Alpha Actinin- Definition, Struktur, Forskrifter, Funktioner 19. maj 2022 af Khushi Jain Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Cytoskelettet indeholder det filamentøse system, som omfatter polymerer af actin, intermediært filamentprotein og tubulin. Det organisatoriske princip for disse proteiner er, at store komplekse strukturer er opbygget af små, enklere komponenter. Disse filamentøse netværksstrukturer er meget dynamiske og stabile. Disse højt organiserede strukturer er involveret i forskellige funktioner såsom vedligeholdelse af cellens strukturelle stillads, tilvejebringelse af mekanisk stabilitet, bevægelse, intracellulær transport osv. Aktinfilamenternes dynamiske natur, deres samling og adskillelse er ansvarlige for cellebevægelse eller migration. Aktinfilamenter er samlet i to strukturelle former: bundter og netværk. Mange actin-bindende proteiner spiller store roller i organiseringen, dannelsen og funktionen af actincytoskelettet. Figur: Alpha Actinin. Til venstre: Ca2+-uafhængig binding af et EFhånddomæne til et nyt motiv i alfa-aktinin-titin-komplekset. Til højre: Krystalstrukturen af det actinbindende domæne fra alfa-actinin i dets lukkede konformation: strukturel indsigt i fosfolipidregulering af alfaactinin. Oprettet med biorender.com. Indholdsfortegnelse Alpha Actinin definition Alpha Actinin struktur o o o ROD domæne Actin bindende domæne CaM-lignende domæne Alpha Actinin regulativer Alfa Actinin funktioner o Rolle i menneskers nyresygdom Referencer Alpha Actinin definition Alpha actinin er et konserveret protein, der tværbinder actin filamentet. Det tilhører en konserveret familie af det actinbindende protein, som er spektrin-superfamilien, som også omfatter dystrofin og spektrin. Alfa actinin er til stede i deres isoformer. I pattedyrsceller producerer 4 alfaactinin-kodende gener seks forskellige proteinprodukter, som findes i forskellige væv med forskellige udtryk. Alfa actinin kan grupperes i to forskellige klasser på basis af udtryk, funktion og biokemiske egenskaber: 1. Muskler (som er calcium-ufølsomme) 2. Ikke-muskel cytoskelet (som er muskelfølsomme) isoformer. De ikke-muskel isoformer er forbundet med de fokale kontakt- og stressfibre, men deres fordeling er anderledes i meget bevægelige celler Alpha Actinin struktur Den består af et stav-domæne og et actin-bindende domæne. 100 kD stavformede proteiner, der danner hoved til hale homodimerer. Alfa-actininmonomer består af tre distinkte domæner: N-terminalt actin-bindende domæne [ABD], fire spektrinlignende gentagelser og C-terminale EF-hænder. ROD domæne den centrale stavregion er sammensat af spektringentagelsen, og det er den mindst konserverede region af alfa-actinin. danner en anti-parallel homodimer, som har en samlet længde på 240 ångstrøm og bredde på 40 – 50 ångstrøm. De gentagne enheder er forbundet med en stiv og kort linker, som giver strukturel stivhed. rolle i bundtningen af aktinfilamenterne. 90 grader snoet langs dimerens akse. Det elektrostatiske potentiale på overfladen er surt og fungerer som en dockingplatform. I skelet- og hjertemuskulatur: tværbinder antiparallelle actinfilamenter fra tilstødende sarkomerer I ikke-muskel og glat muskulatur: vis den forskelligartede orientering. Actin bindende domæne meget bevaret domæne indeholder et par af type 1 og type 2, CH-domæne, og findes også i andre typer af virkende bindende proteiner. På grund af interdomæneinteraktionen på 700-900 ångstrøm danner den en lukket struktur. Domænets kerne er dannet ved sammenføjning af fire principspiraler (A, C, E, G), der danner et enkelt CH-domæne. Naturen af CH1-CH2 domænet er semipolært, hvor nogle dele viser hydrofobicitet, og resten viser polære interaktioner. De to domæner er ikke funktionelt ækvivalente, men viser tilsammen en høj affinitet for binding med actinfilamenter. Elektrontætheden i dette domæne er klokkeformet med en base på 38 ångstrøm og en højde på 42 ångstrøm. Den består af to calpain-homologidomæner, også betegnet som CHdomæne, en halsregion, fire spektrin-gentagelser [SR] og to calmodulin-lignende domæner. CaM-lignende domæne Bindingen af calcium inducerer en konformationsændring af et globulært domæne fra lukket til åbent, hvilket forårsager alfa-helixomlejring og hydrofob resteksponering på overfladen for at gøre det tilgængeligt for at interagere med dets mål. C-terminalen af det CaM-lignende domæne er dannet af 4 EFhåndmotiver. I ikke-muskel isoformer: EF binder til calcium og regulerer aktiviteten af ABD-domænet og reducerer derved den actin-bindende egenskab ved en vis koncentration af calcium. Muskelisoformer: binder ikke med calcium. Alpha Actinin regulativer Den første bindingspartner af alfa-actinin: Cytoplasmatiske haler af beta-underenheden af integrin og det intracellulære adhæsionsmolekyle-1 (ICAM-1) Interaktionen er mellem det negativt ladede stavdomæne og positive cytoplasmatiske peptider. Alfa-actinin er en komponent i tætte områder, det vil sige 'periodiske strukturer, der findes i stressfibre, der anses for at være strukturelle og funktionelle analoger af sarcomeren Z-disk'. Det binder til zyxin og CRP og fungerer således som et stillads for interaktioner og subcellulær fordeling af proteiner. Binder til enigma/cipher familie af proteiner og besidder N-terminalt PDZ domæne. I muskelisoformer: interagerer med TM-receptorer, kontraktile maskineri, adaptere forbundet med det, mange signalproteiner osv. For eksempel virker et vigtigt signalmolekyle kendt som calcineurin i skeletmuskulaturen i bestemmelsen af typen af muskelfibre og hypertrofi. Alfa-actinin fra sacroyces interagerer med enzymer involveret i metabolisering, såsom phosphorylase i glycogenolyse og fructose1-6-bisphosphat en aldose. DNA-Helikaser - Definition, Struktur, Typer, Funktioner, Eksempler 17. maj 2022 af Babita Sharma Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner DNA-helikaser er allestedsnærværende enzymer, der findes i alle livets domæner og er forbundet med nukleinsyremetabolisme såsom DNAreplikation, transkription, translation, DNA-reparation, rekombination, ribosombiogenese og henfald. DNA-helikase blev først opdaget i E. coli i 1976. De er ATP (adenosintriphosphat) afhængige adskillelsesenzymer, der fremmer adskillelse af de to forældrestrenge og afvikler DNA i en position, der kaldes replikationsstartstedet, hvorfra replikationen starter. Det dannede en replikationsgaffel, der gradvist vil bevæge sig væk fra sin oprindelse på grund af den fortsatte afvikling af DNA. Afvikling af skabelon-DNA-helixen ved en replikationsgaffel, hovedsageligt katalyseret af to DNA-helikaser, der virker i forening, hvor den ene løber langs den forreste streng og den anden den efterslæbende streng. DNA-helicase. Helicaser bruger ATP som en energikilde til at bryde hydrogenbindingen mellem de nitrogenholdige basepar af dobbeltstandard DNA. Derudover afvikler nogle DNA-helikaser også DNA-triplekser eller Gquadruplexer og fortrænger protein bundet til enkelt- eller dobbeltstandard-DNA. Alle helikaser deler mindst tre fælles biokemiske egenskaber: 1) nukleinsyrebinding 2) NTP/dNTP-binding og hydrolyse 3) NTP/dNTP hydrolyseafhængig afvikling af dupleksnukleinsyrer i 3' til 5' eller 5' til 3' retningen. Indholdsfortegnelse Struktur af DNA-helikaser Typer af DNA-helikaser o o o o o o Superfamilie SF1: Superfamilie SF2: Superfamilie SF3: Superfamilie SF4: Superfamilie SF5: Superfamilie SF6: Mekanisme af DNA-helikaser Funktioner af DNA-helikaser Eksempler på DNA-helikaser Referencer Struktur af DNA-helikaser Der findes to forskellige typer helicasestrukturer, de ringe, der danner hexamere strukturer, og dem, der ikke gør. En ringstruktur har en central kanal, der omkranser nukleinsyren. Stabiliteten og processiviteten af enzymet øges med stigende topologiske forbindelser mellem proteinet og nukleinsyren. Alle hexamere helicaser er homohexamerer undtagen de eukaryote minichrosomale vedligeholdelseshelikaser. Helicasemotiver betyder ni korte, konserverede aminosyresekvensfingeraftryk (benævnt Q, I, la, lb, II, III, IV, V og VI) indeholdt i de fleste af helicaserne fra forskellige organismer. Disse motiver er generelt grupperet i den centrale region, dvs. region med 200 til 700 aminosyrer. Typer af DNA-helikaser Flere DNA-helikaser er blevet isoleret fra enkeltcelle på grund af de forskellige strukturelle krav til substratet på forskellige stadier i DNA-transaktionen. For eksempel blev et minimum af 14 DNAhelicaser isoleret fra E. coli, 12 fra vira, 6 fra bakteriofager, 8 fra planter, 15 fra gær, 11 fra thymus fra kalven og ca. 24 fra en human celle. Helicaser kan opdeles i 6 superfamilier (SF1 TIL SF6) baseret på identificerede sekvenser blandt konserverede helicasemotiver. Det ringformede enzym, ringdannende, en hexamerisk struktur består af SF3 til SF6 og de ringdannende består af SF1 og SF2. Disse ringlignende strukturer tillader omkransning af DNA'et og translokerer på en processiv måde. Superfamilie SF1: De adskillige strukturer af SF1-helicaser har en fælles kerne med to αβ RecA-lignende domæner. De er monomert involveret i rekombination, transkription, reparation og andre processer. Den strukturelle homologi med RecA-rekombinationsprotein omslutter tandem-alfa-helixerne og de fem sammenhængende parallelle beta-strenge. ATP binder til det aminoproksimale α-β-domæne, der indeholder motiv I (walker A) og motiv II (walker B). Motiv III (SAT) er også til stede i det N-terminale domæne, som vil hjælpe til den etablerede forbindelse mellem aktiviteterne af ATPase og helikaser. Det carboxyterminale α-β-domæne ligner strukturelt det proksimale domæne, selvom det mangler et ATP-bindingssted, som kan stamme fra genduplikation. Superfamilie SF1 er yderligere opdelt i tre underfamilier (PiF1/RecD, Rep/UrvD og UpF1 lignende) og to grupper 3' til 5' for SF1A og 5' til 3' for SF1B på basis af translokationsretning på SSDNA. Figur: Krystalstrukturer af SF1A (PcrA, UvrD) og SF1B (RecD2, Dda) helicaser. Billedkilde: Kevin D. Raney et al. 2013 . Superfamilie SF2: De spiller en vigtig rolle i RNA-metabolisme og forskellige trin i DNAmetabolisme. Inden for superfamilie 2 er der fundet 10 separate familier af helikaser. Hver spiller en specifik rolle i nukleinsyremetabolismen. Superfamilie SF3: Helicaser, der overvejende kodes af små DNA- og RNA-vira og store nukleocytoplasmatiske DNA-vira, falder ind under denne kategori. I SF3-helikaser adskiller spaceren walker A-motiver og Walker Bmotiver. Tredje motiv C ligger mellem B-motivet og C-terminalen af den konserverede region. Superfamilie SF4: Det er en hexamerisk helicase, der hovedsageligt fungerer i bakteriel (relateret til bakteriel dnaB-protein) eller bakteriofagreplikation. Den centrale kerne ligner det α-β RecA-lignende domæne. Superfamilie SF5: E. coli Rho - faktoren er en SF5-hexamer, der terminerer bestemte RNA-transkripter, translokerer kun på RNA og kaster rigeligt lys over replikative helikasers funktion. Superfamilie SF6: De inkluderer AAA+ kernen, som ikke er til stede i SF3. Nogle proteiner i denne gruppe er minkromosomvedligeholdelse (MCM) som RuvA, RuvB og RuvC. Mekanisme af DNA-helikaser Figur: Foreslået Brownsk skraldemekanisme og højst sandsynligt kinetisk skema. Billedkilde: Daniel R. Burnham et al. 2019 . DNA-helikaser er essentielle motorproteiner, der fungerer til at afvikle dupleks-DNA for at give de forbigående enkeltstrengede DNAmellemprodukter, der kræves til replikation, rekombination og reparation. Selvom helicase beskriver en lignende tredimensionel fold, er forskellige oligomere tilstande samlet for at vise fuld aktivitet. hexamerisk samling er den mest etablerede blandt andre, hvor seks underenheder af helikaser samles for at danne sådanne ringformede hexameriske helikaser. I en dobbelthelix stabiliseres oligomerisering af underenheden ved at binde NTP eller metalioner. Ud af 6 potentielle ATP-bindingssteder binder to modsatte ATP tæt, to binder ADP og pi, og to underenheder er tomme. Nærheden mellem ATP og ATP-bindingsstedet er mest afgørende for dannelse af en kovalent binding mellem enzym og sukkerphosphat-rygrad i DNA, og denne energi fra hydrolyse af ATP hjælper med at overvinde aktiveringsbarrieren. Når ATP hydrolyseres, konverterer disse 3 tilstande hinanden på en koordinerende måde og danner en krusningseffekt. Den kontinuerlige krusningseffekt, der løber rundt om ringen, forårsager nogle konformationelle ændringer, og løkken strækker sig ind i midten af hullet i en ring, der (binder DNA). Denne op og ned oscillerende sløjfe trækker en DNA-streng fra midten af hullet, hvilket fører til adskillelsen af DNA-dobbelthelixen i en enkelt streng. Funktioner af DNA-helikaser 1. DNA-helikaser afvikler eller adskiller hydrogenbindingerne mellem nukleotidbaser af to strenge af dobbeltstrenget DNA ved brug af energiækvivalent ATP. 2. DNA-helikaser spiller obligatoriske roller i homolog somatisk genomstabilitet og meiotisk blanding af forældregenomerne i planter. 3. FANCJ er DNA-helikasen muteret i ovariecancer, arvelig bryst og progressiv knoglemarvssvigt (Fanconi anæmi), der forstyrrer helicaseaktivitet. Denne FANCJ hjælper med kræftundertrykkelse og interagerer direkte med BRCA1 til reparation af dobbeltstrengsbrud. 4. Nogle helicaser (for eksempel RECQL1, RECQL4, RECQL5, WRN og BLM) udfører streng-annealing ved at fremme baseparring. 5. De spiller en aktiv rolle i overførslen af genetisk information fra en generation til den næste. Plasmaproteiner - Definition, Klassificering, Egenskaber, Funktioner 10. maj 2022 af Khushi Jain Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Plasmaproteiner også kendt som serumproteiner eller blodproteiner består af simple og konjugerede proteiner. Deres gennemsnitlige koncentration i plasma er ikke fast og påvirkes af tilstedeværelsen af protein, men normalt er den 7,4 % og varierer fra 6,5 % og 8,4 % hos det raske individ. Så ved at bruge deres koncentration som kriterier, kan de bruges til sygdomsdiagnostik og prognosticering. Plasma protein Indholdsfortegnelse Klassificering af plasmaproteiner 1. Albumin o o o 2. Globulin o o o o o Globulin egenskaber en. Alfa 1 globulin b. Alfa 2 globulin c. Betaglobulin 3. Andre vigtige plasmaproteiner o Albumin egenskaber Albumin funktioner Albumin Kliniske betydninger en. ben-jones protein b. Fibrinogen Funktioner af plasmaproteiner Referencer Klassificering af plasmaproteiner 1. Albumin 2. Globulin Alfa 1 globulin Alfa 1: surt glykoprotein Alfa 1 fetoglobulin Alfa 1 antitrypsin Alfa 2 globulin Ceruloplasmin Haptoglobin Beta globulin Transferrin C-reaktivt protein Hemopexin 3. Andet vigtigt plasma ben-jones protein Fibrinogen 1. Albumin Albumin egenskaber Det kugleformede protein består af en enkelt polypeptidkæde og har 610 aminosyrer. Molekylvægt: 69.000 Indeholder 60-70% plasmaprotein Isoelektrisk PH: 4,7 Syntetiseret i leveren Fuld mætning af ammoniumsulfat er påkrævet for dets udfældning. 3,5 til 5,5 g% er dens normale serumkoncentration hos en rask voksen. Albumin funktioner 70-80% af det totale kolloide osmotiske tryk i karret opretholdes af albumin, som er en makromolekylær organisk forbindelse, og uden for 25-30 mm Hg COP-området bidrager albumin alene til 22 mm Hg COP-området. For at trække vandet inde i plasmaet fra interstitiel væske kræves en ydre kraft kendt som kolloidt osmotisk tryk eller onkotisk tryk, som opretholder vandkoncentrationen i plasmaet. Så albumin hjælper med at opbygge det pres. Det hjælper også med calciumioner, ukonjugeret bilirubin, skjoldbruskkirtelhormoner og ikke-esterificeret fedtsyretransport ind i plasmaet. Sure og neutrale lægemidler som warfarinnatrium, diazepam, furosemid, acetylsalicylsyre og penicillin transporteres ved hjælp af albumin. Albumin Kliniske betydninger Når serumalbuminkoncentrationen bliver lavere end 2,5g%, fører det til dannelsen af ødem i kroppen, hvorved væsken begynder at migrere fra det vaskulære rum til de interstitielle rum. Leversygdomme, glomerulonefritis og protein-energi fejlernæring er nogle sygdomme, der dannes på grund af den lavere koncentration af serumalbumin. 2. Globulin Globulin egenskaber Kugleformet protein Vanduopløselig Molekylvægt: 90.000- 1.300.000 Elektroforese bruges til at differentiere det til alfa-, beta- og gammaglobulin. en. Alfa 1 globulin jeg. Alfa 1: Surt glycoprotein Egenskaber Aka orosomucoid protein 60-140mg/ 100 ml= normal serumkoncentration Syntesested: lever Klinisk betydning Progesteron er et steroidhormon, der transporteres ved hjælp af surt glykoprotein. Aka akut fase protein, fordi det fungerer som en biomarkør for akut inflammation. Bær medicin som morfin, propranolol, quinidin osv. ii. Alfa 1- Fetoglobulin Egenskaber Findes hos gravide kvinder i fosterets blodcirkulation Koncentration hos raske personer: <1 mikrogram/100mL. Klinisk betydning Hepatokarcinom kan påvises ved hjælp af fetoglobulin iii. Alfa 1- antitrypsin Egenskaber Aktiviteten af protease kan hæmmes ved at anvende antitrypsin som en serumtrypsinhæmmer. Koncentration: 200-400 mg/100ml hos voksne. Syntesested: lever Under små skader, hepatocellulært karcinom, malignitet, forbrændinger og levercirrhose, øges koncentrationen af antitrypsin og er således et vigtigt akutfasereaktantprotein. Neutrofiler udskiller antitrypsin og udskiller også fra enzymet, der nedbryder elastinprotein i lunge- og levervæv. Klinisk betydning Lungesygdom: Tilstedeværelsen af defekte alleler som "PiM, PiF og PiZ, kan forårsage en genetisk lidelse kendt som alfa 1-antitrypsin-mangel. Obstruktive lungesygdomme og levercirrhose er almindelige hos mennesker med ZZ genotypen. Emfysem og KOL er mest tilbøjelige til at forekomme hos ZZ-genotypepersoner med en rygevane, fordi røgen forårsager oxidation af 358 methionin, der findes i antitrypsin, og gør det inaktivt. Diagnostisk værktøj: malignitet af gonader kan diagnosticeres ved hjælp af antitrypsin. Levercirrhos er: juvenil levercirrhose er et resultat af en antitrypsinmangel. b. Alfa 2 globulin jeg. Ceruloplasmin Egenskaber Type af glycoprotein, som har en co-faktor, såsom otte kobberatomer Serumkoncentration: 30mg/100ml Syntesested: lever 90% af total serum kobber er til stede i ceruloplasmin. Klinisk betydning Omdannelse af en ferro-ion til en ferri-ion sker med dette, og det er derfor et vigtigt ferroxidase-enzym. Et fald i serumkoncentrationen er markøren for leversygdom og mineralmangel. Et autosomalt recessivt træk ved Wilsons sygdom er en ophobning af kobber i leveren og hjernevæv. Symptomerne omfatter ødem i ben og mave, følelsesmæssig forstyrrelse, adfærdsændring, angst og misfarvning af huden. Et andet X-bundet recessivt træk er mangel på kobber i kroppen ved Menkes sygdom. Symptomerne omfatter svaghed i musklen, vækstmangel, hjerneskade, krampeanfald, skøre hår osv. ses normalt hos babyer og resulterer i dødelighed efter 2-3 års fødsel. ii. Hæmoglobin Egenskaber Dannet ved kovalent sammenføjning af to lette kæder eller alfakæder og to tunge kæder eller beta-kæder af disulfidbroer. Syntesested: lever Serumkoncentration: 30-200mg/100 ml. Klinisk betydning Hæmoglobin er frigivelsen fra røde blodlegemer, når det gennemgår lysis som almindeligt selv hos et sundt individ. Fri hæm, der indeholder jernholdige ioner, gennemgår en række reaktioner kendt som Fenton-reaktion, der genererer ROS og kan beskadige protein, DNA og lipidlag og blive giftigt for væv i løse kar. Haptoglobin-hæmoglobin-kompleks dannes, når frit hæmoglobin binder sig til haptoglobin ved hjælp af en alfa-kæde, og det kan passere gennem det glomerulære filter. Tab af frit hæmoglobin i urinen forhindres således af haptoglobin. Frit hæmoglobin gik gennem biologisk nedbrydning, når haptoglobin-hæmoglobin-komplekset optages af makrofager og milten. Cytobeskyttende og antioxidantfunktioner udføres af haptoglobin. En stigning i dets niveau under akut inflammation og infektion gør det til et akut-fase protein. Hæmolytisk anæmi kan påvises ved hjælp af haptoglobin, da dets koncentration falder i hæmolytisk anæmi. c. Betaglobulin jeg. Overfører Egenskaber Det er et glykoprotein, der indeholder jern Syntesested: lever Koncentration i serum: 200-350 mg/100 ml "apo-transferrin er en enkelt polypeptidkæde, som, når det binder med 2 ferri-ioner, danner "transferrin" Klinisk betydning Til biosyntese af hæmoglobin leverer det jern til knoglemarven og distribuerer det i en jernholdig tilstand. Giv medfødt immunitet. Jernmangelanæmi kan påvises ved hjælp af dette, da dets koncentration stiger i jernmangelanæmi. Under levercirrhose, protein-energi fejlernæring, forbrændinger, akut infektion og glomerulonephritis, falder dens koncentration, hvilket kan bruges som en biomarkør. ii. C-reaktivt protein Egenskaber Beta globulin pentamerisk protein Koncentration: mindre end 1 mg/100 ml. stigning i dets koncentration ses under aldring, graviditet, forbrændinger og betændelse Syntesested: lever Det har fået sit navn fra dets interaktion med gruppe C antigene polysaccharider fundet i pneumokokker. Døde cellers og bakteriers plasmamembran indeholder phosphocholin, som reagerer med C-reaktivt protein og danner et kompleks, som kan aktivere komplementsystemet, som igen aktiverer makrofager og T-lymfocytter. Klinisk betydning Det kan fungere som en ikke-specifik biomarkør for infektion og inflammation, da det er et akut-fase-reaktivt protein, og dets serumkoncentration stiger derfor i nærvær af akut infektion eller betændelse. Det kan bedre fungere som en biomarkør for inflammation end erythrocytsedimentationshastighed. iii. Hemopexin Egenskab Beta-globulin dannet af en enkelt polypeptidkæde Syntesested: lever Serumkoncentration: 50-100mg/100 ml hos voksne. Det er lavt hos spædbørn og bliver normalt efter det første fødselsår. Bindes kraftigt med "hæm" i forholdet 1:1. Egenskaber som cytobeskyttelse og antioxidation findes i denne, som ligner haptoglobin. Klinisk betydning Under hæmolytisk anæmi falder dens koncentration, hvilket kan bruges til diagnose. 3. Andre vigtige plasmaproteiner en. ben-jones protein Egenskaber Under malignitet dannes et antistof fra en hurtig deling af monoklonale plasmaceller kendt som paraprotein, således er bence-jones-protein en type paraprotein. Molekylvægt: 45.000 Dannet fra let kæde enten kappa eller lambda unormalt immunglobulin Indeholder 217 aminosyrer. Klinisk betydning Tumorplasma såsom myelomatose indeholder bence-jones-protein i blodet og urinen. Diagnose af myelomatose bruger en koncentration af serum paraprotein, som er 3mg/10 ml som et diagnostisk mål. Dette protein udfældes ved 60 grader Celsius i urinen. Opvarmning ved en højere temperatur end det får bundfaldet til at opløses, og når det samles igen, opstår ppt igen. b. Fibrinogen Egenskaber Aka koagulationsfaktor er et opløseligt plasmaprotein Det er en inaktiveret form for fibrin, der er nødvendig for blodpropper. Syntesested: lever Serumkoncentration: 200-400 mg/100mL Molekylvægt: 350.000-450.000. Klinisk betydning Blodkoagulationsfaktor Ved leversygdom falder dens koncentration Høj blødning kan også diagnosticeres på grund af dens lave koncentration Akut-fase protein Læs også: Mikroskop - definition, dele, funktioner, typer, diagram, anvendelser Antistof - definition, struktur, typer, former, funktioner Hæmatopoiesis og celler i immunsystemet Vacciner- Definition, typer, eksempler, bivirkninger Bindevæv- definition, struktur, celler, typer, funktioner, sygdomme Funktioner af plasmaproteiner 1. Syre-base-regulering: plasmaprotein, der er amfotert, kan fungere som en buffer for at opretholde balancen mellem syrebasen i blod og andre kropsvæsker. 2. Kolloidt osmotisk tryk : aka onkotisk tryk opretholdes af plasmaproteiner, som er essentielle for distributionen af vand i blodkar og interstitielle rum. 3. Blodkoagulering: Plasmaproteiner såsom fibrinogen, prothrombin og andre blodkoagulationsfaktorer er til stede i en inaktiv form i plasma. Under skaden blev de aktiveret og hjælper med at størkne blod. 4. Giver immunitet: B-lymfocytter danner immunoglobuliner, som er til stede i plasma og giver immunitet mod patogener 5. Hjælp til transport af stof: transport af store molekyler fra blodet til væv udføres af albumin og globuliner. 6. Giv næring: plasmaprotein er et simpelt protein, der indeholder aminosyrer og dermed giver næring. 7. Oprethold viskositeten i blodet: Tilstedeværelsen af globuliner og fibrinogener i plasma hjælper med at opretholde blodets viskositet, hvilket er vigtigt for at opretholde et normalt blodtryk. 8. Opbevaring af enzymer: lipase, amylase og transaminase er enzymer, der opbevares i plasma i små mængder. Ændringer i deres koncentration i plasma kan være en biomarkør for sygdommen. 9. Reserveproteiner: Plasmaproteiner omdannes til aminosyrer under faste og transporteres til væv ved cirkulation af blod og bruges til at syntetisere vævsprotein. ATP (Adenosintriphosphate) er et pyrophosphatmolekyle, der giver energi til at udføre metaboliske processer, dvs. opretholde en celles liv. Det er en kompleks organisk højenergiforbindelse, der giver energi til at udføre metaboliske processer. Det omtales som "den molekylære valutaenhed " for den intracellulære energioverførsel eller " cellens energivaluta " eller " cellens energienhed ". Det er den primære energikilde til brug og opbevaring inde i hver celle. ATP Det er et komplekst organisk molekyle bestående af adenin, ribose og en trifosfatdel. Den energi, der frigives under cellulær respiration, fanges i form af to phosphodiesterbindinger i ATP-molekylet. Under hydrolysen af disse højenergi-phosphodiesterbindinger i ATP-molekyler frigives energi, som derefter bruges til cellulære aktiviteter. IUPAC-navn : Adenosin 5'-(tetrahydrogentrifosfat) Molekylformel : C10H16N5O13P3 _ _ _ _ _ _ _ _ Molekylvægt : 507,18 g/mol Massefylde: 1,04 g/cm 3 Opløselighed : Vandopløselig Indholdsfortegnelse Struktur af ATP Produktion af ATP o ATP-syntesemekanismer o o Glukose og ATP 1. Cellulær respiration 2. Foto-phosphorylering 3. Beta-oxidation 4. Fermentering Hydrolyse af ATP Funktioner af ATP Referencer Struktur af ATP Struktur af ATP Den består af adenin, ribose og en trifosfatdel. Adenosin er bundet af 9nitrogenatomet til 1-carbonatomet i ribose, som igen er bundet ved sukkerets 5-carbonatom til en triphosphatgruppe. Tre fosfatgrupper danner en trifosfatdel. De kaldes alfa (α), beta (β) og gamma (γ) fosfatgrupper. Der er tre fosfodiesterbindinger; en mellem fosfatgrupper, den anden mellem fosfatgrupperne og den tredje mellem fosfat og ribosesukker. De to første er højenergi-phosphodiester-binding og producerer energi under hydrolyse. Derfor giver hydrolyse af ATP til ADP (Adenosin Diphosphate) og igen til AMP (Adenosin Monophosphate) energi, men brydningen af phosphodiesterbindingen mellem ribose og fosfatet kræver energi. Produktion af ATP ATP er en energirig forbindelse, der primært syntetiseres under cellulær respiration i aerobe og anaerobe celler. Oxidation af glucose, lipider (fedtstoffer) og aminosyrer producerer ATP-molekylerne inde i cellerne. Den energi, der frigives under oxidationen af disse næringsstoffer, fanges i form af den højenergiske phosphodiesterbinding i ATP-molekylet. Glukose og ATP Kulhydrat er den primære energikilde. Kulhydrater, der indtages i forskellige former (stivelse, saccharose, dextrose, lactose, fruktose osv.) nedbrydes for det meste til monosaccharidform 'glucose'. Glucose udsættes derefter for metaboliske reaktioner, glykolyse , Krebs-cyklus og oxidativ phosphorylering og oxideres for at frigive energi. Denne frigivne energi fanges og lagres i form af ATP. På samme måde producerer protein- og lipidmetabolisme også simple slutprodukter som acetyl CoA, succinyl CoA, ketosyrer, ammoniak osv., som derefter udsættes for Krebs-cyklussen og oxidativ fosforylering for at give ATP-molekyler. ATP-syntesemekanismer ATP-syntese forekommer under flere cellulære processer, herunder phosphoryleringsreaktioner. Det kan forekomme under både aerobe og anaerobe forhold. De væsentlige måder at producere ATP på er; cellulær respiration (oxidativ phosphorylering, substrat-niveau phosphorylering), beta-oxidation og lipid katabolisme, protein katabolisme, fotophosphorylering og fermentering. 1. Cellulær respiration Det er den proces, hvor glucose kataboliseres til acetyl - CoA og udsættes for oxidativ fosforylering til ATP-syntese. Det er den vigtigste mekanisme til at syntetisere det meste af den ATP, der kræves til en celle. ATPproduktionen via cellulær respiration sker i to forskellige stadier; en. Fosforylering på substratniveau ATP-produktion sker direkte under glykolysen. I den glykolytiske vej tilføjer oxidation af G-3-P med G-3-P dehydrogenase-enzym en højenergiphosphatgruppe, som overføres til ADP i den næste reaktion, der genererer ATP-molekyle. I en anden reaktion omdanner den energi, der frigives under dehydrering af 2-phosphoglycerat, lavenergiphosphatbindingen til en højenergiphosphatbinding, som overføres til ADP i den næste reaktion, der producerer et ATP-molekyle. Pyruvat oxideres derefter til acetyl - CoA molekyle af pyruvat dehydrogenase komplekser. Således dannet acetyl - CoA udsættes derefter for Krebs-cyklussen, hvor det oxideres til at producere en ækvivalent ATP, dvs. GTP-molekyle, tre molekyler NADH og et molekyle FADH 2 . Disse NADH- og FADH 2 - molekyler er elektronbærere, der kommer ind i ETC (elektrontransportkæden) og producerer ATP-molekyler. b. Oxidativ phosphorylering De mellemliggende forbindelser som NADH og FADH 2 produceret under glykolyse, pyruvat-decarboxylering og Krebs-cyklus bruges som elektronbærere og udsættes som substrat for elektrontransportkæden (ETC), der genererer protongradient. Protongradienten er koblet med kemiosmose, hvor ATP-syntaseenzymet syntetiserer ATP. 2. Foto-phosphorylering Det er den proces, hvor lysenergien bruges til at fosforylere ADP til ATP inde i klorofylholdige celler. Den generelle reaktion af fotophosphorylering kan udtrykkes som: ADP + lysenergi + Pi → ATP Den er af to typer; cyklisk og ikke-cyklisk fotophosphorylering. en. Cyklisk fotofosforylering Det er fotofosforyleringsprocessen, hvor elektroner frigivet af P700pigmentet i Photosystem-I genbruges tilbage til Photosystem-I. Den frigivne elektron udsættes for en ETC, som genererer en protongradient, der bruges til at producere ATP af ATP-syntase i en proces kaldet kemiosmose. Det forekommer overvejende i bakterieceller. b. Ikke-cyklisk foto-phosphorylering Det er fotofosforyleringsprocessen, hvor de frigivne elektroner ikke bliver genbrugt tilbage til fotosystemet, som producerer dem. I denne mekanisme exciteres både fotosystem-I og -II samtidigt. Elektroner frigivet af P680 af fotosystem-II føres gennem en ETC, der genererer ATP ved phosphorylering af ADP med ATP-syntaseenzym i kemiosmose. Elektronerne bruges derefter til at erstatte elektronerne tabt af P700 af fotosystem-II under fotoexcitation. Elektronerne frigivet af fotosystem-II bruges derefter til at reducere NADP+ til NADPH. Det forekommer overvejende i planteceller og forårsager frigivelse af et O 2 molekyle i hvert trin. 3. Beta-oxidation Det er en katabolisk reaktion, hvor fedtsyrer oxideres til acetyl - CoA, som derefter udsættes for Krebs-cyklussen og ETC samtidigt for dannelsen af ATP. Under hver beta-oxidationscyklus produceres en acetyl - CoA, NADH og FADH 2 . Disse mellemprodukter metaboliserer derefter yderligere frigivelse af ATP i Krebs-cyklussen og oxidative phosphoryleringsprocesser. 