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Informe Practica Profesional III

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Universidad de Chile
Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas
Departamento de Ingeniería Química, Biotecnología y Materiales
Informe de Práctica Profesional III
Desarrollo Tecnológico de Test de Cancer de Mamas
Realizada en GeneProDX (Diag. Paraguay 361), bajo alero del dpto. de
Investigación y Desarrollo
Integrantes:
Profesores:
Auxiliares:
Período de Práctica:
Código del Curso:
Fecha de entrega:
Alfonso Ugarte M.
alfonso.ugarte@ug.uchile.cl
Oriana Salazar A.
Andrea Rodríguez Silva
Paulina Neculpan
30 de enero 2023 - 28 de febrero 2023
BT-6901
17 de abril de 2023
i
Resumen
Esta práctica profesional se realizó en la empresa GeneProDX, empresa dedicada al rubro de la
biomedicina, implementando tests de diagnóstico de cancer. Esta práctica comprendió la planificación del desarrollo tecnológico de un nuevo test de cancer de mamas. La metodología consistió en
la construcción de diferentes documentos excel para la correcta planificación del proyecto. Estos documentos fueron la Carta Gantt, incluyendo tareas y subtareas al mayor nivel de detalle posible, el
resumen de evaluación de costos, el Statement of Work y el documento resumen para el cliente. Para
la construcción de la evaluación de costos se incorporó el uso de cada reactivo e insumo de laboratorio
planificado para cada tarea y subtarea, se incorporó el uso de agua, electricidad y costos de personal. Para el Statement of Work se evaluaron los objetivos y alcances del proyecto y se presentaron
las fechas. Como resultado se obtuvieron documentos realizados responsablemente y bajo constante
supervisión. La construcción de los documentos tuvo un gran impacto de trabajo en equipo, lo que
logró una correcta planificación y alcance de las tareas. Este trabajo tuvo una naturaleza administrativa, por lo que se aplicaron conocimientos de planificación de proyectos. Permitió poner en práctica
habilidades de organización de tareas relacionadas al laboratorio, requiriendo entender profundamente los ensayos PCR, LoD, LoQ, rango dinámico y amplificación y los conceptos relacionados. Tuvo
un gran factor de trabajo en equipo, teniendo en mente la importancia de una buena planificación,
siempre se vió desde un punto de vista de responsabilidad, por lo que se cumplieron los resultados
de aprendizaje. Como conclusión general, el trabajo descrito fue bien logrado, se cumplieron los objetivos impuestos de planificación de un proyecto de desarrollo y las herramientas generadas pueden
usarse para futuros proyectos, lo que generó un impacto positivo en la empresa.
Informe de Práctica Profesional III
BT6901 Practica Profesional III
Índice de Contenidos
ii
Índice de Contenidos
1. Intrducción, Antecedentes y Objetivos
1
2. Metodología Experimental
2.1. Estrategia General . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
2.2. Estrategia Específica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
2.2.1. Construcción de la Carta Gantt . . . . . . . . . . . . . .
2.2.2. Construcción de necesidades y gastos del proyecto . . . .
2.2.3. Construcción del documento SOW (Statement Of Work)
2.2.4. Construcción del documento al cliente . . . . . . . . . .
2.2.5. Materiales y herramientas utilizadas . . . . . . . . . . .
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3. Resultados
3.0.1.
3.0.2.
3.0.3.
3.0.4.
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8
y Discusiones
Exposición de los resultados y discusión . . . . .
Dimensionamiento del impacto e importancia . .
Discusión de las competencias del perfil de egreso
Discusión de la formación académica . . . . . . .
4. Conclusiones
Referencias
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Intrducción, Antecedentes y Objetivos
1.
1
Intrducción, Antecedentes y Objetivos
El cáncer es una enfermedad en la que algunas células del organismo crecen de forma descontrolada y se extienden a otras partes del cuerpo. Puede partir casi en cualquier parte del cuerpo humano
y sucede por variaciones o daños genéticos durante el crecimiento celular, causando que células anormales o dañadas crezcan y se multipliquen cuando no deberían. Estas células pueden formar tumores
cáncerosos (malignos) o no cáncerosos (benignos) [1].
Los tumores cáncerosos se extienden o invaden los tejidos cercanos y pueden desplazarse a lugares
distantes del cuerpo para formar nuevos tumores (metástasis). Los tumores benignos no se extienden
ni invaden los tejidos cercanos, y, a diferencia de los cancerosos, cuando se extirpan no suelen volver
a crecer. [1].
