BioMed Central

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BioMed Central: 让科研成果更加开放
西南大学,2011年10月20日
BioMed Central 中国区出版主管 夏蕊
主要内容
 开放获取简介
 BioMed Central及其期刊资源
 “Publish or Perish”: BioMed Central期刊投稿指南
 西南大学投稿和出版情况
 开放获取简介
开放获取
 背景:“学术期刊危机”
 基本理念:
 科研成果应为全人类所共享
 科研成果应以最快、最便捷的方式传播
 核心概念:对读者免费开放
开放获取的意义
“医学是研究如何挽救生命的科学。以病人生命风险所换来的宝
贵的医学知识,不应被视为任何人的知识财产,在医学知识传
播的过程中,不应该有任何人为的障碍。”
—— 曾昭冲,复旦大学中山医院放疗科教授
BMC Cancer期刊编委会成员
开放获取能给我们带来……
• 最广泛的读者群
开放获取能给我们带来……
• 最快的出版速度:一旦接受,立即发表
开放获取能给我们带来……
• 不受限制的出版空间
开放获取能给我们带来……
• 更高的影响力
- 2004, Kristin Antelman对哲学、政治科学、电子工程
及数学方面论文做了一项研究,结果表明OA文章要比
非OA文章拥有更高的影响力。
- 2006年,PLoS Biology的一项研究发现他们在《美国科学
院院刊》(PNAS)上发表的OA文章比不以OA形式发表的
文章在引用次数上高3倍。
 BioMed Central及其期刊资源
BioMed Central:11年开放获取之路
•
•
•
•
世界上最大的开放获取出版社
2008年10月被施普林格出版集团收购
目前拥有220多种期刊,涵盖医学和生物学各个领域
出版成本由“文章处理费” (APC)支付
BioMed Central期刊特点
 高能见度
其他如:
•
•
•
•
•
Cell Biology
Molecular Biology
Systems Biology
Bioinformatics
Developmental
Biology
……
BioMed Central期刊特点
 高影响力:已有114种期刊被SCI收录,101种期刊具有影响因子
BioMed Central期刊特点
 期刊队伍不断壮大
 期刊队伍不断壮大(新刊筹备中)
 “Translational Neurodegeneration”- Ruijin Hospital,
Shanghai Jiaotong University School of Medicine (上海
瑞金医院)- 陈生弟, 著名神经学家
 “Journal of Animal Science and Biotechnology”Chinese Association of Animal Science and Veterinary
Medicine中国农业大学动物科学技术学院
BioMed Central期刊资源使用
 BioMed Central期刊出版的所有文章均立即被PubMed收录
 PubMed或其他数据库搜索
链接至BioMed Central文章
全文查看和下载
BioMed Central期刊资源使用
 BioMed Central期刊网站:
http://www.biomedcentral.com/journals (所有期刊列表)
或 http://www.biomedcentral.com/journals/bysubject
(所有学科列表)
全文查看和下载
BioMed Central期刊资源使用-信息订阅
 Publish or Perish?
Publish!: BioMed Central中国投稿量快速增长
中国投稿量
中国占世界百分比(%)
4500
12
11.3
4000
10
3500
8.39
3000
2500
8
6.43
6
2000
4.54
1500
4
3.53
1000
500
2.27
2
1.54
0.9
0.83
0
0
2002
2003
2004
2005
2006
2007
2008
2009
2010
投稿指南 – 准备工作
•
•
•
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大量阅读
热门话题
实验设计
选择适当的期刊进行投稿
期刊选择:
期刊选择:它们的区别在哪?
Springer
12 issues per year.
All branches of research on
viruses and virus-like
agents.
Impact factor = 2.209
5.24
BioMed Central
Open Access.
An emphasis on basic retrovirus research
with the aim of communicating cutting
edge information to a large audience
quickly.
The open access journal Archivos de
Medicina offers authors whose papers
have been accepted for publication in
Retrovirology the option of publishing a
Spanish translation of their article.
期刊选择
•
•
•
•
•
•
期刊主题
出版周期
影响因子
期刊拒稿率
文章出版方式(Open Access模式还是订阅模式)
文章出版费用
充分了解,选择最契合自己论文的期刊
BioMed Central大致审稿流程
• 编委会初审,大致标准:
 是否符合期刊主题
 是否有吸引力
 独创性 (检验抄袭、重复投稿等)
 基本语言和表达 (主要看大纲、数据等)
• 选择和邀请审稿人员进行同行评审
• 审稿人员进行同行评审:2-4名评审人员
• 编委会综合考虑评审人员意见作出决定:
立即接受、修改、拒稿
BioMed Central审稿基本标准:Scientifically Sound
• 传递清楚的科学信息,论证有逻辑性
- 论文假设是什么?使用什么模型? 论文要阐述的问题是什么?