4. Fermentering Det er processen med produktion af organisk syre eller alkohol gennem reduktion af pyruvat produceret ved glykolyse af sukker (glukose). Det forekommer i den anaerobe respirationsproces. Det er en fosforyleringsproces på substratniveau, hvor 2 ATP-molekyler produceres fra et enkelt glucosemolekyle. Slutproduktet er enten mælkesyre eller ethanol. Disse produkter kan ikke indgå i oxidativ phosphorylering på grund af mangel på ilt. Derfor produceres der ikke yderligere ATPmolekyler. Derfor er det mindre effektivt end den aerobe respirationsproces i ATP-generering. Hydrolyse af ATP Det er den kataboliske reaktionsproces, hvor de energirige phosphodiesterbindinger af ATP-molekyler nedbrydes (hydrolyseres) og frigiver energi og uorganiske fosfatmolekyler i nærværelse af vand og ATPase-enzym. Det er en eksergonisk reaktion, hvor energien, der er lagret i phosphodiesterbindingen under ATP-dannelse, frigives. Denne frigivne energi bruges af cellen til at udføre flere cellulære aktiviteter og reaktioner. ATP hydrolyseres først og bryder en energirig phosphodiesterbinding for at danne ADP. ADP-molekylet kan yderligere hydrolyseres ved at bryde en anden energirig phosphodiesterbinding for at danne AMP. Nedbrydningen af phosphodiesterbinding katalyseres af ATP hydrolase (ATPase) enzym i nærvær af vand. ATP-hydrolyse er en reversibel reaktion, dvs. ADP og AMP kan rephosphoryleres fra ATP-molekyle. Hydrolyse af ATP til ADP frigiver 7,3 kCal/mol energi. Det kan udtrykkes som: Hydrolyse af ATP til ADP Hvor, ∆G= Gibbs fri energi = – 7,3 kCal/mol energi Yderligere hydrolyse af ADP til AMP frigiver 7,5 kCal/mol energi. Det kan udtrykkes som: Hydrolyse af ADP til AMP Hvor, ∆G= Gibbs fri energi = – 7,5 kCal/mol energi Den overordnede reaktion kan opsummeres som: Hydrolyse af ATP Læs også: Aerob vs anaerob respiration - definition, 11 forskelle, eksempler Celleorganeller (plante, dyr) - struktur, funktioner, diagrammer Mikroskop - definition, dele, funktioner, typer, diagram, anvendelser RNA- Definition, egenskaber, struktur, sammensætning, typer, funktioner Transfer RNA (tRNA) - Definition, struktur, behandling, typer, funktioner Funktioner af ATP 1. ATP spiller en væsentlig rolle i anabolske reaktioner ved at give energi til knogledannelse eller brækkelse. Det er den primære energikilde til cellulære reaktioner og processer. Energi lagres og transporteres i form af ATP inde i levende celler. Alle andre former for kemisk energi i cellen omdannes til ATP før brug. 2. Vitale processer som muskelsammentrækning-afslapning, cellulære bevægelser, impulstransmission, hjertepumpning, blodcirkulation osv. kræver ATP-hydrolyse som brændstof. 3. ATP bruges som energikilde til transport af molekyler ind og ud af cellen under aktive transportmekanismer. 4. ATP fungerer som en intracellulær reserveret energikilde. 5. ATP er involveret i intracellulære signaleringsprocesser. De tjener som substrat for kinaser til phosphatoverførsel, adenylatcyclaseenzymer osv. ATP omdannes til cAMP (cyklisk AMP), som fungerer som sekundære signalmolekyler under intracellulære signaleringsprocesser. 6. ATP er også involveret i ekstracellulær signalering og neurotransmission. Under den purinerge signaleringsproces bruges ATP til celle-til-celle kommunikation. Det tjener også som en neurotransmitter i flere neurale signaleringsprocesser. 7. ATP er nødvendig for biosyntesen af DNA- og RNAmolekyler. DNA-gyrase af prokaryoter eller DNA-topoisomerase II kræver ATP i form af dATP (deoxyribonukleotid adenosintriphosphat). 8. Det er også involveret i proteinsyntesereaktioner ved at aktivere aminoacyl-tRNA-syntetaseenzymer. 9. Adskillige ATP-bindende kassettetransportører (ABCtransportører) er til stede i cellemembraner, som bruger energien fra ATP-binding og hydrolyse til cellulær transport som optagelse af vitaminer, metalioner, biosyntetiske forstadier osv. og udstrømning af lipider, lægemiddelrester, steroler osv. 10. Injicerbare ATP'er bruges som diagnostiske og terapeutiske lægemidler til visse hjertesygdomme (hjertebradyarytmier). 11. ATP viser sig at fungere som en biologisk hydrotrop. ATP kan hindre den termiske aggregering af proteiner og opløseligheden af proteiner. 12. ATP bliver også undersøgt for dets anti-aging egenskaber og bruges i anti-aging lægemidler. Bufferløsninger 29. marts 2022 af redaktører Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner En buffer er en vandig opløsning bestående af en blanding af en svag syre og dens salt eller en svag base og dens salt, der modstår en ændring i pH ved tilsætning af enten syre eller base. Bemærk: - Mange biologiske og kemiske reaktioner kræver en konstant pH-værdi for at reaktionen kan fortsætte. Buffere er ekstremt nyttige i disse systemer til at holde pH på en konstant værdi. Dette betyder ikke, at pHværdien af buffere ikke ændrer sig. Det betyder kun, at ændringen i pH ikke er så stor, som den ville være med en opløsning, der ikke er en buffer. Indholdsfortegnelse TYPER AF BUFFERLØSNINGER FYSIOLOGISK BUFFER BUFFERS BETYDNING I BIOLOGISK FORSKNING REFERENCER TYPER AF BUFFERLØSNINGER Buffere er groft opdelt i to typer: 1. Sur bufferopløsning : Disse er opløsninger, der har en pH-værdi på under 7 og indeholder en svag syre og et af dens salte. For eksempel virker en blanding af eddikesyre og natriumacetat som en bufferopløsning med en pH på ca. 4,75. 2. Alkalisk (basis) bufferopløsning : Disse er opløsninger, der har en pH over 7 og indeholder en svag base og et af dets salte. For eksempel virker en blanding af ammoniumchlorid og ammoniumhydroxid som en bufferopløsning med en pH på ca. 9,25. FYSIOLOGISK BUFFER Fysiologiske buffere er kemikalier, der bruges af kroppen til at forhindre pludselige, hurtige ændringer i en væskes pH. Da buffere er mest i stand til at modstå ændringer i pH, når opløsningens pH er tæt på bufferens unikke pH. Følgelig skal fysiologiske buffere være kemikalier, hvis pH-værdi er tæt på den normale blod-pH, som spænder fra 7,37 – 7,42. De primære buffere i ECF synes at være uorganisk fosfat (pH 6,8) og bicarbonat (pH 6,1). De vigtigste eksempler på fysiologiske buffersystemer er som følger: i) Bicarbonatbuffer ii) Fosfatbuffer iii) Oxyhæmoglobinbuffer Læs også: P-værdi- definition, formel, tabel, finde p-værdi, signifikans Osmose - definition, typer, eksempler (Osmose vs Diffusion) Fotosyntese- Definition, ligning, trin, proces, diagram T-test- definition, formel, typer, applikationer, eksempel Antistof - definition, struktur, typer, former, funktioner BUFFERS BETYDNING I BIOLOGISK FORSKNING 1. Buffere bruges til at holde nogle lægemidler eller medicin i ioniseret form, da ioniserede former er mere opløselige i vandige opløsninger. 2. Buffere bruges til at holde pH-værdien af de fleste af stofferne næsten neutrale, ellers forårsager det irritation i kropsvæv. 3. Det bruges til at kontrollere ydeevnen af elektroder, der bruges til pHbestemmelse. 4. Det bruges til at kontrollere pH-værdien af den kemiske reaktion katalyseret af enzymer. Fordøjelse Og Absorption Af Kulhydrater, Proteiner Og Fedtstoffer 25. marts 2022 af Sagar Aryal Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Kulhydrater , fedtstoffer og proteiner er de vigtigste næringsstoffer, kroppen har brug for til vækst, reparation, bevægelse og opretholdelse af vævs- og organfunktion. Disse makromolekyler nedbrydes og absorberes i kroppen med forskellige hastigheder og i specifikke former, når de rejser gennem organerne i fordøjelsessystemet. Indholdsfortegnelse Fordøjelse af kulhydrater Absorption af kulhydrater Fordøjelse af proteiner Absorption af proteiner Fordøjelse af fedtstoffer Absorption af fedtstoffer Referencer Fordøjelse af kulhydrater Blandt kulhydrater absorberes kun monosaccharidformerne. Derfor skal alle kulhydrater fordøjes til glucose, galactose og fructose for at absorptionen kan fortsætte. Enzymer involveret a-amylaser (spyt og bugspytkirtel) hydrolyserer 1,4glykosidbindinger i stivelse, hvilket giver maltose, maltotriose og αlimit dextriner. Maltase, a-dextrinase og sucrase i tarmbørstekanten hydrolyserer derefter oligosacchariderne til glucose. Lactase , trehalase og sucrase nedbryder deres respektive disaccharider lactose, trehalose og saccharose til monosaccharider. Lactase nedbryder laktose til glucose og galactose. Trehalase nedbryder trehalose til glucose. Sucrase nedbryder saccharose til glucose og fructose. Absorption af kulhydrater 1. Glucose og galaktose De transporteres fra tarmens lumen ind i cellerne ved en Na+afhængig co-transport (SGLT 1) i den luminale membran. Sukkeret transporteres "op ad bakke", og Na+ transporteres "ned ad bakke". De transporteres derefter fra celle til blod ved faciliteret diffusion (GLUT 2). Na+–K+ pumpen i den basolaterale membran holder den intracellulære [Na+] lav, og bibeholder således Na+ gradienten over den luminale membran. 2. Fruktose Fruktose transporteres udelukkende ved faciliteret diffusion; derfor kan det ikke absorberes mod en koncentrationsgradient. Fordøjelse af proteiner Kostproteiner er en kilde til aminosyrer, der bruges til dannelsen af forskellige cellulære stoffer. For det meste skal proteiner nedbrydes til aminosyrer for absorption. Fordøjelsesprodukter af protein kan absorberes som aminosyrer, dipeptider og tripeptider Både endopeptidase - enzymer, som nedbryder proteiner ved at hydrolysere indre peptidbindinger, og exopeptidase -enzym, der hydrolyserer én aminosyre ad gangen fra C-terminalen af proteiner og peptider, er involveret i fordøjelsen af proteiner. Fordøjelsen foregår i maven og tyndtarmen. Enzymer involveret Pepsin Pepsin udskilles i sin zymogen form som pepsinogen af hovedcellerne i maven. Pepsinogen aktiveres til pepsin af gastrisk H+. Den optimale pH for pepsin er mellem 1 og 3. Pepsin hydrolyserer proteiner til peptoner og proteoser. Når pH er >5, denatureres pepsin. I tarmen, når HCO 3 - udskilles i bugspytkirtelvæsker, stiger duodenal pH, og pepsin inaktiveres. Pancreas proteaser Fordøjelsen afsluttes i tyndtarmen ved påvirkning af bugspytkirtel- og tarmsaft. Proteaserne inkluderer trypsin, chymotrypsin, elastase, carboxypeptidase A og carboxypeptidase B. De udskilles i inaktive former, der aktiveres i tyndtarmen som følger: Trypsinogen aktiveres til trypsin af et børstegrænseenzym, enterokinase. Trypsin omdanner derefter chymotrypsinogen, proelastase og procarboxypeptidase A og B til deres aktive former. Absorption af proteiner 1. Frie aminosyrer Na+-afhængig aminosyre-cotransport forekommer i den luminale membran. Det er analogt til cotransporteren for glucose og galactose. Aminosyrerne transporteres derefter fra celle til blod ved lettere diffusion. Der er fire separate bærere for henholdsvis neutrale, sure, basiske og imino-aminosyrer. 2. Dipeptider og tripeptider De optages hurtigere end frie aminosyrer. H+-afhængig cotransport af dipeptider og tripeptider forekommer også i den luminale membran. Efter at dipeptiderne og tripeptiderne er transporteret ind i tarmcellerne, hydrolyserer cytoplasmatiske peptidaser dem til aminosyrer. Aminosyrerne transporteres derefter fra celle til blod ved lettere diffusion. Fordøjelse af fedtstoffer Fedtstoffer, der af natur ikke er opløselige i vand, er både svære at fordøje og absorbere. De blandes ikke med mave eller tarmindhold. Lipider omfatter triglycerider, fosfolipider, kolesterol, steroider og fedtopløselige vitaminer. Det første trin i lipidfordøjelsen er emulgering, som er omdannelsen af store lipiddråber til meget mindre dråber. Emulgeringsprocessen øger overfladearealet af det lipide, der er udsat for fordøjelsesenzymer, ved at formindske dråbestørrelsen. Enzymer involveret 1. I munden Linguale lipaser fordøjer nogle af de indtagne triglycerider til monoglycerider og fedtsyrer. Men de fleste af de indtagne lipider fordøjes i tarmen af bugspytkirtellipaser. 2. Mave I maven bryder blanding lipider til dråber for at øge overfladearealet til fordøjelse af bugspytkirtelenzymer. 3. Tyndtarm Galdesyrer emulgerer lipider i tyndtarmen, hvilket øger overfladearealet til fordøjelsen. De hydrofobe produkter fra lipidfordøjelsen opløses i miceller af galdesyrer. Pancreaslipaser hydrolyserer lipider til fedtsyrer, monoglycerider, kolesterol og lysolecithin. Enzymerne er pancreaslipase, cholesterolesterhydrolase og phospholipase A2 . Læs også: Kulhydrater- definition, klassificering med struktur og funktioner Bindevæv- definition, struktur, celler, typer, funktioner, sygdomme Det menneskelige fordøjelsessystem - Organer, funktioner og diagram Graviditet uge for uge (baby og kropsudvikling, tips) Fysiologi af menneskelig fordøjelse Absorption af fedtstoffer Miceller bringer produkterne fra lipidfordøjelsen i kontakt med den absorberende overflade af tarmcellerne. Derefter diffunderer fedtsyrer, monoglycerider og kolesterol over den luminale membran ind i cellerne. Glycerol er hydrofilt og er ikke indeholdt i micellerne. I tarmcellerne re-esterificeres produkterne fra lipidfordøjelsen til triglycerider, kolesterolester og fosfolipider og danner med apoproteiner chylomikroner. Chylomikroner transporteres ud af tarmcellerne ved eksocytose. Fordi chylomikroner er for store til at komme ind i kapillærerne, overføres de til lymfekar og tilføres blodbanen via thoraxkanalen Western Blotting- Definition, Princip, Trin, Resultater, Anvendelser 23. marts 2022 af Bikash Dwivedi Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Blottingteknikker er effektive teknikker til at detektere makromolekyler såsom proteiner, DNA og RNA'er. Blot refererer til den membran, hvorpå biologiske molekyler såsom proteiner og nukleinsyrer er immobiliseret. Den første opfundne blotting-teknik var Southern Blotting brugt til påvisning af DNA'er af Edwin Southern i 1975. De senere opdagede blotting-teknikker er navngivet med henvisning til hans navn, såsom, Northern Blotting til påvisning af RNA'er og Western Blotting til påvisning af proteiner . Indholdsfortegnelse Hvad er Western Blotting? Western blotting-krav Western blotting-princippet Western blotting-procedure/trin o o o o o Forberedelse af prøve og proteinblotting Membranoverførsel Blokering Antistofbinding Påvisning af protein Western Blotting Resultatfortolkning Western Blotting-applikationer Western Blotting Fordele Western Blotting-begrænsninger Referencer Hvad er Western Blotting? W estern Blotting er en effektiv og meget brugt teknik til adskillelse af et specifikt protein fra en kompleks prøve eller blanding af proteiner. Det er også kendt som immunoblotting, fordi antistofprober bruges til at detektere målproteinet på membranen. Det involverer kombinerede trin af proteinlysering, elektroforese, blotting og antigen-antistof-interaktion. Harry Towbin beskrev først denne metode i 1979. Denne teknik blev kaldt Western Blotting af W. Neal Burnette. Figur: Western Blotting. Oprettet med biorender.com Western blotting- krav 1X fosfatbufret saltvand 1X SDS prøvebuffer Cellelysebuffer Overførselsbuffer 1X TBST (Tris-bufret saltvand+polysorbat 20 (Tween 20)) Blokerende buffer (1X TBST+ 5 % fedtfri tørmælk) Bovint serumalbumin (BSA) Primær antistoffortyndingsbuffer (kan have 5 % BSA eller 5 % fedtfri tørmælk) Signal fire ECL-reagens (Hjælper med at detektere selv piktogrammer af proteiner i western blotting-teknikken) Forhåndsfarvet proteinmarkør Blotting Membran (nitrocellulosepapir) PAGE ( Polyacrylamid Gel Electrophorese) Sæt Western blotting- princippet Proteiner adskilles baseret på form og størrelse ved SDS-PAGEelektroforese. De adskilte proteiner overføres derefter til nitrocellulose eller nylonmembran. På membranen probes de med antistoffer, der er specifikke for proteinet af interesse. Derefter opstår antigen- og antistofkompleksdannelse. Komplekset kan påvises enten ved autoradiografi eller sekundært antistof forbundet med et enzym. Western blotting-procedure/trin Forberedelse af prøve og proteinblotting Proteinet kan ekstraheres fra enhver type celle eller væv ved at lysere dem. Proteaseinhibitorer bruges til at lade proteinet forblive i sin intakte form uden denaturering. Trinene omfatter: Ved første aspiration af cellekulturmedier udføres. Vask af cellerne med PBS og aspiration af PBS udføres. Lysering af celler ved tilsætning af 1X SDS-prøvebuffer (100 mikroliter buffer i hver brønd for en plade med seks brønde) udføres derefter. Overførsel af ekstrakt til mikrocentrifugerøret. (Hold celleekstraktet på is, mens du udfører disse trin.) (Alternativt kan cellelyset også udføres ved brug af 1X cellelysebuffer eller 1X RIPA buffer) Sonikering af ekstrakt i 10 til 15 sekunder til afslutning af cellelyseprocessen. (Dette trin er vigtigt for at mindske prøvens viskositet og bruges især til påvisning af membranbundne og nukleare proteiner.) Mens der bruges SDS-prøvebuffer, skal 120 mikroliter aliquot af prøven tages og opvarmes til 95 til 100 grader Celsius i ca. 5 minutter og afkøles derefter på is. (Når der bruges cellelyse eller RIPA-buffer, skal der tages 20 mikroliter af alikvoten, og blå eller rød påfyldningsbuffer tilsættes, hvilket gør den endelige koncentration på 1X. Derefter opvarmes den til 95 grader Celsius og afkøles på is.) Mikrocentrifugeringen af den afkølede prøve udføres i 55 minutter ved stuetemperatur. Den centrifugerede prøve fyldes på en kvadratisk SDS-PAGE 4-20% gradientgel. Påfyldning af prøve udføres sammen med 10 mikroliter præ-farvet markør og 10 mikroliter biotinyleret proteinstige. Derefter opbevares gelen til løbet ved hjælp af SDS-løbebuffer. Membranoverførsel Når gelen er færdig, skal du opsætte en overføringskassette og overføringsbuffer som følger - våd svamp, filterpapir, gel, nitrocellulosemembran, endnu et filterpapir og svamp. (Hvis de er tilstede skal luftbobler fjernes.) Kassetten lukkes derefter og indsættes i overføringsapparatet i den passende retning. Derefter overføres det til elektroforese under afkølingsbetingelser ved 70 volt i 1,5 til 3 timer. Efter overførsel fjernes nitrocellulosemembranen og holdes til at vaske ordentligt med 25 ml TBST-buffer i fem minutter ved stuetemperatur. Blokering Til membranblokering behandles den med 25 ml blokeringsbuffer (1X TBST med 5 % fedtfri tørmælk) ved stuetemperatur i 1 time. Membranen vaskes derefter igen med 15 ml 1X TBST. (Forskellige mål gælder kun for 100 cm nitrocellulosemembran. Volumen skal justeres for membraner af forskellig størrelse.) Antistofbinding Det primære antistof skal fortyndes med 10 ml anbefalet fortyndingsbuffer i henhold til produktdatabladet. Membranen inkuberes derefter i det fortyndede antistof ved forsigtig omrøring ved 4 grader Celsius for natten. Og en anden dag vaskes membranen først tre gange i 5 minutter med ca. 15 ml TBST. Efter vaskeproceduren fortyndes det artsegnede HRP-bundne sekundære antistof ved 1 til 2000 i 10 ml blokerende buffer. Membranen inkuberes derefter i det sekundære antistof under forsigtig omrøring i en time ved stuetemperatur på en orbitalryster. Den inkuberede membran vaskes igen tre gange i fem minutter hver vask med 15 ml TBST. Påvisning af protein Ved den første forberedes signalbrand ECL-reagens (Udføres ved at blande en del af 2X Reagens A og en del af 2X Reagens) Membranen inkuberes igen i 10 ml ECL-reagens under forsigtig omrøring ved stuetemperatur i et minut. Den overskydende fremkalderopløsning drænes ud uden at lade membranen tørre ud. Membranen er pakket ind i en plastik rap og udsættes for røntgenfilm udført i et mørkt rum. Det gøres i 10 sek, hvilket betragtes som en ordentlig eksponeringstid. Proteinbånd kan observeres under røntgenfilmen. Western Blotting Resultatfortolkning Baseret på teknikken brugt til western blotting kan proteinerne påvises ved brug af kemiluminescens, kolorimetriteknikker, brug af radioisotoper som udført i røntgenfilm og brug af fluorescerende kemikalier mærket til det sekundære antistof. Proteinbåndene i prøven sammenlignes med kontrol- eller størrelsesmarkører, og molekylvægten i Dalton detekteres for at identificere proteinet. Digital billeddannelsesteknikker er også udviklet til fortolkning af adskilte proteiner. Western Blotting- applikationer Det bruges som en bekræftende test for HIV. Bestemmelse af størrelse og mængde af protein i en prøve Serodiagnose af tuberkulær meningitis og neurocystocirkose Adskillelse af protein fra en kompleks blanding Påvisning af autoimmune sygdomme Læs også: Mikroskop - definition, dele, funktioner, typer, diagram, anvendelser DNA-replikation - definition, enzymer, trin, applikationer Aminosyrer og proteiner - definition, struktur, typer, funktioner Celleorganeller (plante, dyr) - struktur, funktioner, diagrammer Antistof - definition, struktur, typer, former, funktioner Western Blotting Fordele Det kan detektere en meget lille mængde (picogram) protein i en prøve. Høj sensitivitet og specificitet Mest egnet og effektiv blandt andre teknikker til HIV-detektion. Western Blotting- begrænsninger Det kræver høje færdigheder og er derfor svært at udføre. I nogle tilfælde binder antistofferne sig til andre proteiner end proteinet af interesse. Hvis det primære antistof for protein af interesse ikke er tilgængeligt, kan det ikke påvises. Primære antistoffer er dyre. Små proteiner tilbageholdes muligvis ikke af membranen. Udseendet af usædvanlige bands Fremkomsten af høj baggrund i klatten Test For Biologiske Molekyler 10. januar 2022 af Anupama Sapkota Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Indholdsfortegnelse Benedikts test for at reducere sukkerarter o o o o o o o o Jodtest for stivelse o o o o o o o Definition Mål Princip Reaktion Krav Procedure Resultat og fortolkning Noter Definition Mål Princip Krav Procedure Resultat og fortolkning Noter Emulsionstest for lipider o o o o o Definition Mål Princip Krav Procedure o Resultat og fortolkning Biuret test for proteiner o o o o o o o Definition Mål Princip Krav Procedure Resultat og fortolkning Noter Referencer og Kilder Benedikts test for at reducere sukkerarter Definition Benedicts test er en biokemisk test udført for at skelne reducerende sukkerarter (monosaccharider og nogle disaccharider) fra ikke-reducerende sukkerarter. Mål For at påvise tilstedeværelsen af simple kulhydrater i en opløsning. At skelne mellem reducerende og ikke-reducerende sukkerarter. Princip Kulhydraterne med en fri eller potentielt fri aldehyd- eller ketongruppe kan virke som et reduktionsmiddel. For at påvise reduktionsmidlet anvendes Benedicts reagens. Det ser dybblå ud og består af kobbersulfat blandet med natriumcitrat og et svagt alkali, natriumcarbonat. Når reducerende sukkerarter opvarmes i nærværelse af alkali, bliver de omdannet til endioler, som er kraftige reduktionsmidler. Enedioler reducerer kobber(II)ioner (Cu 2+ ), der er til stede i Benedikts reagens, til kobber(II)ioner (Cu + ), som udfældes som uopløseligt rødfarvet kobber(II)oxid. Testen er semikvantitativ, da farven på bundfaldet angiver en omtrentlig mængde af sukkeret i prøven. For en prøve, der indeholder reducerende sukker, går farven på prøven under kogning fra blå (uden reducerende sukker til stede), grøn, gul, orange, rød og derefter murstensrød eller brun (med en høj koncentration af reducerende sukkerarter). Citrationerne danner et kompleks med kobber(II)ioner og forhindrer dets udfældning med hydroxidionerne som kobber(II)hydroxid. Reaktion Na2CO3 + 2H2 → 2NaOH + H2CO3 _ _ _ 2NaOH + Cu( OH ) 2 → Na2SO4 Cu(OH) 2 → CuO + H2O D-glucose + 2CuO → D-gluconsyre + Cu 2 O (rød ppt) Krav Reagenser Benedicts reagens: Benedicts reagens fremstilles ved at tilsætte 17,3 g natriumcitrat, 10 g natriumcarbonat og 17,3 g natriumpentahydrat til 100 ml vand i et bægerglas. Testprøver Nødvendige materialer Reagensglas Reagensglasstativ Pipetter Udstyr Vand bad Procedure Ca. 1 ml af testprøven tilsættes til et reagensglas sammen med 2 ml af Benedikts reagens. Reagensglassene lægges derefter i reagensglasstativet, som holdes i kogende vand i 4-10 minutter. Farven i reagensglassene observeres og noteres. Resultat og fortolkning Figur: Observation (resultater) af Benedikts test. Billedkilde: Kemi Learner. Udseendet af et grønligt bundfald indikerer ca. 0,5 g% koncentration; gult bundfald angiver 1 g% koncentration; orange angiver 1,5 g% koncentration og rød angiver 2 g% eller højere koncentration af reducerende sukkerarter. Udseendet af den blå farve indikerer fraværet af reducerende sukker og repræsenterer et negativt resultat. Noter Saccharose, stivelse, inositol giver et negativt resultat, hvorimod laktose og maltose giver et positivt resultat med Benedikts test. Benedict modificerede Fehlings løsning til at lave et enkelt forbedret reagens, som er ret stabilt. Den er meget følsom over for selv små mængder reducerende sukkerarter (0,1%) og giver nok bundfald. En falsk-positiv reaktion for urinprøve kan opnås på grund af tilstedeværelsen af reducerende stoffer som urinsyre, ascorbinsyre eller andre lægemidler som levodopa. Jodtest for stivelse Definition Jod test, også kendt som en stivelse-jod test, er en kemisk test, der bruges til at skelne mono- eller disaccharider fra specifikke polysaccharider som amylase, dextrin og glykogen. Mål For at påvise tilstedeværelsen af polysaccharid, primært stivelse. Princip Jodtest er baseret på det faktum, at polyiodid-ioner danner farvet adsorptionskompleks med spiralformede kæder af glukoserester af amylase (blå-sort), dextrin (sort) eller glykogen (rød-brun). Monosaccharider, disaccharider og forgrenede polysaccharider som cellulose forbliver farveløse. Amylopectin producerer en orange-gul nuance. Reagenset brugt i jodtesten er Lugols jod, som er en vandig opløsning af elementært jod og kaliumiodid. Jod i sig selv er uopløseligt i vand. Tilsætning af kaliumjod resulterer i en reversibel reaktion af iodionen med jod til dannelse af triiodidion, som yderligere reagerer med et jodmolekyle til dannelse af pentaiodidion. Bænkjodopløsning ser brun ud, hvorimod jodid-, triiodid- og pentaiodid-ionen er farveløse. Det observeres, at glukosekædens helix (spiral eller fjeder) struktur er nøglen til denne test. Yderligere afhænger den resulterende farve af længden af glukosekæderne. De dannede triiodid- og pentaiodid-ioner er lineære og glider inde i helixstrukturen. Det menes, at overførsel af ladning mellem helixen og polyiodidionerne resulterer i ændringer i afstanden mellem energiniveauerne, som kan absorbere synligt lys, hvilket giver komplekset dets farve. Farvens intensitet falder med stigningen i temperaturen og tilstedeværelsen af vandblandbare organiske forbindelser som ethanol. Ved opvarmning dissocierer den blå farve amylase-jod-kompleks, men dannes igen ved afkøling, fordi den spiralformede struktur er forstyrret; derved mister amylose sin jodbindingsevne og den blå farve. Den blå farve kommer igen ved afkøling på grund af genvinding af jodbindingskapacitet på grund af genvinding af den spiralformede struktur. Krav Reagens Lugols jod: 5% elementært jod blandes med 10% kaliumiodid for at danne Lugols jod. Testprøve Nødvendige materialer Reagensglas Reagensglasstativ Udstyr Vand bad Procedure 1 ml af testprøven tages i et reagensglas, hvortil der tilsættes 2-3 dråber Lugols reagens. Opløsningen blandes derefter i en hvirvel. Farven på opløsningen observeres. Reagensglassene placeres derefter i det kogende vandbad, indtil farven forsvinder. Rørene afkøles derefter, og opløsningens farve observeres og noteres. Resultat og fortolkning Figur: Observation (resultater) af jodtest for stivelse. Kilde: Comprehensive Natural Science (CNS) . Udseendet af blå-sort eller lilla farve repræsenterer en positiv test, der indikerer tilstedeværelsen af stivelse. Hvis der ikke er nogen ændring i farve, er resultatet negativt og indikerer fravær af stivelse. Noter Denne test kan ikke udføres under sure forhold, da stivelsen hydrolyseres under sådanne omstændigheder. Denne test er en kvalitativ test og indikerer ikke koncentrationen af stivelse. Emulsionstest for lipider Definition Emulsionstest, også kendt som Ethanolemulsionstesten, er en generel gruppetest til påvisning af lipider. Mål For at bestemme tilstedeværelsen af lipider i en prøve. Princip Tilstedeværelsen af lipider observeres ved fremkomsten af et uklart hvidt lag oven på reaktionsblandingen. Denne test er baseret på det faktum, at lipider opløses i ethanol (på grund af hydrofob interaktion), men ved tilsætning af vand spredes lipider spontant og danner miceller (små dråber). Disse dråber danner det øverste lag, da disse er mindre tætte end vand og ethanol, og de virker også uklare hvide, da de afleder lys. Lipiderne kommer ud af opløsningen, fordi den samlede styrke af hydrogenbindingsinteraktion mellem ethanol og vand er meget højere end hydrofobe interaktioner mellem lipider og ethanol. Krav Reagenser Ethanol Vand Nødvendige materialer Reagensglas Reagensglasstativ Pipetter Procedure Få dråber fedt- eller lipidprøve tilsættes til et reagensglas. 2 ml ethanol tilsættes til samme reagensglas. Til denne opløsning tilsættes 2 ml vand, og reagensglasset rystes godt. Udseendet af uklar suspension observeres. Resultat og fortolkning Figur: Positive resultater af emulsionstest for lipider. Kilde: Tinycards . Udseendet af uklar suspension i det øverste lag af opløsningen indikerer et positivt resultat. Dette repræsenterer tilstedeværelsen af lipider i prøven. Prøver med højt lipidindhold vil danne en tykkere uklar suspension. Fraværet af uklar emulsion indikerer et negativt resultat og fravær af lipid. Læs også: Kulhydrater- definition, klassificering med struktur og funktioner Protozoer- Definition, Karakteristika, Klassifikation, Eksempler Phylum Mollusca- karakteristika, klassifikation, eksempler Phylum Platyhelminthes- egenskaber, klassificering, eksempler Mikroskop - definition, dele, funktioner, typer, diagram, anvendelser Biuret test for proteiner Definition Biuret test, også kendt som Piotrowskis test, er en kemisk test til påvisning af peptidbindinger i en prøve og kan også bruges til kvantificering af proteiner, der allerede er i opløsning eller let opløselige i fortyndet alkali. Mål For at påvise tilstedeværelsen af proteiner eller peptidbindinger i en prøve. For at bestemme koncentrationen af proteiner til stede i en prøve. Princip Biuretreagenset indeholder natriumhydroxid, kobber(II)sulfat og kaliumnatriumtartrat. Under alkaliske forhold i biuretreaktionen (pH 14) sker deprotonering af amidnitrogenet, hvilket fører til høj elektrondensitet ved nitrogenatomet, Yderligere kobber(II)-ionkomplekser med fire peptidnitrogener for at give et tetradentate violetfarvet koordinationskompleks. Ved høj pH fører Cu 2+ binding med OH – ion til et uopløseligt bundfald, som minimeres ved tilsætning af kaliumnatriumtartrat, som stabiliserer kobber(II)ionerne. Da peptidbindinger forekommer med samme hyppighed pr. aminosyre i proteiner, kan biuret-testen bruges til at vurdere koncentrationen af proteiner. Krav Reagens Biuret-reagens: 0,3 g CuS04 og 0,9 g natrium-kaliumtartrat tilsættes til 50 ml 0,2N NaOH. Hertil tilsættes 0,5 g KI, og volumen fyldes op til 100 ml ved tilsætning af 0,2N NaOH. Prøve Nødvendige materialer Reagensglas Reagensglasstativ Pipetter Udstyr UV spektrofotometer Vortex Procedure 1 ml af prøven tages i et reagensglas, hvortil der tilsættes få dråber Biuret-reagens. Derefter blandes reagensglasset godt ved at ryste reagensglasset godt. Ændringen i opløsningens farve observeres derefter og noteres. Resultat og fortolkning Figur: Resultater af Biuret-testen for proteiner. Udseendet af den lilla farve af opløsningen indikerer et positivt resultat. Den lilla farve præsenterer omkring 5-160 mg/ml koncentration af proteiner. Fraværet af den lilla farve indikerer et negativt resultat og fraværet af proteiner i prøven. Noter Farven udviklet i denne test er stabil, men det anbefales at tage aflæsningerne af prøven inden for 10 minutter. For signifikant målbar farve er peptider med mindst tre aminosyrer nødvendige. Biuret er ikke et reagens i denne test, men testen hedder sådan, fordi reaktionen først blev opdaget med peptidlignende bindinger i biuret-molekylet. Et mere nøjagtigt navn for reagenset er testen for alkalisk kobberreagens (ACR). Kulhydrater- Definition, Klassificering Med Struktur Og Funktioner 8. januar 2022 af Anupama Sapkota Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Indholdsfortegnelse Kulhydrater Definition o o o o Reducerende og ikke-reducerende sukkerarter o o o o o o o Aldoser Ketoser Struktur Funktioner Eksempel på monosaccharid Glukose B. Disaccharider C. Polysaccharider o o o Hvad er reducerende sukkerarter? Hvad er ikke-reducerende sukkerarter? Dannelse af en glykosidbinding ved kondensation Brud af en glykosidbinding ved hydrolyse A. Monosaccharider o Hvad er monomer? Hvad er en polymer? Hvad er et makromolekyle? Hvad er kovalente bindinger? 