Existen diferencias sustanciales entre las células normales y las cancerosas, como el crecimiento
en ausencia de factores de crecimiento, paso por alto de señales apoptóticas o de muerte programada,
capacidad para esconderse del sistema inmune, entre otras [1].
Las fallas genéticas que pueden causar cáncer se clasifican en 3 tipos relacionados a la función que
realiza el gen que se ve afectado: protooncogenes, genes supresores de tumores y genes reparadores
del ADN. Una falla causante de cáncer en un protooncogen permite una mayor capacidad de supervivencia y crecimiento a la célula, en un gen supresor de tumores permite una mayor capacidad de
división celular, y en un gen reparador de ADN permite acumular mutaciones en otros genes [1].
No todos los tejidos anormales son cánceres, algunos son inofensivos pero se pueden volver cáncer.
Se pueden también clasificar en varias categorías acorde al nivel de probabilidad de convertirse en
cáncer y al nivel de mutación y velocidad de crecimiento que presentan. Tales clasificaciones son
hiperplasia, displasia y carcinoma, aumentando la gravedad y variando las metodologías de funcionamiento respectivamente [[1],[2],[3],[4]].
Los cánceres se pueden clasificar según el órgano donde aparecen. Así, el tipo de cáncer que interesa en este informe es el cáncer de mama. Estos pueden surgir en distintas partes de la mama,
donde cada una tiene principalmente glándulas, conductos y tejido adiposo [5]. También se pueden
subclasificar muchas veces, la más general viene dada por el tejido y lugar donde aparece [5]: cancer
lobular (aquel que aparece en los lobulillos), cancer ductal (aquel que aparece en los canales ductales
que salen de los lobulillos), cancer al pezón, tumos de filoides (aquel que se origina en el tejido conectivo - estroma - y grasa que rodea los conductos ductales y lobulillos), angiosarcoma (aquel que
aparece en el revestimiento de los vasos sanguineos y linfácticos encontrados en cada mama).
Otra subclasificación típica es por tipos de proteínas o genes producidos. Así, luego de una biopsia y posterior análisis de las células, se detecta la aparición de proteínas receptores de estrógeno,
proteínas receptores de progesterona, y el nivel de producción del gen o proteína HER2. Se evalúa
también el grado de avance y cantidad de las células tumorales, así, según el resultado de las proteínas encontradas y el grado, se puede aportar en la determinación del “grado patológico” (estado del
cáncer) y las opciones de tratamiento [5].
El grado patológico es una medida de lo avanzado que está el tumor de una paciente. La cla-
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Intrducción, Antecedentes y Objetivos
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sificación del cáncer de mama va del grado 0 (enfermedad preinvasiva) al grado IV (enfermedad
metastásica). Este tiene en cuenta las características del tumor (“T”) y la presencia de metástasis
en los ganglios linfáticos (“N”) o en órganos distantes (“M”). A estas características se les asignan
puntuaciones individuales denominadas grado patológico T (T0-4), grado N (N1-3) y grado M (M0-1)
que se combinan para formar un grado patológico global final (0-IV). El grado patológico se determina en función de los hallazgos en el momento de la cirugía y es diferente del “grado clínico”, que
es el estimado en función de los hallazgos en el examen clínico y radiológico [6].
La asociación que elabora y estandariza la determinación de los grados de cáncer es el “American
Joint Committee on Cancer” (AJCC). Esta asociación publicó un nuevo protocolo revisado para el
examen de especímenes de pacientes con cáncer de mama invasivo en 2018 en donde, exclusivamente
para el cáncer de mama, se creó una nueva categoría de clasificación denominada “AJCC Prognostic
Stage Group”, que incorpora biomarcadores (como grado nuclear del tumor, presencia de receptores
de estrógeno y progesterona, y estado de HER2) en la determinación del pronóstico para crear diferentes clasificaciones en tumores que poseen el mismo grado anatómico [[6],[7]].
Parte importante de la medición de estos biomarcadores son los paneles multigénicos. Son capaces
de medir el nivel de expresión de una gran cantidad de genes en el tejido con cáncer de mama. De
los varios paneles de testeo, destaca OncotypeDX por tener la mayor cantidad de evidencia. Por
consecuencia, este fue el incorporado en el protocolo 2018 AJCC [7].
Hay varios paneles de testeo multigénicos y sistemas de medición de perfil multigénico presentes
en Chile, como OncotypeDX, MammaPrint, Endopredict y Prosigna, pero los que principalemente
se usan son los dos primeros [[8],[9],[10]].
