Fusing point and areal level space-time data with application to wet deposition Sujit Sahu http://www.soton.ac.uk/∼sks Southampton Statistical Sciences Research Institute, Joint work with Alan Gelfand and David Holland (USEPA) Warwick: March 2009 Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Modelling Ingredients and Innovations Combine observed data with output from computer simulation model. Data Assimilation Modelling large space-time data, about 1.8 million. Change of support problem: reconcile the differences between point and areal data using multi-scale random effects. Missing data, covariate effects, point mass at zero. Auto-regressive (AR) process in time and Conditional Auto-Regressive (CAR) in space. Aggregation in time and space; spatial interpolation. All done using Bayesian Hierarchical Modelling and MCMC Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Modelling Ingredients and Innovations Combine observed data with output from computer simulation model. Data Assimilation Modelling large space-time data, about 1.8 million. Change of support problem: reconcile the differences between point and areal data using multi-scale random effects. Missing data, covariate effects, point mass at zero. Auto-regressive (AR) process in time and Conditional Auto-Regressive (CAR) in space. Aggregation in time and space; spatial interpolation. All done using Bayesian Hierarchical Modelling and MCMC Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Modelling Ingredients and Innovations Combine observed data with output from computer simulation model. Data Assimilation Modelling large space-time data, about 1.8 million. Change of support problem: reconcile the differences between point and areal data using multi-scale random effects. Missing data, covariate effects, point mass at zero. Auto-regressive (AR) process in time and Conditional Auto-Regressive (CAR) in space. Aggregation in time and space; spatial interpolation. All done using Bayesian Hierarchical Modelling and MCMC Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Modelling Ingredients and Innovations Combine observed data with output from computer simulation model. Data Assimilation Modelling large space-time data, about 1.8 million. Change of support problem: reconcile the differences between point and areal data using multi-scale random effects. Missing data, covariate effects, point mass at zero. Auto-regressive (AR) process in time and Conditional Auto-Regressive (CAR) in space. Aggregation in time and space; spatial interpolation. All done using Bayesian Hierarchical Modelling and MCMC Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Modelling Ingredients and Innovations Combine observed data with output from computer simulation model. Data Assimilation Modelling large space-time data, about 1.8 million. Change of support problem: reconcile the differences between point and areal data using multi-scale random effects. Missing data, covariate effects, point mass at zero. Auto-regressive (AR) process in time and Conditional Auto-Regressive (CAR) in space. Aggregation in time and space; spatial interpolation. All done using Bayesian Hierarchical Modelling and MCMC Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Modelling Ingredients and Innovations Combine observed data with output from computer simulation model. Data Assimilation Modelling large space-time data, about 1.8 million. Change of support problem: reconcile the differences between point and areal data using multi-scale random effects. Missing data, covariate effects, point mass at zero. Auto-regressive (AR) process in time and Conditional Auto-Regressive (CAR) in space. Aggregation in time and space; spatial interpolation. All done using Bayesian Hierarchical Modelling and MCMC Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Modelling Ingredients and Innovations Combine observed data with output from computer simulation model. Data Assimilation Modelling large space-time data, about 1.8 million. Change of support problem: reconcile the differences between point and areal data using multi-scale random effects. Missing data, covariate effects, point mass at zero. Auto-regressive (AR) process in time and Conditional Auto-Regressive (CAR) in space. Aggregation in time and space; spatial interpolation. All done using Bayesian Hierarchical Modelling and MCMC Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Challenges in Implementation (MCMC) High dimensional (≈34K) latent spatial processes. Spatially varying slope and intercepts. Parameter identifiability in hierarchical models. Constrained parameter spaces. Selection of model tuning parameters. Complexity in coding, monitoring and diagnosing MCMC convergence. Spatial prediction on a large grid (Eastern US). Friendly Agents Conjugate sampling. Some proper prior processes. Cheap local CAR updates (Gibbs Sampling). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Challenges in Implementation (MCMC) High dimensional (≈34K) latent spatial processes. Spatially varying slope and intercepts. Parameter identifiability in hierarchical models. Constrained parameter spaces. Selection of model tuning parameters. Complexity in coding, monitoring and diagnosing MCMC convergence. Spatial prediction on a large grid (Eastern US). Friendly Agents Conjugate sampling. Some proper prior processes. Cheap local CAR updates (Gibbs Sampling). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Challenges in Implementation (MCMC) High dimensional (≈34K) latent spatial processes. Spatially varying slope and intercepts. Parameter identifiability in hierarchical models. Constrained parameter spaces. Selection of model tuning parameters. Complexity in coding, monitoring and diagnosing MCMC convergence. Spatial prediction on a large grid (Eastern US). Friendly Agents Conjugate sampling. Some proper prior processes. Cheap local CAR updates (Gibbs Sampling). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Challenges in Implementation (MCMC) High dimensional (≈34K) latent spatial processes. Spatially varying slope and intercepts. Parameter identifiability in hierarchical models. Constrained parameter spaces. Selection of model tuning parameters. Complexity in coding, monitoring and diagnosing MCMC convergence. Spatial prediction on a large grid (Eastern US). Friendly Agents Conjugate sampling. Some proper prior processes. Cheap local CAR updates (Gibbs Sampling). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Challenges in Implementation (MCMC) High dimensional (≈34K) latent spatial processes. Spatially varying slope and intercepts. Parameter identifiability in hierarchical models. Constrained parameter spaces. Selection of model tuning parameters. Complexity in coding, monitoring and diagnosing MCMC convergence. Spatial prediction on a large grid (Eastern US). Friendly Agents Conjugate sampling. Some proper prior processes. Cheap local CAR updates (Gibbs Sampling). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Challenges in Implementation (MCMC) High dimensional (≈34K) latent spatial processes. Spatially varying slope and intercepts. Parameter identifiability in hierarchical models. Constrained parameter spaces. Selection of model tuning parameters. Complexity in coding, monitoring and diagnosing MCMC convergence. Spatial prediction on a large grid (Eastern US). Friendly Agents Conjugate sampling. Some proper prior processes. Cheap local CAR updates (Gibbs Sampling). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Challenges in Implementation (MCMC) High dimensional (≈34K) latent spatial processes. Spatially varying slope and intercepts. Parameter identifiability in hierarchical models. Constrained parameter spaces. Selection of model tuning parameters. Complexity in coding, monitoring and diagnosing MCMC convergence. Spatial prediction on a large grid (Eastern US). Friendly Agents Conjugate sampling. Some proper prior processes. Cheap local CAR updates (Gibbs Sampling). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Challenges in Implementation (MCMC) High dimensional (≈34K) latent spatial processes. Spatially varying slope and intercepts. Parameter identifiability in hierarchical models. Constrained parameter spaces. Selection of model tuning parameters. Complexity in coding, monitoring and diagnosing MCMC convergence. Spatial prediction on a large grid (Eastern US). Friendly Agents Conjugate sampling. Some proper prior processes. Cheap local CAR updates (Gibbs Sampling). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Challenges in Implementation (MCMC) High dimensional (≈34K) latent spatial processes. Spatially varying slope and intercepts. Parameter identifiability in hierarchical models. Constrained parameter spaces. Selection of model tuning parameters. Complexity in coding, monitoring and diagnosing MCMC convergence. Spatial prediction on a large grid (Eastern US). Friendly Agents Conjugate sampling. Some proper prior processes. Cheap local CAR updates (Gibbs Sampling). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Chemical Deposition Combustion of fossil fuel produces various chemicals including sulfate and nitrate gases. In the eastern U.S., most SO2 , and NOx release attributed to power plants. Emitted to the air; wet deposition and dry deposition; interest in total deposition. Deposition means return to the earth’s surface by means of precipitation (rain or snow) for example. Wet Deposition = Precipitation × Concentration. Wet deposition is responsible for damage to lakes, forests, and streams. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Chemical Deposition Combustion of fossil fuel produces various chemicals including sulfate and nitrate gases. In the eastern U.S., most SO2 , and NOx release attributed to power plants. Emitted to the air; wet deposition and dry deposition; interest in total deposition. Deposition means return to the earth’s surface by means of precipitation (rain or snow) for example. Wet Deposition = Precipitation × Concentration. Wet deposition is responsible for damage to lakes, forests, and streams. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Chemical Deposition Combustion of fossil fuel produces various chemicals including sulfate and nitrate gases. In the eastern U.S., most SO2 , and NOx release attributed to power plants. Emitted to the air; wet deposition and dry deposition; interest in total deposition. Deposition means return to the earth’s surface by means of precipitation (rain or snow) for example. Wet Deposition = Precipitation × Concentration. Wet deposition is responsible for damage to lakes, forests, and streams. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Chemical Deposition Combustion of fossil fuel produces various chemicals including sulfate and nitrate gases. In the eastern U.S., most SO2 , and NOx release attributed to power plants. Emitted to the air; wet deposition and dry deposition; interest in total deposition. Deposition means return to the earth’s surface by means of precipitation (rain or snow) for example. Wet Deposition = Precipitation × Concentration. Wet deposition is responsible for damage to lakes, forests, and streams. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Chemical Deposition Combustion of fossil fuel produces various chemicals including sulfate and nitrate gases. In the eastern U.S., most SO2 , and NOx release attributed to power plants. Emitted to the air; wet deposition and dry deposition; interest in total deposition. Deposition means return to the earth’s surface by means of precipitation (rain or snow) for example. Wet Deposition = Precipitation × Concentration. Wet deposition is responsible for damage to lakes, forests, and streams. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Chemical Deposition Combustion of fossil fuel produces various chemicals including sulfate and nitrate gases. In the eastern U.S., most SO2 , and NOx release attributed to power plants. Emitted to the air; wet deposition and dry deposition; interest in total deposition. Deposition means return to the earth’s surface by means of precipitation (rain or snow) for example. Wet Deposition = Precipitation × Concentration. Wet deposition is responsible for damage to lakes, forests, and streams. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data The CMAQ model CMAQ = Community Multi-scale Air Quality Model. A computer simulation model which produces “averaged” output on 36km, 12km (used here), and now 4km grid cells. Uses variables such as power station emission volumes, meteorological data, land-use, etc. with atmospheric science (appropriate differential equations) to predict deposition levels. Not driven by monitoring station data. Predictions are biased but no missing data; monitoring data provide more accurate deposition but “missingness”. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data The CMAQ model CMAQ = Community Multi-scale Air Quality Model. A computer simulation model which produces “averaged” output on 36km, 12km (used here), and now 4km grid cells. Uses variables such as power station emission volumes, meteorological data, land-use, etc. with atmospheric science (appropriate differential equations) to predict deposition levels. Not driven by monitoring station data. Predictions are biased but no missing data; monitoring data provide more accurate deposition but “missingness”. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data The CMAQ model CMAQ = Community Multi-scale Air Quality Model. A computer simulation model which produces “averaged” output on 36km, 12km (used here), and now 4km grid cells. Uses variables such as power station emission volumes, meteorological data, land-use, etc. with atmospheric science (appropriate differential equations) to predict deposition levels. Not driven by monitoring station data. Predictions are biased but no missing data; monitoring data provide more accurate deposition but “missingness”. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data The CMAQ model CMAQ = Community Multi-scale Air Quality Model. A computer simulation model which produces “averaged” output on 36km, 12km (used here), and now 4km grid cells. Uses variables such as power station emission volumes, meteorological data, land-use, etc. with atmospheric science (appropriate differential equations) to predict deposition levels. Not driven by monitoring station data. Predictions are biased but no missing data; monitoring data provide more accurate deposition but “missingness”. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data National Atmospheric Deposition Program (NADP) NADP collects point-referenced data at several sites. They then use simple interpolation to produce maps. 6 6 9 5 8 9 6 6 7 7 12 11 4 4 4 6 13 6 7 6 15 11 12 15 8 14 11 8 17 16 20 12 19 18 15 12 16 13 11 13 13 10 28 14 16 13 10 18 21 16 15 8 13 21 15 16 14 13 6 12 1822 14 13 9 15 10 11 10 11 13 11 16 10 11 16 15 14 68 15 11 11 8 13 14 6 10 6 16 16 22 18 20 20 30 16 19 22 12 19 24 17 17 13 18 16 19 17 5 19 16 17 13 8 9 4 14 16 10 10 10 12 12 12 13 20 11 Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Inverse Distance weighting (IDW) “Poor person’s” methodology: Value at a new site = weighted mean of observations, Weights inversely proportional distance2 . Problems Not model based! Unable to accommodate known covariate precipitation! Unable to handle 0’s and missing data. Can’t fuse with model output data. With dynamic data, can only do independent weekly or aggregated annually. No associated uncertainty maps! Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Inverse Distance weighting (IDW) “Poor person’s” methodology: Value at a new site = weighted mean of observations, Weights inversely proportional distance2 . Problems Not model based! Unable to accommodate known covariate precipitation! Unable to handle 0’s and missing data. Can’t fuse with model output data. With dynamic data, can only do independent weekly or aggregated annually. No associated uncertainty maps! Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Inverse Distance weighting (IDW) “Poor person’s” methodology: Value at a new site = weighted mean of observations, Weights inversely proportional distance2 . Problems Not model based! Unable to accommodate known covariate precipitation! Unable to handle 0’s and missing data. Can’t fuse with model output data. With dynamic data, can only do independent weekly or aggregated annually. No associated uncertainty maps! Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Inverse Distance weighting (IDW) “Poor person’s” methodology: Value at a new site = weighted mean of observations, Weights inversely proportional distance2 . Problems Not model based! Unable to accommodate known covariate precipitation! Unable to handle 0’s and missing data. Can’t fuse with model output data. With dynamic data, can only do independent weekly or aggregated annually. No associated uncertainty maps! Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Change of support problem Fuentes and Raftery, 2005 Need to upscale (block-average) point level Z (s, t) to obtain grid level Z (Aj , t). Z 1 Z (Aj , t) = Z (s, t) ds, (1) |Aj | Aj Ak i si Many more A’s than s’s We use Measurement Error model (MEM) at point level centred around grid level values. Make inference at the point level by downscaling. Huge computational advantages, NO integration (1). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Change of support problem Fuentes and Raftery, 2005 Need to upscale (block-average) point level Z (s, t) to obtain grid level Z (Aj , t). Z 1 Z (Aj , t) = Z (s, t) ds, (1) |Aj | Aj Ak i si Many more A’s than s’s We use Measurement Error model (MEM) at point level centred around grid level values. Make inference at the point level by downscaling. Huge computational advantages, NO integration (1). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Our Contribution Model data on weekly time intervals. Fuse with gridded weekly CMAQ output. Use weekly precipitation information, available from other monitoring networks. Interpolate in space, predict in time Obtain quarterly and annual maps. Reveal spatial pattern in deposition. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Our data set Data Weekly deposition data from 128 sites in the eastern U.S. for the year 2001. Use 120 sites to estimate, remaining 8 to validate. Weekly CMAQ output from J = 33, 390 grid cells (about 1.8 million values!) Weekly precipitation data from 2827 predictive sites. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Annual Precipitation • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • 200 • 150 • 100 50 • • • B • • F• • • • • G • • • • • • • • D • • • A • • • • • • • E • • • • • • • • • • • •• • • • • • • • • • • H • • • • • • • • C • • • • • • • • • • • • • • • • • • • Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Exploratory Analyses 4 2.5 2.0 3 wetno3 wetso4 1.5 2 1.0 1 0.5 0 0.0 4 8 12 16 21 25 30 34 38 43 48 52 (a) 4 8 12 16 21 25 30 34 38 43 48 52 (b) Figure: Boxplot of weekly depositions: (a) sulfate and (b) nitrate. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Exploratory Analyses ... log sulfate −2 • • •• • • • • −4 −6 • • −6 ••• • • • • • • • • • •• • • • • • • • •• • •• • • • • • • •• •• • • •• • • • • • • • • • • • • • • • • •• • • • • −4 • • • •• • • • •• • •• • • •• • •••• •• • • ••• • •• •• • ••••••• • •• •••• • •• • •••••••• • • • ••••• •• • • ••••• •• •• ••• ••• •• •• •• • •• • •• • •• ••• • • • •• •••• • •• • • • ••• • •• • • ••• • • •• •• • •• •• • • •• • • • •• • ••• •••• • •• • • • • •• • •• • •• ••• • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • ••••• • • • • • • • • • • • • • • • • ••• • • • • •• • •• ••• • •• • • • • •• • •• • •••• •• • • • • • •• •• • • • • • •• •• • ••• • •• • • • • • •• • • • • • • • • • • • • • • •• • •• • •• • • •• • ••••• • •• ••••••• • • • • • •• • • •• • • •• • •• • • • • •• •• • •• • •• • • • • ••• • • • • • • • • • • •••• • • • • •• • • •• • • • •• • •• • • • • • ••• • • • • •• •• • • • • • •• • • • • • • • • • • • • • • • •• • • • • • •• • • • • 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Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Exploratory Analyses ... • • • • •• • • • • ••• • •• • • • •••• •• •• • •• • •••• •••• •• • •• ••• ••• •• • •••••• •••• •••••••• •• • •• • •• • • ••• ••• • • • •••• • •• • ••• ••• •• •• ••••• •• • ••• • •• •• ••••••• • •• • •• • ••••• ••••• •• • ••• ••• • • •• •• • • ••• •• • •• •• ••• •• • • ••••••• • • • • ••• • ••••• • •• •• ••• • ••• • ••••• •••• •• •• • •• • • ••••• ••• ••••••••• •• • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • ••••••••• • •• • • •• •• • •••• •• • • • •••• • •••• •• • • •• • • • •• •• •• •••• •• • • • • • • • • • • ••• • •• • •• • • • •• ••• • •••• • • • • • • • • • • • • •• •• • • • • • • • • ••• •••• • • •• •• ••• • ••• •• • • • ••• •• •• • • • • • • • •• • •••• • • • • • •• • • • • •• • •• •• • • • • • • • •• •••• • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • 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Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Modelling Requirements No deposition, Z (si , t), without precipitation, P(si , t); enforced by a latent atmospheric space-time process V (si , t) below, i = 1, . . . , n = 120, and for each week t, t = 1, . . . , 52. Similarly, model CMAQ output, Q(Aj , t) for each grid cell Aj , j = 1, . . . , J = 33, 390 and for each week t, enforced using a latent atmospheric areal process Ṽ (Aj , t). Model everything on the log-scale; latent processes take care of point masses at zero. Avoid log(0) problems. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data First stage models Precipitation model exp (U(si , t)) P(si , t) = 0 if V (si , t) > 0 otherwise, Deposition model Z (si , t) = exp (Y (si , t)) 0 Model for CMAQ output exp (X (Aj , t)) Q(Aj , t) = 0 Sujit Sahu if V (si , t) > 0 otherwise. if Ṽ (Aj , t) > 0 otherwise. Fusing point and areal level space-time data Clarification P’s, Z ’s, and Q’s are the observed precipitation, NADP deposition, and CMAQ deposition, respectively. V (s, t) is a conceptual point level latent atmospheric process which drives P(s, t) and Z (s, t). P(s, t) and Z (s, t) = 0 if V (s, t) ≤ 0. U(s, t) and Y (s, t) are log precipitation and deposition, respectively. Models below will specify their values when V (s, t) ≤ 0 or if P(s, t) or Z (s, t) are missing. Ṽ (Aj , t) is a conceptual areal level latent atmospheric process which drives Q(Aj , t). X (Aj , t) is log CMAQ output where modelling below will specify its values when Ṽ (Aj , t) ≤ 0. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data The first stage likelihood f (P, Z, Q|U, Y, X, V, Ṽ) = f (P|U, V) × f (Z|Y, V) × f (Q|X, Ṽ) which takes the form QT Qn “ “ ” ” i=1 1exp u(si , t) 1exp y (si , t) I (v (si , t) > 0) t=1 QJ ” “ j=1 1exp x(A , t) I (ṽ (Aj , t) > 0) j where 1x denotes a degenerate distribution with point mass at x and I(·) is the indicator function. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Deposition Model Y (si , t) = β0 + β1 U(si , t) + β2 V (si , t) + (b0 + b(si )) X (Aki , t) +η(si , t) + ǫ(si , t). Spatially varying coefficients, b = (b(s1 ), . . . , b(sn ))′ is a Gaussian process (GP). Spatio-temporal intercept η t = (η(s1 , t), . . . , η(sn , t))′ is a GP independent in time. Allow for spatially varying calibration of CMAQ. Could imagine common η(si ). ǫ(si , t) ∼ N(0, σǫ2 ), providing the nugget effect. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data The second stage models ... Precipitation U(si , t) = α0 + α1 V (si , t) + δ(si , t), where δ t = (δ(s1 , t), . . . , δ(sn , t))′ is a GP independent in time. CMAQ output X (Aj , t) = γ0 + γ1 Ṽ (Aj , t) + ψ(Aj , t), j = 1, . . . , J. where ψ(Aj , t) ∼ N(0, σψ2 ), independently. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Specification of latent processes Measurement Error Model (MEM) V (si , t) ∼ N(Ṽ (Aki , t), σv2 ), i = 1, . . . , n, t = 1, . . . , T . The process Ṽ (Aj , t) is AR in time and CAR in space Ṽ (Aj , t) = ρṼ (Aj , t − 1) + ζ(Aj , t), ! J X σζ2 , ζ(Aj , t) ∼ N hji ζ(Ai , t), mj i=1 Let ∂j define the mj neighboring grid cells of the cell Aj . hji = 1 mj 0 Sujit Sahu if i ∈ ∂j otherwise. Fusing point and areal level space-time data Clarification Note that we can have Z > 0, Q = 0 and vice versa. Therefore V and Ṽ can have opposite signs. This arises because we are modelling at two different scales - need processes at two different scales. We can view V (s, t) − Ṽ (A, t) as a deviation from the areal average. We assume these realised deviations are independent across space and time. We have a conditional model for V and X given Ṽ . The resulting marginal model for U and Y given Ṽ is multi-scale - additive random effects at two scales. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Completing the second stage specification P Initial condition: Ṽ (Aj , 0) = T1 Tt=1 X (Aj , t). Let D be diagonal with entries σζ2 /mj . f (Ṽt |Ṽt−1 , ρ, σζ2 ) ∝ ′ 1 −1 Ṽt − ρṼt−1 D (I − H) Ṽt − ρṼt−1 . exp − 2 The second stage specification is given by: QT t=1 f (Yt |Ut , Vt , Xt , η t , b, θ) × f (η t |θ) f (Ut |V i t , θ) (1) ×f (Vt |Ṽt , θ) × f (Xt |Ṽt , θ)f (Ṽt |Ṽt−1 , θ) f (b|θ). θ= (α0 , α1 , β0 , β1 , β2 , b0 , γ0 , γ1 , ρ, σδ2 , σb2 , ση2 , σǫ2 , σψ2 , σv2 , σζ2 ). Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Graphical representation of the model. Regional atmospheric driver (point) replacements δ(si , t) V (si , t) MEM Regional atmospheric centering process (areal) Ṽ (Ak , t) i b(si ) η(si , t) U(si , t) 1111111 0000000 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 P(s , t) i (observed precipitation) Y (si , t) X (Ak , t) 1111111 0000000 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 11111 00000 00000 11111 00000 11111 00000 11111 00000 11111 Z (si , t) (observed deposition) Sujit Sahu i Q(Ak , t) i (CMAQ model output) Fusing point and areal level space-time data Graphical representation of a fusion model. Regional atmospheric driver (point) δ(si , t) 111111111111 000000000000 V (A 000000000000 111111111111 000000000000 111111111111 V (si , t) η(si , t) ki , t) block average a(si ) U(si , t) Y (true) (si , t) block average X (Ak , t) i 1111111 0000000 0000000 1111111 0000000 1111111 Z (true) (s , t) 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 P(s , t) Y (si , t) i 0110 1010 1010 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 Q(A , t) 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 0000000 1111111 ki (CMAQ model output) i (observed precipitation) Z (si , t) (observed deposition) Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Predictions At a new site s′ and time t ′ we need Z (s′ , t ′) which depends on Y (s′ , t ′ ). If P(s′ , t ′ ) = 0 then Z (s′ , t ′ ) = 0. Suppose otherwise. Bayesian predictive distributions: Z π(zpred |zobs ) = π(zpred |par) π(par|zobs )dpar. Need to simulate Y (s′ , t ′ ). V (s′ , t ′) ∼ N(Ṽ (A′ , t ′ ), σv2 ). U(s′ , t ′ ), η(s′ , t ′ ) and b(s′ ) are simulated from the conditional distributions at s′ given s1 , . . . , sn X (A′ , t ′) =logQ(A”, t ′ ) if Q(A′ , t ′ ) > 0, otherwise updated in the MCMC. More details in the paper. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Predictions At a new site s′ and time t ′ we need Z (s′ , t ′) which depends on Y (s′ , t ′ ). If P(s′ , t ′ ) = 0 then Z (s′ , t ′ ) = 0. Suppose otherwise. Bayesian predictive distributions: Z π(zpred |zobs ) = π(zpred |par) π(par|zobs )dpar. Need to simulate Y (s′ , t ′ ). V (s′ , t ′) ∼ N(Ṽ (A′ , t ′ ), σv2 ). U(s′ , t ′ ), η(s′ , t ′ ) and b(s′ ) are simulated from the conditional distributions at s′ given s1 , . . . , sn X (A′ , t ′) =logQ(A”, t ′ ) if Q(A′ , t ′ ) > 0, otherwise updated in the MCMC. More details in the paper. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Predictions At a new site s′ and time t ′ we need Z (s′ , t ′) which depends on Y (s′ , t ′ ). If P(s′ , t ′ ) = 0 then Z (s′ , t ′ ) = 0. Suppose otherwise. Bayesian predictive distributions: Z π(zpred |zobs ) = π(zpred |par) π(par|zobs )dpar. Need to simulate Y (s′ , t ′ ). V (s′ , t ′) ∼ N(Ṽ (A′ , t ′ ), σv2 ). U(s′ , t ′ ), η(s′ , t ′ ) and b(s′ ) are simulated from the conditional distributions at s′ given s1 , . . . , sn X (A′ , t ′) =logQ(A”, t ′ ) if Q(A′ , t ′ ) > 0, otherwise updated in the MCMC. More details in the paper. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Choosing φη , φδ and φb Estimation is challenging due to weak identifiability of variances and ranges. So, we fix the φ’s (spatial decay parameters). Use validation mean-square error 8 52 2 1 XX ∗ ∗ VMSE = Z (si , t) − Ẑ (si , t) I(obs) nv i=1 t=1 where I(obs) = 1 if Z (s∗i , t) has been observed and 0 P P otherwise, and nv = 8i=1 52 t=1 I(obs). Here nv = 407. Optimal ranges were 500, 1000 and 500 kilometers, respectively for the exponential covariance function. VMSE is not sensitive near these values. May be we can use importance sampling to compute VMSE for different φ’s. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Choosing φη , φδ and φb Estimation is challenging due to weak identifiability of variances and ranges. So, we fix the φ’s (spatial decay parameters). Use validation mean-square error 8 52 2 1 XX ∗ ∗ VMSE = Z (si , t) − Ẑ (si , t) I(obs) nv i=1 t=1 where I(obs) = 1 if Z (s∗i , t) has been observed and 0 P P otherwise, and nv = 8i=1 52 t=1 I(obs). Here nv = 407. Optimal ranges were 500, 1000 and 500 kilometers, respectively for the exponential covariance function. VMSE is not sensitive near these values. May be we can use importance sampling to compute VMSE for different φ’s. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Validation 4 6 5 3 Prediction Prediction 4 3 2 O O 2 O O O 1 0 O OO O O O O OO O O O O OO O O O OO O OO O O O O O O O O O OO O O O OO OO O O O O O OO O O O OO O O O O O O O O O O O O O OO O O O O O O O O O O O O O O O O OO O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O OO O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O 0 1 O 0 1 2 3 O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O OOOO O O O OO O O O O O O O O OO OO OO O O O O O O O O OO O O O O O O O O O O OO O O O O O O O O O O O O O O OO O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O OO O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O OO O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O O 0.0 0.5 O O O O O 1.0 Sulfate Observation Nitrate Observation (a) (b) 1.5 2.0 Figure: Validation versus the observed values at the 8 reserved sites. Validation prediction intervals are plotted as vertical lines. (a) sulfate and (b) nitrate. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data 20000 30000 grand 40000 50000 0 10000 20000 30000 cmaq 40000 50000 20000 40000 20000 30000 prec 40000 50000 0 10000 20000 40000 50000 10000 30000 10000 20000 30000 beta.v 40000 50000 30000 0 10000 20000 30000 40000 50000 al0 al1 50000 0.764 0.770 0 10000 20000 30000 40000 50000 0 10000 20000 30000 rho 40000 50000 0 10000 20000 30000 sig2delta 40000 50000 0 10000 20000 30000 sig2v 40000 50000 10000 20000 30000 sig2eps 40000 50000 0 10000 20000 30000 sig2psi 40000 50000 2.495 2.510 0 0.430 0.436 0.26 0.30 1.7 1.8 1.9 2.0 g1 0.05 0.07 0.09 g0 0 10000 20000 30000 sig2eta 40000 50000 0 10000 20000 30000 sig2zeta 40000 50000 0.70 0.80 0.90 0 0 0.05 0.15 0.25 −0.6 −0.4 −0.2 10000 0.885 0.900 −3.090−3.075 0 −0.02 0.0 0.02 0.92 10000 0.86 0.89 0 0.05 0.07 0.09 −1.94−1.88−1.82 MCMC Diagnostics Fusing point and areal level space-time data Figure: MCMC traceSujit of Sahu parameters for the sulfate model. ACF 0.0 0.4 0.8 ACF 0.0 0.4 0.8 ACF 0.0 0.4 0.8 MCMC Diagnostics ... 0 20 40 60 80 100 0 20 40 60 80 100 20 40 60 80 100 20 40 60 80 100 60 80 100 20 40 60 80 100 60 80 100 20 40 60 80 100 60 Lag 80 100 60 80 100 20 40 60 80 100 0 20 40 60 80 100 60 80 100 ACF 0.0 0.4 0.8 Lag ACF 0.0 0.4 0.8 40 0 Lag ACF 0.0 0.4 0.8 20 40 ACF 0.0 0.4 0.8 0 Lag 0 100 Lag ACF 0.0 0.4 0.8 40 20 Lag ACF 0.0 0.4 0.8 20 80 ACF 0.0 0.4 0.8 0 Lag 0 60 Lag ACF 0.0 0.4 0.8 40 0 Lag ACF 0.0 0.4 0.8 20 40 ACF 0.0 0.4 0.8 0 Lag 0 20 Lag ACF 0.0 0.4 0.8 0 0 Lag ACF 0.0 0.4 0.8 Lag 0 20 40 60 Lag 80 100 0 20 40 Lag Figure: Auto-correlation Sujit plotSahu of parameters Fusing point andfor arealthe level sulfate space-time data model Spatially varying slopes? Do we need the spatially varying b(s)’s? Only a few of the b(si ) are significant; they are small relative to their standard errors. Importance of precipitation and the spatially varying intercept makes it difficult to find spatially varying contribution of CMAQ. Fusion approaches also have not found spatially varying intercepts. Still can see space-time bias in CMAQ by comparing model predictions with CMAQ output. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Parameter Estimates α0 α1 β0 β1 β2 b0 γ0 γ1 ρ 2 σδ 2 ση σǫ2 2 σψ σv2 2 σζ mean –0.4497 0.1787 –1.9414 0.9103 0.0029 0.0490 –3.0768 0.8957 0.7688 2.6438 0.2812 Sulfate sd 95%CI 0.0871 (–0.6189, –0.2733) 0.0379 (0.1017, 0.2499) 0.0196 (–1.9784, –1.9012) 0.0067 (0.8972, 0.9240) 0.0062 (–0.0091, 0.0151) 0.0053 (0.0386, 0.0599) 0.0035 (–3.0836, -3.0700) 0.0034 (0.8891, 0.9025) 0.0012 (0.7664, 0.7712) 0.0602 (2.5254, 2.7631) 0.0101 (0.2616, 0.3010) mean –0.3548 0.1522 –1.9976 0.8412 0.0040 0.0535 –3.2177 0.7368 0.7492 1.8694 0.3354 Nitrate sd 95%CI 0.0596 (–0.4695, -0.2369) 0.0336 (0.0843, 0.2161) 0.0192 (–2.0344, –1.9605) 0.0070 (0.8274, 0.8553) 0.0060 (–0.0078, 0.0159) 0.0062 (0.0409, 0.0652) 0.0033 (–3.2242, –3.2112) 0.0033 (0.7303, 0.7433) 0.0013 (0.7468, 0.7517) 0.0387 (1.7942, 1.9476) 0.0105 (0.3149, 0.3564) 0.0718 2.5062 0.0057 0.0033 (0.0607, 0.0832) (2.4997, 2.5127) 0.0727 2.2148 0.0074 0.0028 (0.0588, 0.0878) (2.2092, 2.2203) 0.8087 0.4345 0.0259 0.0011 (0.7601, 0.8620) (0.4322, 0.4367) 0.7821 0.4340 0.0237 0.0012 (0.7366, 0.8290) (0.4316, 0.4363) Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Annual Sulfate Deposition 6 6 5 8 9 9 6 6 11 7 13 6 15 11 12 15 14 11 16 16 20 13 12 19 18 15 12 16 28 11 13 16 18 16 19 17 13 19 24 17 10 12 18 14 22 13 16 25 18 21 16 15 14 20 10 21 10 13 11 15 15 16 15 14 16 30 13 13 8 16 14 13 16 22 19 14 6 8 15 17 22 6 20 20 30 16 13 6 10 19 11 15 11 10 5 17 13 8 9 14 16 10 12 12 13 20 11 Figure: Model predicted map of annual sulfate deposition in 2001. The observed annual totals are labeled; a larger font size is used for the validation sites. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Compared with IDW map 6 6 9 5 8 9 6 6 7 7 12 11 4 4 4 6 13 6 7 6 15 11 12 15 8 14 11 8 20 12 19 18 15 12 16 13 11 13 13 10 18 12 28 18 21 16 15 16 21 16 16 14 13 6 12 1822 14 13 9 15 16 10 11 10 11 13 11 15 10 11 11 8 15 14 68 15 11 10 13 14 16 16 22 18 20 20 30 16 19 14 13 19 24 17 8 13 16 19 17 22 17 13 6 10 6 16 17 16 5 19 17 13 8 9 4 14 16 10 10 10 12 12 12 13 20 11 Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Annual Nitrate Deposition 9 7 11 7 10 10 8 9 13 9 13 6 13 10 12 17 13 13 12 15 16 10 11 14 14 14 14 12 17 9 13 14 13 13 15 15 11 13 18 10 12 11 11 11 11 9 9 20 15 8 11 10 9 7 8 8 10 10 12 12 5 8 7 10 11 14 11 12 11 13 10 10 14 16 12 8 10 6 8 11 11 16 14 9 7 15 14 17 13 13 7 11 21 10 8 6 7 11 8 8 8 11 9 12 10 Figure: Model predicted map of annual nitrate deposition in 2001. The observed annual totals are labeled; a larger font size is used for the validation sites. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Map of the length of 95% prediction intervals • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • 15 • • • • • 10 • 5 • • • • • • 20 • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • •• • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • Figure: Uncertainty map of annual sulfate deposition. • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • •• • • • • • • • • • • • • • • • • • • • 14 12 10 8 6 4 2 • • • • • • • • • • Figure: Uncertainty map of annual nitrate deposition. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Quarterly Sulfate Deposition • • •• • • • •• • • • •• • • • • • • • • • • • • •• • •• • • • • ••• • • • • • •• •• • •• • • • • •• • • •• • • • ••• • • • • • • • • • • • •• • •• • • • •• • • • • • • • •• • • • •• • • • •• • • • • • • • • • • • • •• • •• • • • ••• • • • • • •• •• • •• • • • • •• • • •• • • • ••• • • • • • • • • • • • •• • •• • • • •• • • • • • • (a) (b) • • •• • • • •• • • • •• • • • • • • • • • • • • •• • •• • • • • •• • ••• • • • • • • • •• • • • • •• • • •• • • • ••• • • • • • • • • • • • •• • •• • • • •• • • • • • • • •• • • • •• • • • •• • • • • • • • • • • • • •• • •• • • • •• • ••• • • • • • • • • •15 • • • • •• • • •• • • • ••• • • • • • • • • • • • 10 •• • •• • • • •• • 5 • • • • • 0 (c) (d) Figure: (a) Jan–Mar, (b) Apr-Jun, (c) Jul–Sep, (d) Oct-Dec. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Discussion Novel spatio-temporal model for fusing point and areal data which validates well. Inference can be provided for any spatial or temporal aggregation. There are models in between IDW and ours but may sacrifice the features we accommodate. Preferable to fusion using block averaging since number of modelled grid cells is much greater than number of monitoring sites, even worse if across time. Future: With data from more than one year we can study trends in deposition with regard to regulatory assessment. Future: Develop model for dry deposition, hence total deposition. Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data Paper download... Google Search Sujit Sahu to download the paper. One-day meeting on Environmental and Spatial Statistics sponsored by the Royal Statistical Society on June 19, 2009 in Southampton. http://www.s3ri.soton.ac.uk/courses/environmental/. A 3-day short course before that... Sujit Sahu Fusing point and areal level space-time data