1. Stivelse 2. Glykogen 3. Cellulose Referencer og Kilder Kulhydrater Definition Kulhydrater er en stor gruppe organiske forbindelser bestående af kulstof, brint og oxygen, som typisk kan nedbrydes til monomerer for at frigive energi i levende væsener. Disse er de mest udbredte biomolekyler i den levende krop med hensyn til masse. Kulhydrater er også kendt som saccharider, da mange af dem har en relativt lille molekylvægt med en sød smag. Dette kan dog ikke være sandt for alle kulhydrater. Den empiriske formel for kulhydrater er C m (H 2 O) n , hvilket gælder for de fleste monosaccharider. Kulhydrater er hydrater af kulstof og er bredt defineret som polyhydroxyaldehyder eller ketoner og deres derivater. Disse er vidt udbredte molekyler i både plante- og dyrevæv, der tjener som skeletstrukturer i planter og også i insekter og krebsdyr. De forekommer også som fødereserver i planters lagerorganer og dyrs lever og muskler. De er en vigtig energikilde, der kræves til de forskellige metaboliske aktiviteter af levende organismer. Planter er betydeligt mere rige på kulhydrater sammenlignet med dyr. Andre kulhydratpolymerer smører skeletled og deltager i genkendelse og adhæsion mellem celler. Glukose, saccharose, cellulose osv. er nogle af de mest kendte og vigtige kulhydrater, der findes på jorden. Hvad er monomer? En monomer er det enkleste molekyle, der danner den grundlæggende enhed af polymerer og derfor betragtes som byggestenene i polymerer. Monomerer binder med en anden monomer for at danne en kæde af gentagne molekyler ved polymerisationsprocessen. Monomerer kan være enten naturlige eller syntetiske. Naturlige monomerer er aminosyrer og monosaccharider, og eksempler på syntetiske monomerer er vinylchlorid og styren. Hvad er en polymer? En polymer er et stof, der består af store molekyler, der er sammensat af mange gentagne underenheder eller monomerer. Polymerer dannes ved binding af flere monomere enheder i processen kaldet polymerisation. Polymerer kan ligesom monomerer være både syntetiske og naturlige. Naturlige polymerer inkluderer biomolekyler som kulhydrater og proteiner, hvorimod syntetiske polymerer er polystyren og polyvinylchlorid. Hvad er et makromolekyle? Et makromolekyle er et stort molekyle sammensat af tusindvis af atomer dannet ved polymerisation af mindre underenheder kaldet monomerer. Makromolekyler er sammensat af et stort antal atomer, der er bundet sammen af kovalente bindinger. Disse makromolekyler danner sammen polymerer. Makromolekyler er også af to typer; naturlig og syntetisk. Naturlige makromolekyler er biomolekyler som kulhydrater og lipider, og syntetiske makromolekyler er syntetiske polymerer som plast og gummi. Hvad er kovalente bindinger? Figur: Dannelse af ethylglucosid fra glukose og ethanol, der viser det anomere kulstof og den resulterende glykosidbinding. Billedkilde: AxelBoldt . Monomere enheder af kulhydrater kan lide hinanden af kovalente bindinger kaldet glykosidbindinger. En glykosidbinding dannes mellem carboxylgruppen, der er til stede på det anomere carbon i en monomer, og alkoholgruppen, der er til stede i en anden monomer. Kovalente bindinger i kulhydrater er specielle bindinger, der bestemmer meget af formen af den mere komplekse forbindelse, primært fordi disse bindinger hæmmer rotationen af specifikke molekyler mod hinanden. De kovalente bindinger i kulhydrater er enten α- eller βglykosidbindinger afhængigt af stereokemien af carbonatomerne bundet sammen. Den lineære kæde i et kulhydratmolekyle indeholder enten en α-1,4glykosidbinding eller en β-1,4-glykosidbinding. Forgreningen i kulhydrater skyldes imidlertid en 1,6-glykosidbinding. Reducerende og ikke-reducerende sukkerarter Hvad er reducerende sukkerarter? Reducerende sukker er et sukker- eller et kulhydratmolekyle med en fri aldehydgruppe eller en fri ketongruppe, som får molekylet til at virke som et reduktionsmiddel. Alle monosaccharider, sammen med nogle disaccharider og polysaccharider, er reducerende sukkerarter. I tilfælde af andre polysaccharider og disaccharider forbliver aldehydog ketongrupperne bundet i den cykliske form. De fleste reducerende sukkerarter er søde i smagen. Disse sukkerarter kan påvises ved tests som Benedicts test og Fehlings test, da de giver et positivt resultat på disse tests. Eksempler på reducerende sukkerarter omfatter monosaccharider som galactose, glucose, glyceraldehyd, fructose, ribose og xylose, disaccharider som cellobiose, lactose og maltose og polymerer som glykogen. Hvad er ikke-reducerende sukkerarter? Et ikke-reducerende sukker er et sukker- eller kulhydratmolekyle, der ikke har en fri aldehyd- eller ketongruppe og derfor ikke kan fungere som et reduktionsmiddel. Ikke-reducerende sukkerarter har aldehyd- og ketongrupper, men de er involveret i sukkermolekylets cykliske form. Nogle disaccharider og alle polysaccharider er ikke-reducerende sukkerarter. Ikke-reducerende sukkerarter har en mindre sød smag end de reducerende sukkerarter. Disse sukkerarter kan også påvises ved tests som Benedicts test og Fehlings test, da de giver et negativt resultat på disse tests. Eksempler på ikke-reducerende sukkerarter omfatter disaccharider som saccharose, maltose og lactose og polysaccharider som stivelse og cellulose. Dannelse af en glykosidbinding ved kondensation Processen med dannelse af glykosidbindinger i kulhydrater er en kondensationsreaktion, som betyder, at der dannes et molekyle af vand under processen. Kondensationsreaktionen dannes mellem OH-gruppen og det anomere kulstof i et sukker. Disse glykosidbindinger dannes i en dehydreringssyntesereaktion. Når alkoholen angriber det anomere carbon, erstattes OH-gruppen i carbonet med iltatomet i alkoholmolekylet. OH-gruppen i kulstoffet og det resterende H-atom i alkoholen frigives i form af et vandmolekyle. Glykosyleringsreaktionen involverer nukleofil forskydning ved det anomere center. Da reaktionen finder sted ved det sekundære carbonatom ved angreb af svage nukleofiler (sukkeracceptorer), følger den ofte en unimolekylær SN 1 - mekanisme. Resultatet af en glykosidbinding er et sukkermolekyle bundet til et andet molekyle af en ethergruppe. Den dannede etherbinding har et oxygenatom bundet til to carbonatomer, hvilket resulterer i en relativt stabil struktur end med alkoholgruppen. Som et resultat resulterer en glykosidbinding i en mere stabil struktur af sukkeret. Brud af en glykosidbinding ved hydrolyse Brydningen af en glykosidbinding sker ved hydrolyseprocessen ved tilsætning af et vandmolekyle. Hydrolyse af glykosidbinding forekommer både i nærvær af syre eller en alkali. OH-gruppen fra vandmolekylet angriber carbonatomet involveret i glykosidbindingen. Ved syrekatalyseret hydrolyse binder hydrogenatomet sig til oxygenatomet i etherbindingen, der adskiller de monomere enheder. I tilfælde af polysaccharider resulterer hydrolyse i mindre polysaccharider eller disaccharider eller monosaccharider. I det levende system forekommer hydrolyse af polysaccharider i nærværelse af en gruppe enzymer kaldet hydrolaser, der katalyserer hydrolyseprocessen. Klassificering af kulhydrater Kulhydrater er klassificeret i tre forskellige grupper baseret på graden af polymerisation; A. Monosaccharider Monosaccharider er den enkleste form for sukker, der ikke kan hydrolyseres til mindre enheder. Monosacchariderne, ofte kaldet simple sukkerarter, er forbindelser, der har en fri aldehyd (-CHO) eller keton (= CO) gruppe og to eller flere hydroxyl (-OH) grupper. Monosaccharider betragtes som brændstofmolekyler, der er involveret i dannelsen af polymerer som polysaccharider og nukleinsyrer. Monosaccharider er yderligere opdelt i forskellige grupper baseret på forskellige karakteristika som placeringen af carbonylgruppen, antallet af carbonatomer, den indeholder, og carbonatomets stereokemi. Figur: Nogle eksempler på monosaccharider. Baseret på placeringen af carbonylgruppen er monosaccharider af to typer; Aldoser Monosaccharider med en aldehydgruppe som carbonylgruppen betegnes som aldoser. Ketoser Monosaccharider med en ketongruppe som carbonylgruppen betegnes som ketoser. Baseret på antallet af kulstofatomer er monosaccharider opdelt i trioser, tetroser, pentoser, hexoser og heptoser med tre, fire, fem, seks og syv kulstofatomer. Monosaccharider er yderligere opdelt i D- og L-former baseret på orienteringen af det asymmetriske carbon længst væk fra carbonylgruppen. Struktur Den empiriske formel for alle monosaccharider er (CH 2 )O, hvilket indikerer, at det centrale carbonatom er bundet til to hydrogenatomer og et oxygenatom. En carbonylgruppe er til stede i alle monosaccharider, hvor hvis gruppen er til stede i enden, danner den en aldose, og hvis den er til stede i midten, danner den et ketosesukker. Monosaccharider med mere end fem carbonatomer eksisterer i form af ringe i opløsningstilstanden. Ringstrukturen dannes, når hydroxylgruppen på det femte carbon reagerer med det første carbonatom. Monosaccharider er sammensat af et enkelt sukkermolekyle uden glykosidbinding. Alle monosaccharider er reducerende sukkerarter med en fri aldehydeller ketongruppe. Funktioner Monosaccharider er et af de vigtigste brændstoffer for energi i levende væsener, og de fleste af dem giver 4 kcal energi pr. gram kulhydrat. Monosaccharider er involveret i syntesen af forskellige biomolekyler som ribose og ribulose involveret i syntesen af nukleinsyrer, coenzymer som NAD, NADH, Coenzym A osv. Adskillige monosaccharider forbundet med glykosidbindinger resulterer i polymerisationsprocessen og danner større polysaccharider. I planter fungerer ribulosebiphosphat som kuldioxidacceptor under fotosyntesen. Eksempel på monosaccharid Glukose Glucose er et vigtigt monosaccharid, der giver energi og struktur til forskellige dele af en celle. Glucose er en forbindelse med seks carbonatomer med molekylformlen C 6 H 12 O 6 . Det er en aldohexose med seks carbonatomer og en fri aldehydgruppe. Glucosemolekylet eksisterer i både åben-kæde- og ringform, sidstnævnte dannet som et resultat af intermolekylær interaktion mellem aldehyd-carbonet og C-5-hydroxylgruppen. Glukose findes i to former; α-glucose og β-glucose. Hvis -OHgruppen knyttet til det anomere carbon er under ringen, er molekylet alfa-glucose, og hvis -OH-gruppen er over ringen, er molekylet beta-glucose. α-glukosen udgør den velsmagende del af planterne som frugter og blomster, hvorimod β-glukosen danner den strukturelt hårde del af planten som stilken og rødderne. Disse to former kan imidlertid konvertere hinanden, da glucosen ændrer struktur fra åben kæde til cyklisk eller ringform. Glucose er et essentielt monosaccharid, der nedbrydes under glykolyse, hvilket giver energi og forstadier til cellulær respiration. Lange kæder af glucosemolekyler er forbundet med glykosidbindinger for at danne essentielle polysaccharider som stivelse og glykogen. Glucose danner sammen med andre molekyler også grundlaget for forskellige strukturelle dele af en celle. B. Disaccharider Figur: Nogle eksempler på disaccharider. Et disaccharid er et sukkermolekyle sammensat af to monomere enheder forbundet med en glykosidbinding, der er et resultat af en kondensationsreaktion. Disaccharider er de enkleste polysaccharider sammensat af enten identiske eller to forskellige monosaccharider. De mest almindelige og umodificerede disaccharider har molekylformlen C 12 H 22 O 11 . Disaccharider er af to typer; reducerende og ikke-reducerende disaccharider. Reducerende disaccharider har en fri carbonylgruppe, hvorimod ikke-reducerende disaccharider ikke har en fri carbonylgruppe. Disaccharider som maltose, saccharose og lactose har den samme molekylære formel, men har forskellige atomarrangementer. Disaccharider er en vigtig energikilde, da de kan nedbrydes til at producere monosaccharider, der er involveret i de metaboliske veje i levende væsener. Læs også: Phylum Arthropoda- Karakteristika, klassifikation, eksempler Phylum Coelenterata (Cnidaria) - Karakteristika, klassificering, eksempler Phylum Echinodermata- Karakteristika, klassifikation, eksempler Bindevæv- definition, struktur, celler, typer, funktioner, sygdomme Celleorganeller (plante, dyr) - struktur, funktioner, diagrammer C. Polysaccharider Polysaccharider er sukkermolekyler med mere end ti monosaccharidenheder bundet sammen af glykosidbindinger. Polysaccharider kaldes også glycan. Polysaccharider er en lang kæde af monosaccharider, hvor polysaccharidet kan være enten homopolysaccharid eller heteropolysaccharid. Homopolysaccharider er dannet af identiske monosaccharider, og heteropolysaccharider er dannet af forskellige monosaccharider. Polysaccharider har forskellige former afhængigt af de tilstedeværende monosaccharider og carbonatomerne forbundet med hinanden. Nogle polysaccharider er lineære, mens andre er forgrenede. Figur: Nogle eksempler på polysaccharider. Eksempler på polysaccharider 1. Stivelse Stivelse er et polysaccharid, der omfatter glucosemonomerer forbundet med glykosidbindinger. Stivelse er en organisk forbindelse, der findes i alle levende planter, og som er fremstillet af det overskydende glukose, der produceres under fotosyntesen. Stivelse er form for reserveføde i planter opbevaret i kloroplaster i form af granulat og lagerorganer som rødder, knold, stængel og frø. Struktur Stivelse er en homoglycan sammensat af en enkelt type sukkerenhed, uanset stivelsens kilde. Et enkelt stivelsesmolekyle har 300 til 1000 glucosenheder bundet sammen. De fleste stivelser er sammensat af to slags polysaccharider, en lineær α-(1→4)-bundet glucan, kaldet amylose, og en α-(1→4)-bundet glucan med 4,2 til 5,9 % α-(1→6)-grenbindinger kaldet amylopectin. Forholdet mellem amylose og amylopectin varierer også afhængigt af stivelsens kilde; den spænder fra 17 til 70 % amylose og en tilsvarende 83 til 30 % amylopectin. α-amylose eller blot amylose har et molekylvægtområde på 10.000 til 50.000, som kan dannes i planteceller ved eliminering af et vandmolekyle fra en glycosid OH-gruppe af et α-Dglucosemolekyle og alkoholisk OH-gruppe på kulstof 4 af det tilstødende a-D-glucosemolekyle. Bindingen i amylose er således et a-1,4-glucosid. β-amylose eller amylopectin har en høj molekylvægt på 50.000 til 1.000.000, hvilket indikerer tilstedeværelsen af 300-5.500 glucosenheder pr. molekyle. Yderligere a-1,6-glucosidbindinger findes i amylopectin ud over a1,4-glucosidbindingerne. I planter er stivelsesmolekyler arrangeret i form af semi-krystallinske granulater. Funktioner Stivelse er den mest almindelige og essentielle opbevaringsform for kulhydrater i planter. Det er en vigtig energikilde i en kulhydratdiæt, hvor hydrolysen af stivelse giver glukose, som metaboliseres yderligere for at producere energi. 2. Glykogen Glykogen er et forgrenet polysaccharid, der er en vigtig form for glucose hos dyr og mennesker. Det betegnes ofte som 'animalsk stivelse' og opbevares i dyrs lever og muskler. Struktur Glykogen er et forgrenet polysaccharid og ligner amylopectin i sin struktur. Glykogenmolekyle er sammensat af glucoseunderenheder, der er bundet sammen af α-1,4-bindinger, der forgrener sig via α-1,6bindinger for hver tiende glukoserester. Disse bindinger resulterer i en spiralformet polymerstruktur, der eksisterer i form af granulat i cytoplasmaet. Glykogen ligner stivelse, men har flere grene og er mere kompakt end stivelse. Glykogen syntetiseres i kroppen, når der er et overskud af glukose produceret i kroppen. Funktioner Glykogens primære funktion er lagring af overskydende glukose i kroppen, når blodsukkerniveauet stiger. Glykogen nedbrydes derefter til glukosemolekyler for at give energi til kroppen, når blodsukkerniveauet falder. Ved at tillade dannelse og hydrolyse hjælper glykogen med at opretholde blodsukkerniveauet. About 6-10% of the weight of the liver is made up of glycogen which is converted into glucose molecules during fasting. Reserved glycogen in the muscle cells serves as a fuel or the supply of ATP during muscle contraction. 3. Cellulose Cellulose is the most abundant extracellular structural polysaccharide in plants and the most abundant of all biomolecules in the biosphere. Cellulose is found in all land plants but is absent in meat, egg, fish, and milk. It, however, cannot be metabolized by the human system. Cellulose occurs in the cell walls of plants where it contributes in a major way to the structure of the organism. Structure The molecular weight of cellulose ranges between 200,000 and 2,000,000, thus corresponding to 1,250–12,500 glucose residues per molecule. Det dannes af den glykosidiske binding mellem OH-gruppen på C1 i et β-D-glucosemolekyle og den alkoholiske OH-gruppe på C4 i det tilstødende β-D-glucosemolekyle. Det ligner i struktur med amylose, bortset fra at glucosenhederne er forbundet med β-1, 4-glucosidbindinger. Funktioner Cellulose er det vigtigste strukturelle polysaccharid i planter, der danner de forskellige strukturer af planteceller, herunder cellevæggen. Cellulose har høj stivhed og styrke, der gør det muligt for cellen at have en solid struktur og form. Cellulose kan nedbrydes til mindre monosaccharider som glucose, som derefter kan nedbrydes metabolisk for at producere energi. Det er også vigtigt for dannelsen af papir og træ. Aminosyrer Og Proteiner - Definition, Struktur, Typer, Funktioner 7. januar 2022 af Anupama Sapkota Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Indholdsfortegnelse Aminosyrer og deres struktur Hvad er proteiner? o Dannelse af peptidbinding o o o o o o o o o o o o o 1. Hæmoglobin 2. Insulin 3. Pepsin Konjugerede proteiner o 1. Kollagen 2. Keratin 3. Elastin Kugleformede proteiner o 1. Hydrogenbindinger 2. Ioniske bindinger 3. Disulfidbindinger Hydrofobe og hydrofile interaktioner Fibrøse proteiner o 1. Primær struktur 2. Sekundær struktur 3. Tertiær struktur 4. Kvartær struktur Proteinbinding o Kondensation Hydrolyse Hvad er polypeptider? Protein struktur o Syntese af peptider 1. Glykoproteiner 2. Lipoproteiner Proteindenaturering Proteiners roller og funktioner Referencer og Kilder Aminosyrer og deres struktur Proteiner er makromolekyler, der består af monomerer kaldet aminosyrer. Aminosyrer er byggestenen i alle proteiner. En aminosyre er en simpel organisk forbindelse, der består af en basisk gruppe (-NH 2 ), en sur gruppe (-COOH) og en organisk Rgruppe, der er unik for hver aminosyre. Udtrykket aminosyre er en forkortelse for alfaaminocarboxylsyre. Hvert molekyle har et centralt carbonatom, kaldet α-carbon, som begge grupper er knyttet til. De resterende to bindinger for det centrale kulstof opfyldes af hydrogenatomet og en organisk R-gruppe. Den organiske R-gruppe kan være så simpel som et hydrogenatom (H) eller en methylgruppe (— CH 3 ) eller en mere sofistikeret gruppe. Således er α-carbonet i alle aminosyrerne asymmetrisk undtagen i glycin, hvor α-carbonet er symmetrisk med et hydrogenatom som en R-gruppe. På grund af denne asymmetri eksisterer aminosyrerne (undtagen glycin) i to optisk aktive former: dem, der har - NH2- gruppen til højre, betegnes som D-former, og dem, der har - NH2- gruppen til venstre som L-former. Egenskaben til at eksistere i to optisk forskellige former betegnes som chiralitet. Aminosyrer er amfotere forbindelser med både sure og alkaliske grupper. Disse eksisterer også altid som ioner undtagen ved det isoelektriske punkt. Den generelle formel for en aminosyre er: COOH-CH-NH2 | R Hvad er proteiner? Proteiner er meget komplekse makromolekyler, der består af en eller flere lange kæder af aminosyrer forbundet med peptidbindinger. Et protein er et makronæringsstof, der er til stede i alle levende væsener og er direkte involveret i forskellige metaboliske veje. Proteiner er artsspecifikke og er unikke for hver organisme. Tilsvarende er disse også organspecifikke, idet proteinerne i hjernen er forskellige fra dem i musklerne. Proteiner består af 20 forskellige aminosyrer, og et proteinmolekyles egenskab er en funktion af de tilstedeværende aminosyrer. Planter er i stand til at syntetisere alle aminosyrer, der er nødvendige for at lave proteiner, hvorimod dyr ikke kan. Aminosyrer i proteiner er bundet sammen af peptidbindinger, der dannes mellem NH2 - gruppen i en aminosyre til COOH-gruppen i en anden aminosyre. Proteiner kaldes også polypeptider, da de er lange kæder af aminosyrer forbundet med peptidbindinger. Oprettet med BioRender.com Syntese af peptider Et peptid er en kortkædet aminosyre, som sammen med andre peptider danner et protein. Peptidkæder dannes, når to eller flere aminosyrer er forbundet med hinanden via peptidbindinger. En peptidkæde kan have så få som to aminosyrer. Længere peptider kaldet polypeptider har halvtreds til hundrede aminosyrer. Peptides are categorized into different groups based on the number of amino acids present in the peptide; peptides with two amino acids are termed dipeptides whereas, peptides with more than ten amino acids are termed polypeptides. The peptide bond formed in proteins is a special type of amide bond that exists between two molecules where an α-carboxyl group of one molecule combines with the α-amino group of another molecule. The resulting chain of amino acids is thus called a peptide. Peptide bond Formation A peptide bond is formed between two amino acid molecules where the αcarboxyl group of one amino acid molecule reacts with the α-amino group of an adjacent molecule, resulting in a special type of amide bond. Condensation The reaction involved in the formation of the peptide bond is an example of a condensation reaction resulting in dehydration (removal of water). The formation of a peptide bond begins as the carboxyl group of one amino acid moves towards the amino group of another amino acid. During the process, a hydroxyl group (OH) is lost from the carboxyl group (COOH) of the first amino acid whereas, one hydrogen is lost from the amino group (NH2) of the other amino acid. Thus, a water molecule (H2O) is released along with the formation of an amide bond (C-N) between the two amino acids. The formation of a single peptide bond between two amino acids results in a dipeptide molecule. Peptide bond formation is a dehydration synthesis reaction as this process involves the removal of a water molecule along with the synthesis of proteins. Hydrolysis Peptide hydrolysis is an essential process in some synthetic reactions where amino acids in one peptide are cleaved and transferred to another peptide, resulting in the synthesis of a separate peptide chain. Peptide bond hydrolysis is also one of the mechanisms of peptide bond degradation. It involves the cleavage of polypeptides into smaller peptides or the degradation of smaller peptides into individual amino acid molecules. Hydrolysis of the peptide bond is catalyzed by the presence of acid and involves the addition of a water molecule. During hydrolysis, a water molecule is inserted between the CO-NH bond in the peptide sequence. As a result, two amino acids are separated with terminal NH2 group in one and COOH group in another. What are polypeptides? Polypeptides are long chains of amino acids where more than ten amino acids are linked together by peptide bonds. One or more polypeptides linked together form a protein. One end of a polypeptide has a free amino group called the aminoterminal or N-terminal, whereas the other end has a free carboxyl group called the carboxyl-terminal or C-terminal. The sequence of amino acids in a polypeptide is determined by the codons present in the messenger RNA from which the polypeptide is translated. The sequence of codons in mRNA, in turn, is dependent on the nucleotide sequences in the DNA molecule. Protein struktur Fordi protein er et komplekst makromolekyle, er dets struktur blevet beskrevet ved hjælp af fire grundlæggende strukturelle niveauer i organisationen. Disse strukturelle niveauer omtales ofte som primære, sekundære, tertiære og kvartære. Tre af disse strukturelle niveauer (primære, sekundære og tertiære) kan eksistere i molekyler sammensat af en enkelt polypeptidkæde. I modsætning hertil involverer den fjerde (kvartære) interaktioner af polypeptider i et multikædet proteinmolekyle. 1. Primær struktur Den grundlæggende primære struktur af et protein er relativt enkel og består af en eller flere lineære kæder af en række aminosyreenheder. Den primære struktur af et protein angiver antallet og sekvensen af aminosyrer, som danner polypeptidkædens bestanddele. Den primære binding mellem aminosyrerne i proteiner er peptidbindingen, som forbinder α-carboxylgruppen i en aminosyrerest til α-aminogruppen i den tilstødende aminosyre. Proteinerne kan bestå enten af en eller flere polypeptidkæder. En delvis dobbeltbinding skabes mellem kulstof og nitrogen i amidbindingen, hvilket hjælper med at stabilisere peptidbindingen. En resonanseffekt skabes, når det nitrogen, der er involveret i bindingen, donerer sit enlige par til carbonylgruppen. Resonansmekanismen er meget stabiliserende, da elektronerne kan delokaliseres over flere atomer, hvilket genererer en resonansstruktur, som er stabil end den native struktur. Den således skabte resonansstruktur stabiliserer bindingen, men begrænser også rotationen af amidbindingen på grund af den partielle dobbeltbinding. Peptidbindinger skaber en plan konfiguration, der undergår minimal bevægelse omkring CN-bindingen, men de andre enkeltbindinger på hver side af CN-bindingen udviser en høj grad af rotationsbevægelse. 2. Sekundær struktur Den lineære, udfoldede primære struktur af polypeptidkæden antager ofte en spiralformet form for at producere den sekundære struktur. Den sekundære struktur af proteiner refererer til det steriske eller rumlige forhold mellem aminosyrer, der er tæt på hinanden i aminosyresekvensen. Foldningen af kæden skyldes hovedsageligt tilstedeværelsen af hydrogenbindinger, som enten kan være intramolekylære eller intermolekylære. Foldningen og hydrogenbindingen mellem tilstødende aminosyrer resulterer i dannelsen af en stiv og rørformet struktur kaldet en helix. Sekundære strukturer i proteiner er af to typer afhængigt af arten af hydrogenbindingen; α-helix og β-foldet plade. en. Alfa-helix struktur Alfa-helix-strukturen dannes, når CO-gruppen i hver aminosyre er hydrogenbundet til NH-gruppen af aminosyren, der er til stede fire rester foran i den lineære sekvens. Den a-spiralformede struktur afhænger af den intramolekylære hydrogenbinding mellem NH- og CO-grupperne af peptidbindinger. b. Beta-plisseret struktur Den β-foldede pladestruktur er dannet ved parallel opstilling af et antal polypeptidkæder med hydrogenbindinger mellem >C = O- og NH-grupperne i tilstødende kæder. R-grupperne i de indgående aminosyrer i én polypeptidkæde rager skiftevis over og under arkets plan. Dannelsen af β-foldede ark afhænger af intermolekylær hydrogenbinding, selvom intramolekylære hydrogenbindinger også er til stede. 3. Tertiær struktur Den tertiære struktur af proteinmolekylet er en tredimensionel struktur af protein dannet ved foldning af sekundær struktur i visse specifikke mønstre. Den tertiære struktur stabiliseres generelt af udvendige polære hydrofile hydrogen- og ionbindingsinteraktioner og interne hydrofobe interaktioner mellem ikke-polære aminosyresidekæder. Baseret på deres tertiære struktur opdeles proteiner ofte i kugleformede eller fibrøse typer. en. Fibrøse proteiner Fibrøse proteiner har aflange reb-lignende strukturer, der er stærke og hydrofobe og normalt består hovedsageligt af en enkelt type sekundær struktur. De strukturer, der giver støtte, form og ekstern beskyttelse til hvirveldyr, er lavet af fibrøse proteiner som α-keratin. b. Kugleformede proteiner Kugleformede proteiner indeholder ofte flere typer sekundær struktur og er mere sfæriske og hydrofile. Således er de fleste enzymer og regulatoriske proteiner som immunoglobuliner kugleformede proteiner. 4. Kvartær struktur Det tredimensionelle arrangement af proteinunderenheder i proteiner indeholdende to eller flere identiske eller forskellige polypeptidkæder eller underenheder er den kvaternære struktur. Underenhederne holdes sammen af ikke-kovalente kræfter mellem komplementære overfladehydrofobe og hydrofile områder på polypeptidunderenhederne. Disse kræfter tillader polypeptidkæderne at gennemgå hurtige konformationelle ændringer, der påvirker proteinernes biologiske aktivitet. Proteinbinding Udover de primære peptidbindinger er flere andre sekundære bindinger ansvarlige for dannelsen af den stabile netstruktur af proteiner. Nogle af de almindelige sekundære bindinger til stede i proteiner er: 1. Hydrogenbindinger En hydrogenbinding dannes i proteiner på grund af tendensen hos et brintatom, der er kovalent bundet til et elektronegativt atom, til at dele elektroner med de tilstødende atomer som O eller N. I en peptidbinding kan hydrogenbinding observeres som nedenfor: -C=O ∙∙∙∙∙∙∙∙∙∙∙∙ HNDen stiplede linje mellem oxygen- og hydrogenatomer i peptidbinding repræsenterer en hydrogenbinding. Hydrogenbinding i protein er vigtig, da den stabiliserer den sekundære struktur af proteiner. 2. Ioniske bindinger Ionbindinger i proteiner observeres mellem de sure og basiske grupper af de indgående aminosyrer. Elektrostatiske interaktioner eksisterer også mellem forskelligt ladede grupper til stede på sidekæderne af aminosyrer. Ioniserede grupper er involveret i stabilisering af interaktioner mellem protein og andre molekyler i stedet for at stabilisere proteinstrukturen. Disse ionbindinger er, selvom de er svagere end hydrogenbindingerne, ansvarlige for at opretholde den tredimensionelle struktur eller den tertiære struktur af de kugleformede proteiner. 