OncotypeDX: Se utiliza para tumores con receptores de hormonas positivos en etapas I, II o IIIa
que no se han propagado a más de tres ganglios linfáticos y que son HER2 negativos. La prueba
evalúa un conjunto de 21 genes en las células cancerosas que se obtuvieron de las muestras del
tumor al realizar la biopsia para asignar una “puntuación de recurrencia” que va desde 0 a 100.
La puntuación refleja el riesgo de que el cáncer de seno regrese (recurrencia) en los próximos 10
años y la probabilidad de que el usuario mejore al recibir quimioterapia tras la cirugía [8].
MammaPrint: Analiza la actividad de 70 genes en una muestra de tejido del tumor de mama
para evaluar el riesgo de recurrencia del cáncer de mama en pacientes con tumores de tamaño
pequeño y sin metástasis en los ganglios linfáticos [[9],[11]].
EndoPredict: Analiza la actividad de 12 genes en una muestra de tejido del tumor de mama
para evaluar el riesgo de recurrencia del cáncer de mama a largo plazo en pacientes con cáncer
de mama con receptores de estrógeno positivos y HER2 negativo [12].
Prosigna: Test genético basado en la firma genética PAM50, que evalúa la expresión o actividad de 50 genes clave en tejido tumoral; permitiendo estimar el riesgo de recurrencia de la
enfermedad, y el subtipo biológico intrínseco específicos a cada paciente [13].
Cabe notar que el desarrollo y producción de estos tests son de origen extranjero y ninguno se
produce en Chile. Esto ha motivado a la empresa GeneProDX a desarrollar un test modificado y optimizado para la obtención de un perfil multigenético basado en OncotypeDX por su basta literatura
y extenso testeo [10]. El proyecto en si mismo corresponde, entonces, al desarrollo de un test capaz
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Intrducción, Antecedentes y Objetivos
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de generar un perfil genético mediante qPCR usando 21 marcadores biologicos en formato multiplex,
con la finalidad de determinar el impacto potencial de la quimioterapia en el paciente estudiado. Mediante el desarrollo de este test en la empresa podrán taclear problemas como la falta de tests locales
que permitan una mayor velocidad de respuesta, la reducción de costos asociada con una producción
local, y la optimización poblacional que permite adaptar el test en un ambiente latinoamericano. El
resultado esperado tendría ventajas sobre los tests existentes ya que se optimizaría en eficiencia y
tiempo el test más validado actualmente [[9],[10]], manteniendo el formato de plataforma pequeña
de 21 genes en comparación con los 50+ genes que utiliza gran parte del resto de las plataformas
desarrolladas por las empresas competencia.
GeneProDX considera que la implementación de un proyecto como el descrito en el párrafo anterior
implica un gran impacto paciente, impacto médico y un impacto tecnológico que permite solucionar
el problema mencionado.El impacto paciente radica en la obtención de resultados fidedignos que permitan analizar y recomendar tratamientos quimioterapéuticos que efecivamente sirven al utilizarse y
evitar el caso contrario, lo que implica ahorro de costos, estres, daños físicos e inmunológicos y finalmente aportando a mantener o mejorar la calidad de vida del paciente. El aporte clínico radica en la
ayuda a entender los nodulos indeterminados y el aporte tecnológico en el desarrollo y optimización
de tecnologías.
Más aún, se consideran completamente capaces de lograrlo gracias a las competencias que han
adquirido como empresa. Anteriormente desarrollaron el test TyroidPrint y hoy en día lo están portando a un formato pequeño, capaz de comprimir todo el proceso de análisis a solo unas horas y
con una sola máquina. El proceso de desarrollo que implica, permite establecer una base conocida
para el desarrollo del proyecto de testeo para cancer de mamas. Junto con la experiencia, han desarrollado herramientas cuantitativas capaces de estandarizar las distintas etapas, como cartas Gantt,
documentos formales, etapas de validación y consultorías para corroborar los avances. Combinándose
con que recientemente el paper que describe el desarrollo de OncotypeDX se liberó a uso publico, se
llega a que la tecnología descrita es alcanzable.
En este contexto se inserta este trabajo de práctica profesional III, donde, en el departamento de
I+D de la empresa, se iniciará el desarrollo tecnológico del “Proyecto APO”, que consiste en un test
de diagnóstico molecular para cancer de mama.
El objetivo general de la práctica es apoyar la realización de una Declaración de Trabajo (Statement of Work) y gestion del Proyecto APO.
