MUTASI Agustina Setiawati, M.Sc., Apt Mutasi, mutan & mutagen Mutasi • Perubahan basa dalam sekuen DNA (Pd umumnya di dalam suatu gene). • Perubahan ini termasuk : substitusi basa, adisi, penyusunan ulang dan delesi Mutan • Organisme yang mengalami mutasi. • Mutasi tersebut tentunya terjadi dalam gena yang menyebabkan terjadinya perbedaan yang nyata dengan bentuk normal (Wild-Type). Mutagen • pengaruh fisika atau senyawa kimia yang menyebabkan mutasi. Mutagens A spontaneous mutation occurs once in 108 cells. The mutation rate can be increased by exposing cells to mutagens, which are either chemicals or physical agents such as UV-irradiation. Both chemicals and physical agents act by causing genetic damage that results in base changes in DNA Mutagenesis - Proses terjadinya suatu mutasi - Bisa terjadi secara: (a) Spontan (natural process) terjadi <1 in 108 E. coli misalnya saat kesalahan replikasi DNA (a) Diinduksi (mis. dengan mutagen(EMS atau sinar UV). Mismatches saat DNA replikasi Mutan Replikasi 5’-ATTGG-3’ 3’-TAACC-5’ 5’-ATGGG-3’ 3’-TAACC-5’ 5’-ATGGG-3’ 3’-TACCC-5’ Normal 5’-ATTGG-3’ 3’-TAACC-5’ Perubahan struktur Mutasi DNA Kerusakan nukleotida 5’-ATXGG-3’ 3’-TAGCC-5’ 5’-ATXGG-3’ 3’-TAACC-5’ Mutan 5’-ATXGG-3’ 3’-TAGCC-5’ 5’-ATCGG-3’ 3’-TAGCC-5’ 5’-ATTGG-3’ 3’-TAACC-5’ Normal Mutan Tipe mutasi A. Point mutation/Mutasi Titik a. Substitusi satu basa dengan nukleotida yang lain 2 tipe: Transisi – perubahan purine ke purine (A to G, G to A) atau pirimidin ke pirimidin (C to T, T to C) Transversi – perubahan purine ke pirimidin atau sebaliknya, e.g. A to C/T, C to A/G b. Insersi atau delesi Penambahan atau pengurangan satu base-pairs. MUTASI TITIK 1. Silent mutation Perubahan basa tidak meyebabkan perubahan pada kodon 5’ ATG GGA GCT CTA TTA ACC TAA 3’ met gly ala leu leu thr stop Silent mutation transisi 5’ ATG GGA GCT CTA TTG ACC TAA 3’ met gly ala leu leu thr stop Mutasi pada aras gena 2. Missense mutation Perubahan basa Perubahan kodon 5’ ATG GGA GCT CTA TTA ACC TAA 3’ met gly ala leu leu thr stop Missense mutation ( transversi) 5’ ATG GGA GCT CTA TTT ACC TAA 3’ met gly ala leu phe thr stop Mutasi pada aras gena 3. Nonsense mutation Perubahan basa menjadi stop kodon 5’ ATG GGA GCT CTA TTA ACC TAA 3’ met gly ala leu leu thr stop Nonsense mutation ( & transversion) 5’ ATG GGA GCT CTA TGA ACC TAA 3’ met gly ala leu stop Mutasi pada aras gena 4. Frameshift mutation Hilangnya satu basa perubahan pada pembacaan 5’ ATG GGA GCT CTA TTA ACC TAA 3’ met gly ala leu leu thr stop Frameshift mutation 5’ ATG GGG AGC TCT ATT AAC CTA A 3’ met gly ser ser ile asn leu KODON DAN ASAM AMINO YG DISANDI Base-pair and Frameshift Mutations Mutation type THE NUN SAW OUR CAT EAT THE RAT THE NSN SAW OUR CAT EAT THE RAT Nonsense THE SUN SAW OUR CAT EAT THE FAT Missense THE Frameshift NUS AWO URC ATE ATT HER AT Tipe mutasi B. Inversi Pemotongan sebagian DNA dan kemudian disisipkan pada tempat yg sama tetapi pada