3. Disulfidbindinger Disulfidbindingen er den anden type kovalent binding, der findes mellem aminosyrerester i proteiner og polypeptider. Denne binding dannes ved oxidation af thiol- eller sulfhydryl-(-SH)grupperne af to cysteinrester for at give cystein. Selvom disulfidbroerne er meget stærke sammenlignet med styrken af ikke-kovalente bindinger, er de af kort rækkevidde og kan kun stabilisere den tertiære struktur, når bindingen er fuldstændig dannet. Hydrofobe og hydrofile interaktioner Hydrofobe interaktioner forekommer mellem sidekæderne eller i det væsentlige hydrofobe R-grupper. Hydrofobe grupper forenes indbyrdes, hvilket forårsager eliminering af vand for at danne bindinger mellem forskellige segmenter af en kæde eller mellem forskellige kæder. Hydrofobe interaktioner kan også føre til andre bindinger som hydrogenbindinger eller ionbindinger mellem andre grupper. De hydrofobe bindinger hjælper også andre proteininteraktioner, for eksempel dannelsen af enzym-substratkomplekser og antistofantigen-interaktioner. Hydrofile interaktioner resulterer i hydrogenbinding mellem elektronegative atomer og hydrogenatomer. Fibrøse proteiner 1. Kollagen Kollagen er det mest udbredte protein hos pattedyr, der udgør omkring 25-33% af alle kroppens proteiner. Det er det vigtigste strukturelle element i den menneskelige krop, som findes i bindevæv såsom sener, brusk, den organiske matrix af knogler og øjets hornhinde. Strukturelt er kollagenhelixen en unik sekundær struktur, der er ret adskilt fra α-helixen. Den er venstrehåndet og har tre aminosyrerester pr. omgang. Kollagen er også en coiled-coil, men med distinkte tertiære og kvaternære strukturer, hvor tre separate polypeptider, kaldet αkæder, er supersnoet om hinanden. Typisk indeholder de omkring 35 % glycin, 11 % alanin og 21 % prolin og 4-hydroxyprolin. 2. Keratin Keratin eller α-keratin er et fibrøst protein, der udgør næsten hele tørvægten af hår, uld, negle, kløer, fjerpinde, horn, hove og meget af det ydre hudlag hos pattedyr. α-keratinerne er en del af en bredere familie af proteiner kaldet intermediate filament (IF) proteiner. α-keratin helix er en højrehåndet α-helix, den sekundære struktur, der findes i mange andre proteiner. To strenge af α-keratin, orienteret parallelt, er viklet om hinanden for at danne en super snoet spole, der forstærker styrken af den overordnede struktur. Et individuelt polypeptid i α-keratin coiled-coilen har en relativt simpel tertiær struktur, domineret af en α-spiralformet sekundær struktur med sin spiralakse snoet i en venstrehåndet superhelix. Sammenfletningen af de to a-spiralformede polypeptider i keratin fungerer som et eksempel på en kvaternær struktur. Figur: Fibrøst. Oprettet med BioRender.com 3. Elastin Elastin er et vigtigt protein, der findes i forskellige organer, der kræver elasticitet som lunger, blære og elastisk brusk. Polypeptidkæden består af tropoelastinprotein, der indeholder glycin og valin og modificerede alanin- og prolinrester. Det er klassificeret som et fibrøst protein på grund af dets strukturelle funktion og uopløselighed i vand. Elastin mangler en regulær sekundær struktur og har krydsbindinger af forskellige proteinsekvenser. Elastin er også rig på glycin og prolin, men det har ikke et glycinmolekyle som hver tredje rest som i kollagen. Kugleformede proteiner 1. Hæmoglobin Hæmoglobin er ilttransportøren i erytrocytter og udgør omkring 90 % af proteinet i røde blodlegemer. Det er et tetramerisk protein med fire polypeptidkæder holdt sammen af ikke-kovalente interaktioner. To af de fire polypeptidkæder er α-kæder, og de resterende to er βkæder. α- og β-kæderne af hæmoglobin indeholder flere segmenter af αhelix holdt sammen som et par af ion- og hydrogenbindinger. Tilsvarende passer de fire polypeptidkæder næsten tetraedrisk sammen for at producere den karakteristiske kvaternære struktur. 2. Insulin Insulin er et peptidhormon, der produceres af betacellerne i bugspytkirtlen, og som regulerer metabolismen af kulhydrater, fedtstoffer og proteiner. Insulin produceret i kroppen lagres i form af hexameren, men den aktive form er en monomer. Hexameren tjener som en måde at holde proteinet stabilt og beskyttet. En enkelt proteinmonomer af insulin er sammensat af 51 aminosyrer dannet af to peptidkæder forbundet med disulfidbindinger. En af kæderne har to α-helixer, mens de andre kæder har en α-helix og to β-sheets. Aminosyresekvensen i insulin er meget konserveret og adskiller sig kun lidt mellem forskellige arter. Figur: Kugleformede proteiner. Oprettet med BioRender.com 3. Pepsin Pepsin er et enzym, der nedbryder proteiner til mindre peptider eller aminosyrer. Det er en af de tre vigtige proteaser i den menneskelige krop sammen med trypsin og chymotrypsin. Pepsin frigives af cellerne på mavevæggen i form af pepsinogen, som ved blanding med saltsyre aktiveres til pepsin. Den dominerende sekundære struktur i pepsin er β-sheets sammen med seks højrehåndede α-helixer. Pepsin er også en del af osteløbe, der bruges til at stivne mælk under fremstillingen af ost. Konjugerede proteiner 1. Glykoproteiner Glykoproteiner er de proteiner, der indeholder kulhydrater som en protesegruppe. De indeholder små mængder kulhydrater (normalt mindre end 4%). Glycoproteiner fungerer som vigtige integrerede proteiner i forskellige biologiske membraner, der hjælper med celle-celleinteraktioner. Immunoglobuliner er vigtige glykoproteiner i immunsystemet, der fungerer som antistoffer og beskytter mod antigener. På samme måde findes opløselige glykoproteiner også i ægalbumin og blodplasma. Figur: Konjugerede proteiner. Oprettet med BioRender.com 2. Lipoproteiner Lipoproteiner er proteiner, der danner komplekser med lipider som cephalin, lecithin og kolesterol. Disse er opløselige i vand, men uopløselige i organiske opløsningsmidler. Lipoproteinerne fungerer som de midlertidige mellemprodukter i processen med overførsel af lipider fra absorptionsstedet til anvendelsesstedet. Lipoproteiner klassificeres i fire grupper baseret på migrationen af deres fraktion i en tæthedsgradientseparationsteknik. Læs også: Kulhydrater- definition, klassificering med struktur og funktioner Mikroskop - definition, dele, funktioner, typer, diagram, anvendelser Vand- Definition, Struktur, Karakteristika, Egenskaber, Funktioner Antistof - definition, struktur, typer, former, funktioner Kulstofkredsløb - definition, trin, eksempler, betydning, menneskelige påvirkninger Proteindenaturering Proteindenaturering er processen med ødelæggelse af den kvaternære, tertiære og sekundære struktur af proteiner ved påføring af ekstern kraft eller stærke kemikalier som syre og base. Denaturering af protein kan ødelægge celleaktivitet, da de fleste af de metaboliske veje kræver proteiner i den ene eller den anden form. Efter denaturering udviser proteiner en række egenskaber som konformationsændring og tab af opløselighed. Hydrogenbindinger, der er ansvarlige for den tertiære struktur af proteiner, er svage og bryder let med varme og stråling. Denaturering påvirker dog ikke den primære struktur af proteiner. I nogle tilfælde er denaturering reversibel, og proteinerne kan genvinde deres oprindelige form, når stressoren er fjernet. Nogle tilfælde af denaturering er dog irreversible. Proteiners roller og funktioner Proteiner er essentielle biomolekyler, der er kritiske for liv og til at udføre forskellige aktiviteter. Nogle af de vigtige biologiske roller af proteiner er: 1. Mange proteiner fungerer som katalysatorer, der øger hastigheden af kemiske reaktioner i forskellige metaboliske veje. 2. De fibrøse proteiner er en komponent af forskellige væv, der holder skeletelementerne sammen som kollagen, som er en strukturel enhed af bindevæv. 3. Nukleoproteinerne tjener som bærere af genetiske karakterer og styrer derfor nedarvningen af egenskaber. 4. Proteiner udfører også transportfunktioner, der regulerer transporten af mange forbindelser ind og ud af cellerne og akkumuleres inde i meget højere koncentrationer end forventet fra diffusion alene. 5. Forskellige proteinhormoner regulerer væksten af planter og dyr, udover at kontrollere mange andre fysiologiske funktioner. 6. Blodplasma har flere opløselige proteiner, der kan bruges til behandling af chok produceret af alvorlige skader og operationer. 7. Interferoner er regulatoriske glycoproteiner produceret af mange eukaryote celler som reaktion på virusinfektion, endotoksiner, antigene stimuli og mange parasitære organismer. 8. Peptider fra mennesker kaldet defensiner er antibiotika i naturen. Lipider- Definition, Struktur Og Funktioner, Fedtsyrer 6. januar 2022 af Anupama Sapkota Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Oprettet med BioRender.com Indholdsfortegnelse Hvad er lipider? o Triglycerider o o Struktur af triglycerider Triglyceriders funktioner Hvad er fedtsyrer? Mættede og umættede fedtsyrer o o o Alkoholer og estere 1. Mættede fedtsyrer 2. Umættede fedtsyrer Læs også: 20 forskelle mellem mættede og umættede fedtsyrer Glycerol og dannelsen af esterbindinger Fosfolipider o o 1. Hydrofile (polære) fosfathoveder 2. Hydrofobe (ikke-polære) fedtsyrehaler Steroler (kolesterol) Lipiders funktioner Referencer og Kilder Hvad er lipider? Lipider er en gruppe af forskellige makromolekyler bestående af fedtsyrer og deres derivater, der er uopløselige i vand, men opløselige i organiske opløsningsmidler. Lipider består af fedtstoffer , olier , hormoner og visse komponenter af membraner, der er grupperet sammen på grund af deres hydrofobe interaktioner. Lipiderne er væsentlige bestanddele af kosten på grund af deres høje energiværdi. Disse er også essentielle for de fedtopløselige vitaminer og de essentielle fedtsyrer, der findes sammen med fedtet i de naturlige fødevarer. Fedtstoffer kombineret med proteiner (lipoproteiner) er væsentlige bestanddele af cellens cellemembraner og mitokondrier . Lipider forekommer naturligt i levende væsener som planter, dyr og mikroorganismer, der danner forskellige komponenter som cellemembraner, hormoner og energilagringsmolekyler. Lipider findes i enten flydende eller ikke-krystallinske faste stoffer ved stuetemperatur og er farveløse, lugtløse og smagløse. Disse er sammensat af fedtsyrer og glycerol. Alkoholer og estere Oprettet med BioRender.com Den vigtigste og hyppigste alkohol, der findes i lipider, er glycerol. Glycerol er et lille organisk molekyle bestående af tre hydroxylgrupper (OH-). Glycerol udgør simple lipider, som er estere af fedtsyrer og glycerol og lignende alkoholer. Alkoholen kan være glycerol eller anden langkædet alkohol. De langkædede alkoholer er for det meste mono-hydroxy med en enkelt OH-gruppe. Afhængigt af den anvendte alkohol består simple lipider af fedtstoffer, olie eller voks. Fedtstoffer og olier er estere af fedtsyrer og glycerol, hvorimod voks er estere af fedtsyrer og langkædede alkoholer. Esterne af fedtsyrer dannes efter dehydreringsreaktionen mellem fedtsyrerne og alkoholmolekylerne. Triglycerider Triglycerider er en type lipid, som er en ester af tre fedtsyrer med glycerol. Triglycerider er hovedbestanddelene af kropsfedt hos mennesker, andre hvirveldyr og vegetabilske fedtstoffer. Struktur af triglycerider Triglycerider er tri-estere, hvor tre fedtsyremolekyler er bundet til et enkelt glycerolmolekyle af kovalente esterbindinger. Reaktion HOCH 2 CH(OH)CH 2 OH + RCO 2 H + R′CO 2 H + R″CO 2 H → RCO 2 CH 2 CH(O 2 CR′)CH 2 CO 2 R″ + 3H 2 O De tre fedtsyrer, der er involveret i kondensationsreaktionen, er normalt forskellige, og deres kædelængde er også forskellig fra hinanden. I naturligt forekommende triglycerider indeholder fedtsyrekæderne for det meste 16, 18 eller 20 kulstofatomer. Lige carbonatomer til stede i dyr og planter, der angiver vejen for deres biosyntese fra to-carbon acetyl CoA. Simple triglycerider kan også have identiske fedtsyrer, der danner homotriglycerider. Ladningerne i triglycerider er jævnt fordelt rundt om molekylerne, hvilket forhindrer dannelsen af brintbindinger med vandmolekyler, hvilket gør dem uopløselige i vand. Oprettet med BioRender.com Triglyceriders funktioner Triglycerider er vigtige makromolekyler, da de lagrer det meste af energien i kroppen. Disse lagres i fedtceller, som derefter frigives til blodbanen ved påvirkning af forskellige hormoner, når det er nødvendigt. Fedtet lagret i kroppen danner et lag af isolering under huden, som er med til at holde kropstemperaturen. Triglycerider hjælper også med absorption og transport af fedtopløselige vitaminer i kroppen. Hvad er fedtsyrer? Fedtsyrer er organiske molekyler, der er langkædede carboxylsyrer med 4-36 kulstofatomer. Kulbrintekæderne er enten mættede eller umættede, afhængigt af bindingerne mellem kulstofatomerne. Hvis alle carbon-carbonbindinger er enkeltstående, er syren mættet; hvis en eller flere carbon-carbon dobbeltbindinger er til stede, er syren umættet. Naturligt forekommende fedtsyrer er for det meste uforgrenede, og disse forekommer i tre hovedklasser af lipider; triglycerider, phospholipider og cholesterylestere. Fedtsyrer findes ikke i fri tilstand, men forbliver forbundet med alkohol for at danne triglycerider. Fedtsyrer lagres som en energireserve (fedt) gennem en esterbinding til glycerol for at danne triglycerider. Oprettet med BioRender.com Mættede og umættede fedtsyrer 1. Mættede fedtsyrer Mættede fedtsyrer er den enkleste form for fedtstoffer, der er uforgrenede lineære kæder af CH 2 -grupper, der er forbundet med carbon-carbon-enkeltbindinger med en terminal carboxylsyre. Udtrykket 'mættet' bruges til at angive, at det maksimale antal brintatomer er bundet til hvert kulstofatom i et fedtmolekyle. Den generelle formel for disse syrer er CnH2n + 1COOH . Fedtsyrer opnået fra en animalsk kilde er for det meste lige nummererede lineære kæder af mættede fedtsyrer. Mættede fedtsyrer har normalt et højere smeltepunkt end deres modstykker, hvorfor mættede fedtsyrer forbliver i fast tilstand ved stuetemperatur. Disse er for det meste faste og findes i animalsk fedt som smør, kød og sødmælk. Men nogle mættede fedtsyrer findes også i vegetabilske kilder som vegetabilsk olie, kokosolie og jordnøddeolie. 2. Umættede fedtsyrer Umættede fedtsyrer er mere komplekse fedtsyrer med bøjede carbonhydridkæder forbundet med en eller flere carbon-carbondobbeltbindinger med en terminal carboxylsyregruppe. Udtrykket "umættet" angiver, at carbonatomerne ikke har de maksimalt mulige hydrogenatomer bundet til carbonatomer. På grund af tilstedeværelsen af dobbeltbindinger er cis- og transkonformationen af disse molekyler vigtige. De umættede fedtsyrer, der findes i den menneskelige krop, findes i cis-konformationen Umættede fedtsyrer har et lavere smeltepunkt sammenlignet med mættede fedtsyrer, og de eksisterer derfor i flydende tilstand ved stuetemperatur De fleste vegetabilske olier og fiskeolier er nogle af de vigtige kilder til umættede fedtsyrer. Læs også: 20 forskelle mellem mættede og umættede fedtsyrer Glycerol og dannelsen af esterbindinger Billedkilde: Wikipedia . Glycerol er en simpel organisk forbindelse i tre hydroxylgrupper, der er en farveløs, lugtfri og tyktflydende væske. Det danner rygraden i mange lipider, der kaldes glycerider. Fedtet hydrolyseres senere til fedtsyrer og glycerol, hvor fedtsyren giver energi til kroppen, hvorimod glycerol omdannes til glukose. Reaktionen involveret i dannelsen af esterbindinger betegnes som kondensationsreaktion, hvor den frie hydroxyl-ende af glycerolmolekylet slutter sig til OH i COOH-gruppen af fedtsyren. Kondensationsprocessen kaldes esterificering på grund af dannelsen af esterbindinger mellem de to molekyler. Lipidmolekylerne dannet af tre fedtsyrer og et enkelt glycerolmolekyle betegnes som triacylglyceroler eller triglycerider. Fosfolipider Et fosfolipid er et organisk molekyle bestående af fedtsyrer, en fosfatgruppe og en glycerolgruppe, der udgør hovedkomponenten i forskellige cellulære membraner. Fosfolipid-dobbeltlag udgør en vigtig del af cellemembranen til den selektive transport af molekyler ind og ud af cellen. Fosfatgruppen danner det hydrofile hoved, hvorimod fedtsyrerne danner de hydrofobe haler. Hoved- og haleregionerne i fosfolipider er forbundet af et glycerolmolekyle. Den hydrofobe og hydrofile interaktion mellem forskellige molekyler og lipiddobbeltlaget muliggør passage af biomolekyler. Disse interaktioner gør cellemembranen amfipatisk. 1. Hydrofile (polære) fosfathoveder Det hydrofile hoved eller vandelskende del af fosfolipiderne indeholder en negativt ladet fosfatgruppe med en uidentificeret alkylgruppe. Det hydrofile område kan være polært eller ladet. Fosfolipidmembranens hoveder vender udad, der forbliver i vekselvirkning med den vandige opløsning inden i og uden for cellen. Da vand er et polært molekyle, danner det hydrofile hoved straks elektrostatisk interaktion med vandmolekylet. Oprettet med BioRender.com 2. Hydrofobe (ikke-polære) fedtsyrehaler Den hydrofobe del af fosfolipid-dobbeltlaget kaldes også for den vand-frygtede del, der består af lange ikke-polære fedtsyrehaler. Disse haler interagerer let med andre hydrofobe molekyler, men interagerer ikke med vandmolekyler. Haleregionen er en ikke-polær ende, hvor ladningsløse molekyler er til stede. De hydrofobe haler er således gemt mod det indre af membranen for at afskærme halerne fra det omgivende vand. Denne ordning er også energetisk gunstig. De hydrofobe interaktioner danner en god barriere mellem indersiden og ydersiden af cellen som vand, og andre ladningsmolekyler kan ikke uden videre krydse den hydrofobe kerne af membranen. Læs også: Aminosyrer og proteiner - definition, struktur, typer, funktioner Celleorganeller (plante, dyr) - struktur, funktioner, diagrammer P-værdi- definition, formel, tabel, finde p-værdi, signifikans Graviditet uge for uge (baby og kropsudvikling, tips) Kulhydrater- definition, klassificering med struktur og funktioner Steroler (kolesterol) Steroler er en type lipider sammensat af steroidalkoholer, der forekommer naturligt i planter, dyr, svampe og flere bakterier. Den vigtigste og mest velkendte type sterol er kolesterol, som spiller en væsentlig rolle i cellemembranstruktur og -funktioner. Kolesterol fungerer som en forløber for fedtopløselige vitaminer som D-vitamin og hormoner. Kolesterol er dannet af fire forbundne carbonhydridringe, der danner hovedparten af steroidstrukturen. Den ene ende af kolesterol består af en kulbrintehale, mens den anden ende er knyttet til en alkoholgruppe. Hydroxylgruppen forbinder sig med andre hydroxylgrupper eller carbonyloxygen af fosfolipider. Kolesterol kan biosyntetiseres i kroppen af forskellige dyr. Hos mennesker udgør leveren 100 % af alt kolesterol, der kræves til kroppen. Kolesterol anses for at være afgørende for reguleringen af membranfluiditet hos dyr. Det øger også cellemembranens permeabilitet for natrium- og kaliumioner. Men hvis koncentrationen af kolesterol stiger ud over det normale, kan det kombineres med andre komponenter i blodet og danne plak. Plakken kan binde sig til væggene i arterier og vener, hvilket resulterer i koronararteriesygdom. Lipiders funktioner Biologiske lipider er en kemisk forskelligartet gruppe af forbindelser, og lipidernes biologiske funktioner er lige så forskellige som deres kemi. I kroppen fungerer fedt som en effektiv energikilde og lagres også i fedtvævet. Disse tjener også som et isolerende materiale i det subkutane væv og omkring visse organer. Fosfolipider og steroler er vigtige strukturelle elementer i biologiske membraner. Tilsvarende er fedtstoffer kombineret med proteiner (lipoproteiner) vigtige bestanddele af cellens cellemembraner og mitokondrier. Lipider fungerer også som cellens strukturelle komponent og tilvejebringer den hydrofobe barriere, der tillader adskillelse af det vandige indhold af cellen og subcellulære strukturer. Andre lipider, selvom de er til stede i relativt små mængder, spiller afgørende roller som enzymcofaktorer, elektronbærere, lysabsorberende pigmenter og hydrofobe ankre for proteiner. Kolesterol fungerer som en forløber for fedtopløselige vitaminer som D-vitamin og hormoner. Lipider er også aktivatorer af enzymer som glucose-6-phosphatase, β-hydroxybutyric dehydrogenase og stearyl CoA desaturase. Enzymer- Definition, Struktur, Typer, Virkemåde, Funktioner 5. januar 2022 af Anupama Sapkota Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Indholdsfortegnelse Enzymer Definition o o Enzymer og aktiveringsenergi Enzymes struktur o o o o Aktivt sted for enzymer Enzym-substrat kompleks Enzymspecificitet Funktioner / biologiske roller af enzymer Enzymkatalyserede reaktioner Cofaktorer og coenzymer o o 1. Lås og nøgle hypotese 2. Induceret fit-hypotese Enzymers egenskaber o 1. Ribonuklease (RNase) 2. Lysozym 3. Chymotrypsin Hvordan virker enzymer? o 1. Intracellulære enzymer 2. Ekstracellulære enzymer Hvad er kofaktorer? Hvad er coenzymer? Referencer og Kilder Enzymer Definition Et enzym er et proteinbiomolekyle , der fungerer som en biokatalysator ved at regulere hastigheden af forskellige metaboliske reaktioner uden selv at blive ændret i processen. Navnet 'enzym' betyder bogstaveligt 'i gær', og dette blev henvist til at betegne en af de vigtigste reaktioner involveret i produktionen af ethylalkohol og kuldioxid gennem agenturet af et enzym zymase, der er til stede i gær. Enzymer er biologiske katalysatorer, der katalyserer mere end 5000 forskellige biokemiske reaktioner, der finder sted i alle levende organismer. Disse er dog forskellige fra andre katalysatorer, som er kemiske og kan holde i det uendelige. Enzymer er proteiner, der er tilbøjelige til at beskadige og inaktivere. Enzymer er også meget specifikke og virker normalt på et specifikt substrat af specifikke reaktioner. Oprettet med BioRender.com 1. Intracellulære enzymer De enzymer, der virker i cellerne, hvori de produceres, kaldes intracellulære enzymer eller endoenzymer. Da disse enzymer katalyserer de fleste af cellens metaboliske reaktioner, omtales de også som metaboliske enzymer. De fleste af enzymerne i planter og dyr er intracellulære enzymer eller endoenzymer. Intracellulære enzymer nedbryder normalt store polymerer til mindre kæder af monomerer. Alle intracellulære enzymer gennemgår intracellulær fordøjelse under celledød. 2. Ekstracellulære enzymer De enzymer, der frigives af levende celler og katalyserer nyttige reaktioner uden for cellen, men i dens miljø, er kendt som ekstracellulære enzymer eller exoenzymer. Exoenzymer fungerer hovedsageligt som fordøjelsesenzymer, der katalyserer nedbrydningen af komplekse makromolekyler til enklere polymerer eller monomerer, som derefter let kan absorberes af cellen. Disse virker for det meste i slutningen af polymerer for at nedbryde deres monomerer en ad gangen. Exoenzymer er enzymer, der findes i bakterier, svampe og nogle insektædere som Drosera og Nepenthes. Ekstracellulære enzymer, i modsætning til intracellulære enzymer, gennemgår ekstern fordøjelse under celledød. Enzymer og aktiveringsenergi Ifølge overgangstilstandsteorien, for at en kemisk reaktion kan forekomme mellem to reaktantmolekyler, skal deres frie energiniveau hæves over et tærskelniveau for at bringe dem til en højenergiovergangstilstand. Den frie energi, der er nødvendig for at hæve et molekyle fra dets stabile lavenergigrundtilstand til en ustabil tilstand med højere energi, er kendt som aktiveringsenergi. Hastigheden af en reaktion afhænger af antallet af reaktantmolekyler, der har nok energi til at nå overgangstilstanden for det langsomste trin (hastighedsbestemmende trin) i reaktionen. Som regel besidder meget få molekyler nok energi til at nå overgangstilstanden. Enzymer reducerer imidlertid værdien af aktiveringsenergi for en reaktion og øger derved fænomenalt reaktionshastigheden. Nogle enzymer sænker aktiveringsenergien, efter at enzymet danner et kompleks med substratet, som ved at bøje substratmolekyler på en måde letter bindingsbrud. Andre enzymer fremskynder reaktionen ved at bringe de to reaktanter tættere på i den rigtige orientering. Enzymes struktur Alle enzymer er proteiner sammensat af aminosyrekæder forbundet med peptidbindinger. Dette er den primære struktur af enzymer. Alle enzymer har et meget specifikt bindingssted eller aktivt sted, som deres substrat binder til for at producere et enzym-substratkompleks. De tredimensionelle strukturer af mange proteiner er blevet observeret ved røntgenkrystallografi. Disse strukturer adskiller sig fra et enzym til et andet, og nogle af enzymerne og deres struktur er beskrevet nedenfor: 1. Ribonuklease (RNase) Ribonuklease er et lille kugleformet protein, der udskilles af bugspytkirtlen i tyndtarmen, hvor det er involveret i katalysen af hydrolysen af visse bindinger i ribonukleinsyrer, der findes i indtaget mad. Dette enzymprotein består af en enkelt polypeptidkæde på 124 aminosyrerester med lysin i N-terminalen og valin i C-terminalen. Omkring 25% af segmenterne er i α-helixstruktur, mens resten er βsheets. Desuden er der otte cysteinrester, som tilsyneladende danner fire disulfidbindinger, der understøtter proteinets tertiære struktur. Det aktive sted er til stede i fordybningen i midten af kæden, og resterne, der danner det aktive sted, er 6-8, 11, 12, 41, 42, 46-48 og 117-119. 2. Lysozym Lysozym er et andet lille kugleformet protein, der er til stede i tårer, næseslim, mavesekret, mælk og æggehvide. Enzymet lysozym består af 129 aminosyrer bundet sammen for at danne den primære struktur, og den første aminosyre er lysin. Enzymet har ca. 12% β-konformation og 40%-α heliske segmenter. Lysozym har en kompakt foldet konformation med de fleste af dets hydrofobe R-grupper inde i den kugleformede struktur, væk fra vand, og dets hydrofile R-grupper udenfor, vendt mod det vandige medium. Det aktive sted har seks understeder, der binder forskellige substrater eller inhibitorer, og aminosyreresterne på de aktive steder er 35, 52, 59, 62, 63 og 107. 3. Chymotrypsin Chymotrypsin er et pattedyrs fordøjelsesenzym, der produceres i tyndtarmen, og som katalyserer hydrolysen af proteiner. Chymotrypsin er yderst selektiv i sin virkning, da det kun katalyserer hydrolysen af de peptidbindinger, der er til stede på carboxylsiden af aminosyrer med aromatiske eller voluminøse hydrofobe Rgrupper. Et molekyle af chymotrypsin består af 3 korte polypeptidkæder på henholdsvis 13, 131 og 97 aminosyrerester, understøttet af to interkæde- disulfidbindinger. Den sekundære struktur af chymotrypsin består af adskillige antiparallelle β-plisserede arkområder og en lille α-spiralstruktur. Hvordan virker enzymer? Virkningsmekanismen af enzymer i en kemisk reaktion kan forekomme på flere måder; substratbinding, katalyse, substratpræsentation og allosterisk modulering. Men den mest almindelige virkemåde for enzymer er ved binding af substratet. Et enzymmolekyle har et specifikt aktivt sted, hvortil dets substrat binder og producerer et enzym-substratkompleks. Reaktionen fortsætter ved bindingsstedet for at producere de produkter, som forbliver forbundet kortvarigt med enzymet. Produktet frigives derefter, og enzymmolekylet frigøres i en aktiv tilstand for at starte endnu en katalyserunde. For at beskrive virkningsmekanismen af enzymer til forskellige modeller er blevet foreslået; 1. Lås og nøgle hypotese Billedkilde: BioNinja . Lås- og nøglemodellen blev foreslået af Emil Fischer i 1898 og er også kendt som skabelonmodellen. Ifølge denne model sker bindingen af substratet og enzymet på det aktive sted på en måde, der ligner den, hvor en nøgle passer til en lås og resulterer i dannelsen af et enzym-substratkompleks. Faktisk afhænger enzym-substratbindingen af en gensidig tilpasning mellem enzymets og substratets molekylære struktur. Det dannede enzym-substratkompleks er meget ustabilt og nedbrydes næsten øjeblikkeligt for at producere slutprodukterne af reaktionen og for at regenerere det frie enzym. Denne proces resulterer i frigivelse af energi, som igen hæver energiniveauet af substratmolekylet, og dermed inducerer den aktiverede eller overgangstilstand. I denne aktiverede tilstand bliver nogle bindinger af substratmolekylet gjort modtagelige for spaltning. Denne model har imidlertid få ulemper, da den ikke kan forklare stabiliteten af enzymets overgangstilstand og også konceptet med stivheden af det aktive sted. 2. Induceret fit-hypotese Billedkilde: BioNinja . Hypotesen om induceret pasform er en modificeret form af låse- og nøglehypotesen foreslået af Koshland i 1958. Ifølge denne hypotese bevarer enzymmolekylet ikke sin oprindelige form og struktur. I stedet inducerer kontakten af substratet nogle konfigurationsmæssige eller geometriske ændringer i det aktive sted af enzymmolekylet. Som et resultat er enzymmolekylet lavet til at passe fuldstændigt til konfigurationen og aktive centre af substratet. I mellemtiden forbliver andre aminosyrerester begravet i det indre af molekylet. Imidlertid kan rækkefølgen af begivenheder, der resulterer i konformationsændringen, være anderledes. Nogle enzymer kan først gennemgå en konformationsændring og derefter binde substratet. I en alternativ vej kan substratet først bindes, og derefter kan en konformationel ændring forekomme i det aktive sted. For det tredje kan begge processer forekomme samtidig med yderligere isomerisering til den endelige bekræftelse. Enzymers egenskaber Enzymmolekyler er store, og på grund af deres store størrelse har enzymmolekylerne ringe diffusionshastigheder. Som et resultat danner enzymer kolloide systemer i vand. Enzymer virker katalytisk og accelererer hastigheden af kemiske reaktioner, der forekommer i biologiske systemer og involverer biologisk substrat. De fleste enzymer deltager heller ikke i de reaktioner, de katalyserer. Tilsvarende genvindes nogle enzymer, der er involveret i reaktionen, uden at undergå nogen kvalitativ eller kvantitativ ændring ved reaktionens afslutning. De fleste enzymer er meget specifikke i deres virkning. Da enzymerne er proteinholdige i naturen, er de modtagelige for varme. Hastigheden af en enzymvirkning stiger med stigningen i temperaturen; hastigheden øges ofte 2 til 3 gange for en temperaturstigning på 10ºC. Enzymerne katalyserer reversionen af de reaktioner, de katalyserer. Enzymer er også pH-følsomme, da pH - værdien af et medium vil påvirke effektiviteten af et enzym, og deres aktivitet er maksimal ved en specifik pH. Aktivt sted for enzymer Enzymer er meget større end det substrat, de virker på, og derfor er der nogle specifikke regioner eller steder på enzymet til binding til substratet, kaldet aktive steder. Selv i enzymer, der adskiller sig meget i deres egenskaber, har det aktive sted i deres molekyle nogle fælles træk; 1. 0. Det aktive sted for et enzym er en relativt lille del i et enzymmolekyle. 1. Det aktive sted er en 3-dimensionel enhed, der består af grupper, der kommer fra forskellige dele af den lineære aminosyresekvens. 2. Arrangementet og orienteringen af atomer i det aktive sted er veldefinerede og meget specifikke, hvilket er årsagen til enzymernes markante specificitet. Men i nogle tilfælde ændrer det aktive sted sin konfiguration for at binde et stof. 3. Interaktionerne eller kræfterne mellem det aktive sted og substratmolekylet er relativt svage. 