Durante la práctica se cumplieron las siguientes funciones:
1. Realizar una planificación general del proyecto que detalle su ejecución, gestión de recursos (incluyendo personal, instalaciones, equipos y procedimientos de control de calidad), presupuesto,
plazos, e identificación de riesgos.
2. Diseñar un cronograma (Carta Gantt) para establecer niveles de prioridad de las actividades ,
hitos, entregables y responsabilidades de cada integrante del equipo.
3. Apoyar la coordinación de reuniones de planificación, la gestión de recursos, las solicitudes de
cotizaciones y la realización de compras.
4. Utilización y manejo de diferentes herramientas que apoyen la gestión de proyectos.
Informe de Práctica Profesional III
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Metodología Experimental
2.
2.1.
4
Metodología Experimental
Estrategia General
La estrategia general consistió en tres etapas para el proyecto: construcción de la Carta Gantt,
construcción de necesidades y gastos del proyecto, y construcción del documento SOW (Statement
Of Work). Para la construcción de la carta Gantt, se editó una planilla preconstruida liberada de
Microsoft Excel, y se adaptó siguiendo el protocolo interno de la empresa, usando Cartas Gantts de
proyectos pasados. En la etapa de construcción de necesidades y gastos del proyecto, se desarrolló
una planilla de registro de gastos en Excel y se calculó al detalle los gastos por reactivos, por insumos
de laboratorio, por gastos de instalación, electricidad, agua y gastos de RRHH. Para la construcción
del documento SOW, se formuló un template acorde a los SOW entregados en proyectos anteriores
en la empresa, incluyendo las secciones "detalles de la empresa", "descripción del proyecto", .objetivos
del proyecto", y otras secciones relevantes a explicarse a continuación.
2.2.
2.2.1.
Estrategia Específica
Construcción de la Carta Gantt
Se obtuvo una planilla preconstruida desde las planillas liberadas de microsoft excel, posteriormente se editó para automatizar la introducción de bloques, horarios y tareas.
Para la definición de tareas, se siguió un protocolo interno que describía los pasos a seguir para la
construcción de un sistema de testeo similar al objetivo, y se adaptó siguiendo las cartas gantts de los
proyectos pasados de la empresa. Como sistema general, se divide en fases o etapas de complejidad
para el correcto avance del proyecto. Estas etapas fueron conversadas y revisadas por la Lab Manager
y la Scientific Director. Las fechas asignadas del plan se analizaron personalmente con las mismas
encargadas de la revisión.
2.2.2.
Construcción de necesidades y gastos del proyecto
Se construyó una planilla de registro de gastos en excel con las necesidades exactas de cada etapa,
incluyendo las variables importantes de registro y de observación para cotizaciones. Las categorías
incluídas se determinaron con la Lab Manager intentando considerar todos los gastos y así obtener
una estimación representativa. Debido a que se trata de un laboratorio, se determinaron cantidades de insumos y reactivos al mayor nivel de detalle posible. Posteriormente se juntaron todos los
datos para establecer el consumo por tarea y subtarea y calcular el gasto provisto en electricidad
según la última tarifa de gasto eléctrico indicada en la factura de pagos de electricidad de la empresa.
Las planillas detalle de los gastos se integraron en una planilla resumen similar a un análisis
OPEX (de gastos operacionales).
Para determinar los gastos de reactivos, ya con la planilla de los tipos y cantidades totales de
reactivos necesarios, se procedió a realizar una cotización en 3 lugares por reactivo, se corrigió con la
Lab Manager y la Lab Tecnician y posteriormente se procedió a cotizar tomando en cuenta el precio,
Informe de Práctica Profesional III
BT6901 Practica Profesional III
Metodología Experimental
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cantidad de reactivo y prestigio de la empresa. Finalmente se calcularon los precios por cantidad a
usar dividiendo el gasto total del producto comprado en la cantidad de unidades de reactivo utilizado.
Además, la planilla OPEX incorporó un gasto de mantención equivalente al 20 % de los gastos totales
incurridos en otras secciones. Se incorporaron los gastos de insumos de la misma manera, logrando
un análisis económico breve y preliminar pero completo.
2.2.3.
Construcción del documento SOW (Statement Of Work)
La construcción del documento inicia con la formulación de un template acorde a los SOW entregados en proyectos anteriores en a empresa. Las secciones llenadas del template fueron .Engagement
Details": corresponde a los detalles iniciales del proyecto (nombre del proyecto, fecha de entrega
del SOW, fecha de inicio y termino del proyecto, Bussiness manageer y GPDX project manager).
