Basic Mendelian genetics applied to livestock Asst.Prof.Dr.Wuttigrai Boonkum Department of Animal Science Khon Kaen University What is genetics ? • “Genetics is the study of heredity, the process in which parents pass certain genes onto their offspring.” • Offspring inherit their biological parents’ genes that express specific traits, such as some physical characteristics, natural talents, and genetic disorders. What is genetics ? Watson and Crick (found in April, 1953) Genetic concepts • Heredity describes how some traits are passed from parents to their offspring. • The traits are expressed by genes, which are small sections of DNA that are coded for specific traits. • Genes are found on chromosomes. • Humans have two sets of 23 chromosomes— one set from each parent. Mendelian Inheritance • The inherited traits are determined by genes that are passed from parents to offspring. • A offspring inherits two sets of genes one from each parent. • A trait may not be observable, but its gene can be passed to the next generation. Example number of chromosome in animal Common name Human Horse Ass European cattle Zebu cattle American bison Domestic buffalo River buffalo Musk Ox Reindeer Sheep Goat Swine Dog Cat Rabbit Mouse Rat Chicken Scientific name Homo sapiens Equus caballus Equus asinus Bos tausus Bos indicus Bison bison Bubalus bubalis Bubalus bubalis Ovibos moschatus Rangifer tarandus Ovis aries Capra hircus Sus scrofa Canis familiaris Felis catus Oryctolagus cuniculus Mus musculus Rattus norvegicus Gallus gallus Chromosome number 46 64 62 60 60 60 48 52 48 70 54 60 38 78 38 44 40 42 70-80 Classical (Mendelian) Genetics • • • • Principles of genetics were developed in the mid 19th century by Gregor Mendel an Austrian Monk Developed these principles without ANY scientific equipment - only his mind. Experimented with pea plants, by crossing various strains and observing the characteristics of their offspring. Studied the following characteristics: – – – – • • • Pea color (Green, yellow) Pea shape (round, wrinkled) Flower color (purple, white) Plant height (tall, short) Made the following observations (example given is pea shape) When he crossed a round pea and wrinkled pea, the offspring (F1 gen.) always had round peas. When he crossed these F1 plants, however, he would get offspring which produced round and wrinkled peas in a 3:1 ratio. Laws of Inheritance • Law of Segregation: When gametes (sperm egg etc…) are formed each gamete will receive one allele or the other. • Law of independent assortment: Two or more alleles will