orientasi yg berbeda 5’-ATTGG-3’ 5’-ATCAG-3’ 3’-TAACC-5’ 3’-TAGTC-5’ Reversion This is the reverse process of mutation and involves a mutant regaining a wild-type phenotype, either through: 1. A back mutation (direct reverse of the mutation) 2. A reverse or suppressor mutation (not a direct reverse, but a mutation at a second site generally within the same gene which suppresses the effect of the first mutation). The mutant is described as a revertant. A practical example of reversion is the Ames test which is used to test for carcinogens. What is reversion? WT, active Mutate - to + Mutant, inactive + +- + Mutate + to +- -+ WT, active WT ?, active Same site revertant different site revertant C.Mutasi pada Kromosom Depurinasi spontan Kehilangan 300 purin perhari pada pH 7, 37C Pada sel mamalia 10.000 purin/hari Kecepatan meningkat jika suhu naik atau pH turun Adanya senyawa alkikasi (etil etena sulfonat, nitrogen mustrat) menaikkan kecepatan depurinasi MUTAGEN FISIKA Fotoliase MUTAGEN KIMIAWI MUTAGEN KIMIAWI BASA ANALOG ◦ 5-Bromourasil dan 2-aminopurin bergabung pada DNA seperti asam nukleat lainnya ◦ BU = analog timin, yang berpasangan dengan A tetapi juga dapat berpasangan dengan G ◦ Terjadi mutasi dari A:T menjadi G:C BROMURASIL DALAM BENTUK ENOL BU:G AFLATOKSIN B1 AFLATOKSIN B1 OLEH SITOKROM P450 DIUBAH MENJADI SENYAWA EPOKSID YG BEREAKSI DENGAN G G:C MENJADI T:A SENYAWA INI BEREAKSI DENGAN 7-N GUANOSIN menghasilkan radikal G:C MENJADI T:A A flato xin B 1 e xo -8,9 -Ep o x id e fo rm s D N A -A d d u cts O O HO O H O O P 450 H N NH 2 O O CH O O CH 3 dR 3 DNA D N A -A d d u c t (N 7 -d G u o ) e x o -8 ,9 -ep o x id e O O H N N O O H O + O DNA H O O HN H O O O CH 3 A fla to x in B 1 O O P 450 O H O O O SG GST H HO O O O H O H O CH 3 e n d o -8 ,9 -e p ox id e O O CH 3 ASAM NITRIT MENGOKSIDASI ADENIN (A) MENJADI HIPOSANTIN ◦ HIPOSANTIN INI AKAN BERPASANGAN DENGAN C ◦ A:T MENJADI G:C A:T G:C Etil Metil Sulfoksida (EMS) AKRIDIN ORANYE PENYAKIT AKIBAT MUTASI Xerodermal pigmentosum Huntington Disease Leukimia Xeroderma Pigmentosum (XP) Autosomal resesive Mutasi pada beberapa gene yang terlibat dalam repair – pemotongan dimer pirimidin Peka terhadap sinar UV –kanker kulit CC 4.7 HUNTINGTON DISEASE CAG : GLUTAMIN NORMAL PENDERITA 36 -82 KOPI HUNTINGTON DISEASE CAG : GLUTAMIN PENDERITA 36 -82 KOPI Fagile X syndrome: berpengaruh pada sistem regulasinya Chromosome 1 Gene A Gene B Chromosome 2 Fusion Gene Primary transcript Fusion mRNA Unique Properties Chimaeric protein Altered Pattern of gene expression Acts as an oncogene 65% of leukaemias are characterised by particular somatically acquired chromosome translocations Differentiation Blocked Continued self-renewal Bcr-abl = constitutively active tyrosine kinase (The protein product from this fusion gene only found in ~70% of patients) Chronic myeloid leukaemia (CML) is characterised by the t(9;22)(q34;q11) reciprocal translocation TERIMA KASIH