- 简洁很重要:冗长的讨论和描述往往分散读者对主要内容的注意力
• 清晰的实验设计
- 正确和必要的控制;最新技术 ;正确的方法;合适的样本量;充
分的数据分析
• 对数据的正确阐述
- 结论明确,数据客观支持结论,恰当阐述本研究的局限性
- 不要吹嘘论文的重要性和创新性
- 正确引用参考文献
BioMed Central期刊金字塔
High threshold
Low threshold
BioMed Central期刊金字塔
• High threshold期刊:
- 和现有研究相比有重大进展
- 研究和结论有广泛意义或对其他领域的研究也有参考意义 (例
如对所有生物学领域都有参考意义)
- 使用的资料和方法可被广泛应用
- 结论必须强有力
• Low threshold期刊:
- 不要求和现有研究相比有重大进展但必须有新的东西
- 研究和结论可以只对某领域有意义(例如仅在植物学领域)
- 不要求得出强有力的结论:例如允许该研究存在局限性、缺
少某些不重要的实验控制等。
BioMed Central审稿标准:拒稿原因
• 结果不正确或不够正确,例如:
- 需要进行进一步控制
- 需要更多的数据和实验支撑
- 需要对数据进行进一步分析
• 不正确的表述,例如:
- 忽略重要的参考文献和现有研究
- 论证或模型没有数据支撑
- 与已有研究结果相悖却缺乏有力的数据支撑
• 论文创新性不够
- 现有研究已得出相似结论
[如此项为拒稿唯一原因,那可能将此篇论文推荐至其他相关期刊]
BioMed Central审稿标准:拒稿原因
• 不够有吸引力
- 不够吸引人/与期刊水平不相称
[如此项为拒稿唯一原因,那可能将此篇论文推荐至其他相关期刊]
• 道德因素和其他,例如:
- 重复投稿/抄袭
- 损害他人名誉
- 对他人研究成果进行不当的批评
拒稿原因:语言
• 据不完全统计,BioMed Central中国的作者文章不被接收的重要
原因之一是其论文语言(英语)很难被审稿人读懂
• 另一个重要原因在于写作方式
提交论文前做好语言润色工作
投稿指南 - BioMed Central投稿页面
 Authors 项下: http://www.biomedcentral.com/authors/submit
Submit a journal
 期刊页面: http://www.biomedcentral.com/journals
Submit a new manuscript
 西南大学投稿和出版情况
西南大学与BioMed Central
• 从2008年1月到2011年8月共在BioMed Central期
刊上投稿52篇。涵盖生物学(包括:分子生物
学、植物生物学、基因组生物学等)、基因组
学、遗传学等多个领域。
西南大学投稿和出版情况
数据截止到2011年8月
20
18
16
14
12
10
8
6
4
2
0
19
18
13
投稿量
出版量
9
2
0
2008
1
2009
1
2010
2011
西南大学历年投稿Top 5期刊
•
•
•
•
•
BMC Genomics (10)
BMC Evolutionary Biology (8)
BMC Biology (7)
Genome Biology (4)
BMC Molecular Biology(3)
西南大学历年出版Top 5期刊
•
•
•
•
•
BMC Genomics(6)
BMC Molecular Biology(2)
Proteome Science (1)
BMC Evolutionary Biology(1)
Acta Veterinaria Scandinavica (1)
• BMC Genomics is an open access, peer-reviewed journal that
considers articles on all aspects of genome-scale analysis, functional
genomics, and proteomics.
• APC: £1035
• http://www.biomedcentral.com/bmcgenomics/
• 西南大学作者文章举例:
Jinjun, Wang “The complete mitochondrial genome of the citrus red
mite Panonychus citri (Acari: Tetranychidae): high genome
rearrangement and extremely truncated tRNAs”, 2010-06-20
• BMC Evolutionary Biology is an open access journal publishing original
peer-reviewed research articles in all aspects of molecular and nonmolecular evolution of all organisms, as well as phylogenetics and
palaeontology.