4. De aktive steder i enzymmolekylerne er for det meste til stede i riller eller sprækker, hvorfra store mængder vand er udelukket. Enzym-substrat kompleks Enzym-substrat-komplekset er et overgangsmolekyle, der dannes efter, at substratet binder sig til enzymet. Dannelsen af enzym-substratkomplekset er vigtig af flere årsager. Den vigtigste og mest bemærkelsesværdige årsag er, at substratet binder sig til enzymet midlertidigt, og enzymet frigives, når reaktionen er afsluttet. Dette gør det muligt at bruge et enkelt enzymmolekyle millioner af gange, og derfor kræves der kun en lille mængde enzym i hver celle. En anden fordel ved et enzym-substratkompleks er reduktionen i den frie energi (aktiveringsenergi), der kræves for, at substratet kan stige til højenergiovergangstilstanden. Enzymspecificitet De fleste enzymer er meget specifikke over for det substrat, de virker på. Enzymspecificitet eksisterer på en måde, så de kan virke på én specifik type substratmolekyle eller på en gruppe af strukturelt beslægtede forbindelser eller på kun én af de to optiske isomerer af en forbindelse eller kun én af de to geometriske isomerer. Baseret på dette er fire mønstre for enzymspecificitet blevet anerkendt; 1. Absolut specificitet Nogle enzymer er kun i stand til at virke på ét substrat, og et eksempel på dette er enzymet urease, der kun virker på urinstof for at producere ammoniak og kuldioxid. 2. Gruppespecificitet Andre enzymer katalyserer alle reaktioner af en strukturelt beslægtet gruppe af forbindelser. Det er observeret i mælkesyredehydrogenase (LDH), der katalyserer indbyrdes omdannelse af pyrodruesyre og mælkesyre sammen med en række andre strukturelt beslægtede forbindelser. 3. Optisk specificitet En anden vigtig form for specificitet ses i nogle enzymer, hvor et bestemt enzym vil reagere med kun en af de to optiske isomerer af en forbindelse. Oxidationen af D-aminosyrerne til de tilsvarende ketosyrer med aminosyreoxidase er et eksempel på optisk specificitet. Blandt de enzymer, der udviser optisk specificitet, kan nogle interkonvertere de to optiske isomerer af en forbindelse. Et eksempel på dette er alanin racemase , der katalyserer interkonverteringen mellem L- og D-alanin. 4. Geometrisk specificitet Geometrisk specificitet observeres i nogle enzymer, der udviser specificitet over for cis- og trans-formerne. Et eksempel på dette er enzymet fumarase , der katalyserer indbyrdes omdannelse af fumarsyre og æblesyre Funktioner / biologiske roller af enzymer Enzymer er afgørende for alle biologiske processer, der hjælper med fordøjelsen og stofskiftet. Desuden er disse også involveret i flere andre processer; 1. Enzymer som kinaser og fosfataser er vigtige for celleregulering og signaltransmission. 2. Forskellige enzymer produceres i hele kroppen til regulering af reaktioner involveret i forskellige metaboliske veje. 3. Aktiveringen og inhiberingen af enzymer, der resulterer i en negativ feedback-mekanisme, justerer syntesehastigheden af mellemmetabolitter i overensstemmelse med cellernes behov. 4. De katalyserer også post-translationelle modifikationer, der involverer phosphorylering, glycosylering og spaltning af polypeptidkæden. 5. Nogle enzymer er også involveret i reguleringen af enzymniveauer ved at ændre hastigheden af enzymnedbrydning . 6. Da en stram regulering af enzymer er afgørende for homeostase, kan enhver ændring i enzymstrukturen og produktionen resultere i sygdomme . 7. Enzymer syntetiseret i forskellige organismer bruges også i forskellige industrier til vinproduktion, osteproduktion, brødblegning og design af stof . Læs også: Kulstofkredsløb - definition, trin, eksempler, betydning, menneskelige påvirkninger Fotosyntese- Definition, ligning, trin, proces, diagram Graviditet uge for uge (baby og kropsudvikling, tips) Celleorganeller (plante, dyr) - struktur, funktioner, diagrammer Aminosyrer og proteiner - definition, struktur, typer, funktioner Enzymkatalyserede reaktioner Nogle eksempler på enzymkatalyserede reaktioner omfatter; 1. Inversion af rørsukker Invertase omdanner rørsukker til glukose og fruktose. invertase C 12 H 22 O 11 + H 2 O → C 6 H 12 O 6 + C 6 H 12 O 6 (saccharose/rørsukker) (glukose) (fructose) 2. Nedbrydning af urinstof Urease katalyserer nedbrydningen af urinstof til ammoniak og kuldioxid. urease (NH 2 ) 2 CO + H 2 O → 2NH 3 + CO 2 (urinstof) (ammoniak) (kuldioxid) 3. Isomeriseringsreaktion Isomerase-enzym katalyserer omdannelsen af glyceraldehyd-3phosphat til dihydroxy-acetone-phosphat. 4. Proteinfordøjelse Pepsin omdanner proteiner til kortere polypeptider. pepsin Proteiner → polypeptider Cofaktorer og coenzymer Hvad er kofaktorer? Cofaktorer er ikke-proteinmolekyler, der er nødvendige for, at nogle enzymer kan vise deres fulde aktivitet. Kofaktorer kan enten være uorganiske forbindelser som metalioner eller organiske forbindelser som flavin og hæm. Nogle cofaktorer som zinkatom i carbonanhydrase findes tæt bundet til enzymets aktive sted og hjælper med katalyse. De enzymer, der kræver cofaktorer, kaldes apoenzymer, når de ikke har en cofaktor bundet til sig. Men når cofaktorerne er bundet, betegnes enzymet som holoenzymer. Hvad er coenzymer? Coenzymer er mindre organiske molekyler, der er løst bundet til nogle enzymer. Coenzymers primære funktion er at transportere kemiske grupper fra et enzym til et andet. Almindelige coenzymer omfatter NADH, NADPH og ATP, og nogle er forbindelser afledt af vitaminer. Coenzymer bliver normalt ladninger som følge af enzympåvirkning, hvorfor disse også betragtes som sekundære substrater. I nogle enzymer frigives coenzymer fra enzymet under den kemiske reaktion. Niveauet af coenzymer regenereres løbende og holdes på et stabilt niveau i kroppen. Faktorer, Der Påvirker Enzymvirkning Og Immobiliserede Enzymer 4. januar 2022 af Anupama Sapkota Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Faktorer, der påvirker enzymvirkningen Enzymer er biologiske katalysatorer, der accelererer hastigheden af kemiske reaktioner i det biologiske system af levende væsener. Ligesom katalysatorer påvirkes enzymer også af en række faktorer, der regulerer enzymvirkningen. Disse faktorer er relateret til den kemiske natur af enzymer, da enzymer er proteiner, og proteiner påvirkes af de fleste af disse faktorer. Nogle af de faktorer, der påvirker enzymvirkningen, er beskrevet nedenfor: Indholdsfortegnelse 1. Temperatur 2. pH (ved hjælp af bufferopløsninger) 3. Enzymkoncentration 4. Underlagskoncentration 5. Inhibitorkoncentration Affinitet af forskellige enzymer til deres substrat Enzym immobiliseret i alginat og enzymer fri i opløsning Fordele ved at bruge immobiliserede enzymer Referencer og Kilder 1. Temperatur Enzymer er termolabile eller varmefølsomme, fordi de er proteinholdige i naturen. Temperaturen påvirker reaktionshastigheden ved at ændre aktiviteten af det involverede enzym. Ligesom i de fleste proteiner stiger hastigheden af et enzyms virkning med stigningen i temperaturen. Hastigheden øges med to til tre gange for hver 10°C temperaturstigning. Men når temperaturen bliver høj, falder aktiviteten af et enzym. Temperaturer over 60°C forårsager ødelæggelse og koagulering af enzymer. Denne temperatur er skadelig for enzymatiske reaktioner, da enzymernes struktur ændres irreversibelt. Nogle enzymer, der findes i tørt væv, kan dog tåle højere temperaturer som 100°C til 120°C. Mens man studerer effekten af stigende temperatur, kan det observeres, at reaktionens begyndelseshastighed støt stiger med temperaturen. Men når en bestemt temperatur er krydset, begynder den enzymatiske aktivitet at ophøre med mindre og mindre produkt, der dannes. Denne særlige temperatur eller temperaturområde betegnes som en optimal temperatur for et enzym. Denne temperatur er ikke let at bestemme, netop fordi det er et noget vagt begreb, og vil afhænge af, hvor lang tid målingerne foretages over. På trods af det viser de opnåede omtrentlige værdier ofte en tydelig sammenhæng med kropstemperaturerne for de organismer, som enzymet kom fra. Enzymer fundet i pattedyr har således en optimal temperatur i området 35°C til 45°C, men enzymer i bakterier, der lever i varme kilder, kan have en optimal temperatur på 80°C. Ved lave temperaturer dominerer enzymets katalytiske aktivitet, selvom der finder en vis termisk denaturering sted i denne periode. Når temperaturen når 0°C, kan inaktivering af enzymet observeres, hvilket er en reversibel type ændring, og enzymet genvinder sin katalyserende kraft ved at øge temperaturen til det optimale. Effekten af temperatur og varme observeres også under lagring af enzymer, da den bedste konservering af enzympræparater er ved nedkøling eller hurtig frysning. 2. pH (ved hjælp af bufferopløsninger) pH er en anden vigtig parameter, der påvirker enzymets aktivitet ved at ændre dets form og struktur. Ligesom temperatur medfører pH eller H+ ionkoncentrationen af mediet, hvor enzymet er til stede, betydelige ændringer i aktiviteten af sådanne enzymer. Ændringen i pH forårsager ionisering af aminosyreatomer og molekyler, mens den også ændrer graden af dissociation af substratet. Desuden kan en ændring i pH også medføre ændringer i de ladninger, der er til stede på enzymet, hvilket påvirker dannelsen af enzym-substratkomplekset. Enzymer har således en særlig værdi af pH eller koncentration af H+ ion, ved hvilken enzymet virker bedst. Enzymets aktivitet falder imidlertid med enhver ændring (stigning eller fald) i nævnte pH-værdi. Denne specifikke pH, hvor aktiviteten af et enzym er maksimal, betegnes som den optimale pH for det pågældende enzym. Denne pH kan være specifik for hvert enzym og bestemmes af forskellige faktorer som enzymets sammensætning og struktur. Andre faktorer, der bestemmer den optimale pH-værdi for et enzym, omfatter arten af buffersystemet, tilstedeværelsen af andre kolloider, aktivatorer eller inhibitorer, cellevævets alder og substratets beskaffenhed. Ændring i pH-værdien af den anvendte bufferopløsning medfører ændringer i aktiviteten af et enzym, da det påvirker enzymets struktur og form. Brugen af forskellige bufferopløsninger med lavere eller højere pHværdier kan påvirke ioniseringstilstanden af de sure (carboxyl) eller basiske (amin) grupper. Med ændringen i aminosyrens ioniserede tilstand påvirkes også de ioniske bindinger, der opretholder enzymernes tredimensionelle struktur. Dette kan føre til en reduktion i enzymaktivitet og endda inaktivering. pH viser sig også at ændre strukturen og formen af substrater, hvilket forhindrer binding af substrat til enzymets aktive sted. Disse ændringer kan være reversible for et snævert pH-område, men hvis pH-ændringen er signifikant, kan enzymer og substrat blive denatureret, hvilket forårsager permanent tab af aktivitet. 3. Enzymkoncentration Effekten af enzymkoncentration på aktiviteten af et enzym kan kun observeres, når substratet er til stede i overskud, hvilket får reaktionen til at være uafhængig af substratkoncentrationen. I så fald vil enhver ændring i antallet af dannede produkter over et bestemt tidsrum være afhængig af enzymkoncentrationen. For at observere effekten af enzymkoncentration skal nulteordensreaktioner således undersøges. For at bestemme koncentrationen af enzym i et system, skal mængden af katalyseret substrat bestemmes. Dette afhænger igen af andre faktorer som temperatur og pH. Men for at bestemme forholdet mellem koncentrationen af enzym og hastigheden af enzymvirkning, skal substratet være til stede i overskud, hvilket resulterer i en nulteordensreaktion. Under sådanne forhold øges enzymvirkningen lineært med tiden, hvilket forårsager, at den dobbelte mængde af produkter dannes, når processen køres i dobbelt tid. Reaktionshastigheden eller enzymets aktivitet stiger med stigningen i enzymkoncentrationen, så længe der er nok substratmolekyler til at binde til enzymets aktive steder. Når alle de aktive steder er fyldt, øges enzymaktiviteten ikke. 4. Underlagskoncentration Virkningen af stigningen i substratkoncentrationen på den enzymatiske virkning skal bestemmes ved en konstant koncentration af enzymet. Når koncentrationen af enzymet er konstant, stiger hastigheden af en kemisk reaktion eller aktiviteten af enzymet med stigningen i substratkoncentrationen op til et punkt, hvor den er maksimal. Efter dette tidspunkt ændrer stigningen i substrat ikke enzymets aktivitet eller reaktionshastigheden. Det er fordi, med en stigning i substratkoncentrationen, stiger antallet af substratmolekyler, der binder til det aktive sted af enzymet. Men når alle de aktive steder er fyldt, påvirker stigende substratkoncentration ikke enzymets aktivitet. Enzymvirkningen er således den højeste, når alle enzymmolekyler er til stede i form af enzym-substratkomplekset. 5. Inhibitorkoncentration Inhibitorer er forbindelser, der omdanner enzymerne til inaktive stoffer og dermed negativt påvirker hastigheden af enzymatisk katalyseret reaktion kaldes en enzymhæmmer, og den involverede proces kaldes enzymhæmning. Disse molekyler kan påvirke enzymets aktivitet ved enten at binde sig til det aktive sted eller nogle andre områder af enzymet. Dette forhindrer binding af substrat til det aktive sted, hvilket påvirker hastigheden af dannelsen af enzym-substratkomplekset. Koncentrationen af sådanne inhibitorer er indirekte proportional med hastigheden af enzymvirkning. Med stigningen i koncentrationen af inhibitorer falder hastigheden af dannelsen af enzym-substratkompleks, hvilket igen mindsker koncentrationen af dannede produkter. Afhængigt af arten af inhibering (konkurrerende eller ikkekonkurrerende), kan virkningen af inhibitorer reduceres ved at ændre koncentrationen af substratet. Ved kompetitiv inhibering kan enzymvirkningshastigheden øges ved at øge substratkoncentrationen i mediet. Ved ikke-kompetitiv inhibering kan hastigheden imidlertid ikke øges, selv med stigningen i substratkoncentrationen. Oprettet med BioRender.com Affinitet af forskellige enzymer til deres substrat Som diskuteret ovenfor, når koncentrationen af substratmolekyler øges, mens andre betingelser holdes konstante, når katalysehastigheden af en reaktion med et enzym en maksimal værdi. Dette skyldes kombinationen af hvert enzymmolekyle med substratet eller dets produkter, hvilket resulterer i mætning af enzymoverfladen. Forholdet mellem substratkoncentrationen og enzymvirkningen er afhængig af enzymets affinitet for substratet. For at beskrive enzymets affinitet til substratet anvendes Michaelis konstant km. Km er defineret som den substratkoncentration, ved hvilken reaktionshastigheden eller enzymaktiviteten er halvdelen af den maksimale hastighed. Således antages det substrat med den laveste Km, hvorpå enzymet virker som katalysator, at være enzymets naturlige substrat, selvom dette måske ikke er sandt for alle enzymer. Enzymers affinitet til deres substrat afhænger også af enzymets og substratets beskaffenhed og forskellene i foreningsmåden mellem enzymer og substrat. Ligesom hydrolytiske enzymer, der virker på krystalloide substrater, formodes at have en lav affinitet, hvorimod andre oxiderendereducerende enzymer end katalase antages at have en højere affinitet. Proteolytiske enzymer, der hydrolyserer kolloide stoffer, falder ind under enzymerne med middel affinitet til oxygen, hydrogenperoxid og xanthin. Læs også: Enzymer- Definition, struktur, typer, virkemåde, funktioner Graviditet uge for uge (baby og kropsudvikling, tips) Koldblodede vs varmblodede dyr – definition, 16 forskelle, eksempler Fotosyntese- Definition, ligning, trin, proces, diagram Hæmatopoiesis og celler i immunsystemet Enzym immobiliseret i alginat og enzymer fri i opløsning Immobilisering af enzym er processen med at begrænse enzymmolekylerne til en adskilt fase fra den, hvori substraterne og produkterne er til stede, opnået ved at fiksere molekylerne til og inden i et passende materiale. Calciumalginat fremstilles ved at reagere en blanding af natriumalginatopløsning og enzymopløsning med calciumchlorid. Enzymerne immobiliseret på bærermatricer som alginat har øget modstandsdygtighed over for ændringer i pH og temperatur af mediet sammenlignet med frie enzymer i opløsning. Tilsvarende har anvendelsen af immobiliserede enzymer adskillige fordele sammenlignet med anvendelsen af frie enzymer. Immobiliserede enzymer kan udvindes fra reaktionsblandingen og kan gøres tilgængelige til genbrug igen. Aktiviteten af frie enzymer stiger med stigningen i enzymkoncentration og inkubationsperiode indtil et punkt, hvorefter der ikke sker nogen stigning. Imidlertid har enzym immobiliseret på alginat stigende aktivitet med stigningen i enzymkoncentration selv efter timer af inkubationsperioden. Fordele ved at bruge immobiliserede enzymer Immobiliseringen af enzymer tillader deres gentagne anvendelse, eftersom et sådant enzympræparat let kan adskilles fra reaktionssystemet. Det er lettere at adskille og genbruge immobiliseret sammenlignet med frie enzymer. Nem adskillelse og genbrug muliggør reducerede enzymomkostninger. Immobiliserede enzymer kan også anvendes i ikke-vandige systemer, hvilket kan være yderst ønskeligt i nogle tilfælde. Kontinuerlige produktionssystemer kan anvendes med immobiliserede enzymer, som ikke er mulige med frie enzymer. Termostabiliteten af immobiliserede enzymer er højere end frie enzymer. Immobiliserede enzymer har forbedrede enzymegenskaber. Flere enzymer kan immobiliseres, hvilket gør multienzymreaktioner mulige. Immobiliserede enzymer kan anvendes i meget højere koncentrationer end frie enzymer. Systemer med immobiliserede enzymer har reduceret spildevandsproblemer. Enzymhæmmere - Konkurrencedygtig, IkkeKonkurrencedygtig, Slutprodukthæmning 3. januar 2022 af Anupama Sapkota Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Indholdsfortegnelse Hvad er enzymhæmmere? 1. Reversibel hæmning o o o o en. Konkurrencehæmning b. Ikke-konkurrencedygtig hæmning c. Ukonkurrencedygtig hæmning Læs også: Faktorer, der påvirker enzymvirkning og immobiliserede enzymer 2. Irreversibel hæmning 3. Slutprodukthæmning Referencer og Kilder Hvad er enzymhæmmere? Inhibitorer er forbindelser, der omdanner enzymerne til inaktive stoffer og dermed negativt påvirker hastigheden af enzymatisk katalyseret reaktion kaldes en enzymhæmmer, og den involverede proces kaldes enzymhæmning. Nogle enzymhæmmere er normale kropsmetabolitter, der hæmmer et bestemt enzym, mens andre hæmmere kan være fremmede stoffer, såsom lægemidler eller toksiner. Hæmningen kan være en del af den normale cellulære kontrol af en metabolisk vej, en sygdomstilstand eller enten en terapeutisk foranstaltning. Billedkilde: BioNinja , Bio-Flix , OpenStax Biology . Baseret på hæmmernes virkningsmekanisme er enzymhæmning klassificeret i tre grupper: 1. Reversibel hæmning Reversibel hæmning er hæmningen af et enzym forårsaget af reversible hæmmere, der dissocierer meget hurtigt fra dets målenzym, fordi det bliver meget løst bundet til enzymet. Reversibel hæmning forhindres ved at fjerne inhibitoren fra enzymet. Reversible inhibitorer binder til enzymer med ikkekovalente interaktioner som hydrogenbinding og hydrofobe interaktioner. Disse svage interaktioner resulterer sammen i stærk binding. Disse inhibitorer gennemgår ikke kemiske reaktioner, men fjernes let ved fortynding eller dialyse. Reversibel hæmning er af tre typer; kompetitiv hæmning, ikke-konkurrerende hæmning og ikkekompetitiv hæmning afhængig af tre forskellige faktorer: 1. om hæmningen kan overvindes ved at øge koncentrationen af substratet, 2. om inhibitoren binder på det aktive sted eller det allosteriske sted i enzymmolekylet 3. om inhibitoren binder enten kun med det frie enzym eller kun med enzym-substratkomplekset eller med en af de to. en. Konkurrencehæmning Billedkilde: BioNinja . Kompetitiv inhibering er inhiberingen af enzymatisk aktivitet ved kompetitiv binding af inhibitorer til det aktive sted. Hæmmeren kaldes en kompetitiv hæmmer, da den konkurrerer med substratet om at binde sig til det aktive sted. Den kompetitive inhibitor har en tæt strukturel lighed med substratet. Inhibitoren kan kombineres med enzymet (E), og danner et enzym-inhibitor (EI) kompleks i stedet for et enzym-substrat (ES) kompleks. Graden af inhibering afhænger af koncentrationerne af substratet og inhibitoren. Hæmningen kan således øges ved at øge koncentrationen af inhibitorer og kan reduceres ved at mindske koncentrationen af substratet. Virkningen af en kompetitiv inhibitor kan vendes ved høje substratkoncentrationer, fordi en tilstrækkelig høj substratkoncentration med succes vil konkurrere ud inhibitormolekylet i binding til det aktive sted. En kompetitiv inhibitor mindsker reaktionshastigheden ved at reducere andelen af enzymmolekylerne bundet til et substrat. Eksempel: Mange mikroorganismer, som bakterier, syntetiserer vitamin folinsyre fra para-aminobenzoesyre (PABA), og nogle sulfalægemidler, der er strukturelle analoger af PABA, virker som en enzymhæmmer og optager det aktive sted for nogle bakterielle enzymer, der katalyserer denne reaktion. b. Ikke-konkurrencedygtig hæmning Billedkilde: BioNinja . Ikke-kompetitiv inhibering er inhiberingen af enzymatisk aktivitet ved binding af inhibitorer til enzymet på et andet sted end det aktive sted. Den ikke-kompetitive tern antyder, at der ikke er nogen konkurrence mellem substratet og inhibitoren om bindingen til det aktive sted og heller ikke har nogen strukturel lighed med substratet. De inhibitorer, der er involveret i denne proces, betegnes ikkekompetitive inhibitorer. Da inhibitor og substrat kan kombineres på forskellige steder, finder dannelsen af både enzym-inhibitorkomplekser og enzymsubstratkomplekser sted. Ved ikke-kompetitiv inhibering kan inhibitoren og substratet samtidigt binde til det samme enzymmolekyle, da deres bindingssteder er forskellige og heller ikke overlapper. Under kompetitiv inhibering inaktiveres enzymet, når en inhibitor er bundet, uanset om der også er substrat til stede eller ej. Bindingen af inhibitoren medfører konformationelle ændringer i enzymets aktive sted, hvilket forhindrer bindingen af substratmolekylet. Desuden sænker inhibitoren effektivt koncentrationen af aktive enzymer og sænker dermed reaktionshastigheden. Ikke-konkurrerende hæmning, i modsætning til kompetitiv hæmning, kan ikke overvindes ved at øge substratkoncentrationen. Eksempler: Forskellige tungmetalioner (Ag + , Hg 2+ , Pb 2+ ) hæmmer aktiviteten af en række enzymer såsom urease. c. Ukonkurrencedygtig hæmning Ikke-kompetitiv inhibering er inhiberingen af enzymatisk aktivitet ved binding af inhibitoren på et allosterisk sted som i tilfælde af ikke- kompetitiv inhibering, men bindingen finder sted med enzymsubstrat (ES) komplekset og ikke det frie enzymmolekyle. Mekanismen for inhibering involveret i ukompetitiv inhibering er ved fjernelse af et aktiveret enzym-substratkompleks, som forårsager et fald i den maksimale hastighed af den kemiske reaktion. For eksempel er tetramethylensulfoxid og 3-butylthiolenoxid ukompetitive hæmmere af leveralkoholdehydrogenase. Læs også: Faktorer, der påvirker enzymvirkning og immobiliserede enzymer 2. Irreversibel hæmning Billedkilde: Bio-Flix . Irreversibel hæmning er hæmningen af enzymatisk aktivitet ved den irreversible ændring i strukturen forårsaget på grund af bindingen af inhibitoren til enzymet eller ved at ødelægge nogle funktionelle grupper på enzymet, som er afgørende for dets aktivitet. En irreversibel inhibitor adskiller sig meget langsomt fra sit målenzym, fordi den bliver meget tæt bundet til sit aktive sted, mens den inaktiverer enzymmolekylet. Irreversibel hæmning, i modsætning til reversibel hæmning, kan ikke fjernes eller reduceres ved fjernelse af inhibitorer fra enzymmolekylet. Irreversible inhibitorer binder til enzymmolekylet ved stærke kovalente bindinger, da de ofte indeholder reaktive funktionelle grupper som aldehyder, alken og haloalkaner. Irreversible inhibitorer er generelt specifikke for en gruppe enzymer, da de ødelægger enzymerne ved at ændre det aktive sted og ikke ved at ødelægge strukturen af proteinerne. Hæmningen af enzymatisk aktivitet sker på en tidsafhængig måde, som sædvanligvis forekommer eksponentielt. Eksempel: Alkyleringsreagenser, såsom iodoacetamid, virker som irreversible inhibitorer og hæmmer den katalytiske aktivitet af nogle enzymer ved at modificere cystein og andre sidekæder. Læs også: Enzymer- Definition, struktur, typer, virkemåde, funktioner Faktorer, der påvirker enzymvirkning og immobiliserede enzymer Feedback-mekanisme - definition, typer, proces, eksempler, applikationer Mikroskop - definition, dele, funktioner, typer, diagram, anvendelser Graviditet uge for uge (baby og kropsudvikling, tips) 3. Slutprodukthæmning Figur: Metaboliske veje er en række reaktioner katalyseret af flere enzymer. Feedback-inhibering, hvor slutproduktet af pathwayen hæmmer et opstrømstrin, er en vigtig regulatorisk mekanisme i celler. Billedkilde: OpenStax Biology . Slutprodukthæmning er en cellulær kontrolmekanisme, hvor aktiviteten af enzymer hæmmes af enzymets slutprodukt. Slutprodukthæmning kaldes også feedbackhæmning. Denne hæmning er involveret i reguleringen af, hvor meget af slutprodukterne, der skal produceres. De fleste biokemiske processer er komplekse og kræver flere enzymer for at producere det ønskede produkt. I sådanne processer virker slutprodukthæmning på processens første enzym. Slutprodukthæmmere binder sig til det allosteriske sted på enzymet, der forårsager ændringer i enzymets form, hvilket ændrer det aktive sted. Ved feedbackhæmning binder slutproduktet sig til det allosteriske sted, hvilket forårsager ændringer i enzymet. Denne hæmning er afgørende for levende væsener, da den hjælper kroppen med at undgå potentielt farlige forhold. For eksempel: slutprodukthæmning observeres hos mennesker, hvor enzymet, der er ansvarligt for produktionen af kolesterol i leveren, hæmmes af tilstedeværelsen af kolesterol i blodet. ktiv Transport - Egenskaber, Typer Og Betydning 27. maj 2021 af Sagar Aryal Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner For at opretholde liv skal mange stoffer transporteres ind i, ud af og mellem celler. I nogle tilfælde kan dette opnås gennem passiv transport, som ikke bruger energi. I mange tilfælde skal cellen dog transportere noget mod sin koncentrationsgradient. I disse tilfælde kræves aktiv transport. Aktive transportmekanismer kræver brug af cellens energi, normalt i form af adenosintrifosfat (ATP). Hvis et stof skal bevæge sig ind i cellen mod sin koncentrationsgradient, altså hvis koncentrationen af stoffet inde i cellen skal være større end dets koncentration i den ekstracellulære væske, skal cellen bruge energi på at flytte stoffet. Aktiv transport bruger specifikke transportproteiner, kaldet pumper, som bruger metabolisk energi (ATP) til at flytte ioner eller molekyler mod deres koncentrationsgradient. For eksempel, hos både hvirveldyr og hvirvelløse dyr er koncentrationen af natriumion omkring 10 til 20 gange højere i blodet end i cellen. Koncentrationen af kaliumion er omvendt, generelt 20 til 40 gange højere inde i cellen. En sådan lav natriumkoncentration inde i cellen opretholdes af natrium-kaliumpumpen. Der findes forskellige typer pumper til de forskellige typer af ioner eller molekyler såsom calciumpumpe, protonpumpe osv. Indholdsfortegnelse Funktioner ved Active Transport Typer af aktiv transport Primær aktiv transport Sekundær aktiv transport Bærerproteiner til aktiv transport Betydningen af aktiv transport Referencer Funktioner ved Active Transport Under aktiv transport bevæger molekyler sig fra et område med lav koncentration til et område med høj koncentration. Dette er det modsatte af diffusion, og disse molekyler siges at flyde mod deres koncentrationsgradient. Aktiv transport kaldes "aktiv", fordi denne type transport kræver energi for at flytte molekyler. ATP er den mest almindelige energikilde til aktiv transport. Da molekyler bevæger sig mod deres koncentrationsgradienter, kan aktiv transport ikke finde sted uden hjælp. Det kræver et transmembranprotein eller proteinkompleks kaldet en transportør, som koordinerer hele processen, og en energikilde som ATP. Hver type transportprotein, som er designet til at transportere en specifik ion eller næringsstof ind i cellen, binder et molekyle af dets substrat på den ene side af membranen og ændrer derefter form og frigiver substratet på den anden side. Disse proteiner kaldes ofte "pumper", fordi de bruger energi til at pumpe molekylerne hen over membranen. Typer af aktiv transport 1. Primær aktiv transport Primær aktiv transport kaldes også direkte aktiv transport eller uniport. Det involverer at bruge energi (normalt ATP) til direkte at pumpe et opløst stof hen over en membran mod dets elektrokemiske gradient. Stoffer, der transporteres gennem cellemembranen ved primær aktiv transport omfatter metalioner, såsom Na+, K+, Mg2+ og Ca2+. Disse ladede partikler kræver ionpumper eller ionkanaler for at krydse membraner og distribuere gennem kroppen. Baseret på transportmekanismen samt genetisk og strukturel homologi betragtes der fire klasser af ATP-afhængige ionpumper: P-klasse pumper F-klasse pumper V-klasse pumper ABC superfamilie P-, F- og V-klasserne transporterer kun ioner, mens ABC-superfamilien også transporterer små molekyler. De fleste af de enzymer, der udfører denne type transport, er transmembrane ATPaser. Det mest undersøgte eksempel på primær aktiv transport er plasmamembranen Na+,K+-ATPase. Andre velkendte eksempler på primær aktiv transport er mitokondriers redox H+gradientgenererende system, det lysdrevne H+gradientgenererende system af fotosyntetiske thylakoidmembraner og den ATP-drevne syrepumpe (H+) fundet i mavesækkens epitelbeklædning. . 