讲座提纲
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什么是分子育种
历史回顾
全基因组策略
基因型鉴定
表现型鉴定
环境型鉴定 (etyping)
标记-性状关联分析
标记辅助选择
决策支撑系统
展望
作物许多重要性状通常表现为数量变异。
经典数量遗传学把控制同一性状的多个基因作
为一个整体进行研究， 曾一度陷入死胡同。
上个世纪80年代分子标记的发展，为复杂性状
的遗传和改良注入了新的活力。
数量性状遗传改良的希望和曙光
Paterson, A. H., E. S. Lander, J. D. Hewitt, S. Peterson, S. E.
Lincoln and S. D. Tanksley. 1988. Resolution of quantitative traits
into Mendelian factors by using a complete linkage map of
restriction fragment length polymorphisms. Nature 335:721-726.
Received: July 8, 1988
Accepted: September 9,1988
Google 被引次数：1503 (11:16, April 10, 2014)
Lander, E. S. and D. Botstein. 1989. Mapping Mendelian factors
underlying quantitative traits using RFLP linkage maps. Genetics
121:185-199.
Received: August 2, 1988
Accepted: October 6, 1988
Google被引次数：4701 (11:17, April 10, 2014)
中国早期的数量性状基因定位
1990-1994
1990 “限制性片段长度多态性在数量基因定位中的应用”。 全国高校
青年教师遗传学进展报告文集, 中国遗传学会, 第303-309页。
1992 “分子标记在数量基因定位中的应用”。遗传14（2）45-48
1992年3-8月 “ 数量遗传的分子基础” 系列讲座，中国科学院遗传所
1993 “发展中的遗传学分支学科—分子数量遗传学”，《遗传学基础
理论问题文集， 北京师范大学出版社，1993年12月
1993年10月 浙江农业大学研究生“ 数量遗传的分子基础” 专题讲座
1994年10月“分子标记在数量基因定位中的应用”， 生物数学专题研
讨会， 浙江农业大学和农学会生物数学分会
1994年11月 “分子数量遗传学研究进展与展望”，全国青年教师遗传
学进展报告会，中国遗传学会，上海农学院
1994年11月 “分子标记在植物数量性状遗传改良中的应用”，第三届
全国青年作物遗传育种讨论会，中国作物学会，南京农业大学。
博士论文
利用DNA限制性片段长度多态性定位水稻数量性状基因
徐云碧, 申宗坦, 徐吉臣, 朱衡, 陈英, 朱立煌, 1994. 利用分子标记连锁图谱进行
水稻数量基因的区间作图。中国科学(B辑) 24:971-976
徐云碧, 申宗坦, 朱立煌, 陈英, 1994. 水稻形态性状与分子标记的相互关联及其
检测。浙江农业学报 6:1-6
徐云碧, 申宗坦, 陈英, 朱立煌, 1995. 利用最大似然法进行水稻产量基因的分子
作图。遗传学报 22:37-42
徐云碧, 申宗坦, 陈英, 朱立煌, 1995. QTL 区间作图的统计理论和计算机软件及
其应用。作物学报 21:1-8
徐云碧, 申宗坦, 陈英, 朱立煌, 1995. 分子标记与 QTL 之间重组率的最大似然
估计及其程序设计。 中国农业科学 28 (增刊): 56-60
徐云碧, 申宗坦, 陈英, 朱立煌, 1995, 水稻籼粳杂种 F2 群体 RFLP 标记的异常
分离及其染色体分布。植物学报 37:91-96
徐云碧 朱立煌 1994 分子数量遗传学
中国农业出版社， 291页
Xu, Yunbi. and Zhu, Lihuang (1994)
Molecular Quantitative Genetics
China Agriculture Press, Beijing
Milestone Publications Since 1994
Xu, Y. 1997. Quantitative trait loci: separating, pyramiding, and cloning. Plant
Breeding Reviews 15:85-139. Citation # = 72
Xu, Y. 2002. Global view of QTL: Rice as a model. In: M. S. Kang (ed),
Quantitative Genetics, Genomics, and Plant Breeding. CAB International,
pp.109-134. Citation # = 56
Xu, Y. 2003. Developing marker-assisted selection strategies for breeding hybrid
rice. Plant Breeding Reviews 23:73-174. Citation # = 43
Xu, Y., S. R. McCouch and Q. Zhang. 2005. How can we use genomics to
improve cereals with rice as a reference genome? Plant Molecular Biology
59:7-26. Citation # = 68
Xu, Y. and J. H. Crouch. 2008. Marker-assisted selection in plant breeding: from
publications to practice. Crop Science 48:391–407. Citation # = 278
Xu, Y. 2010. Whole genome strategies for molecular plant breeding. Third
International Conference for Plant Molecular Breeding, Beijing China.
Xu, Y., Y. Lu, C. Xie, S. Gao, J. Wan, B. M. Prasanna. 2012. Whole-genome
strategies for marker-assisted plant breeding. Molecular Breeding 29:833–854
Xu, Y., C. Xie, J. Wan, Z. He and B.M. Prasanna. 2013. Marker-assisted selection
in cereals: platforms, strategies and examples. In: P. K. Gupta and R. K.
Varshney (eds.), Cereal Genomics II, Springer Science+Business Media
Dordrecht, pp375-411.
几个重要概念的发展和深化
 1997 数量性状基因座位 (QTL) 的分离、累加和克隆
 1997 发育性状的动态QTL定位 (Dynamic Mapping)
 2001 QTL的全视野观察 (Global View)
 2001 Near Iso-Environment (近等环境) 下的QTL解析
 2003 杂交水稻的分子标记辅助育种策略
 2005 以水稻作为模式作物改良其他禾谷类作物
 2008 完成从论文到实践的转变需要克服的瓶颈因素
 2010 分子标记辅助育种的全基因组策略
 2012 Etyping (Environmental Assay, 环境型鉴定)
 2013 标记辅助选择的平台与策略
Complex traits
Quantitative
traits
Partitioning
Single manipulable traits
Mapping
Non-Allelic QTL
on chromosomes
Cloning
Cloned QTL
Assembling
Assembled QTL
Optimizing
QTL
in genetic
background
QTL
from
related
species
Promoter
Regulater
Enhancer
QTL from related traits
Genetic Background and Interaction
(Xu 1997. Plant Breed. Rev. 15:85-139)
QTL
from
distant
species
十年磨一➹
2001年开始构思
2002年与CABI签订出版合同
2010年出版
Molecular Plant Breeding
Yunbi Xu
ISBN: 978 1 84593 392 0
2010 734 pages
作序
诺贝尔奖获得者布劳格
美国科学院院士 R. Phillips
中文版 (2014)
陈建国 华金平 等翻译
科学出版社出版
波斯文版
Reviewed by over 30 worldwide experts
Molecular Plant Breeding
1. Introduction
2. Molecular Breeding Tools: Markers and Maps
3. Molecular Breeding Tools: Omics and Chips
4. Populations in Genetics and Breeding
5. Plant Genetic Resources: Management , Evaluation and Enhancement
6. Molecular Dissection of Complex Traits: Theory
7. Molecular Dissection of Complex Traits: Practice
8. Marker-Assisted Selection: Theory
9. Marker-Assisted Selection: Practice
10. Genotype-by-Environment Interaction
11. Isolation and Functional Analysis of Genes
12. Gene Transfer and Genetically Modified Plants
13. Intellectual Property Rights and Plant Variety Protection
14. Breeding Informatics
15. Decision Support Tools
16. 分子植物育种：进展与展望—中文版跋