometry Western Blot PARP Cleavage: Apoptosis Marker Active Caspase-3 CBA Standard Curves Control MCF-7 Camptothecin Jurkat Camptothecin FL3-H Control Jurkat Camptothecin Data Examples MCF-7 Camptothecin 10,000 ng 3000 ng Protein (ng) FL2-H Western Blots Jurkat Control MCF-7 Camptothecin pAb Camptothecin Control mAb C2-10 F21-852 C2-10 F21-852 116 kDa 32 kDa 85 kDa 17 kDa Pro/Active Caspase-3 pAb C210: Full Length/Cleaved PARP F21-852: Cleaved PARP Median Fluorescence Intensity (MFI) Cleaved PARP by CBA and Western Blot in Jurkat Cells Following Camptothecin Treatment 10000 Hour 1 Hour 2 Hour 3 Hour 4 1000 100 10 1 1 10 100 1000 10000 10 100 1000 10000 10 100 1000 10000 10 100 Protein Lysate (ng) Hour 1 Hour 2 Hour 3 Lanes: titration of cell lysate on each gel Hour 4 1000 10000 3 Bead Apoptosis CBA Assay Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Active Caspase-3 Y Y Y Y Wash Read on Y Flow Cytometer LYSATE OR SUPERNATANT Y Y Y Cleaved PARP BEADS Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Bcl-2 DETECTOR ANTIBODY Y Y Y Y Cytometric Bead Array Analysis of Cell Lysates Bcl-2 MCF-7 MFI U937 Active Caspase-3 Control Camptothecin Protein (units) Cleaved PARP FCM中需要注意的地方: 1. FCM可以做什么?不可以做什么? 2. FCM是否可以单独使用?需与什么设备共事? 3. FCM需要进行什么准备? 4. 指标和荧光素如何选择? 5. 如何进行收集才是正确的? 6. 如何选择正确的分析方案和工具? 7. 如何判读数据? 整体峰移只能用MFI评价 背景群落应予跟踪 疑似特异峰可以在斜率折点设门 Our weapon:EPICS ALTRA Flow Cytosorter References Practical Flow Cytometry (4th ed.) Howard M. Shapiro, 2003 Flow Cytometry, A Practical Approach (2nd ed.) M. G. Ormerod, 1994 Flow Cytometry and Sorting (2nd ed.) M. R. Melamed, 1990 Acknowledgement 赵静、谭文军、薛向军、陈志忠 BECKMAN COULTER公司流式应用工程师 Christopher “Kit” Snow Principal Staff Scientist Beckman Coulter Inc.