1. Sekundær aktiv transport I sekundær aktiv transport, også kendt som koblet transport eller cotransport, bruges energi til at transportere molekyler over en membran; i modsætning til primær aktiv transport er der imidlertid ingen direkte kobling af ATP; i stedet er den afhængig af den elektrokemiske potentialforskel, der skabes ved at pumpe ioner ind/ud af cellen. Sekundær aktiv transport flytter flere molekyler hen over membranen, hvilket driver et molekyles opadgående bevægelse. Et molekyle hjælper med at opsætte den nødvendige gradient for at tillade bevægelse af mange kemikalier ind og ud af cellen. Energien til at producere op ad bakke transport af et opløst stof er afledt af den potentielle energi af et andet opløst stof, der løber ned ad dens koncentrationsgradient. Den energi, der stammer fra pumpning af protoner over en cellemembran, bruges ofte som energikilde i sekundær aktiv transport. Hos mennesker er natrium (Na+) en almindeligvis co-transporteret ion over plasmamembranen, hvis elektrokemiske gradient derefter bruges til at drive den aktive transport af en anden ion eller molekyle mod dens gradient. I bakterier og små gærceller er en almindeligt samtransporteret ion brint. Natrium-calcium-bytter, SGLT2 Bærerproteiner til aktiv transport En vigtig membrantilpasning til aktiv transport er tilstedeværelsen af specifikke bærerproteiner eller pumper for at lette bevægelse. Der er tre typer af disse proteiner eller transportere: uniportere, symportere og antiportere. En uniporter bærer en specifik ion eller molekyle. En symporter bærer to forskellige ioner eller molekyler, begge i samme retning. En antiporter bærer også to forskellige ioner eller molekyler, men i forskellige retninger. Alle disse transportører kan også transportere små, uladede organiske molekyler som glucose. Disse tre typer bærerproteiner findes også i faciliteret diffusion, men de kræver ikke ATP for at virke i den proces. Nogle eksempler på pumper til aktiv transport er Na + -K + ATPase, som bærer natrium- og kaliumioner, og H + -K + ATPase, som bærer hydrogen- og kaliumioner. Begge disse er antiporterbærerproteiner. To andre bærerproteinpumper er Ca 2+ ATPase og H + ATPase, som kun bærer henholdsvis calcium- og kun hydrogenioner. Læs også: ATP- Definition, Struktur, Produktion, Syntese, Funktioner Mikroskop - definition, dele, funktioner, typer, diagram, anvendelser Hæmatopoiesis og celler i immunsystemet Bindevæv- definition, struktur, celler, typer, funktioner, sygdomme Aktiv og passiv immunitet - definition, typer, forskelle Betydningen af aktiv transport Aktiv transport af opløste stoffer over biologiske membraner drevet af elektrokemiske gradienter (dvs. sekundær aktiv transport) spiller en central rolle i fundamentale cellulære processer, såsom næringsstofoptagelse, udskillelse af toksiske forbindelser og signaltransduktion. Aktiv transport er blandt de mest almindelige metoder, der bruges til encellede organismers optagelse af næringsstoffer såsom visse sukkerarter, de fleste aminosyrer, organiske syrer og mange uorganiske ioner. Sekundær aktiv transport er involveret i transport af en bred vifte af molekyler, såsom ioner, næringsstoffer, vitaminer og osmolytter i højere organismer. Aktiv transport muliggør effektiv absorption af stoffer, der er afgørende for cellulær funktion (og visse lægemidler, der ligner dem strukturelt) og selektiv eliminering af affaldsprodukter og fremmede kemikalier, herunder mange lægemidler. Glyoxylat-Cyklus-Processen - En Oversigt Og Sammenfatning 3. november 2020 af redaktører Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Spirende frø kan omdanne lagrede lipider til glucose ved en cyklisk proces kendt som glyoxylatcyklussen. Dyrelignende hvirveldyr kan ikke bruge acetatet af acetyl CoA til glukoneogenese. Så de kan ikke omdanne lipid til glucose via gluconeogenese, fordi lagret lipid først bryder ind i acetat af acetyl CoA og derefter indgår i gluconeogenese, de har ingen sådan proces til at føre acetatet ind i gluconeogenese, fordi deres acetat er frigivet til CO2 via TCA cyklus og oxaloacetat som modtager acetatreform her ingen ekstra dannelse af succinat eller oxaloacetat. Men spirende frø har en anden type cyklus til at overtage dette problem, de kan omdanne acetat af acetyl CoA til succinat, som vil indgå i gluconeogenese via omdannelse til oxaloacetat, processen foregår til glyoxysomer. Figur: Oversigt over glyoxylatcyklussen. Billedkilde: Wikipedia . Indholdsfortegnelse Glyoxylat-cyklussens proces o o o o o Træd først Trin andet Trin tredje Trin fjerde Trin femte Referencer Glyoxylat-cyklussens proces Denne proces foregår til glyoxysomer og producerede succinat, som trænger ind i mitokondrier og omdannes til fumarat og derefter malat, nu kommer dette malat ind i cytoplasmaet og omdannes til oxaloacetat, som omdannes til PEP og går ind i gluconeogenese. Processen med glyoxylatcyklus har nogle trinreaktioner som sådan TCA-cyklussen, og nogle er også forskellige. Den detaljerede proces for glyoxylatcyklussen er som følger: Træd først Her i det første trin som citronsyrecyklussen tager claisen kondensation, oxaloacetat modtager acetat fra acetyl CoA og omdannes til citrat ved virkningen af citratsyntase-enzym. Trin andet Dette trin ligner også aconitase-trinnet i TCA, her omdannes også citrat til isocitrat ved virkningen af aconitase-enzymet. Trin tredje Her virker isocitrat dehydrogenase ikke, i modsætning til TCA her virker et separat enzym Isocitrat lyase, som opdeler isocitrat til, 2 carbonforbindelse glyoxylat og 4 carbonforbindelse succinat. Trin fjerde I dette trin finder indtastning af et andet acetat fra Acetyl CoA sted, glyoxylat modtager acetat fra Acetyl CoA og omdannes til fire-carbon sammensat malat. Trin femte I dette trin omdannes malat til oxaloacetat ved virkningen af malatdehydrogenase, derfor reduceres NAD+ til NADH, og oxaloacetat gendannes, som kan indgå i cyklisk gentagelse. Det er den komplette Glyoxylat-cyklus, men her skal vi tale om succinat, som produceres i denne cyklus. Succinat kommer ind i den glykolytiske vej via et trin i TCAcyklussen. Succinat omdannes til fumarat ved virkningen af succinatdehydrogenase og FAD reduceret til FADH2 inde i mitokondrierne. Nu omdannes fumarat til malat ved virkningen af fumarase-enzymet. Nu omdannes dette malat til oxaloacetat i nærvær af malatdehydrogenaseenzym, og NAD+ reduceres til NADH. Nu kan dette oxaloacetat indgå i glukoneogenese. Og denne plante kan omdanne lagrede lipider til glukose uden ekstra omkostninger til energi. Og NADH FADH produceret i denne cyklus kan producere ATP via ETS, og noget af denne ATP bruges under gluconeogenese. Mens gluconeogenese af hvirveldyr er en meget dyr proces og kræver ekstra energi, overtager spirende frø dette problem ved glyoxylatcyklus og kan bruge Acetyl CoA i gluconeogenese. Citronsyrecyklussen (TCA) og glyoxylatcyklussen er koordineret reguleret, fordi mellemprodukter af glyoxylat kan indgå i TCA. Og succinat går ind i gluconeogenese via et eller andet trin af TCA. Hvordan Indgår Andre Kulhydrater I Den Glykolytiske Vej? 3. november 2020 af redaktører Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Andre kulhydrater såsom polysaccharider som diætstivelse og glykogen nedbryder deres monomer (glukose) under fordøjelsen ved virkningen af amylaseenzym, og nu absorberes glucose i cellen, hvor det kommer ind i glykolyse, men endogent glykogen, nogle disaccharider (trehalose, maltose, laktose). ), og nogle monosaccharider, som ikke er mellemprodukterne i den glykolytiske vej, indgår i glykolyse med en tidligere reaktion for at forberede dem til indtræden. Billedkilde: Slide Share . Indholdsfortegnelse Endogen glykogenindtrængning Indtrængen af disaccharider o o o Indtrængen af monosaccharider o o o Trehalose-indgang Saccharoseindgang Laktoseindtrængning Indtrængen af fruktose Galaktoseindtrængen Mannose indgang Laktoseintolerance (laktasemangel) Galaktosæmi (mangel på galactosemetaboliserende enzym) Referencer Endogen glykogenindtrængning Endogent glykogen nedbrydes til dets monomer ved hjælp af tre enzymer, glykogenphosphorylase, glykogenafgrenende enzym og phosphoglucomutase. Glycogenphosphorylase fjerner glucose 1-phosphat fra den ikke-reducerende ende, det forgrenende enzym fjerner glucose fra forgreningspunktet, og phosphoglucomutase ændrer glucose 1-P til glucose 6-P. Nu kan glukose 6-P indgå i glykolyse. Indtrængen af disaccharider Trehalose-indgang Trehalose nedbrydning til glucosemonomer ved virkningen af trehalase enzym, nu kan fri glucose trænge ind i den metaboliske vej Saccharoseindgang Saccharose enzymatisk nedbrydning til glucose og fructose ved brug af vandmolekyle er hydrolyse af saccharose, fri glucose kan ind i den katalytiske vej. Og fruktose kommer ind efter en anden enzymatisk reaktion. Laktoseindtrængning Ved hjælp af lactase-enzym lactose-nedbrydning til glucose og galactose, gennemgår galactose nu en anden enzymatisk reaktion før indtræden. Indtrængen af monosaccharider Indtrængen af fruktose Fructose indgår i glykolyse enten ved phosphorylering på sjette carbon med hexokinase-enzym for at ændre til fructose 6-P eller ved phosphorylering på det første carbon for at ændre til fructose 1-P ved fructokinase-enzym. Nu nedbrydes fructose 1-P til dihydoxyacetonephosphat (DHAP) og glyceraldehyd ved virkningen af fructose 1-phosphat aldolase, og derefter glyceraldehyd phosphoryleres ved tredje kulstof omdannet til glyceraldehyd 3-p ved trilysekinase af ATP. Nu kan DHAP og glyceraldehyd indgå i den glykolytiske vej på det punkt, hvor dehydrogenering af glyceraldehyd 3-P finder sted. Galaktoseindtrængen Galactose ændres til glucose ved tre enzymatiske reaktioner, først enzym galactokinase, andet enzym UDP glucose: galactose 1-P uridylyltransferase, og tredje er glucose 4-epimerase. I den første reaktion phosphorylerer galactokinase-enzym galactose ved første carbon og ændrer det til galactose 1-P. Nu andet enzym UDP-glucose: galactose 1-P uridylyltransferase overfører UDP fra UDP-glucose til galactose 1-Pdannende UDP-galactose, overfører en phosphatgruppe fra galactose til glukosedannende glucose1-P. Nu katalyserer tredje enzym glucose 4epimerase epimeriseringen af UDP galactose til UDP glucose, denne UDP glucose ændres til glucose 1-P gennem det andet trin af denne vej, som er glucoseoverførsel UDP til galactose 1-P. Nu ændres disse glucose 1-Pmolekyler til glucose 6-P ved virkningen af phosphoglucomutase-enzymet. Mannose indgang Mannose indgår i den glykolytiske vej via en to-trins reaktion, i det første trin phosphorylerer hexokinase mannose til dannelse af mannose 6-P ved hydrolyse af ATP, derefter isomeriserer mannose 6-P til fructose 6-P ved virkningen af phosphomannose isomerase. Laktoseintolerance (laktasemangel) Det skyldes mangel på eller funktionsfejl af laktase-enzym, uden laktaseenzym kan den ramte person ikke fordøje mælkesukker (laktose), så ufordøjet laktose kan ikke absorberes fra tarmen og bakterier omdanner det til det giftige produkt, hvilket fører til diarré . Den ramte person kan bruge fordøjet mælk. Læs også: Kulhydrater- definition, klassificering med struktur og funktioner Glykogenmetabolisme - Nedbrydning og biosyntese af glykogen Enzymer- Definition, struktur, typer, virkemåde, funktioner Cellecyklus- Definition, faser, regulering og kontrolpunkter Faktorer, der påvirker enzymvirkning og immobiliserede enzymer Galaktosæmi (mangel på galactosemetaboliserende enzym) Galaktosæmi skyldes en mangel i et af de tre enzymer af galactosekatabolisme, det første enzym galactokinase, det andet enzym UDP-glucose: galactose 1-P uridylyltransferase og det tredje er glucose 4epimerase. Galactosekoncentrationen er høj i blod og urin, og galactosemetabolitten galactitol, aflejring i øjenlinsen forårsager grå stær i spædbarnsalderen. Pyruvats Skæbne (Skæbne For Slutproduktet Af Glykolytisk Vej) 3. november 2020 af redaktører Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Pyruvat kan indgå i mælkesyregæring og alkoholgæring i anaerob tilstand, i aerob tilstand kan pyruvattab brint og kuldioxid omdannes til acetyl CoA og indgå i TCA-cyklussen og også indgå i den biosyntetiske vej. I tilfælde af lave glucoseniveauer indgår pyruvat i glukoneogenesen. Figur: Pyruvats skæbne. Billedkilde: sachabiochem0001 . Indholdsfortegnelse Pyruvats skæbne under anaerobe forhold o o Pyruvat fungerer som terminale elektronacceptorer i mælkesyrefermentering Pyruvats skæbne i alkoholisk gæring Pyruvats skæbne i tilfælde af aerob respiration Pyruvats skæbne i den biosyntetiske vej Referencer Pyruvats skæbne under anaerobe forhold Under anaerobe forhold opdeles pyruvat i mælkesyregæring og alkoholisk gæring Pyruvat fungerer som terminale elektronacceptorer i mælkesyrefermentering Når væv ikke kan forsynes af ilt, eller under træning, når mindre ilt når musklerne end deres behov, så fungerer pyruvat som en terminal elektronacceptor fra NADH (dannet under glykolyse ) og omdannes til laktat, en proces kaldet mælkesyrefermentering. RBC, nethindeceller og muskler under træning og under hypoxisk tilstand respirerer ved mælkesyregæring. Under mælkesyrefermentering accepterer pyruvat en elektron fra NADH og reduceres til laktat for at genoprette NAD+ for yderligere cyklus af reaktionen. Pyruvat + NADH → laktat + NAD lactat dehydrogenase Laktat dannet i de aktive muskler, der transporteres til leveren, hvor det kan nedbrydes eller genoprettes til glukose, den genoprettede glukose fra lactat, der transporteres til musklerne, kaldes denne cyklus for en Coricyklus. Pyruvats skæbne i alkoholisk gæring Gær og andre mikroorganismer fermenterer glucose til ethanol, glykolytisk slutprodukt pyruvat går i alkoholisk gæring, dette trin foregår via en totrins reaktion. Det første trin er decarboxyleringen af pyruvat, hvor pyruvat ændres til acetaldehyd ved at miste kulstof ved virkningen af pyruvat-decarboxylaseenzym i nærvær af TPP og Mg++. Pyruvat → Acetaldehyd + CO2 pyruvat decarboxylase I det andet trin accepterer acetaldehyd en elektron fra NADH (dannet under glykolyse) for at genoprette den til NAD+ for den videre cyklus og omdannes til ethanol ved virkningen af alkoholdehydrogenase-enzym. Acetaldehyd + NADH → Ethanol + NAD+ alkohol dehydrogenase Pyruvats skæbne i tilfælde af aerob respiration Under aerob respiration ændres pyruvat til Acetyl CoA og indgår nu i TCAcyklussen (Krebs-cyklus), via oxidativ decarboxylering, katalyseres denne reaktion af pyruvat-dehydrogenasekompleks lavet af tre enzymer E1, E2, E3. E1 = pyruvat dehydrogenase, E2 = dihydrolipoyl transacetelase, E3 = dihydrolipoyl dehydrogenase). Pyruvatdehydrogenasekompleks (E1, E2 & E3) kræver 5 coenzymer til denne reaktion, nemlig TPP, lipoat, CoA-SH, FAD, NAD+ for at katalysere denne reaktion. E1 bundet med TPP frigiver CO2 fra pyruvat og overfører aktiv acetylgruppe til TPP, nu TPP overfører acetylgruppe på lipoat bundet med E2, og lipoat overfører acetylgruppe til CoA.SH, der danner Acetyl CoA, nu overfører E3 H fra reduceret lipoat til FAD, som overfører en elektron til NAD+ og danner NADH + H+. Nu kan denne acetyl CoA indgå i TCA. Pyruvat + E1 + E2 + E3+TPP+ lipoat+CoA-SH+ FAD+ NAD+ → Acetyl CoA+ E1+E2+E3+ TPP+ lipoat+FAD+NADH+H+ Læs også: Kulstofkredsløb - definition, trin, eksempler, betydning, menneskelige påvirkninger Aerob vs anaerob respiration - definition, 11 forskelle, eksempler Mikroskop - definition, dele, funktioner, typer, diagram, anvendelser Bindevæv- definition, struktur, celler, typer, funktioner, sygdomme Fotosyntese- Definition, ligning, trin, proces, diagram Pyruvats skæbne i den biosyntetiske vej Pyruvat kan også indgå i de biosyntetiske veje, såsom fedtsyrebiosyntese og gluconeogenese. Pyruvat ændret til acetyl CoA ved virkningen af pyruvat dehydrogenase kompleks, denne acetyl CoA indgår også i biosyntesevejen ved siden af TCA. Pyruvat kan også indgå i gluconeogenese ved at pyruvat carboxykinase omdanner det til oxaloacetat, som med flere trins reaktion ændres til glucose. Pentosephosphatvej - En Oversigt Og Et Resumé 3. november 2020 af redaktører Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Pentose phosphate pathway (PPP) Det kaldes også en Phosphogluconate Pathway eller Hexose Monophosphate Pathway. I denne vej er NADP+ en elektronacceptor i stedet for NAD+. Dette finder sted i den tofasede oxidative fase af PPP og den ikke-oxidative fase af PPP. Figur: Pentosephosphatvejen (PPP). PPP forgrener sig efter det første trin af glykolyse og går tilbage til fructose 6-phosphat og glyceraldehyd 3phosphat i den glykolytiske og gluconeogene vej. PPP'en producerer R5P og NADPH til biosyntese og redoxregulering. Enzymer i det oxidative og ikke-oxidative PPP er skraveret i grønt. Billedkilde: Forside. Endocrinol., 09. juni 2020 | https://doi.org/10.3389/fendo.2020.00365 Indholdsfortegnelse Den oxidative fase af pentosephosphatvejen Den ikke-oxidative fase af pentosephosphatvejen Glucose 6-P dehydrogenase mangel Wernicke Korsakoffs syndrom (transketolase- og TPP-mangel) Referencer Den oxidative fase af pentosephosphatvejen Trin først – I den første reaktion oxiderede glucose 6-phosphat til 6phosphoglucono-delta-lacton i nærværelse af glucose 6-phosphat dehydrogenase enzym, hvor NADP+ fungerer som en elektronacceptor. Trin andet - I dette trin hydrolyseres 6-phosphoglucono-delta-lacton af specifik lactonase til 6-phosphogluconat. Trin tredje - Nu finder oxidativ decarboxylering af 6-phosphogluconat til D-ribulose 5-phosphat sted ved hjælp af 6-phosphogluconate dehydrogenase-enzym, og NADP+ fungerer som en elektronacceptor. Trin fjerde - Nu isomeriserer ribulose 5-P til ribose 5-P af phosphopentose-isomerase. Den ikke-oxidative fase af pentosephosphatvejen Trin fem – Her finder epimerisering af ribulose 5-P til xylulose 5-P sted med ribulose 5-P epimerase. Trin seks - Nu reagerer ribose 5-P og xylulose 5-P for at give sedoheptulose 7-P og glyceraldehyder 3-P i nærvær af transketolase. Trin syv – Sedoheptulose 7-P og glyceraldehyd 3-P reagerer for at give fructose 6-P og erythrose 4-P. Trin otte - Nu reagerer erythrose 4-P og xylulose 5-P for at give fructose 6P og glyceraldehyd 3-P. Trin ni - I dette trin isomeriserer fructose 6-P til glucose 6-P af phosphohexose-isomerase-enzym. Trin ti - I dette trin indgår glyceraldehyd 3-P i gluconeogenese og omdannes til glucose. Glucose 6-P dehydrogenase mangel Glucose 6-P dehydrogenase mangel for det meste asymptomatisk; symptomer vises kun med en kombination af flere miljøfaktorer. Den græske matematiker Pythagoras forbød sin tilhænger at spise favabønne (falafel en ret har favabønne som ingrediens også forbudt), fordi dette gør mange mennesker syge med en tilstand kaldet favisme, hvor erytrocytlyset finder sted inden for 24-48 timer, frigivet hæmoglobin ind i blodet, hvilket forårsager gulsot og nogle gange fører til nyresvigt, antimalariamedicin primaquin eller sulfa-antibiotika giver også det samme symptom hos personer med glukose 6-P-mangel. NADPH produceret i den første reaktion af PPP af glucose 6-P dehydrogenase, denne NADPH bruges i flere biosyntetiske veje, bruges også til beskyttelse mod oxidativ skade af hydrogenperoxid, superoxid og meget reaktiv oxidant dannet under metabolisme, toksiciteten af det antimalariamiddel og den giftige ingrediens i fava-bønner. Under afgiftning omdannes hydrogenperoxid til vand af reduceret glutathion og glutathionperoxidase enzym. Nu omdannes oxideret glutathion til reduceret glutathion af glutathionreduktase og NADPH. Hos personer med glukose 6-P-mangel hæmmes NADPH-produktionen, så oxideret glutathion omdannes ikke til sin reducerede form, nu hæmmes også afgiftning af hydrogenperoxid. Hydrogenperoxid bryder også ind i vand og ilt af katalase-enzymet, som også kræver NADPH, så dette trin hæmmes også. Så kan brintoverilte ikke afgiftes, så dette fører til oxidativ skade på celleindholdet. toksiciteten af det antimalariamiddel og den giftige bestanddel af fava-bønner. Under afgiftning omdannes hydrogenperoxid til vand af reduceret glutathion og glutathionperoxidase enzym. Nu omdannes oxideret glutathion til reduceret glutathion af glutathionreduktase og NADPH. Hos personer med glukose 6-P-mangel hæmmes NADPH-produktionen, så oxideret glutathion omdannes ikke til sin reducerede form, nu hæmmes også afgiftning af hydrogenperoxid. Hydrogenperoxid bryder også ind i vand og ilt af katalase-enzymet, som også kræver NADPH, så dette trin hæmmes også. Så kan brintoverilte ikke afgiftes, så dette fører til oxidativ skade på celleindholdet. toksiciteten af det antimalariamiddel og den giftige bestanddel af fava-bønner. Under afgiftning omdannes hydrogenperoxid til vand af reduceret glutathion og glutathionperoxidase enzym. Nu omdannes oxideret glutathion til reduceret glutathion af glutathionreduktase og NADPH. Hos personer med glukose 6-P-mangel hæmmes NADPH-produktionen, så oxideret glutathion omdannes ikke til sin reducerede form, nu hæmmes også afgiftning af hydrogenperoxid. Hydrogenperoxid bryder også ind i vand og ilt af katalase-enzymet, som også kræver NADPH, så dette trin hæmmes også. Så kan brintoverilte ikke afgiftes, så dette fører til oxidativ skade på celleindholdet. Nu omdannes oxideret glutathion til reduceret glutathion af glutathionreduktase og NADPH. Hos personer med glukose 6-P-mangel hæmmes NADPH-produktionen, så oxideret glutathion omdannes ikke til sin reducerede form, nu hæmmes også afgiftning af hydrogenperoxid. Hydrogenperoxid bryder også ind i vand og ilt af katalase-enzymet, som også kræver NADPH, så dette trin hæmmes også. Så kan brintoverilte ikke afgiftes, så dette fører til oxidativ skade på celleindholdet. Nu omdannes oxideret glutathion til reduceret glutathion af glutathionreduktase og NADPH. Hos personer med glukose 6-P-mangel hæmmes NADPH-produktionen, så oxideret glutathion omdannes ikke til sin reducerede form, nu hæmmes også afgiftning af hydrogenperoxid. Hydrogenperoxid bryder også ind i vand og ilt af katalase-enzymet, som også kræver NADPH, så dette trin hæmmes også. Så kan brintoverilte ikke afgiftes, så dette fører til oxidativ skade på celleindholdet. som også kræver NADPH, så dette trin er også hæmmet. Så kan brintoverilte ikke afgiftes, så dette fører til oxidativ skade på celleindholdet. som også kræver NADPH, så dette trin er også hæmmet. Så kan brintoverilte ikke afgiftes, så dette fører til oxidativ skade på celleindholdet. Glykogenmetabolisme - Nedbrydning Og Biosyntese Af Glykogen 3. november 2020 af redaktører Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Glykogen er lagret polysaccharid i hvirveldyr og nogle mikroorganismer, mens stivelse i tilfælde af planten. Indholdsfortegnelse Glykogen nedbrydning o o o Biosyntese af glykogen o o o o Phosphoglucomutase virkning UDP-glucose pyrophosphorylase virkning Glykogensyntasevirkning Amylo (1-4) til (1-6) transglycosylase (glykogenforgrenende enzym) virkning Koordinere regulering af glykogensyntese og nedbrydning o o Glykogen phosphorylase virkning Glykogen-afgrenende enzymvirkning Phosphoglucomutase enzymvirkning Regulering af glykogenphosphorylase Regulering af glykogensyntase ved phosphorylering og dephosphorylering Referencer Glykogen nedbrydning Nedbrydning af glykogen sker gennem de tre enzymatiske reaktioner, glykogenphosphorylase, glykogenafgrenende enzym og phosphoglucomutase. Tre trin er som følger - Glykogen phosphorylase virkning Glycogenphosphorylase fjerner glucoserester som alfa-D glucose 1phosphat fra den ikke-reducerende ende, med brydning af alfa 1-4 glykosidbinding ved uorganisk fosfatangreb, denne proces gentages, indtil den når fire glucose fra forgreningspunktet. Yderligere nedbrydning finder sted efter virkningen af det afgrenende enzym. Glykogen-afgrenende enzymvirkning Det afgrenende enzym katalyserer to på hinanden følgende reaktioner til overførsel af grenen. Transferaseaktivitet af det afgrenende enzym - I denne reaktion overfører afgreningsenzym oligosaccharider fra gren til lineær. Alfa 1-6 glycosidaseaktivitet af det forgrenende enzym – I dette trin afforgrener enzymet nedbrydning alfa 1-6 glycosidbinding, der frigør en glucose. Phosphoglucomutase enzymvirkning Det omdanner frigjort glucose 1-phosphat til glucose 6-phosphat, som kan indgå i glykolyse . Oprettet med BioRender.com Biosyntese af glykogen Glykogenbiosyntese finder på en eller anden måde sted i alle celler i dyrekroppen, men finder hovedsageligt sted i leveren og skeletmuskulaturen. Ligesom glykolyse starter den også med glucose 6phosphat, kondenseret til glykogen gennem virkningen af fire enzymer som phosphoglucomutase, UDP-glucose pyrophosphorylase, glykogensyntase, amylo (1-4) til (1-6) transglycosylase. Phosphoglucomutase virkning Her omdannes glucose 6-phosphat til glucose 1-phosphat ved påvirkning af phosphoglucomutase. UDP-glucose pyrophosphorylase virkning Nu omdannes glucose 1-phosphat til UDP-glucose ved brug af UTP og frigørende PPi. UDP-glucose, sukker-nukleotidet donerer glukose til glykogensyntese. Denne reaktion er irreversibel, hvilket gør den irreversible syntetiske vej. Glykogensyntasevirkning Det katalyserer overførslen af glucoserester fra UDP glucose til den ikkereducerende ende af glykogen, dette enzym kan syntetisere glykogen uden primer her fungerer tidligere glykogenmolekyler som en primer, og enzym overfører glucose til den ikke-reducerende ende af primer glykogen, hvilket øger 1 glucoserest i hver cyklus. Når der ikke er nogen tidligere glykogener tilgængelige, så fungerer glycogenin (et protein) som en primer. Glykogensyntase kan ikke syntetisere (1-6)binding, fundet ved forgreningspunktet, så her har der brug for et andet enzym. Amylo (1-4) til (1-6) transglycosylase (glykogenforgrenende enzym) virkning Katalyserer overførslen af 6-7 glukoseresters lange fragment fra ikkereducerende ende til hydroxylgruppen af C-6 i den indre glukoserest, der skaber forgreningspunkt med (1-6) glykosidbinding, nu fungerer grenpunktet også som en primer. Læs også: Kulhydrater- definition, klassificering med struktur og funktioner Fotosyntese- Definition, ligning, trin, proces, diagram Graviditet uge for uge (baby og kropsudvikling, tips) Aminosyrer og proteiner - definition, struktur, typer, funktioner Hvordan indgår andre kulhydrater i den glykolytiske vej? Koordinere regulering af glykogensyntese og nedbrydning Glykogenbiosyntese og nedbrydning reguleres af koordination. Glykogenphosphorylase reguleres allosterisk og hormonalt, og glykogensyntase reguleres af phosphorylering og dephosphorylering. Regulering af glykogenphosphorylase Carl og Gerty Cori fandt ud af, at glykogenphosphorylase findes i to indbyrdes konverterbare former glykogenphosphorylase, en katalytisk aktiv og glykogenphosphorylase b katalytisk mindre aktiv. Phosphorylase b, der overvejende findes i hvilende muskler under kraftig muskelaktivitet adrenalin fører til phosphorylering af specifik ser-rest, omdanner den til mere aktiv form Phosphorylase a. Og når muskler gennemgår hvilefase, fjerner phosphorylase phosphatase phosphat fra phosphorylase a omdanner det til mindre aktiv form phosphorylase b. Processen reguleres i reaktionen på glukose. Regulering af glykogensyntase ved phosphorylering og dephosphorylering Glykogensyntase kan også eksistere i en aktiv og inaktiv form. Her er aktiv form glykogensyntase-a i uphosphoryleret form, dets fosforylering med glykogensyntasekinase 3 (GSK-3) fører til inaktiv form af glykogensyntaseb. Glykogensyntasekinase tilføjer phosphorylgruppe til tre ser-rester nær carboxylterminalen, den phosphorylerer simpelthen ikke, før en anden proteinkinase-caseinkinase II-phosphorylatglycogen på en nærliggende restproces kaldet priming. Enzym PP1 forårsager dephosphorylering ved phosphatase-virkning, hvilket gør det aktivt. Her kan processen reguleres i responsen på glucose 6-phosphat. Glykolyse Og Glukoneogenese - En Oversigt Og Sammenfatning 3. november 2020 af redaktører Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Glykolyse og glukoneogenese Glykolyse er processen med nedbrydning af glucose, mens gluconeogenese er syntesen af glucose. Glukoneogenese er det modsatte af glykolyse med nogle bypass-trin. Indholdsfortegnelse Glykolyse o o o Glukoneogenese o o o o Forberedende fase Udbetalingsfase Læs mere: Glykolyse 10 trin med diagram og ATP-dannelse Første bypass-trin Andet bypass-trin Tredje bypass-trin Læs mere: Gluconeogenese- De novo syntese af glukose Referencer og Kilder Glykolyse Glykolyse er en nedbrydning af et molekyle glucose til 2 pyruvatmolekyler gennem en række enzymkatalyserede reaktioner, og ATP & NADH produceres. Dette er en ti-trins proces, afsluttet i to-fase forberedelse og udbetalingsfaser. Første til fem reaktioner hører til den forberedende fase og seks til ti reaktioner hører til udbetalingsfasen. Glykolyseprocessen er som følger: Glykolysediagram Forberedende fase Trin først – I dette trin omdannes glucose til glucose 6-phosphat ved hydrolyse af en ATP til ADP i nærvær af hexokinaseenzym, det er en irreversibel reaktion. Trin andet – Dette er et isomeriseringstrin, glucose 6-phosphat omdannet til fructose 6-phosphat i nærvær af enzymet phosphohexoisomerase. Trin tredje - I løbet af dette trin finder igen irreversibel hydrolyse af ATP til ADP sted, og fructose 6-phosphat omdannes til fructose 1,6-bisphosphat, i nærvær af phosphofructokinase. Trin fjerde - Det er et trin til spaltning af 6-carbonforbindelse fructose 1,6bisphosphat til to triose phosphater, nemlig glyceraldehyd 3-phosphat og dihydroxyacetone phosphat, ved hjælp af aldolase enzym. Trin femte - Dihydroxyacetonephosphat isomeriseres til glyceraldehyd 3phosphat af triosephosphatisomerase. Udbetalingsfase Trin sjette – Her oxidation af 2 molekyler glyceraldehyd 3-phosphat til 1,3bisphosphoglycerat ved brug af to uorganiske fosfater, i nærvær af glyceraldehyd 3-phosphat dehydrogenase enzym og reduktion af 2NAD+ til 2NADH, H+. Trin syvende – Det er det første trin af ATP-produktion, her 2 molekyler af 1,3-bisphosphoglycerat omdannet til to molekyler af 3-phosphoglycerat med libration af 2ATP ved brug af 2ADP i nærvær af phosphoglycerat kinase. Trin otte - I dette trin ændres 2 molekyler af 3-phosphoglycerat til 2 molekyler af 2-phosphoglycerat ved phosphoglycerat mutase. Trin niende – Nu ved tilstedeværelse af enolase-enzym omdannes 2 molekyler 2-phosphoglycerat til 2 molekyler phosphoenolpyruvat ved frigørelse af 2 molekyler vand. Trin tiende – Det er det andet trin i ATP-produktionen og den tredje irreversible reaktion af denne vej. Her ændres 2 molekyler phosphoenolpyruvat til 2 molekyler pyruvat med libration 2ATP og brug af 2ADP i nærvær af pyruvatkinaseenzym. Læs mere: Glykolyse 10 trin med diagram og ATPdannelse Glukoneogenese Det er den omvendte reaktion af glykolyse fra pyruvat til glucose med 3 bypass-trin. Her studerer vi kun omkring 3 beståede trin, andre trin har en omvendt reaktion af glykolyse, så det er ikke nødvendigt at beskrive. Figur: Gluconeogenese-vej med nøglemolekyler og enzymer. Mange trin er det modsatte af dem, der findes i glykolysen. Billedkilde: Unused0026 (Wikipedia) . Første bypass-trin Det første trin, der skal omgås, er pyruvat til phosphoenolpyruvat, i dette trin ændres pyruvat ikke blot til PEP, men det er gennem det bypassede trin. For det første ændres 2 molekyler pyruvat til 2 molekyler oxaloacetat med hydrolyse af 2ATP med pyruvatcarboxylaseenzym. Derefter omdanner PEP-carboxykinase-enzym 2 molekyler oxaloacetat til 2 molekyler PEP med hydrolyse af 2GTP. Andet bypass-trin Det andet trin, der skal omgås, er fructose 1,6-bisphosphat til fructose 6phosphat, dette er heller ikke reversibelt, så det omgås af fructose 1,6bisphosphatase enzymet ved fjernelse af fosfat fra det første carbon af fructose 1,6- bisphosphat ændrer det til fructose 6-phosphat. Tredje bypass-trin Det tredje trin, der skal omgås, er glucose 6-phosphat til glucose, dette trin er heller ikke blot reversibelt, og omgås af glucose 6-phosphatase ved fjernelse af fosfat fra sjette kulstof af glucose, hvilket frigiver fri glucose. Glykolyse 10 Trin Med Diagram Og ATPDannelse 21. august 2020 af Somak Banerjee Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Aerob respiration refererer til begrebet nedbrydning af næringsstoffer og produktion af energi. Enhver organisme, når den indtager ethvert næringsmateriale, gennemgår materialet en række biokemiske reaktioner, hvorved simple former for kulhydrater, proteiner og lipider produceres. Derefter nedbrydes disse producerede forbindelser yderligere og producerer den energi, der kræves til organismen. Glykolyse refererer til den biokemiske vej, hvorved glukose nedbrydes til pyruvat og producerer energi i form af ATP. Det finder sted ved den cytoplasmatiske matrix af enhver prokaryot eller eukaryot celle. Glykolyse er også kendt som Embden – Meyerhof – Parnas pathway (EMP), da stien først blev opdaget af Gustav Embden, Otto Meyerhof og Jakub Karol Parnas. Glykolysediagram Indholdsfortegnelse Oversigt o o o o o o o 1. Fosforylering af glukose 2. Omdannelse af Glucose 6-phosphat til Fructose 6-phosphat 3. Fosforylering af Fructose 6-phosphat 4. Spaltning af Fructose 1,6 bis-phosphat 5. Interkonvertering af triosefosfaterne 6. Oxidation af Glyceraldehyd 3-phosphat til 1,3, Bisphosphoglycerat 7. Phosphoryloverførsel fra 1,3-bisphosphoglycerat til ADP o o o 8. Omdannelse af 3 phosphoglycerater til 2 phosphoglycerater 9. Dehydrering af 2 phosphoglycerater til phosphoenolpyruvat 10. Overførsel af phosphorylgruppen Antal ATP Reference Oversigt Glykolyseprocessen er opdelt i to faser. For det første består den forberedende fase af fem forskellige reaktioner. I denne fase omdannes glukosemolekylet til glyceraldehyd 3 fosfat ved at bevæge sig gennem forskellige reaktioner. To molekyler af ATP er investeret i denne fase, mens to nyligt syntetiserede molekyler af ATP er også fundet i slutningen af den forberedende fase. For det andet Payoff-fasen, hvor glyceraldehyder 3 fosfat bevæger sig gennem fem forskellige biokemiske reaktioner og omdannes til pyruvat. Produktion af ATP'er som energimolekyler er et vigtigt aspekt af udbetalingsfasen. Hvert trin i processen er nu beskrevet som følgende 1. Fosforylering af glukose Dette er det første trin i den forberedende fase, hvor glucose aktiveres ved involvering af enzymet kaldet hexokinase og omdannes til glucose 6 fosfat. Et ATP-molekyle bruges under dette trin som fosfatdonor. Hexokinase kræver Mg 2+ for at katalysere reaktionen. 