"Description - Objective": para desarrollar esta sección se tomó de guía el paper de literatura [14]. Se
desarrolló una introducción, una breve explicación de las partes del proyecto y se fijaron los objetivos,
tanto el general con la Scientific Director, como los específicos con ayuda de la Carta Gantt diseñada.
"Scope of Services": corresponde a alcances y exclusiones, "Timeline": se incorporó la totalidad de
meses requeridos para completar el proyecto y la cantidad de meses que requería cada actividad
descrita en los alcances, "Milestones": se definió que contenidos iba a tener cada entregable y en
que fechas se iban a entregar. El resto de los puntos que cubrió el template los vió internamente la
empresa ya que requieren información demasiado sensible y que solo se maneja por la administración.
2.2.4.
Construcción del documento al cliente
Con la data generada se procedió a filtrar información sensible y dejar el documento a un nivel presentable, es decir, simple pero que contuviese la suficiente información. Se determinaron las
categorías resumen a presentar con la Lab Manager y Scientific Director.
2.2.5.
Materiales y herramientas utilizadas
Debido a la fecha en la que se realizó la práctica, el estado de la empresa consistía en un entre
proyecto, es decir, terminando uno y comenzando el siguiente (descrito en este documento), por lo
que el laboratorio no se utilizó. Así, durante el curso de esta práctica, solo se hicieron las tareas
descritas anteriormente, requiriendo equipos de computador y programas como Excel, y Microsoft
Teams.
Informe de Práctica Profesional III
BT6901 Practica Profesional III
Resultados y Discusiones
3.
3.0.1.
6
Resultados y Discusiones
Exposición de los resultados y discusión
Debido a la naturaleza administrativa del trabajo realizado, los resultados obtenidos consisten en
las planillas construidas y datos recolectados (sección que no es desclasificable acorde a la empresa).
La parte más importante que se desarrolló fueron las tareas y subtareas. Estas se dividieron en 7
fases, donde la primera consiste en la creación de los documentos pertinentes al inicio del proyecto
y los procesos de recolección de muestras y extracción de RNA de las mismas. La segunda consiste
en la revisión in silico de la información de la sonda y primers requeridos para el qPCR acorde
a la literatura [14]. La tercera trata del diseño de los oligos requeridos para los genes descritos en
la literatura, conteniendo etapas como la revisión de la información existente, revisión de diseños,
ordenar los diseños a los fabricantes y realizar un reporte de las fases anteriores. La cuarta y quinta
consisten en los sitemas de testeo de los oligos diseñados; inicialmente como oligos individuales con
ensayos noRT, NTC y gDNA, y posteriormente en multiplex con matrices de corrección de overlapping, añadiendo un entregable de los análisis. La sexta y septima son caracterizaciones analíticas de
las combinaciones obtenidas. Primero se analiza cada reacción multiplex con ensayos LoB, LoQ, LoD
y Rango Dinámico, y luego se repite como Composite Score; añadiendo un entregable de los resultados.
Teniendo la Carta Gantt y las tareas y subtareas asignadas, se desarrolló un worklog que contuvo la fase, la tarea y subtarea, cantidad de trabajadores asignados, horas hombre y horas máquina
requeidas, cargo del supervisor a cargo de la tarea, cargos asignados al desarrollo de la tarea y una
sección para la firma en caso de completitud de la tarea.
La planilla de gastos incluyó un desgloce exhaustivo de los mismos. Se calculó en base a las necesidades de la empresa para el desarrollo del proyecto. Estas necesidades se calcularon al detalle de la
cantidad de pocillos por placa de pcr que se iban a realizar (para los 21 genes), incluyendo categorías
como consumo por experimento, cantidad de experimentos totales esperados, valor por experimento
y costo total. Luego de tener lista la planilla de insumos se procedió a desarrollar la planilla de gastos
de energía y agua. Para el gasto de agua se determinó si las tareas y subtareas necesitaban agua o nó,
resultando que no se necesitaba agua externa por lo que ese gasto se fue a cero. Para la planilla de
gasto energético se determinaron los equipos necesarios para cada tipo de experimento descrito en las
tareas, los tiempos que se utilizarían y las potencias que utilizaban. Posteriormente se juntaron todos
los datos para establecer el consumo por tarea y subtarea y calcular el gasto provisto en electricidad
según la última tarifa de gasto eléctrico indicada en la factura de pagos de electricidad de la empresa.