separate independently of each other when gametes are formed Law of segregation (กฏการแยกตัวของยีน) • คู่ข องยีน จะมี การแยกออกจากกั นเมื่ อสั ตว์ มีก าร สร้ างเซลล์ สื บ พั น ธุ์ และจะเข้ า คู่ กั น อี ก ครั ้ง อย่ า ง อิสระเมื่อมีการผสมพันธุ์เป็ น zygote (นิยมพูด ถึงยีน 1 คู่) ชื่อเรียกอื่น : A • • • • A A a a a Mendel’s 1st Law 1st Law of Genetics Law of random assortment of genes Law of segregation and recombination Law of segregation Segregation of genes Recombination of genes Inter se mating Six basic genotype crosses เมื่อผสมพันธุ์สัตว์ ท่ มี ี genotype homozygous x homozygous ได้ ลูกที่มี genotype แบบ เดียว homozygous x heterozygous ได้ ลูกที่มี genotype 2 แบบ ½:½ heterozygous x heterozygous ได้ ลูกที่มี genotype ครบ ทุกแบบ parents progeny 1 AA x AA all AA 2 AA x aa all Aa 3 aa x aa all aa 4 Aa x AA 1/2 Aa, 1/2AA 5 Aa x aa 1/2Aa, 1/2aa 6 Aa x Aa 1/4AA, 1/2Aa, 1/4aa Law of independent assortment (กฎการรวมตัวอย่างอิ สระของยีน) ยีน แต่ ล ะต าแหน่ ง จะสามารถแยกไปกั บ อี ก ยีน หนึ่ ง ได้ อย่ างอิสระเมื่อมีการสร้ างเซลลสืบพันธุ์ และมีโอกาสมาเข้ าคู่ กันได้ ใหม่ อย่ างอิสระด้ วยเมื่อมีการผสมพันธุ์เป็ น zygote กล่ า วคื อ ยี น แต่ ล ะต าแหน่ งจะสามารถเกิ ด กฎการแยกตั ว (Law of segregation) ได้ อย่ างอิสระนั่นเอง กฎนีก้ ล่ าวถึงยีนตัง้ แต่ 2 คู่หรื อ 2 ตาแหน่ ง และควบคุม ตัง้ แต่ 2 ลักษณะขึน้ ไป โดยแต่ ละลักษณะนัน้ แสดงออกอย่ าง อิสระต่ อกัน ชื่อเรี ยกอื่น : • Mendel’s 2nd Law • 2nd Law of Genetics • Law of Random Assortment of Characters Law of independent assortment (กฎการรวมตัวอย่างอิ สระของยีน) Dihybrid Cross การผสมพันธุ์ระหว่างคู่ heterozygous genotype ของลักษณะทีถ่ ูกควบคุมด้วยยีน 2 คู่ ในการคานวณหา genotype และ phenotype ทีเ่ กิด จากการผสมของยีนหลายตาแหน่ง สามารถทาได้ 3 วิธี ได้แก่ • Punnett Square Method • Algebraic Method • Branch or Forked-line Method Example dominant and recessive genes in animal ชนิดสัตว์ โค Dominant trait ขนสีดำ(black coat) ไม่มีเขำ (poll) หน้ ำสีขำว(white face) มีสีตลอดลำตัว(solid) ขนสีแดง(solid red) กีบเท้ ำปกติ(cloven hooves) Recessive trait ขนสีแดง(red) มีเขำ(horn) หน้ ำปกติ(solid face) มีสีจดุ บนลำตัว(spot) ขนสีน ้ำตำลเหลือง(dilute red) กีบเท้ ำติดกัน(mule foot) ม้ ำ ลำตัวสีดำ(black coat) ขนสีน ้ำตำลแดง(bay) ลำตัวหำงและแผงคอสีน ้ำตำล mane) ขนเรี ยบ(smooth hair) สุกร ลำตัวสีดำ(black) ลำตัวคำดสีขำว(belt) กีบเท้ ำติดกัน(mule foot) เส้ นขนหยำบ(hairy hair) ขนสีขำว(white wool) ตำสีน ้ำตำล(brown eyes) หงอนกุหลำบ(rose comb) หงอนถัว่ (pea comb) ผิวหนังซีดขำว(white skin) ขนสีขำวเล็กฮอร์ น ขนสีอื่นๆ(color) ขนที่หน้ ำแข้ ง(feather shank) ขนสีดำ(black) มีหงอน crest ที่หวั ลำตัวสีแดง(red) ลำตัวปกติ(solid) กีบเท้ ำปกติ(cloven hoove) เส้ นขนอ่อนนุ่ม(woolly hair) ขนสีดำ(black wool) ตำสีฟ้ำ(blue eyes) หงอนจักร(single comb) หงอนจักร(single comb) ผิวหนังสีเหลือง(yellow skin) ขนสีอื่นๆ(color) ขนสีขำว Wyandott แข้ งปกติ(clean shank) ขนสีแดง(red) หัวปกติ(no crest) สุนขั ขนสีอื่นๆ(color) ขนสีแดง(red) สีตลอดลำตัว(solid) สีเข้ ม(solid) ขนสีขำว(white) ขนสีเหลือง(yellow) มีจดุ สีขำวบนลำตัว(white spot) สีเงิน(blue, dilute) แมว ขนสันเกรี ้ ยน(short hair) ขนสีดำ(black hair) ขนสีอื่นๆ(color) ขนสีผสม agouti (wild type) ขนยำวฟู(long hair) ขนสีน ้ำตำล(brown hair) ขนสีขำว(white) ขนสีปกติ(non agouti) แกะ ไก่ พันธุ์ Angus Arshire ขนสีน ้ำตำลแดง(chestnut/sorrel) ขนสีอื่น(non-bay) (chestnut หำงและแผงคอสีทอง (flaxen mane) ขนหยิก(curly hair) Hamshire, Hamshire Wyandott, Pymouth, Wild, Rhode Doberman Pussia Duroc Sex and Color inheritance 1. Sex-Linked Traits ยีนมีตาแหน่ งอยู่บนโครโมโซมเพศโดยตรง ดังนัน้ การกาหนดเพศของ สัตว์ (sex determination) จึงมีผลต่ อการแสดงออกของยีน Sex and Color inheritance 1. Sex-Linked Traits Sex-linked ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม ตัวอย่ างลักษณะที่แสดงออกแบบ sex-linked ในสัตว์ ชนิดสัตว์ ลักษณะ การควบคุม คน, สุนัข, ม้า, สุกร โรคเลือดไหลไม่หยุด (hemophilia) recessive คน โรคตาบอดสี (night blindness) recessive แมว การมีสีดา/ส้ม (tortoiseshell) codominant ไก่, นกกระทา การมีขนบาร์ (barr feather) การมีขนสีเงิน (silver plumage) การมีขนงอกเร็ว (fast feathering) dominant dominant recessive นกพิราบ การมีหัวสีครีม (creamyhead) การมีลายที่หัว (streak head) การมีสีแดง, น้าเงิน และน้าตาล codominant dominant multiple alleles Sex and Color inheritance 2. Sex-Influenced Traits ยีนมีตาแหน่งอยู่บนออโตโซม หากสัตว์ม ี genotype แบบ dominant หรือ recessive homozygous ก็จะแสดงออกเหมือนกันทัง้ สองเพศ แต่จะควบคุมให้มกี ารแสดงออกในเพศแตกต่างกัน หากสัตว์ม ี genotype เป็ น แบบ heterozygous Genotype h+ h+ h+h hh Phenotype เพศผู ้ เพศเมีย มีเขา มีเขา ไม่มีเขา มีเขา ไม่มีเขา ไม่มีเขา ตัวอย่างลักษณะที่แสดงออกแบบ sex-influenced ในสัตว์ ที่เป็ น heterozygous ชนิดสัตว์ ลักษณะ เพศผู ้ เพศเมีย โค การมีสี mahogany ในโค Aireshire mahogany red คน การมีศีรษะล้าน (baldness) ผมบาง ปกติ แกะ การมีเขา มีเขา ไม่มีเขา แพะ การมีเครา (beard) มีเครา ไม่มีเครา Sex and Color inheritance 3. Sex-Limited Traits ยีนมีตาแหน่งอยู่บนออโตโซม แต่จะสามารถควบคุมให้มกี ารแสดงออกได้ เฉพาะในเพศใดเพศหนึง่ เท่านัน้ ตัวอย่ างลักษณะที่แสดงออกแบบ sex-limited ในสัตว์ ชนิดสัตว์ ลักษณะ เพศผู ้ เพศเมีย โค, กระบือ, แพะ, แกะ การให้นม การสร้างน้าเชื้อ ไม่ให้ สร้าง ให้ ไม่สร้าง สัตว์ปีก การให้ไข่ การมีขนเพศผู ้ ไม่ให้ มี ให้ ไม่มี คน การมีหนวดเครา มี ไม่มี Crossing over เป็ นกระบวนการแลกเปลี่ ยนชิ้ นส่ วนของยี นระหว่าง โครโมโซม (non-sister chromosome) ที่เป็ นคู่กัน ผลจากการเกิด crossing over จะทาให้เกิดการ แลกเปลี่ยนชิ้นส่วนโครโมโซม (ยีน) ....... อาจส่งผลให้ ยีนที่อยู่บนโครโมโซมเดียวกันไม่ถกู ถ่ายทอดไปด้วยกัน ....... การเกิด crossing over … เมื่ อ สิ้ นสุ ด การแบ่ ง เซลล์ ไ มโอซิ ส จะได้ เ ซลล์ สื บ พั น ธุ์ ท่ี แตกต่างกัน 2 ชนิด 1. Parental type (gamete ชนิดที่ไม่เกี่ ยวข้องกั บการเกิ ด crossing over) 2. Recombination type (gamete ชนิดที่เกิดจากโครมาติดเกิด crossing over) แผนที่ยีน • แผนทีย่ นี (genetic map) หมายถึงคือการนายี นที่อยู่ บนโครโมโซมเดี ย วกั น มาเรี ย งล าดั บ และเพื่ อ บอก ระยะห่างระหว่างยีน บนโครโมโซม • ระยะทางระหว่างยีน (genetic distance) คานวณได้จาก อัตราการเกิด crossing over โดยกาหนดให้ 1% crossing over มีค่าเท่ากับระยะทาง 1 map unit หรือ 1 centimorgan (cM) ประโยชน์ของการทาแผนที่ยีนบนโครโมโซม 1. ช่วยในการหาลาดับของยีนที่เรียงตามยาวบนโครโมโซม 2. สามารถหาระยะทางระหว่างยีนบนโครโมโซม (ระยะทางของยี นบนโครโมโซมจะวั ดในหน่วยของ map unit) ใช้ ใ นการศึ ก ษาการแสดงของลั ก ษณะต่ า งๆ ได้ ทั้ ง ใน โครโมโซมของ prokaryote และ eukaryote 3. มีประโยชน์ในการศึกษาทาง molecular biology และ genetic engineering 4. เมื่อมีการผ่าเหล่า (mutation) ทาให้ทราบและบอก ชนิดของการเกิดการผ่าเหล่าได้ทันที Linkage gene ต่อการปรับปรุงพันธุ์สัตว์ • ประยุ ก ต์ ใ ช้ ก ลุ่ ม ยี นที่ มี ค วามเกี่ ย วข้ อ งกั น และ ถ่ายทอดไปด้ วย (linked) เพือ่ เป็ นเครื่องหมาย ทางพันธุกรรมช่วยในการคัดเลือกพันธุ์สัตว์ได้ • โดยเฉพาะลั กษณะทางเศรษฐกิ จที่ควบคุมด้ วยยี น หลายคู่ .. การคั ดเลื อกยี นใดยี นหนึ่งเพือ่ บอกบ่งชี้ ทาได้ ยาก .. เช่ น ยี นควบคุมการให้ผลผลิ ตน้า นม และยีนอื่ นๆที่ควบคุมลักษณะเชิงปริมาณ เป็ นต้น Multiple allele : การควบคุมการแสดงออกยี น ณ locus หนึ่งประกอบด้ วย ยี นที่มี allele มากกว่า 2 อั ลลีล ขึ้นไป เช่น กรุ๊ปเลือด ระบบ ABO I A, I B , I O I A, I B , I O IAIA, I AIO = Type A IBIB, IBIO = Type B IAIB = Type AB IOIO = Type O Multiple allele • การควบคุมการแสดงออกโดยยีนมากกว่า 2 อัลลีนอยู่บนตาแหน่งเดียวกันบนคู่ โฮโมโลกัสโครโมโซม การมีสขี นในกระต่าย การมีสขี นในกระต่ายถูกควบคุมด้วยยีนคู่เดียวแบบ multiple alleles โดย C cch ch c = Full color (ขนสีดาหรือน้าตาลตลอดทั้งตัว) = Chinchilla (ขนสีเทาและขาวแซมตลอดตัว) = Himalayan (ขนสีขาวแต่มีสีดาที่ปลายหู จมูก หาง และเท้า) = Albino (ขนสีขาว ตาแดง) Multiple allele Phenotype Genotype Black CC, Cch, Ccch, Cc Chinchilla cchcch, cchch, cchc Himalayan chch, chc Albino cc Multiple allele ชนิด จานวนระบบ ชื่อระบบหมู่เลือด1/ โค 12 A(10), B(>500), C(>70),FV(5), J(>4), L(2), M(3), N(2), S(8), Z(3), R’S’(3), T’(2) กระบือ 15 A(3), B(8), F(4), N(3), O(4), Q(4), J(3), L(2), P(2), R(2),S(2), T(2), Z(2), A’(2), B’(2) ม้า 