2. Omdannelse af Glucose 6-phosphat til Fructose 6phosphat Phosphohexose isomeriserer (Phosphogulco isomerase) katalyserer reaktionen i nærvær af Mg 2+ , hvilket fører til reversibel isomerisering af glucose 6 fosfater (aldose) til fructose 6 fosfat (ketos). Denne isomerisering spiller en vigtig rolle for at fuldende den overordnede vej for glykolyse. Omlejringen af carbonyl- og hydroxylgruppen ved C1 og C2 er et afgørende skridt for at føre vejen videre. 3. Fosforylering af Fructose 6-phosphat Dette trin udnytter ATP som fosfatdonor og ved hjælp af enzymet phosphofructokinase – 1 (PFK-1) enzym (som katalyserer reaktionen), overføres en phosphorylgruppe til fructose 6-phosphat og producerer fructose 1,6-bis-phosphat. Dette er en irreversibel reaktion, der opstår på cellulært niveau, og det betragtes også som det første forpligtede skridt mod glykolyse, da glucose 6 fosfat og fructose 6 fosfat har andre forskellige involveringer, mens fructose 1, 6 bis-fosfat kun er målrettet mod glykolyse. 4. Spaltning af Fructose 1,6 bis-phosphat Her spaltes fructose 1,6 bisphosphat og producerer to forskellige triosefosfater såsom glyceraldehyd 3 fosfat og dihydroxyacetone fosfat. Aldolkondensationsreaktionen er reversibel og katalyseret af enzymet fructose 1,6 bis-phosphat aldolase (almindeligvis kendt som aldolase). 5. Interkonvertering af triosefosfaterne Glyceraldehyd 3-phosphat, produceret i det foregående trin, gennemgår forskellige biokemiske reaktioner af vejen. Mens dihydroxyacetonephosphat på den anden side hurtigt og reversibelt omdannes til glyceraldehyd 3-phosphat ved involvering af enzymet triosephosphat isomeriserer. 6. Oxidation af Glyceraldehyd 3-phosphat til 1,3, Bisphosphoglycerat Dette er det første trin i udbetalingsfasen. Reaktionen katalyseres af enzymet glyceraldehyd 3-phosphatdehydrogenase. Sammen med 1,3 bisphosphoglycerat produceres NADH+ H + også i denne fase. NADH er også et energimolekyle. 7. Phosphoryloverførsel fra 1,3-bisphosphoglycerat til ADP 3 Phosphoglycerat produceres i dette trin ved involvering af enzymet phosphoglycerat kinase. Enzymet overfører højenergi-phosphorylgruppen fra carbonylgruppen i 1,3-bisphosphoglycerat til ADP. Det fører til dannelsen af ATP. 8. Omdannelse af 3 phosphoglycerater til 2 phosphoglycerater I dette trin forskydes phosphorylgruppen i 3 phosphoglycerater til C-2stillingen, hvilket giver 2 phosphoglycerater. Reaktionen katalyseres af enzymet phosphoglycerat mutase, som kræver Mg 2+ ion for sin aktivitet. 9. Dehydrering af 2 phosphoglycerater til phosphoenolpyruvat Phosphoenol pyruvat produceres af 2 phosphoglycerater på grund af frigivelsen af vandmolekyler. Reaktionen katalyseres af enzymet enolase. 10. Overførsel af phosphorylgruppen Pyruvatkinase katalyserer den sidste reaktion af glykolyse, hvor phosphorylgruppen frigives fra phosphoenolpyruvat og forbindes med ADP og fører til produktion af ATP. Antal ATP ATP produceret fra glykolyse = 2 ATP 2 NADPH (3 ATP hver i ETC)= 6 ATP i ETC Glykolyse 10 Trin Med Diagram Og ATPDannelse 21. august 2020 af Somak Banerjee Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Aerob respiration refererer til begrebet nedbrydning af næringsstoffer og produktion af energi. Enhver organisme, når den indtager ethvert næringsmateriale, gennemgår materialet en række biokemiske reaktioner, hvorved simple former for kulhydrater, proteiner og lipider produceres. Derefter nedbrydes disse producerede forbindelser yderligere og producerer den energi, der kræves til organismen. Glykolyse refererer til den biokemiske vej, hvorved glukose nedbrydes til pyruvat og producerer energi i form af ATP. Det finder sted ved den cytoplasmatiske matrix af enhver prokaryot eller eukaryot celle. Glykolyse er også kendt som Embden – Meyerhof – Parnas pathway (EMP), da stien først blev opdaget af Gustav Embden, Otto Meyerhof og Jakub Karol Parnas. Glykolysediagram Indholdsfortegnelse Oversigt o o o o o o o 1. Fosforylering af glukose 2. Omdannelse af Glucose 6-phosphat til Fructose 6-phosphat 3. Fosforylering af Fructose 6-phosphat 4. Spaltning af Fructose 1,6 bis-phosphat 5. Interkonvertering af triosefosfaterne 6. Oxidation af Glyceraldehyd 3-phosphat til 1,3, Bisphosphoglycerat 7. Phosphoryloverførsel fra 1,3-bisphosphoglycerat til ADP o o o 8. Omdannelse af 3 phosphoglycerater til 2 phosphoglycerater 9. Dehydrering af 2 phosphoglycerater til phosphoenolpyruvat 10. Overførsel af phosphorylgruppen Antal ATP Reference Oversigt Glykolyseprocessen er opdelt i to faser. For det første består den forberedende fase af fem forskellige reaktioner. I denne fase omdannes glukosemolekylet til glyceraldehyd 3 fosfat ved at bevæge sig gennem forskellige reaktioner. To molekyler af ATP er investeret i denne fase, mens to nyligt syntetiserede molekyler af ATP er også fundet i slutningen af den forberedende fase. For det andet Payoff-fasen, hvor glyceraldehyder 3 fosfat bevæger sig gennem fem forskellige biokemiske reaktioner og omdannes til pyruvat. Produktion af ATP'er som energimolekyler er et vigtigt aspekt af udbetalingsfasen. Hvert trin i processen er nu beskrevet som følgende 1. Fosforylering af glukose Dette er det første trin i den forberedende fase, hvor glucose aktiveres ved involvering af enzymet kaldet hexokinase og omdannes til glucose 6 fosfat. Et ATP-molekyle bruges under dette trin som fosfatdonor. Hexokinase kræver Mg 2+ for at katalysere reaktionen. 2. Omdannelse af Glucose 6-phosphat til Fructose 6phosphat Phosphohexose isomeriserer (Phosphogulco isomerase) katalyserer reaktionen i nærvær af Mg 2+ , hvilket fører til reversibel isomerisering af glucose 6 fosfater (aldose) til fructose 6 fosfat (ketos). Denne isomerisering spiller en vigtig rolle for at fuldende den overordnede vej for glykolyse. Omlejringen af carbonyl- og hydroxylgruppen ved C1 og C2 er et afgørende skridt for at føre vejen videre. 3. Fosforylering af Fructose 6-phosphat Dette trin udnytter ATP som fosfatdonor og ved hjælp af enzymet phosphofructokinase – 1 (PFK-1) enzym (som katalyserer reaktionen), overføres en phosphorylgruppe til fructose 6-phosphat og producerer fructose 1,6-bis-phosphat. Dette er en irreversibel reaktion, der opstår på cellulært niveau, og det betragtes også som det første forpligtede skridt mod glykolyse, da glucose 6 fosfat og fructose 6 fosfat har andre forskellige involveringer, mens fructose 1, 6 bis-fosfat kun er målrettet mod glykolyse. 4. Spaltning af Fructose 1,6 bis-phosphat Her spaltes fructose 1,6 bisphosphat og producerer to forskellige triosefosfater såsom glyceraldehyd 3 fosfat og dihydroxyacetone fosfat. Aldolkondensationsreaktionen er reversibel og katalyseret af enzymet fructose 1,6 bis-phosphat aldolase (almindeligvis kendt som aldolase). 5. Interkonvertering af triosefosfaterne Glyceraldehyd 3-phosphat, produceret i det foregående trin, gennemgår forskellige biokemiske reaktioner af vejen. Mens dihydroxyacetonephosphat på den anden side hurtigt og reversibelt omdannes til glyceraldehyd 3-phosphat ved involvering af enzymet triosephosphat isomeriserer. 6. Oxidation af Glyceraldehyd 3-phosphat til 1,3, Bisphosphoglycerat Dette er det første trin i udbetalingsfasen. Reaktionen katalyseres af enzymet glyceraldehyd 3-phosphatdehydrogenase. Sammen med 1,3 bisphosphoglycerat produceres NADH+ H + også i denne fase. NADH er også et energimolekyle. 7. Phosphoryloverførsel fra 1,3-bisphosphoglycerat til ADP 3 Phosphoglycerat produceres i dette trin ved involvering af enzymet phosphoglycerat kinase. Enzymet overfører højenergi-phosphorylgruppen fra carbonylgruppen i 1,3-bisphosphoglycerat til ADP. Det fører til dannelsen af ATP. 8. Omdannelse af 3 phosphoglycerater til 2 phosphoglycerater I dette trin forskydes phosphorylgruppen i 3 phosphoglycerater til C-2stillingen, hvilket giver 2 phosphoglycerater. Reaktionen katalyseres af enzymet phosphoglycerat mutase, som kræver Mg 2+ ion for sin aktivitet. 9. Dehydrering af 2 phosphoglycerater til phosphoenolpyruvat Phosphoenol pyruvat produceres af 2 phosphoglycerater på grund af frigivelsen af vandmolekyler. Reaktionen katalyseres af enzymet enolase. 10. Overførsel af phosphorylgruppen Pyruvatkinase katalyserer den sidste reaktion af glykolyse, hvor phosphorylgruppen frigives fra phosphoenolpyruvat og forbindes med ADP og fører til produktion af ATP. Antal ATP ATP produceret fra glykolyse = 2 ATP 2 NADPH (3 ATP hver i ETC)= 6 ATP i ETC Pancreashormoner 5. februar 2020 af redaktører Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Indholdsfortegnelse Bugspytkirtel 1. Insulin o o o Struktur Regulering Fungere 2. Glukagon o o Struktur Fungere 3. Somatostatin 4. Pancreas polypeptid (PP) Diabetes mellitus Type 1 diabetes mellitus Type 2 diabetes mellitus Arvelige former for diabetes mellitus 5. Amylin Referencer Pancreashormoner Bugspytkirtel Bugspytkirtlen er et kirtelorgan i den øvre midterregion, men den fyldes ud som to organer i ét: et mave-relateret eksokrint organ og et hormonafgivende endokrine organ. Bugspytkirtlen fungerer som et eksokrint organ og udleder katalysatorer for at adskille proteiner, lipider, sukkerarter og nukleinsyrer i næring. Bugspytkirtlen fungerer som et endokrint organ og udskiller hormonerne insulin og glukagon for at kontrollere glukoseniveauet i løbet af dagen. Begge disse forskellige kapaciteter er afgørende for kroppens udholdenhed. Disse er skabt af et specifikt væv i bugspytkirtlen og derefter udledt til den slanke ramme og ankommet til leveren ved indgangen venøs spredning. Det specifikke væv kaldes Langerhans øer. Langerhanske øer taler til omkring 1-2 % af bugspytkirtlen. Tre slags celler genkendes i disse øer. A-celler – ansvarlig for produktionen af glukagon (25 % af alle øceller). B-celler - ansvarlige for insulinproduktion (60% af alle ø-celler). D-celler – ansvarlige for produktionen af somatostatin (10 % af alle ø-celler). F-celler - ansvarlige for produktionen af pancreas-polypeptider (5% af alle ø-celler). Langerhanske øer påtager sig et væsentligt job i stivelsesfordøjelsen, således i en plasmaglucoseabsorption. Det involverer: Glykolyse - den anaerobe omdannelse af glucose til laktat. Foregår i røde blodlegemer, nyremarven og skeletmuskulaturen. Glykogenese - syntesen af glykogen fra glucose. Glukose lagres (i leveren, musklerne) i form af glykogen, og dette tjener til at opretholde en konstant plasmaglukosekoncentration. Glykogenolyse - nedbrydning af glykogen til glucose. Gluconeogenese - produktion af glukose fra ikke-sukkermolekyler (aminosyrer, laktat, glycerol) Lipolyse - nedbrydning af triacylglyceroler til glycerol og frie fedtsyrer. Lipogenese - syntesen af triacylglyceroler. Fungere Bugspytkirtelhormoner er ansvarlige for opbevaring af fedt og glukose, som glykogen, efter måltidet. Muliggør mobilisering af energireserver på grund af madmangel, stress og fysisk aktivitet. Oprethold den konstante plasmaglukosekoncentration. Fremme vækst. Billedkilde: Pancreatic Hormones and Control of Blood Glucose: Et blik og en oversigt over bugspytkirtlen 1. Insulin Struktur Insulin er et peptid, der indeholder en α-kæde på 21 aminosyrer lang bundet til en 30 aminosyre β-kæde via to disulfidbroer. Forstadiet til insulin er preproinsulin, som indeholder en signalsekvens, der fjernes yderligere i det endoplasmatiske retikulum og omdanner forstadiet til dets pro-hormon kaldet proinsulin. Proinsulin ændres til insulin efter fjernelse af et C-peptid fra pro-hormonet. Insulinreceptoren består af 2 ekstracellulære α-underenheder og to transmembrane β-underenheder. Når insulin er tæt på receptoren, binder det til receptorens a-underenheder. Denne binding fører til autophosphorylering af insulinreceptorens β-underenheder. Disse βunderenheder fungerer derefter som receptortyrosinkinaser, der phosphorylerer insulinreceptorunderenheder. Signalet bevæger sig derefter nedstrøms til intracellulære proteiner. Regulering Insulin udskilles hovedsageligt som reaktion på stigninger i blodets glukoseniveau. Det højere niveau af glukose forårsager, at glukose trænger ind i B-cellerne og omdannes til et glukose-6-fosfat. Dette skaber den cytosoliske ATP og fører til en lukning af ATP-gatede K+-kanaler, der fører til depolarisering, hvilket resulterer i, at spændingsstyrede Ca 2+ kanaler åbner og niveauet af cytosolisk Ca 2+ stiger og rekrutterer exocytose af insulin og genåbning af K+ kanaler. Insulinsekretion stimuleres under fordøjelsen via acetylcholin (vagusnerven), gastrin, sekretin. Visse aminosyrer som arginin og leucin stimulerer også sekretionen samt frie fedtsyrer og nogle steroidhormoner. Sekretionen hæmmes via epinephrin og noradrenalin. Disse aktiveres, når hypoglykæmi detekteres af centrale kemoreceptorkanaler og derefter til depolarisering. Depolarisering forårsager en åbning af spændingsstyrede Ca 2+ kanaler, og niveauet af cytosolisk Ca 2+ stiger og initierer exocytose af insulin og genåbning af K + kanaler. Insulinsekretion stimuleres under fordøjelsen via acetylcholin (vagusnerven), gastrin, sekretin. Visse aminosyrer som arginin og leucin stimulerer også sekretion samt FFA'er og nogle steroidhormoner. Sekretionen undertrykkes via epinephrin og noradrenalin. Disse udløses, når hypoglykæmi genkendes af fokale kemoreceptorkanaler og derefter til depolarisering, hvilket resulterer i, at spændingsstyrede Ca2 + -kanaler åbner, og niveauet af cytosolisk Ca2 + stiger og initierer exocytose af insulin og genåbning af K + -kanaler. Insulinsekretion stimuleres under fordøjelsen via acetylcholin (vagusnerven), gastrin, sekretin. Insulinsekretion stimuleres under fordøjelsen via acetylcholin (vagusnerven), gastrin, sekretin. Fungere Insulin har anabolske og lipogene virkninger. Opbevaringen af glukose i leveren stimuleres og aktiverer også enzymer for at fremme glykolyse og glykogenese. Derudover fremmer det optagelsen og lagringen af aminosyrer i den slags proteiner og fremmer væksten. Insulin øger også mængden af GLUT-4. (Glucosetransportører er til stede i skeletmyocytter, så glukose kan trænge ind i cellen. Glucose kan bevæge sig ind i cellen på to forskellige måder. Den ene er med natrium som en sekundær aktiv transport og den anden er gennem glukosetransporter, lettet diffusion). Insulin påvirker mange organer. Det stimulerer skeletmuskelfibre til optage glukose og ændre det til glykogen; optage aminosyrer fra blodet og omdanne dem til protein. virker på leverceller stimulerer dem til at optage glukose fra blodet og ændre det til glykogen mens hæmning af enzymproduktion, der er involveret i at nedbryde glykogen tilbage, hæmmer "gluconeogenese"; det vil sige omdannelsen af fedt og proteiner til glukose. virker på fedtceller (fedt) for at stimulere optagelsen af glukose og syntesen af fedt. virker på celler i hypothalamus for at reducere appetitten. Under sådanne omstændigheder aktiverer insulin disse virkninger ved at binde et transmembranprotein indlejret i de reagerende cellers cellemembran til insulinreceptoren. For at opsummere er slutproduktet af disse reaktioner: kapaciteten af de opløselige kosttilskud tilbageholdt fra fordøjelsessystemet til uopløselige, vitalitetsrige genstande (glykogen, protein, fedt) et fald i blodsukkerniveauet 2. Glukagon Struktur Glucagon er et peptid afledt af proglucagon (glicentin). Glukagonsekretion stimuleres af aminosyrer, arginin og alanin, fra fordøjede proteiner og desuden af hypoglykæmi på grund af fysisk træning og sympatiske drivkræfter. Udledningen hæmmes af glucose, somatostatin og høje plasmakoncentrationer af frie fedtsyrer. Fungere Glukagon antagoniserer hovedsageligt insulin. Signalet fra glukagonreceptoren spredes via cAMP. Glukagon øger glykogenolyse i leveren, stimulerer glukoneogenese fra laktat, proteinnedbrydning og lipolyse. Dens vigtigste rolle er at opretholde den regelmæssige koncentration af glukose mellem måltiderne for at sikre konstant energiforsyning. 3. Somatostatin Somatostatin frigives som reaktion på højere plasmakoncentrationer af glucose og arginin. Gennem parakrine veje hæmmer frigivelsen af insulin og også sekretionen af glukagon. Under mangel på glukose forekommer denne proces ikke på grund af frigivelsen af katekolaminer, der hæmmer udskillelsen af somatostatin. 4. Pancreatisk polypeptid ( PP ) F-cellerne på øerne udskiller et 36-aminosyre pancreaspolypeptid, som reducerer appetitten. PP's funktion er at selvregulere bugspytkirtelsekretionsaktiviteter (endokrine og eksokrine); det har også virkninger på hepatiske glykogenniveauer og gastrointestinale sekretioner. Dets sekretion hos mennesker øges efter et proteinmåltid, faste, træning og akut hypoglykæmi og reduceres af somatostatin og intravenøs glukose. Diabetes mellitus Diabetes mellitus is an endocrine disorder characterized by many signs and symptoms. Primary among these are: failure of the kidney to proficiently recover glucose all together that glucose overflows into the urine resulting rise in the level of urine due to the osmotic effect of glucose There are three categories of diabetes mellitus: Type 1 Type 2 Inherited Forms of Diabetes Mellitus Type 1 Diabetes Mellitus (Also known as Insulin-Dependent Diabetes Mellitus or IDDM) is portrayed by pretty much low or no flowing insulin; most generally shows up in youth. It results from the obliteration of the beta cells of the islets. The annihilation results from a cell-intervened immune system assault against the beta cells. What triggers this assault stays a riddle. One prospect: peptides got from insulin may attach to random peptides to make a “neoantigen”; that is, an antigen that was absent when resilience to self-antigens was being built up. Type 1 diabetes is constrained via cautiously managed infusions of insulin. (Insulin can’t be taken by mouth since being a protein, it would be processed. On the other hand, the U.S. FDA has endorsed an insulin inhaler that conveys insulin through the lungs and may lessen the quantity of every day infused dosages required). For a long time, insulin removed from the organs of cows and pigs was utilized. Notwithstanding, pig insulin varies from human insulin by one amino corrosive; meat insulin by three. Albeit both work in people to bring down glucose, they are seen by the insusceptible framework as “foreign” and initiate a counteracting agent reaction in the patient that blunts their impact and requires higher dosages. This can be solved by: Convert pig insulin into human insulin by evacuating the one amino corrosive that recognizes them and supplanting it with the human adaptation. This methodology is costly, so now the supported methodology is to Insert the human gene for insulin into E. coli and grow recombinant human insulin in culture tanks. Insulin is not a glycoprotein so E. coli can make a completely useful particle (trade name = Humulin). Yeast is also utilized (trade name = Novolin). Recombinant DNA innovation has additionally made it potential to make marginally changed types of human insulin that work quicker (Humalog® and NovoLog®) or slower (Lantus®) than standard human insulin. Injections of insulin must be done cautiously. Injections after overwhelming activity or long after dinner may drive the glucose level down to a hazardously low worth causing an insulin response. The patient gets bad-tempered, exhausted, and may lose awareness. In the event that the patient is as yet cognizant, giving a wellspring of sugar (e.g., sweet) by mouth typically takes care of the issue rapidly. Injections of glucagon are sometimes used. Type 2 Diabetes Mellitus Type 2 is also known as Non-Insulin-Dependent Diabetes Mellitus (NIDDM) and adult-onset diabetes. However, this sort, in the end, prompts insulin reliance and furthermore is presently showing up in numerous kids so those terms are never again proper. Many people develop Type 2 diabetes mellitus without a drop in insulin levels (in any event from the start). As a rule, the issue gives off an impression of being an inability to communicate an adequate number of glucose transporters in the plasma membrane (and T-system) of their skeletal muscles. Normally at the point insulin ties to its receptor on the cell surface and starts a chain of occasions that prompts the inclusion in the plasma film of expanded quantities of a transmembrane glucose transporter (called GLUT4). This transporter formulates a network that allows the facilitated diffusion of glucose into the cell. Skeletal muscle is the main “sink” for expelling abundance glucose from the blood (and changing over it into glycogen). In T2D, the patient’s capacity to expel glucose from the blood and convert it into glycogen might be just 20% of typical. This is called insulin resistance. Curiously, excessive vital exercise appears to build the statement of the glucose transporter on skeletal muscle and this may clarify why T2D is progressively regular in individuals who live lavish lives. T2DM usually occurs in adults & mainly in obese people. However, throughout the most recent couple of years in the U. S., the frequency of type 2 diabetes in kids has developed to where they currently represent 20% of all recently analyzed cases (and, similar to their grown-up partners, are normally obese). A few medications, which can all be taken by mouth, are helpful in reestablishing better command over glucose in patients with T2D. In any case, late over the span of malady, patients may need to start to take insulin. It is just as following quite a while of siphoning out insulin with an end goal to defeat the patient’s insulin obstruction, the β-cells become depleted. Inherited Forms of Diabetes Mellitus A few instances of diabetes result from mutated genes acquired from one of the two parentages. Examples: the mutant inheritable factor for one or another of the transcription factors needed for transcription of the insulin gene changes in one of the two duplicates of the quality encoding the insulin receptor. These patients, for the most part, have extrasignificant levels of coursing insulin however imperfect receptors. The mutated receptors: maybe unsuccessful to be articulated accurately at the cell surface or maybe unsuccessful to convey an operative sign to the inside of the cell. a mutated variety of the gene encoding glucokinase. mutations in the inheritable factor coding part of potassium channels in the cell membrane of the β-cell. The channels become unsuccessful to close appropriately making the cell become hyperpolarized and blocking insulin secretion. changes in a few mitochondrial qualities which decrease insulin discharge by β-cell. These ailments are acquired from the mother as just her mitochondria get by in the prepared egg. While symptoms usually appear in childhood or adolescence, patients with acquired diabetes vary from most youngsters with T2D in having a history of diabetes in the family and not being obese. Read Also: Endocrine System- Definition, Glands, Hormones, Functions, Disorders Connective Tissue- definition, structure, cells, types, functions, diseases The Human Digestive System- Organs, Functions and Diagram Pituitary Gland- Definition, Structure, Hormones, Functions, Disorders Pancreas- Definition, Structure, Hormones, Functions, Disorders 5. Amylin Amylin is a peptide of 37 amino acids, which is also released by the β-cells of the pancreas. Some of its actions: inhibits the secretion of glucagon; slows the clearing of the stomach; sends a signal of fullness to the brain. The entirety of its activities will in general increase actions like insulin, diminishing the degree of glucose in the blood. A manufactured type of amylin with modification (pramlintide or Symlin®) is utilized in the treatment of T2D. eedback-Mekanisme - Definition, Typer, Proces, Eksempler, Applikationer 21. januar 2021 af Anupama Sapkota Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Indholdsfortegnelse Definition af feedbackmekanisme Positiv feedback-mekanisme loop o o Definition af positiv feedback-mekanisme Trin / proces / mekanisme for positiv feedback-mekanisme o Negativ feedback-mekanisme loop o o o Eksempler på positiv feedback-mekanisme Definition af negativ feedback-mekanisme Trin / proces / mekanisme for negativ feedback-mekanisme Eksempler på negativ feedback-mekanisme Anvendelser af feedback-mekanisme Positiv feedback vs negativ feedback (8 nøgleforskelle) Referencer Kilder Feedback Mekanism Definition Feedbackmekanismen er det fysiologiske reguleringssystem i en levende krop, der arbejder på at bringe kroppen tilbage til den normale indre tilstand eller homeostase. Disse mekanismer findes også i naturen i forskellige økosystemer og dyregrupper. Feedbackmekanismen i det levende system opstår i form af en løkke, som hjælper med at opretholde homeostase. Feedbackmekanismen aktiveres som følge af ændringen i systemet, der udløser et output. Det biokemiske kontrolsystem i levende væsener er sammensat af forskellige komponenter som molekyler, gener og regulatoriske interaktioner af sådanne komponenter. Interaktionen mellem komponenterne kan betegnes som positiv, når aktiveringen af en komponent fører til aktivering af en anden. Den betegnes negativ, hvis aktiveringen af en komponent fører til deaktivering af en anden. Begrebet feedbackmekanisme blev oprindeligt introduceret i kybernetik for at beskrive et kontrolsystems evne til at ændre sit output som et svar på input. I levende systemer arbejder feedback-mekanismer eller feedbackloops på at bringe kroppen mod homeostase ved enten at forstærke en specifik biologisk vej eller funktion eller ved at hæmme den. Den vigtigste funktion af feedbackmekanismen i ethvert system er at bringe kroppens tilstand i en stabil tilstand. Feedbackmekanismen består af tre forskellige komponenter; kontrolcenter, detektor og effektor. Kontrolcentret er 'hjerne' i systemet, der bestemmer yderpunkterne, inden for hvilke den variable faktor skal ligge. Detektoren eller sensoren modtager input og integrerer den indkommende information for at sende den til kontrolcentret. Baseret på de indgående signaler afgør kontrolcentret, om der er behov for en justering, og sender signalet til effektoren. Effektoren modtager outputtet og resulterer i en passende ændring for at holde den variable faktor inden for sin grænse. Feedbackmekanismen er en dynamisk proces, der foretager ændringer løbende for at justere forskellige fysiologiske parametre. Typer af feedbackmekanisme Feedbackmekanismer er af to typer afhængigt af ændringerne i input eller afvigelsen af de fysiologiske parametre fra deres grænser. Selvom disse mekanismer er forskellige i deres reaktioner på ændringer i variabler, er komponenterne i løkken ens. Billedkilde: OpenStax . Positiv feedback-mekanisme loop Definition af positiv feedback-mekanisme En positiv feedback-mekanisme, som navnet antyder, er en vej, der som reaktion på en afvigelse i output får output til at ændre sig endnu mere i retning af den initiale afvigelse. En positiv feedback-mekanisme forstærker afvigelserne og bringer tilstandsændringer til outputtet. Positive feedback-mekanismer er langt mindre almindelige end negative feedback-mekanismer, da det flytter kroppen væk fra homeostase. Processen med positiv feedback-mekanisme forstærker progressivt responsen, så længe stimulus fortsættes. Den positive feedback loop kan bestå af enten en enkelt komponent, der aktiverer sin egen aktivitet, eller flere komponenter med direkte og indirekte interaktioner. Positive feedback-sløjfer i biologiske processer observeres ofte i processer, der skal ske hurtigt og hen imod afslutning, da output har en tendens til at øge effekten af stimulus. Positive mekanismer er meget få i levende systemer som menneskekroppen, men disse kan også observeres i økosystemet, som i tilfælde af modning af frugt. Trin / proces / mekanisme for positiv feedbackmekanisme Processen med en positiv feedback-loop består af et kontrolsystem, der består af forskellige komponenter, der arbejder i en cirkulær bane for at stimulere eller hæmme hinanden. Den overordnede proces kan beskrives ud fra komponenterne i systemet. 1. Stimulering Det første trin i den positive feedback-løkke er den stimulering, der sætter løkken i gang for at fuldføre en proces. Stimulierne i den menneskelige krop er for det meste hormoner, der frigives af forskellige organer som følge af initieringen af en proces. Et eksempel på en stimulus, der igangsætter en positiv feedbackmekanisme, er sammentrækningen under fødslen. 2. Reception Det andet trin i løkken er modtagelsen af stimuli gennem forskellige sensorer, der sender informationen til kontrolenheden. Disse receptorer er for det meste nerver, der sender signalet fra stimulusstedet til kontrolenheden, som hos mennesker er hjernen. 3. Bearbejdning Det næste trin i løkken er behandlingen af informationer sendt til kontrolenheden af receptorerne. Kontrolenheden samler informationen for at kontrollere, om stimulus er uden for det normale interval for værdien og præsenterer et output. Ved fødslen modtager hjernen information om sammentrækningerne i livmodervæggen og stimulerer derefter hypofysens udskillelse af hormonet oxytocin. 4. Yderligere aktivering af stimuli Informationen fra hjernen sendes til handlingsstedet via forskellige nerver for at inducere et output som reaktion på stimulus. I tilfælde af den positive feedback-loop har signalerne fra hjernen en tendens til at aktivere stimulus endnu længere i afvigelsesretningen. Stimuleringen af hypofysen til at frigive oxytocin, som yderligere øger sammentrækningerne af muskler i livmodervæggen under fødslen er et eksempel på denne proces. Eksempler på positiv feedback-mekanisme 1. Menstruationscyklus I begyndelsen af menstruationscyklussen frigiver æggestokkene hormonet østrogen. Østrogenet virker som en stimulans for den positive feedback-loop. Informationen sendes til hjernen, som derefter stimulerer frigivelsen af gonadotropin-frigivende hormon fra hypothalamus og luteiniserende hormon fra hypofysen. Disse hormoner frigives som en reaktion på stimulus af kontrolenheden. Disse hormoner forårsager yderligere frigivelse af østrogen fra æggestokkene, og løkken fortsætter, indtil niveauerne af disse hormoner stiger nok til at inducere frigivelsen af follikelstimulerende hormon. Frigivelsen af follikelstimulerende hormon resulterer endelig i ægløsning, og til sidst begynder menstruationscyklussen. Dette er et eksempel på en positiv feedback-mekanisme, da stigningen i én faktor inducerer bevægelsen af output i samme retning, indtil opgaven er fuldført. 