• APC: £1035
• http://www.biomedcentral.com/bmcevolbiol/
• 西南大学作者文章举例:
Ze, Zhang “The small heat shock protein (sHSP) genes in the silkworm,
Bombyx mori, and comparative analysis with other insect sHSP genes”,
2009-05-20
• BMC Molecular Biology is an open access journal publishing original
peer-reviewed research articles in all aspects of DNA and RNA in a
cellular context, encompassing investigations of chromatin, replication,
recombination, mutation, repair, transcription, translation and RNA
processing and function.
• APC: £1035
• http://www.biomedcentral.com/bmcmolbiol/
• 西南大学作者文章举例:
Deshou, Wang “Characterization, phylogeny, alternative splicing and
expression of Sox30 gene”, 2010-08-26
• Proteome Science is an open access, peer-reviewed, online journal
considering research in proteomics. The journal is specifically interested in
manuscripts that integrate functional or structural proteomic analysis with cell
or developmental biology.
• APC: £1035
•http://www.proteomesci.com/
•西南大学作者文章举例:
•Yong, Hou “Comparative analysis of proteome maps of silkworm
hemolymph during different developmental stages”, 2010-04-12
•Acta Veterinaria Scandinavica is an open access journal encompassing
all aspects of veterinary research and medicine of domestic and wild
animals.
• APC: £1275
•http://www.actavetscand.com/
•西南大学作者文章举例:
•Guozhong, Dong “Diet-induced bacterial immunogens in the
gastrointestinal tract of dairy cows: Impacts on immunity and
metabolism ”
2011-04-03
 BioMed Central生命科学、植物学相关期刊
举例
http://genomebiology.com
• Editor: Clare Garvey
• Genome Biology publishes articles from the full spectrum of biology.
Subjects covered include any aspect of
– Molecular biology, Cellular biology
– Organismal or population biology studied from a genomic
perspective,
– Genomics, proteomics, bioinformatics, genomic methods
– Computational biology, sequence analysis (including large-scale and
cross-genome analyses),
– Comparative biology and evolution
www.retrovirology.com
• Editor-in-Chief: Kuan-Teh Jeang (USA)
• Retrovirology is an open access, online journal that
publishes stringently peer-reviewed, high-impact articles
on basic retrovirus research
www.biomedcentral.com/bmcbiol
• BMC Biology - the flagship biology journal of the BMC
series - publishes research and methodology articles of
special importance and broad interest in any area of
biology and biomedical sciences
http://www.biomedcentral.com/bmcplantbiol/
• BMC Plant Biology is an open access journal publishing
original peer-reviewed research articles in all aspects of
plant biology, including molecular, cellular, tissue, organ
and whole organism research.
www.biology-direct.com
• Editors-in-Chief: Eugene V Koonin (USA), Laura F
Landweber (USA), David J Lipman (USA)
• Biology Direct will serve the life science research
community as an open access, peer-reviewed online
journal encompassing the full spectrum of
– Biological science
– Make all research articles available free of charge on
the website immediately on publication
http://www.plantmethods.com/
• Editors-in-Chief: Brian Forde, Lancaster University
• Plant Methods is an open access, peer-reviewed online
journal that encompasses all aspects of technological
innovation in the plant sciences.
www.biomedcentral.com/bmcmicrobiol
• BMC Microbiology is an open access, peer-reviewed journal
that considers articles on
– analytical and functional studies of prokaryotic and
eukaryotic microorganisms, viruses and small parasites
– host and therapeutic responses to them, and their interaction
with the environment
www.biomedcentral.com/bmcdevbiol
• BMC Developmental Biology considers articles on
– the development, growth, differentiation and
regeneration of multicellular organisms, including
molecular, cellular, tissue, organ and whole organism
research
www.virologyj.com
• Editor-in-Chief: Robert F. Garry (USA)
• Virology Journal is an open access, peer-reviewed, online
journal that presents high-quality original research
concerning viruses, and establishes a strategic alternative
to the traditional virology communication process
www.parasitesandvectors.com
• Editor-in-Chief: Chris Arme (UK)
• Parasites & Vectors is an open access, peer-reviewed
online journal dealing with
– the biology of s, parasitic diseases, intermediate hosts,
vectors and vector-borne pathogens.
10月24日—10月30日为开放获取周
欢迎大家踊跃投稿并
祝大家成功!!!
BioMed Central联系方式
王丹青
Tel: 010-82670211-856
Fax:
010-8267022
Email:
[email protected]
com
夏蕊
Tel: 010-82670211-858
Fax:
010-8267022
Email:
[email protected]
m
欢迎大家登录我们官方微博:
http://weibo.com/2216240737/profile/
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