La planilla resumen de gastos incluyó los totales de cada desgloce mencionado, resultando en las
siguientes categorías: costos fijos generales (RRHH), costos variables (reactivos e insumos de laboratorio) y costos de emergencia considerados como el 20 % del total de los costos anteriores.
Para el documento Statement of Work se incluyeron todas las categorías mencionadas en la metodología. En general, los alcances incluyeron los tests que se planificaron realizar, el manejo de los
reactivos, actividades de la carta gantt y procesos relacionados al trato con clientes. Las exclusiones
abarcan transporte de muestras y reactivos desde proveedores a la empresa, fabricación y desecho de
reactivos y mantenimiento de equipos y maquinarias.
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Resultados y Discusiones
7
El último documento que se desarrolló, el documento al cliente, resumió los costos bajo categrías
totales: Gastos fijos (RRHH), Gastos Variables (reactivos, insumos de laboratorio y de instalación)
y gastos de mantención (equivalente al 20 % del costo total de los otros gastos). Además la hoja
contenía un planificador con el resumen de actividades planificadas en la Carta Gantt, indicando la
semana de inicio, las semanas requeridas, fecha de inicio y término planificadas, cargo de supervisión
de la tarea y cargos asociados al desarrollo de la tarea; incluyendo la carta gantt asociada. La idea
de este archivo fue presentar la información requerida para que el cliente se interesara en el proyecto
sin exponer información confidencial acerca del desarrollo del mismo.
Los documentos resultantes fueron prometedores. La metodología expuesta se construyó para obtener el análisis más detallado posible considerando el tiempo y la capacidad de la empresa. Todos los
alcances, exclusiones, tareas, reactivos e insumos utilizados, y tiempos fueron ampliamente discutidos
con el equipo y ninguna decisión se tomó sin supervisión, por lo que se puede afirmar la utilidad
del plan desarrollado. Más aún, las fechas no son fijas ya que se construyó de manera dinámica,
permitiendo modificar la fecha inicial para aplazar o mover todas las fechas posteriores, incluyendo
también un sistema de indicador de atrasos donde se modifican las fechas y la carta Gantt acorde al
tiempo de atraso de las tareas.
3.0.2.
Dimensionamiento del impacto e importancia
Este trabajo tuvo una naturaleza administrativa, por lo que se aplicaron conocimientos de planificación de proyectos. Permitió poner en práctica habilidades de organización de tareas relacionadas
al laboratorio, requiriendo entender profundamente los ensayos PCR, LoD, LoQ, rango dinámico y
amplificación y los conceptos relacionados. En base a esto se puede asegurar que se cumple el primer
resultado de aprendizaje: realizar un trabajo a nivel de ingeniero recién egresado donde se pongan
en práctica las competencias del perfil de egreso.
Respecto al segundo punto de los aprendizajes esperados, esta práctica profesional tuvo un gran
factor de trabajo en equipo, ya que no hubiese podido lograrse sin la expertiz del resto. Hubo un
gran componente de cooperación, estuvieron abiertos a las entrevistas y, teniendo en mente la importancia de una buena planificación, siempre se vió desde un punto de vista de responsabilidad. Esta
última afirmación se respalda en todas las revisiones que se hicieron del trabajo a medida que se iba
desarrollando.
La importancia del buen desarrollo del trabajo realizado en esta práctica, para la empresa, radica en el aporte a la expansión de la cartera de proyectos prototipados y basados en un enfoque de
biología molecular. En este caso permitió dar el pie inicial para partir un proyecto de cancer de mama.
Desde un punto de vista técnico, el impacto del trabajo realizado corresponde a la incorporación
de nuevas tecnologías y documentos al laboratorio para una mejora posterior. Desde un punto de
vista económico es el .análisis de impacto económico"descrito en los documentos descritos y aporte
en mano de obra que siempre tiene un impacto económico positivo. La buena planificación de un
proyecto tiene también un impacto ambiental indirecto muy importante, ya que no se sobre-encargan
reactivos e insumos de laboratorio, que posteriormente se vencen, sino que solo se compra lo necesario. Por lo anterior, éticamente hablando, es mucho mejor contar con una buena planificación si
se desarrollará un nuevo proyecto, por eso fue importante realizar este trabajo con un alto grado de
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Resultados y Discusiones
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responsabilidad.
3.0.3.
