Table S2. Segregation analysis of 151 crucian carp Carassius auratus EST-SSR
markers in an F1 population
Locus
Number of
Progeny
Epected
progeny
genotype
ratio
ab
99
aa:ab:bb
ab
ab
98
JE67
aa
ab
JE102
ab
JE109
Male
Female
Observed
P value
JE20
ab
1:2:1
46:28:25
0.0000*
JE61
aa:ab:bb
1:2:1
22:48:28
0.6771
98
aa:ab
1:1
50:48
0.8415
ab
98
aa:ab:bb
1:2:1
25:55:18
0.2908
ab
aa
100
aa:ab
1:1
58:42
0.1096
JE111
ab
ab
82
aa:ab:bb
1:2:1
20:40:22
0.9277
JE119
ab
aa
99
aa:ab
1:1
46:53
0.4839
JE121
ab
ab
98
aa:ab:bb
1:2:1
25:52:21
0.7082
JE126
aa
ab
96
aa:ab
1:1
54:42
0.2207
JE134
ab
aa
99
aa:ab
1:1
46:53
0.4839
JE135
ab
ab
96
aa:ab:bb
1:2:1
28:46:22
0.6317
JE136
ab
aa
99
aa:ab
1:1
52:47
0.6171
JE138
aa
bb
100
ab
1
100
/
JE163
ab
aa
96
aa:ab
1:1
43:53
0.3078
JE164
ab
aa
97
aa:ab
1:1
44:53
0.3594
JE179
ab
ab
98
aa:ab:bb
1:2:1
17:41:40
0.0012*
JE180
ab
aa
100
aa:ab
1:1
25:75
0.0000*
JE223
ab
ab
94
aa:ab:bb
1:2:1
30:47:17
0.1653
JE227
ab
ab
94
aa:ab:bb
1:2:1
11:55:28
0.0119*
JE253
ab
ab
97
aa:ab:bb
1:2:1
19:59:19
0.1028
JE254
aa
ab
97
aa:ab
1:1
49:48
0.9203
JE271
ab
cd
94
ac:ad:bc:bd
1:1:1:1
19:21:28:29
0.0801
JE293
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
23:58:19
0.2369
JE294
aa
ab
87
aa:ab
1:1
45:42
0.7518
JE346
aa
ab
94
aa:ab
1:1
37:57
0.0391*
JE351
ab
ab
98
aa:ab:bb
1:2:1
21:67:10
0.0003*
JE369
ab
aa
96
aa:ab
1:1
35:61
0.0080
JE374
ab
ab
97
aa:ab:bb
1:2:1
28:45:24
0.6570
JE380
ab
ab
99
aa:ab:bb
1:2:1
25:51:23
0.9185
JE388
ab
ab
97
aa:ab:bb
1:2:1
41:38:18
0.0004*
JE429
ab
aa
97
aa:ab
1:1
43:54
0.2636
JE481
ab
cd
97
ac:ad:bc:bd
1:1:1:1
18:28:27:24
0.4735
JE488
aa
ab
99
aa:ab
1:1
41:58
0.0875
JE502
ab
ab
99
aa:ab:bb
1:2:1
26:46:27
0.7711
JE540
ab
ac
96
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
24:23:22:27
0.5092
JE580
ab
ab
97
aa:ab:bb
1:2:1
42:22:33
0.0000*
JE588
ab
ab
96
aa:ab:bb
1:2:1
44:23:29
0.0000*
JE594
ab
aa
100
aa:ab
1:1
35:65
0.0003*
JE606
ab
ab
93
aa:ab:bb
1:2:1
36:36:21
0.0083*
JE609
ab
ab
97
aa:ab:bb
1:2:1
26:54:17
0.2322
name
JE635
ab
aa
95
aa:ab
1:1
31:64
0.0007*
JE638
ab
aa
96
aa:ab
1:1
46:56
0.6801
JE641
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
27:32:41
0.0002*
JE668
ab
ab
97
aa:ab:bb
1:2:1
36:37:24
0.0148*
JE671
ab
ab
89
aa:ab:bb
1:2:1
12:68:9
0.0001*
JE680
aa
ab
94
aa:ab
1:1
49:45
0.6801
JE695
ab
aa
96
aa:ab
1:1
47:49
0.8415
JE742
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
45:47:8
0.0000*
JE764
aa
ab
96
aa:ab
1:1
46:50
0.6801
JE813
ab
ac
98
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
19:24:23:32
0.3043
JE821
aa
bb
100
ab
1
100
/
JE929
ab
aa
94
aa:ab
1:1
42:52
0.3032
JE934
ab
ac
93
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
29:26:20:18