8 A(5), C(2), D(6), K(2), P(3), Q(6), T(2), U(2) สุกร 15 A-O(2,2)2/, B(2), C(2), D(2), E(13), F(3), G(2), H(6), I(2), J(3), K(5), L(6), M(9), N(3), O(2) แกะ 7 A(2), B(>60), C(3), D(2), M(4), R-P(2,2)2/, XZ(2) Pleiotropic gene • การทีย่ นี เพียงตาแหน่งเดียวสามารถควบคุมการแสดงออกได้มากกว่า 1 ลักษณะ Modifying Gene • Modifying gene คือยี นหรือกลุ่มยี นที่ทาหน้าที่ ดั ดแปลงการแสดงออกของยี นหลั ก (major gene) โดย modifying gene ส่วนใหญ่มักมี อยู่หลายตาแหน่ง • Modifying gene โดยมากควบคุมในลักษณะ ปริมาณ ในขณะที่ major gene ที่เกี่ยวข้องมักเป็ น ยีนที่ควบคุมการมีลักษณะเชิงคุณภาพ Modifying Gene Holstein Friesian • Ex. การมีสขี าว-ดาของโคนมพันธุ์ Holstein Friesian พบว่า การมีจุดขาวบนพืน้ ลาตัวสีดานัน้ เป็ นลักษณะเด่น ซึง่ ถูกควบคุมโดย major gene ในขณะทีข่ นาดและตาแหน่งบนลาตัวของจุดขาวเหล่านัน้ จะ ถูกควบคุมด้วย modifying gene อีกหลายตาแหน่ง Poly gene การถ่ายทอดลักษณะที่ถกู ควบคุมด้วยยี นหลายคู่ (poly = many) เมื่อเราเรียงการกระจายของลักษณะตั้งแต่ให้ค่า ต่าที่สดุ ถึงสูงที่สดุ จะได้กราฟการกระจายเป็ น รูประฆังค่า 6/16 4/16 4/16 1/16 B 1/16 D M L W Lethal Gene • การควบคุมการแสดงออกโดยยีนโดยก่อให้เกิดลักษณะผิดปกติและอาจก่อให้เกิดการตายในทีส่ ุด ลักษณะการตายในสัตว์ ชนิด Embryonic dead Fetus abortion Stillbirth, Stillborn ลักษณะการตาย การตายเมื่ออายุ < 28-30 วัน ตัวอ่ อนที่ตายจะไม่แสดงอาการแท้งออกมาให้เห็น การตายเมือ่ อายุ > 28-30 วัน จนถึงก่อนคลอด ตัวอ่ อนที่ตายมีการพัฒนาเป็ นอวัยวะแล้วจะแท้งออกมา การตายแรกคลอดหรือขณะคลอด Lethal Gene Lethal Gene • Dominant Lethal การควบคุ ม ลั ก ษณะของสั ต ว์ ใ นลั ก ษณะที่ dominant homozygous genotype จะตาย • Recessive Lethal การควบคุ ม ลั ก ษณะของสั ต ว์ ใ นลั กษณะที่ recessive homozygous genotype จะตาย • Semilethal สั ต ว์ มีลั ก ษณะผิด ปกติ เ นื่ อ งจาก dominant หรื อ recessive lethal แต่ยังสามารถเลี้ยงให้มีชีวิตรอดได้ถ้า มีการจัดการดูแลอย่างเหมาะสม ชนิดสัตว์ โรค ลักษณะ Type โค Achondroplasia (Dexter) Cerebral hernia Umbilical hernia Polydactylism Hairless Short spine Streak hairless Fused nostrils, malformed skull Bulldog/dwarf กระโหลกและกระดูกผิดรู ป ถุงนา้ ในสมอง ไส้ เลื่อนช่ องท้ อง นิว้ เท้ าเกิน ไม่ มีขนลาตัวและผิวหนังผิดปกติ ส่ วนยื่นกระดูกสัน้ หลังสัน้ ไม่ มีขนลาตัวแบบเป็ นแถบ โพรงจมูกโหว่ กระดูกผิดปกติ โครงร่ างผิดรู ป แคระ I R D D R R DS D I ม้ า Atresia coli ลาไส้ ใหญ่ ตีบตัน R สุกร Paralysis of hindlegs Amputation Atresia anai Hydrocephalus อัมพาตขาหลัง แขนขากุด ไม่ มีรูทวาร สมองบวมนา้ R R RS R แกะ Gray fleece ขนสีเทา I สัตว์ ปีก Creeper Wingless ขาสัน้ ผิดรู ป อัมพาตคอพับ ปี กกุด I R สุนัข Hairless ไม่ มีขนลาตัวและผิวหนังผิดปกติ I กระต่ าย Pelger เม็ดเลือดขาวรู ปร่ างผิดปกติ I