Discusión de las competencias del perfil de egreso
Las competencias del perfil que se cumplieron fueron concebir, diseñar, evaluar y optimizar proyectos (debido al desarrollo de las herramientas de excel para poder planificar un proyecto relacionado
a un nuevo sistema de testeo de cancer de mama), a fin de generar soluciones científico-tecnológicas
a problemas relacionados con la biotecnología, en este caso biomedicina, en un contexto público y/o
privado. Donde se fue capaz de generar nuevas herramientas dando mayor valor agregado y optimizando el proceso de desarrollo.
En general, se pudo construir desde cero un sistema de planificación utilizable para futuros proyectos, donde se evaluó e incorporó la información existente de proyectos anteriores y se adaptó para
el desarrollo de nuevas herramientas biomédicas.
3.0.4.
Discusión de la formación académica
La formación recibida durante la carrera es amplia y bien justificada. Es aplicable a una inmensa
cantidad de contextos y permite desenvolverse y entenderse con situaciones difíciles de resolver. Los
cursos recibidos me permitieron pensar ordenadamente e implementar a futuro un plan, incorporando
lo necesario en experimentos que, de haber tenido otra formación y otros cursos, hubiese sido imposible de entender. Me permitieron visualizar problemas que otros integrantes del equipo no habían
visto y me permitió generar soluciones implementables a los mismos.
Aún así, creo que la malla es demasiado larga y comprende conocimientos que no necesariamente son requeridos si el alumno sabe a donde quiere aplicar sus conocimientos. Como propuesta de
mejora podría aumentar el foco a los electivos y eliminar la obligatoriedad a cursos que no sean
fundamentales en la carrera, como Dinámica y Control de Procesos o los electivos de historia. Se
podría fomentar mucho más el foco empresarial de la carrera, acortar o resumir los ramos iniciales
cosa de presentarle a los nuevos alumnos todos los campos aplicables de la carrera, y que eso les
permita guiar los electivos hacia alguno.
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BT6901 Practica Profesional III
Conclusiones
4.
9
Conclusiones
En conclusión, el trabajo realizado consistió en la creación de documentos y la recolección de datos, con un enfoque administrativo. La metodología desarrollada incluyó siete fases, que se centraron
en la revisión de información, el diseño de oligos, sistemas de testeo y caracterizaciones analíticas. Se
creó un worklog y una planilla de gastos detallada, que incluyó un desglose exhaustivo de los costos
fijos y variables y los costos de emergencia. Se elaboraron dos documentos finales, el Statement of
Work y el documento al cliente, que incluyeron un resumen de actividades planificadas y un planificador, pero sin exponer información confidencial. En resumen, los documentos fueron prometedores
y la metodología se construyó para obtener resultados precisos y eficientes.
Por lo descrito, se afirma que se cumplieron los objetivos tanto general como específicos. Se logró
realizar una planificación general del proyecto, detallando su ejecución, gestión de recursos, presupuestos y plazos. Se logró diseñar el cronograma, estableciedo niveles de prioridad a las actividades,
hitos, entregables y responsabilidades específicas por tarea. Se aportó en la planificación y gestión de
recursos, realizando cotizaciones y apoyando la realización de compras mediante archivos de registro;
y para lograr todo se utilizaron herramientas de gestión.
El trabajo realizado permitió la aplicación de conocimientos de planificación de proyectos y la
práctica de habilidades de organización de tareas relacionadas con los ensayos PCR, LoD, LoQ, rango dinámico y amplificación. Como resultado, se cumple el objetivo de aprendizaje de la práctica de
realizar un trabajo a nivel de ingeniero recién egresado donde se apliquen las competencias del perfil
de egreso. Además, la práctica profesional destacó por la importancia del trabajo en equipo, donde
se fomentó la cooperación, la responsabilidad y la buena planificación. Todo ello respaldado por las
revisiones realizadas a lo largo del desarrollo del trabajo.
Desde un punto de vista técnico, el trabajo realizado permitió la incorporación de nuevas tecnologías y documentos al laboratorio, y desde un punto de vista económico, tuvo un impacto positivo
en términos de análisis de impacto económico y mano de obra. Además, la buena planificación de
un proyecto tiene un impacto ambiental indirecto importante al evitar la sobrecompra de reactivos e
insumos de laboratorio que se vencen posteriormente. Finalmente, el trabajo realizado en la práctica
tuvo un impacto significativo en la empresa al aportar a la expansión de la cartera de proyectos
basados en biología molecular y permitir el inicio de un nuevo proyecto de cáncer de mama. Por lo
tanto, éticamente hablando, contar con una buena planificación en un proyecto es fundamental, y se
ha demostrado en esta práctica profesional que su realización con un alto grado de responsabilidad
puede tener un gran impacto positivo en diferentes aspectos.