0.3353
JE965
ab
ab
96
aa:ab:bb
1:2:1
25:50:21
0.7788
JE988
ab
aa
100
aa:ab
1:1
49:51
0.8415
JE1018
ab
aa
93
aa:ab
1:1
53:40
0.1773
JE1025
ab
ab
91
aa:ab:bb
1:2:1
32:45:14
0.0283*
JE1060
aa
ab
96
aa:ab
1:1
54:42
0.2207
JE1072
ab
ab
98
aa:ab:bb
1:2:1
22:46:30
0.4630
JE1089
ab
aa
100
aa:ab
1:1
46:54
0.4237
JE1100
ab
aa
100
aa:ab
1:1
48:52
0.6892
JE1108
ab
ac
98
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
28:30:16:24
0.1960
JE1125
aa
ab
100
aa:ab
1:1
47:53
0.5485
JE1178
ab
aa
100
aa:ab
1:1
34:66
0.0009*
JE1191
ab
ac
100
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
22:22:34:22
0.2289
JE1293
ab
ab
97
aa:ab:bb
1:2:1
18:35:44
0.0000*
JE1329
aa
ab
95
aa:ab
1:1
37:58
0.0312*
JE1407
ab
ac
98
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
29:26:29:14
0.1005
JE1430
ab
ab
94
aa:ab:bb
1:2:1
21:49:24
0.8353
JE1543
ab
aa
96
aa:ab
1:1
43:53
0.3078
JE1567
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
25:52:23
0.9560
JE1583
ab
aa
99
aa:ab
1:1
53:46
0.4839
JE1601
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
19:52:29
0.1921
JE1664
ab
ac
97
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
20:31:29:17
0.1261
JE1704
aa
ab
100
aa:ab
1:1
46:54
0.4503
JE1738
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
25:48:27
0.8479
JE1783
aa
ab
95
aa:ab
1:1
45:50
0.6101
JE1790
aa
ab
94
aa:ab
1:1
45:49
0.6801
JE1884
ab
ab
98
aa:ab:bb
1:2:1
33:32:33
0.0063*
JE1898
ab
ab
96
aa:ab:bb
1:2:1
30:39:27
0.1686
JE1941
ab
ab
96
aa:ab:bb
1:2:1
24:29:43
0.0000*
JE2046
aa
bb
97
ab
1
97
/
JE2109
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
23:55:22
0.9231
JE2143
ab
aa
100
aa:ab
1:1
49:51
0.8231
JE2157
ab
ab
93
aa:ab:bb
1:2:1
26:47:20
0.6771
JE2197
ab
ab
92
aa:ab:bb
1:2:1
27:51:14
0.0926
JE2293
ab
aa
100
aa:ab
1:1
49:51
0.8231
JE2396
aa
ab
93
aa:ab
1:1
52:41
0.2542
JE2413
ab
ac
100
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
2:45:46:7
0.0001*
JE2555
ab
ab
90
aa:ab:bb
1:2:1
20:54:16
0.1381
JE2691
ab
ac
97
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
24:31:15:27
0.1261
JE2793
aa
ab
93
aa:ab
1:1
32:61
0.0026*
JE2854
ab
aa
93
aa:ab
1:1
41:52
0.2542
JE2939
aa
ab
95
aa:ab
1:1
51:44
0.4708
JE3039
ab
aa
95
aa:ab
1:1
36:59
0.0182*
JE3088
ab
aa
95
aa:ab
1:1
52:43
0.3565
JE3165
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
30:47:23
0.5741
JE3215
ab
ac
94
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
21:25:21:27
0.7650
JE3218
ab
ab
95
aa:ab:bb
1:2:1
20:49:26
0.6538
JE3238
ab
ab
96
aa:ab:bb
1:2:1
17:49:30
0.1686
JE3259
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
21:53:26
0.6505
JE3346
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
27:70:3
0.0000*
JE3263
ab
cc
100