2. Fødsel Figur: Normal fødsel er drevet af en positiv feedback-loop. En positiv feedback-loop resulterer i en ændring i kroppens status snarere end en tilbagevenden til homeostase. Billedkilde: OpenStax . Positiv feedback-mekanisme hos mennesker observeres også under fødslen, som fremkaldes af babyens presning af æggestokvæggen. Den trykkende fornemmelse sendes til hjernen via forskellige nerver, og som reaktion stimulerer hjernen hypofysen til at producere oxytocin. Oxytocin er ansvarlig for sammentrækningerne af livmodermusklerne, som forårsager fosterets bevægelse mod livmoderhalsen, hvilket yderligere øger stimulus. Den positive feedback-loop fortsætter, indtil barnet er født. Negativ feedback-mekanisme loop Definition af negativ feedback-mekanisme En negativ feedback-mekanisme eller sløjfe er en vej stimuleret af afvigelsen i outputtet, som forårsager ændringer i output til den modsatte retning af den oprindelige afvigelse. Den negative feedback-mekanisme flytter de variable faktorer mod den stabile tilstand eller homeostase, efter at kontrolenheden fortolker omfanget af afvigelsen. Negative feedback-loops er mere almindelige end positive, da de har tendens til at stabilisere systemet. Sløjfen registrerer ændringen i output og virker i den modsatte retning for at ophæve den stimulus, der forårsager ændringen. Disse sløjfer aktiveres under to forhold; når værdien af variablen er over normalværdien og skal bringes ned, og når værdien af variablen er under normalværdien og skal bringes op. Negative feedback-mekanismer forekommer som en del af homeostase for at bringe variablerne tilbage til deres normale niveauer ved at modvirke stimulus, hvilket forårsager afvigelsen i første omgang. Ligesom i en positiv feedback-mekanisme indeholder en negativ feedback-mekanisme også forskellige komponenter, der tilsammen er med til at opretholde en stabil tilstand. Trin / proces / mekanisme for negativ feedbackmekanisme Processen med negativ feedback-mekanisme ligner den positive feedbackløkke, da processen aktiveres af stimuli, hvilket i sidste ende fører til ændringer, der har tendens til at annullere disse stimuli. Den overordnede proces kan beskrives som nedenfor: 1. Stimulering Det første trin i den negative feedback-løkke er genereringen af stimuli som et resultat af afvigelsen af fysiologiske parametre fra den normale værdi. Afvigelsen af fysiologiske parametre kan forekomme i begge ekstremer. Afvigelsen kan enten kræve aktivering eller hæmning af forskellige fysiologiske aktiviteter i kroppen for at opretholde den normale tilstand. Den mest almindelige og letforståelige stimulus er ændringen i kropstemperaturen væk fra den normale grænse. 2. Reception Ændringerne i de fysiologiske parametre modtages af kontrolenheden via forskellige receptorer til stede i forskellige dele af kroppen. Nogle af de almindelige receptorer involveret i transmissionen af stimulus inkluderer nerver og andre termoreceptorer. 3. Bearbejdning Sløjfens kontrolenhed er hjernen, som først afgør, om ændringen i den fysiologiske parameter kræver aktivering af hæmning af løkken. Afhængigt af afvigelsesretningen udsender hjernen signaler for at fortryde ændringerne via forskellige mekanismer. I tilfælde af ændringer i kropstemperaturen fungerer cellegruppen i hjernens hypothalamus som kontrolenhed. 4. Modvirke stimulus Som det sidste trin i sløjfen udsender kontrolenheden signaler for at ophæve virkningerne, der forårsager ændringer i de fysiologiske faktorer. Forandringerne kan være af forskellig art og rettet mod forskellige dele af kroppen. Informationen sendes til forskellige organer via nervesystemet. I tilfælde af et fald i kropstemperaturen udsender hypothalamus signaler, der resulterer i rysten, sammensnøring af blodkar og adfærdsændringer som at krølle sammen. Disse aktiviteter resulterer i en stigning i kropstemperaturen, som så hæmmer løkken, og processen er afsluttet, indtil kropstemperaturen falder igen. Eksempler på negativ feedback-mekanisme 1. Regulering af blodsukkerniveau Niveauet af glukose i blodet styres af en negativ feedbackmekanisme. Hvis blodsukkerniveauet stiger ud over normalområdet, optages mere glukose i tarmen og lagres i form af glykogen i leveren. Omdannelsen og konserveringen styres af frigivelsen af insulin fra bugspytkirtlen. Hormonet insulin stimulerer muskler og lever til at optage glukosen. Hvis blodsukkerniveauet falder, og der kræves mere glucose i blodet, hæmmes frigivelsen af insulin, hvilket reducerer absorptionen af blodsukker. Figur: Regulering af blodsukkerniveau. Billedkilde: OpenStax . 2. Temperaturregulering Regulering af kropstemperatur ved endotermer er et andet klassisk eksempel på en negativ feedback-mekanisme i den menneskelige krop. Når temperaturen i kroppen stiger ud over det normale, signalerer hjernen forskellige organer i kroppen som huden om at frigive varme i form af sved. Disse fysiologiske aktiviteter falder i sidste ende temperaturen til et punkt, hvor den negative feedback-mekanismes veje lukker ned. En lignende proces opstår, hvis kropstemperaturen stiger ud over den normale værdi for at opretholde homeostase. Figur: I en negativ feedback-loop modstås en stimulus - en afvigelse fra et sætpunkt - gennem en fysiologisk proces, der returnerer kroppen til homeostase. (a) En negativ feedback-loop har fire grundlæggende dele. (b) Kropstemperaturen reguleres af negativ feedback. Billedkilde: OpenStax . Anvendelser af feedback-mekanisme Feedbackmekanisme har applikationer i forskellige systemer og områder til forskellige formål. 1. I biologi er feedbackmekanismer involveret i opretholdelsen af homeostase i organismer såvel som økosystemer. Både positive og negative feedback-mekanismer er involveret i homeostase, men negativ feedback-mekanisme er mere almindelig. 2. Feedbackmekanismen bruges i matematik og dynamiske systemer til at ændre adfærden af forskellige systemer i henhold til applikationens behov. 3. Forskellige undersøgelser af klimavidenskab er blevet udført ved brug af positive og negative feedback-mekanismer til at observere effekten på atmosfæren, havet og landjorden. 4. Den mest almindelige anvendelse af feedbackmekanisme er i elektronisk teknik, hvor mekanismen bruges i komponenter som forstærkere, oscillatorer og logiske kredsløb. Positive Feedback vs Negative Feedback (8 Key Differences) Characteristics Positive Feedback Negative Feedback Definition The positive feedback mechanism is a pathway that in response to a deviation in the output causes the output to change even more in the direction of the initial deviation. A negative feedback mechanism or loop is a pathway stimulated by the deviation in the output, which causes changes in output to the direction opposite to the initial deviation. Effect on the homeostasis A positive feedback mechanism breaks down the homeostasis system of the body. A negative feedback mechanism works to maintain the conditions of homeostasis in the body. Occurrence The positive feedback mechanism is less common and occurs in specific situations. Den negative feedback-mekanisme er mere almindelig og forekommer i forskellige organer og systemer i kroppen. Stabilitet Den positive feedback-mekanisme er mindre stabil. Den negative feedback-mekanisme er mere stabil. Effekt I et system med en positiv feedbackmekanisme øges det effektive input ved tilføjelse af faktisk input med feedback-signalet. I et system med en negativ feedbackmekanisme reduceres det effektive input, da feedbacksignalet hæmmer det faktiske input. Ekstern afbrydelse En positiv feedback-mekanisme kan kræve en ekstern afbrydelse. En negativ feedback-mekanisme kræver ikke en ekstern afbrydelse. Ændringer Det øger ændringen i fysiologiske faktorer. Det modstår ændringer i fysiologiske faktorer. Positiv feedback-mekanisme i naturen observeres under fødslen hos mennesker og under modningen af frugter. Eksempler Den negative feedback-mekanisme observeres under termoregulering og opretholdelse af blodsukkerniveauet. RNA Polymerase- Definition, Egenskaber, Struktur, Typer, Funktioner 27. februar 2022 af Rajat Thapa Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Indholdsfortegnelse RNA polymerase definition Ejendomme Eukaryot RNA-polymerasemekanisme Prokaryot RNA-polymerasemekanisme Struktur af prokaryot RNA-polymerase Struktur af eukaryotisk RNA-polymerase Typer og funktioner Ofte stillede spørgsmål om RNA-polymerase Referencer RNA polymerase definition RNA-polymerase er et enzym med flere enheder, der syntetiserer RNAmolekyler fra DNA-molekylet under transkriptionsprocessen. Det er ansvarligt for at transskribere generne kodet i DNA-molekyler til kodebare sekvenser RNA, hvilket yderligere hjælper under proteinsyntese. RNA-polymerase spiller en vital rolle i transkription, hvor den binder sig til promotorregionerne af DNA og initierer transkriptionsprocessen. Ydermere tilføjer dette enzym også ribonukleotider og vokser RNA-kæden ved at bruge DNA'et som skabelon. Desuden afslutter den også processen, hvis den støder på termineringssekvenser i template-DNA'et. RNA-polymerase katalyserer dannelsen af phosphodiesterbindinger ved at tilføje ribonukleosidtrifosfater (NTP'er) til den voksende kæde af nye strenge. Den bruger DNA-skabelonen til at bygge et polynukleotid med komplementære basepar. De frie nukleotider U parrer med T i DNA-skabelonen, G parrer med C i DNA-skabelonen. Ejendomme RNA-polymerase læser skabelon-DNA'et som 3′ til 5′, men syntetiserer polynukleotidet i en 5′ til 3′-retning. RNA-polymerase har ikke nukleaseaktiviteter, så kan ikke korrekturlæse, som DNA-polymerase gør. Det kræver ikke en primer for at starte tilføjelsen af indkommende ribonukleotider. I en prokaryot celle er en enkelt art af RNA-polymerase til stede. Den eukaryote celle kræver imidlertid forskellig RNA-polymerase for at syntetisere forskellige RNA'er. Derudover kræver eukaryotisk RNA-polymerase mange andre proteiner for at initiere transkription, hvorimod prokaryot RNApolymerase binder direkte til promotorregionerne i DNA . Eukaryot RNA-polymerasemekanisme Den største forskel i arbejdsmekanismen for eukaryotisk RNApolymerase og prokaryot RNA-polymerase er, at eukaryotisk RNApolymerase ikke kan starte transkriptionsprocessen af sig selv, men prokaryot RNA-polymerase kan. Den eukaryote RNA-polymerase har brug for yderligere proteiner for at udføre sine funktioner, disse yderligere proteiner omtales som transkriptionsfaktorer. Promotorregioner af gener, der transskriberes af RNA- polymerase, har en sekvens, der ligner TATA-boksen med 25-30 nukleotider, kun en lille smule opstrøms fra transkriptionsinitieringsstedet. Til denne sekvens på 25-30 nukleotider binder transkriptionsfaktor TFΙΙD. TFΙΙD i sig selv er en multi-underenhedsforbindelse, som giver et bindingssted for en anden transkriptionsfaktor kaldet TFΙΙB, der danner et kompleks i promotorregionen. Dette kompleks tjener som en bro for bindingen af RNA-polymerase. Denne binding af RNA-polymerase til komplekset ved promotorregionen lettes af en anden transkriptionsfaktor kaldet TFΙΙF. Efter rekruttering af RNA-polymerase til promotorregionen kræves yderligere transkriptionsfaktorer TFΙΙE TFΙΙH for at starte transkription. TFΙΙH er en multi-underenhedsfaktor, der fungerer som en helicase til at afvikle det dobbeltstrengede DNA for at gøre transskribering af gener mulig. Denne faktor fungerer også som en kinase, der phosphorylerer RNA-polymerase, hvilket får den til at bryde væk fra initieringskomplekset og dermed lader RNA-polymerasen løbe langs DNA-skabelonen for at syntetisere kæder af RNA'er, vi går nu ind i forlængelse. Forlængelse er karakteriseret ved tilsætning af ribonukleosidtrifosfat (rNTP) via dannelse af phosphodiesterbinding og frigivelse af pyrophosphatmolekyler, denne reaktion katalyseres af to divalente metalioner, nemlig: Magnesiumion og Manganion. Magnesiumion er ansvarlig for at bringe 3'OH-gruppen i primeren tæt på et phosphatatom fra indkommende rNTP. På grund af hvilket den 3' frie hydroxylgruppe i primeren nu nukleofilt angriber et phosphatatom i triphosphatgruppen af indkommende rNTP'er og danner en phosphodiesterbinding. Efterhånden som en binding dannes, udvikles der en betydelig ladning på ilten, som var dyrebart bundet med fosfatatomet, og for at stabilisere denne ladning spiller manganion en afgørende rolle. Derudover hjælper manganion også med afgang af pyrophosphatgrupperne. Skabelonen af DNA indeholder en terminal sekvens, som markerer afslutningen af transkriptionsprocessen, hvis resultat er kæder af RNA'er. Denne terminale sekvens indeholder normalt 40 nukleotider og er den GC-rige strækning, der normalt ender på seks eller syv A. Afslutningen kan dog også ske ved at spalte de voksende kæder af RNA fra RNA-polymerase ved påvirkning af et hexamerprotein kaldet rho. Prokaryot RNA-polymerasemekanisme I modsætning til eukaryotisk RNA-polymerase binder prokaryot RNApolymerase sig direkte til promotorregionerne i DNA'et uden hjælp fra nogen transkriptionsfaktorer. RNA-polymerase-holoenzym binder til promotorregionen og afvikler DNA-strengene og begynder syntesen af RNA. RNA'er syntetiseres i 5′ til 3′-retningen ved at læse skabelonen af DNA i 3′- til 5′-retningen. Forlængelse er karakteriseret ved tilsætning af ribonukleosidtrifosfat (rNTP) via dannelse af phosphodiesterbinding og frigivelse af pyrophosphatmolekyler, denne reaktion katalyseres af to divalente metalioner, nemlig: Magnesiumion og Manganion. Magnesiumion er ansvarlig for at bringe 3'OH-gruppen i primeren tæt på et phosphatatom fra indkommende rNTP. På grund af hvilket den 3' frie hydroxylgruppe i primeren nu nukleofilt angriber et phosphatatom i triphosphatgruppen af indkommende rNTP'er og danner en phosphodiesterbinding. Efterhånden som en binding dannes, udvikles der en betydelig ladning på ilten, som var dyrebart bundet med fosfatatomet, og for at stabilisere denne ladning spiller manganion en afgørende rolle. Derudover hjælper manganion også med afgang af pyrophosphatgrupperne. Skabelonen af DNA indeholder en terminal sekvens, som markerer afslutningen af transkriptionsprocessen, hvis resultat er kæder af RNA'er. Denne terminale sekvens indeholder normalt 40 nukleotider og er en GC-rig strækning, der normalt ender på seks eller syv A. Afslutningen kan dog også ske ved at spalte de voksende kæder af RNA fra RNA-polymerase ved påvirkning af et hexamerprotein kaldet rho. Struktur af prokaryot RNA-polymerase RNA-polymerase i en prokaryot celle er sammensat af fem polypeptidunderenheder: en alfa (α) underenhed, en beta (β) underenhed, en beta prime (β') underenhed, en omega (ω) underenhed og en sigma (σ) underenhed . Polymerasen er et holoenzym med flere underenheder. Det første trin i fremstillingen af RNA-polymerase er dimeriseringen af alfa-underenheden (α) og fungerer som et stillads for at bringe to andre underenheder: beta (β) underenhed og beta prime (β') underenhed. En af alfa-underenhederne interagerer med beta (β)underenheden, mens den anden alfa-underenhed (α) interagerer med beta-prime (β')-underenheden. beta (β)-underenhed er den primære underenhed, der har polymeraseaktivitet og syntetiserer nye RNA-molekyler sammen med skabelonen af DNA. beta prime (β') underenhed binder til DNA'et og koordinerer også metalioner for deres katalytiske aktiviteter. (ω) underenhed er den mindste af alle og er involveret i samlingen af holoenzym og opretholdelse af polymerasens strukturelle integritet. Og endelig er sigma (σ) underenheden afgørende i genkendelsen af promotorregionen i DNA'et for at initiere transkriptionsprocessen. Den katalytiske kerne består imidlertid af αββ'ω, og sigma (σ)underenheden associerer kun med kernen under genkendelsen af promotorregionen i DNA-skabelonen. Når først initieringsstedet er bestemt, dissocieres sigma (σ) underenheden fra den katalytiske kerne. Struktur af eukaryotisk RNA-polymerase Den eukaryote celle indeholder tre typer af forskellige RNApolymeraser, der er involveret i syntesen af forskellige typer RNA'er med deres egne specifikke funktioner. RNA-polymerase Ι transskriberer gener, der giver rRNA'er. RNA-polymerase ΙΙ transkriberer proteinkodende gener og resulterer i syntesen af mRNA'er. RNA-polymerase ΙΙΙ transskriberer gener, der giver tRNA'er. Alle disse tre er komplekse multi-underenheder enzymer bestående af 8-14 underenheder hver. Selvom de genkender forskellige promotorer og transskriberer forskellige RNA'er, deler de for det meste fælles træk. Selv de to største underenheder af eukaryotisk RNA-polymerase er tæt beslægtet med β- og β'-underenheder af prokaryot RNApolymerase. Derudover har disse tre typer eukaryote RNA-polymeraser fem lignende underenheder i deres strukturer. Specificiteten i disse tre polymeraser bestemmes af de interaktioner, de har med forskellige andre proteiner, også kaldet transkriptionsfaktorer. Eukaryote RNA-polymeraser kan ikke binde til promotorregionen af DNA direkte som prokaryot RNA-polymerase gør, derfor har de brug for disse transkriptionsfaktorer for at binde til DNA og initiere syntesen af RNA'er. De forskellige transkriptionsfaktorer, der er involveret i syntesen af forskellige typer RNA'er, er afgørende for at bestemme den krævede type RNA-polymerase. RNA-polymerase er strukturelt bredt opdelt i to underenheder, en større underenhed og en anden stor underenhed, der virker kohærent til at transskribere respektive gener. Længden af disse underenheder er forskellig i alle disse tre diskuterede RNA-polymeraser. For eksempel indeholder RNA-polymerase ΙΙ 11 spaltede løkker i to underenheder, hver løkke har en specifik længde af aminorester. Derfor er variationen i længden af aminosyrerester i hver spalteløkke det, der adskiller en polymerase fra den anden. Læs også: Antistof - definition, struktur, typer, former, funktioner Mikrobiel genetik Transfer RNA (tRNA) - Definition, struktur, behandling, typer, funktioner Messenger RNA (mRNA) - Definition, struktur, behandling, typer, funktioner PCL-sygepleje (CTEVT) 1. års seneste pensum (revideret 2018) Typer og funktioner RNA-polymerases hovedfunktion er at transskribere et specifikt gen i DNA'et og syntetisere RNA. Denne syntese er karakteriseret ved afviklingen af den specifikke del af DNA'et og tager den som en skabelon til at transskribere de gen-rettede RNA'er. 1. RNA-polymerase Ι Dette enzym er ansvarlig for syntetisering af ribosomalt RNA. Det transkriberer genet i nukleolus og syntetiserer rRNA'et i selve kernen, hvorfra det transporteres til cytoplasma via enten nuklear pore eller af bærerproteiner, hvor det danner ribosomer Tilgængeligheden af rRNA-molekyler produceret af RNA-polymerase 1 kan påvirke vigtige funktioner i vores krop, da rRNA er den strukturelle enhed af ribosomet, som igen er et sted for proteinsyntese. 1. RNA-polymerase ΙΙ Dette enzym er ansvarlig for syntetisering af messenger RNA. Det transskriberer proteiner, der koder for gener fra DNA'et til egnede mRNA'er, der kan bearbejdes yderligere for at deltage i translation. Virkningen af dette enzym påvirker direkte de proteiner, der skal syntetiseres, hvis ukorrekt transskription af gener, så ville føre til oversættelse af defekte proteiner, som kan have en alvorlig indvirkning på vores krop. 1. RNA-polymerase ΙΙΙ Dette enzym er ansvarlig for syntetisering af transfer-RNA. tRNA er ansvarlig for at binde aminosyrer og lave en polypeptidkæde i henhold til de kodoner, der er til stede i mRNA-molekyle under proteinsyntese. Figur: Transkriptionelle initieringskomplekser af de tre eukaryote RNApolymeraser. Billedkilde: Akihiko Yokoyama 2019 . 1. RNA-polymerase er et attraktivt mål for farmaceutiske lægemidler på grund af dets allestedsnærværende natur og forskellige funktioner gennem hele cellens levetid. Desuden tillader den biokemiske forskel i eukaryot og prokaryot RNApolymerase, at specifikke lægemidler kun målretter mod prokaryote celler uden at forstyrre vores egne celler. 2. Med fremskridt inden for molekylære undersøgelser og molekylære teknikker kan aktiviteten af RNA-polymerase ændres ved at modificere deres underenheder eller generelle involverede transkriptionsfaktorer for at syntetisere påkrævet RNA. Ofte stillede spørgsmål om RNA-polymerase Q. Hvad er RNA-polymerase ? Ans. RNA-polymerase er et enzym med flere enheder, der syntetiserer RNA-molekyler fra DNA-molekylet under transkriptionsprocessen. Q. Hvilke typer RNA-polymerase er der? Ans. De 5 typer RNA-polymeraser er RNA-polymerase Ι, RNA-polymerase ΙI, RNA-polymerase ΙII, RNA-polymerase ΙV og RNA-polymerase V. Q. Hvad er RNA-polymerases funktion? Ans. RNA-polymerases hovedfunktion er at transskribere et specifikt gen i DNA'et og syntetisere RNA. Q. Hvad er underenhederne af prokaryot RNA-polymerase? Ans. De 5 polypeptidunderenheder af prokaryot RNA-polymerase er en alfa (α) underenhed, en beta (β) underenhed, en beta prime (β') underenhed, en omega (ω) underenhed og en sigma (σ) underenhed. RNA- Definition, Egenskaber, Struktur, Sammensætning, Typer, Funktioner 24. januar 2022 af Rajat Thapa Abonner os for at modtage de seneste noter. Email adresse* Abonner Indholdsfortegnelse RNA definition Egenskaber af RNA Struktur af RNA Sammensætning af RNA Typer af RNA o o o Nogle andre typer RNA o o 1. mRNA (budbringer-RNA) 2. rRNA (ribosomalt RNA) 3. tRNA (overførsels-RNA) 1. Ribozymer 2. Antisense RNA'er Funktioner af RNA Referencer RNA definition RNA (Ribonukleinsyre) er et enkeltstrenget nukleinsyremolekyle og består af ribonukleotider. Et ribosenukleotid i RNA-kæden består af et ribosesukker, en fosfatgruppe og en base. I hvert ribosesukker tilsættes en af de fire baser: Adenin (A), Guanin (G), Cytosin (C) og Uracil (U). Basen er knyttet til et ribosesukker ved hjælp af en fosfodiesterbinding. Da RNA omfatter mange ribose-nukleotider, kan længden af kæderne af nukleotider variere alt efter deres typer eller deres funktioner. RNA adskiller sig således fra DNA på den type sukker, der bruges til at lave molekylet og udskiftning af base Thymin i DNA med Uracil i RNA. Derudover er DNA et dobbeltstrenget molekyle, mens RNA er et enkeltstrenget molekyle. RNA- Definition, egenskaber, struktur, sammensætning, typer, funktioner. Oprettet med BioRender.com Egenskaber af RNA RNA er et enkeltstrenget molekyle og ikke en dobbelthelix, en af konsekvenserne af dette er, at RNA kan danne en række tredimensionelle molekylære komplekser end DNA. RNA har ribosesukker i dets nukleotider i stedet for deoxyribose. Disse to sukkerarter adskiller sig fra hinanden i nærvær eller fravær af et iltatom. Ribose sukker er også en cyklisk struktur bestående af 5 kulstof og en ilt ligesom DNA. Men den største forskel er tilstedeværelsen af ekstra OH-gruppe i 2'-karbon af ribose, som er fraværende i deoxyribosesukker. OH-gruppen i 2' kulstof gør RNA-molekylet tilbøjeligt til hydrolyse. Nogle undersøgelser har også konkluderet, at denne kemiske ansvar af RNA på grund af ekstra OH-gruppen har ført til, at DNA er det genetiske lagerhus, da det mangler OH-gruppe i 2'Carbon, hvilket gør det mere stabilt at opbevare information. RNA-nukleotider bærer de nitrogenholdige baser, puriner og pyrimidiner. Men i RNA i stedet for Pyrimidin Thymin er Uracil til stede, som også danner hydrogenbinding med Adenin, ligesom Thymin gør i DNA-molekyle. Struktur af RNA Struktur af RNA. Oprettet med BioRender.com RNA er en typisk enkeltstrenget biopolymer af ribonukleotider bundet til hinanden via en phosphodiesterbinding. En RNA-streng syntetiseres i 5'- til 3'-retningen fra en lokalt enkeltstrenget DNA-region. Det har ribosesukker, der er knyttet til fire baser: Adenin, Guanin, Uracil og Cytosin. Ribosesukker har en ekstra OH-gruppe i 2' kulstof sammenlignet med deoxyribosesukker i DNA. Denne ekstra OH-gruppe i RNA har fået dem til at blive syntetiseret til kortsigtede funktioner. Den tredimensionelle struktur af RNA er afgørende for dets stabilitet og funktion. RNA, der er et enkeltstrenget molekyle, kan danne en kompleks struktur ved at tillade dets ribosesukkere og baser at blive modificeret på virkningen af cellulære enzymer (der binder kemiske grupper) til at udføre forskellige funktioner. De er endda i stand til at folde på sig selv og vise intramolekylær hydrogenbinding mellem komplementære strenge, hvilket gør det til et dobbeltstrenget molekyle, der udviser specifik funktion. Sammensætning af RNA RNA er en biopolymer af nukleotider bundet til hinanden via en phosphodiesterbinding. Nukleotidet, der udgør RNA'et, omtales også som Ribose-nukleotid på grund af tilstedeværelsen af ribosesukker i deres struktur. Samlet set er RNA sammensat af et ribosesukker, fosfat og nitrogenholdig base. Ribosesukker er en cyklisk struktur, der består af fem kulstofatomer og et oxygenatom. Dette sukker indeholder to OH-grupper ved 2' kulstof og 3' kulstof. Dette ribosesukker er knyttet til en nitrogenholdig base via hydrogenbinding. Der er fire nitrogenholdige baser, nemlig: Adenin (A), Guanin (G), Uracil (U) og Cytosin (C). Disse nitrogenholdige baser parrer komplementært med hinanden: G med C og A med U. Typer af RNA Af mange typer RNA er de tre velkendte og mest almindeligt diskuterede og fundet i næsten alle organismer. Disse tre typer RNA er: 1. mRNA (budbringer-RNA) 2. rRNA (ribosomalt RNA) 3. tRNA (overførsels-RNA) 1. mRNA (budbringer-RNA) mRNA (budbringer-RNA). Oprettet med BioRender.com Det er et enkeltstrenget RNA-molekyle, der er komplementært til en af DNA-strengene. mRNA er versionen af de genetiske materialer, der forlader kernen og flytter til cytoplasmaet, hvor ansvarlige proteiner syntetiseres. Dette RNA har den største betydning under proteinsyntese, når ribosomet bevæger sig langs dette mRNA, læser det basesekvenserne og bruger den genetiske kode til at oversætte dem til specifikke proteiner. Disse koder er i form af tripletsekvenser af nitrogenholdige baser og omtales ofte som kodoner. Som vi nu ved, at mRNA er ansvarlig for at overføre den genetiske information til ribosomer, hvor ved at aflæse basesekvenserne på mRNA, oversættelsen af proteiner er muliggjort, således at navnet minder om dets funktioner, dvs. messenger RNA. Vi kan endda sige, at mRNA er det molekyle, der bruger genetisk kode, der er til stede på en del af DNA og fremstiller proteiner. Hvis mRNA ikke ville have eksisteret, kunne informationen om DNA aldrig blive brugt af vores krop. 2. rRNA (ribosomalt RNA) rRNA (ribosomalt RNA). Oprettet med BioRender.com Det er et enkeltstrenget RNA-molekyle, der findes i celler, og som udgør den del af den proteinsyntetiserende organel, Ribosom . Det syntetiseres inde i kernen, især i nukleolus, hvor rRNA-kodende gener er til stede. Det syntetiserede rRNA kan være af varierende størrelse, almindeligvis skelnes mellem små og store. Disse nyligt syntetiserede rRNA'er kombinerer med ribosomale proteiner og danner henholdsvis mindre underenheder og større underenheder af ribosomer. Disse rRNA'er er afgørende for at genkende konserverede områder af indkommende mRNA'er og tRNA, hvilket letter deres binding og udfører proteinsyntese. Derudover har rRNA også enzymatisk aktivitet (peptidyltransferase) og katalyserer dannelsen af peptidbindingen mellem to tilpassede proteiner/aminosyrer under proteinsyntese. 3. tRNA (overførsels-RNA) tRNA (overførsels-RNA). Oprettet med BioRender.com Det er en type RNA-molekyle, der hjælper med at afkode information til stede i mRNA-sekvenser til specifikke proteiner. Det kodes af DNA i cellekernen og transskriberes ved hjælp af RNApolymerase ΙΙΙ. Strukturen af tRNA folder sig selv og skaber en intrakomplementær baseparring, som giver hydrogenbundne stilke og associerede løkker, der indeholder nukleotider med modificerede baser. Strukturen i todimensional ligner et kløverblad med tre løkker og en åben ende. er sædvanligvis 75-90 ribonukleotider lange. Hver af disse løkker, der består af arme, har et særskilt navn og funktion. De tre-løkke bestående arme er nemlig: DHU eller D arm, som har genkendelsessted for specifikt enzym amino-acyl tRNA syntetase; T-arm, der består af ribosomgenkendelsessted og Anticodon-arm, der genkender og binder til mRNA til stede i ribosomet. Den åbne ende uden sløjfe er stedet for binding af aminosyre via 3' OH-binding med COOH-gruppen i aminosyren . Generelt læser tRNA koden på mRNA-sekvensen i Ribosom og oversætter specifik aminosyre, det gør det langs længden af mRNA'et og udsender en polypeptidkæde af aminosyrer (proteiner) i forbindelse med andre vigtige enzymer som aminoacyl tRNAsyntetase og peptidyltransferase. Nogle andre typer RNA 1. Ribozymer Disse typer RNA'er refererer til de RNA'er, der er i stand til at vise enzymatiske aktiviteter. De blev først opdaget i introner af precursor ribosomalt RNA fra Tetrahymena thermophilus , hvor det blev fundet, at disse ikkekodende sekvenser var i stand til at udskære sig selv uden noget protein eller ekstern kilde. Disse RNA'er spiller vitale roller i større reaktioner som RNAsplejsning, viral replikation og tRNA-biosyntese. rRNA'er viser også enzymatiske aktiviteter og kan derfor betegnes som Ribozymer. 2. Antisense RNA'er Antisense RNA'er er de RNA'er, der indeholder sekvenser, der er komplementære til proteinkodende sekvenser af mRNA. Disse er enkeltstrengede ligesom mRNA, men kan ikke kode for proteiner. Imidlertid kan de interferere og inaktivere deres komplementære mRNA-sekvenser og dermed inhibere proteinsyntese. Denne evne hos antisense RNA'er har fået forskere til at skabe kunstige antisense RNA'er, der kan hæmme proteinsyntesen af potentielle sygdomsfremkaldende organismer eller af inficerede celler, som derefter ender med at dræbe uønskede celler. Læs også: Transfer RNA (tRNA) - Definition, struktur, behandling, typer, funktioner DNA-replikation - definition, enzymer, trin, applikationer Aminosyrer og proteiner - definition, struktur, typer, funktioner Antistof - definition, struktur, typer, former, funktioner DNA- Definition, egenskaber, struktur, sammensætning, typer, funktioner Funktioner af RNA Den primære funktion af RNA er i proteinsyntese. Uden RNA kunne informationen kodet i DNA aldrig være blevet transskriberet til at lave essentielle proteiner, som en celle har brug for for at bevare sin integritet. mRNA'er er nu blevet brugt i vid udstrækning i farmaceutiske industrier til at syntetisere potentielle vacciner. Desuden bruges mRNA'er nu til at udvikle nye kategorier af medicin mRNA'er har gjort dannelsen af cDNA-biblioteket mulig. rRNA'er er strukturelle enheder af ribosomer, som er essentielle organeller under proteinsyntese. Ribozymer kan hjælpe med at undertrykke ekspressionen af specifikt mRNA ved at spalte dem ud uden at stole på værtens maskineri. Kunstige antisense RNA'er er i stand til at standse proteinsyntese ved at binde sig til mRNA'erne, som har bidraget til menneskets evne til at bekæmpe sygdomme og mutationer.