Se lograron cumplir las siguientes competencias del perfil de egreso: concebir, diseñar, evaluar y
optimizar proyectos en el campo de la biotecnología, específicamente en la biomedicina, con el desarrollo de nuevas herramientas para el sistema de testeo de cáncer de mama. La formación académica
recibida fue fundamental para poder llevar a cabo el proyecto, permitiendo pensar de manera ordenada y generar soluciones implementables. Se sugiere que como propuesta de mejora, se aumente el
enfoque empresarial de la carrera y se permita a los alumnos enfocarse en los cursos y electivos más
relevantes para su futuro laboral, lo que podría ser logrado a través de la eliminación de cursos que
no son fundamentales y un aumento en los electivos.
Informe de Práctica Profesional III
BT6901 Practica Profesional III
Referencias
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Referencias
[1] National Cancer Institute. (2023). What Is Cancer? Retrieved April 16, 2023, from https://www.
cancer.gov/about-cancer/understanding/what-is-cancer
[2] National Cancer Institute. (s. f.). Hiperplasia. En Diccionario de cáncer. Recuperado el 16 de
abril de 2023, de https://www.cancer.gov/espanol/publicaciones/diccionarios/diccionario-cancer/
def/hiperplasia
[3] National Cancer Institute. (s.f.). Displasia. Diccionario del cáncer. Recuperado el 16 de abril
de 2023, de https://www.cancer.gov/espanol/publicaciones/diccionarios/diccionario-cancer/def/
displasia
[4] National Cancer Institute. (s.f.). Displasia. Diccionario del cáncer. Recuperado el 16 de abril
de 2023, de https://www.cancer.gov/espanol/publicaciones/diccionarios/diccionario-cancer/def/
displasia
[5] American Cancer Society. (2022). What is Breast Cancer? Retrieved
https://www.cancer.org/cancer/breast-cancer/about/what-is-breast-cancer.html
from
[6] Johns Hopkins Medicine. (n.d.). Staging & Grading. Johns Hopkins Breast Center.
https://pathology.jhu.edu/breast/staging-grade/
[7] Karim, R., Somervaille, T. C. P.,
futuristic approach in the field of
https://doi.org/10.3390/cancers11121811
Lim, S. (2019). Patient-derived xenografts, a
personalized medicine. Cancers, 11(12), 1811.
[8] American Cancer Society. (2021). Pruebas para la expresión génica del cáncer de seno. Recuperado
el 16 de abril de 2023, de https://www.cancer.org/es/cancer/cancer-de-seno/comprension-de-undiagnostico-de-cancer-de-seno/pruebas-para-la-expresion-genetica-del-cancer-de-seno.html
[9] Benavides-Serralde, J. A., Pérez-Castro, E. (2011). Cáncer de mama en Venezuela: magnitud del
problema y características clínico-patológicas. Revista de la Facultad de Medicina, 34(4), 31-44. Recuperado de https://ve.scielo.org/scielo.php?script=scia rttextpid = S0798 − 05822011000400005
[10] Maldonado, C., Espinoza, M., Aravena, M. (2015). Prevalencia de cáncer de mama en
mujeres jóvenes de la región de Valparaíso, Chile. Revista médica de Chile, 143(6), 725-730.
https://dx.doi.org/10.4067/S0034-98872015000600005
[11] National Cancer Institute. (s.f.). Mammaprint. Diccionario del cáncer. Recuperado el
16 de abril de 2023, de https://www.cancer.gov/espanol/publicaciones/diccionarios/diccionariocancer/def/mammaprint
[12] Breastcancer.org. (s.f.). Prueba EndoPredict. Breastcancer.org. Recuperado el 16 de abril de 2023,
de https://www.breastcancer.org/es/pruebas-deteccion/prueba-endopredict
[13] NanoString Technologies. (n.d.). Prosigna® Breast Cancer Prognostic Gene Signature Assay. Oncogenomics. Retrieved from https://www.oncogenomics.es/productos/prosigna/
[14] Cronin M, Sangli C, Liu ML, Pho M, Dutta D, Nguyen A, Jeong J, Wu J, Langone KC, Watson D.
Analytical validation of the Oncotype DX genomic diagnostic test for recurrence prognosis and therapeutic response prediction in node-negative, estrogen receptor-positive breast cancer. Clin Chem.
2007 Jun;53(6):1084-91. doi: 10.1373/clinchem.2006.076497.
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