ac:bc
1:1
52:48
0.4028
JE3412
ab
cd
95
ac:ad:bc:bd
1:1:1:1
16:31:28:20
0.1073
JE3425
ab
ab
99
aa:ab:bb
1:2:1
27:59:13
0.0226*
JE3445
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
38:45:17
0.0074*
JE3451
ab
ab
99
aa:ab:bb
1:2:1
14:65:20
0.0054*
JE3476
ab
ac
93
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
20:24:33:16
0.0775
JE3503
ab
aa
100
aa:ab
1:1
33:67
0.0007*
JE3592
aa
ab
98
aa:ab
1:1
57:41
0.1062
JE3598
ab
ab
97
aa:ab:bb
1:2:1
21:45:31
0.2767
JE3604
ab
ab
99
aa:ab:bb
1:2:1
18:59:22
0.1374
JE3608
ab
aa
100
aa:ab
1:1
44:56
0.2161
JE3630
ab
ab
94
aa:ab:bb
1:2:1
25:41:28
0.4232
JE3692
ab
aa
98
aa:ab
1:1
45:53
0.4201
JE3695
ab
ab
94
aa:ab:bb
1:2:1
33:42:19
0.0732
JE3707
ab
ab
96
aa:ab:bb
1:2:1
47:23:26
0.0000*
JE3718
ab
ab
90
aa:ab:bb
1:2:1
38:47:5
0.0000*
JE3739
ab
ab
96
aa:ab:bb
1:2:1
22:54:20
0.4538
JE3844
ab
ac
95
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
24:26:30:15
0.1660
JE3887
ab
ac
93
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
31:22:24:16
0.1762
JE3931
aa
ab
100
aa:ab
1:1
47:53
0.5485
JE3956
ab
ac
99
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
20:27:34:18
0.0933
JE3958
ab
aa
100
aa:ab
1:1
47:53
0.6033
JE3965
ab
ab
98
aa:ab:bb
1:2:1
23:49:26
0.9139
JE3970
ab
ab
98
aa:ab:bb
1:2:1
30:50:18
0.2254
JE4202
ab
aa
98
aa:ab
1:1
48:50
0.8415
JE4236
ab
ac
99
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
20:20:29:30
0.2994
*
JE4246
ab
ab
90
aa:ab:bb
1:2:1
13:60:17
0.0056*
JE4264
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
20:53:27
0.5117
JE4354
aa
ab
100
aa:ab
1:1
49:51
0.8415
JE4471
ab
ab
95
aa:ab:bb
1:2:1
37:32:26
0.0018*
JE4567
ab
ab
94
aa:ab:bb
1:2:1
25:42:27
0.5627
JE4581
ab
ab
100
aa:ab:bb
1:2:1
24:49:27
0.9048
JE4592
ab
ab
94
aa:ab:bb
1:2:1
25:39:30
0.1959
JE4724
ab
ab
95
aa:ab:bb
1:2:1
22:44:29
0.4607
JE4759
aa
ab
93
aa:ab
1:1
46:47
0.9203
JE4879
aa
ab
94
aa:ab
1:1
39:55
0.0991
JE4920
ab
ac
93
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
23:22:28:20
0.6846
JE4950
aa
ab
96
aa:ab
1:1
49:47
0.8415
JE4970
aa
ab
96
aa:ab
1:1
50:46
0.6801
JE4984
97
aa:ab
1:1
39:58
0.0538
aa
ab
JE5069
aa
ab
97
aa:ab
1:1
40:57
0.8429
JE5075
ab
ac
100
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
23:52:4:21
0.0000*
JE5081
aa
ab
94
aa:ab
1:1
39:55
0.0991
JE5100
ab
ab
95
aa:ab:bb
1:2:1
29:47:19
0.3465
JE5108
ab
aa
98
aa:ab
1:1
51:47
0.6892
JE5179
ab
ac
98
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
30:18:25:25
0.3947
JE5234
ab
ab
99
aa:ab:bb
1:2:1
19:47:33
0.1218
JE5247
ab
cd
98
ac:ad:bc:bd
1:1:1:1
18:29:23:28
0.3705
JE5258
ab
ac
94
aa:ab:ac:bc
1:1:1:1
27:23:24:20
0.7867
Designates significant deviation from expected Mendelian ratios at P<0.05