SEMINARIOS 2015-Biofisica

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BIOFÍSICA 2015

SEMINARIOS 2015

1 ‐ AFM (Gabriela Coux ‐ coux@ibr-conicet.gov.ar)

Methods in Molecular Biophysics (Serdyuk – Zaccai – Zaccai). Cap. F2

(pag. 641 ‐ 657)---

Impreso en Cátedra

.

AFM: a nanotool in membrane biology. Muller DJ. Biochemistry. 2008.

5;47(31):7986 ‐ 98--Archivo pdf en Transparente Virtual .

2 ‐ Electroforesis capilar (Guillermo Bahr ‐ bahr@ibr-conicet.gov.ar)

Methods in Molecular Biophysics (Serdyuk – Zaccai – Zaccai). Cap. D5

(pag. 388 ‐ 413), Sección D.5.7 específico de electroforesis capilar.---

Impreso en Cátedra.

DNA Adsorption to the Reservoir Walls Causing Irreproducibility in Studies of Protein_DNA Interactions by Methods of Kinetic Capillary

Electrophoresis (2011). M. Kanoatov and S. N. Krylov. Anal. Chem, 83,

8041 –8045--Archivo pdf en Transparente Virtual .

Method for Determination of Peak Areas in Nonequilibrium Capillary

Electrophoresis of Equilibrium Mixtures (2011). Leonid T. Cherney, Mirzo

Kanoatov, and Sergey N. Krylov, Annalytical Chemisttry--Archivo pdf en

Transparente Virtual .

Highly sensitive detection of S-nitrosylated proteins by capillary gel electrophoresis with laser induced fluorescence (2011). S. Wanga, M. L.

Circub, H. Zhouc, D. Figeysc, T. Y. Awb, J. Feng. Journal of

Chromatography A, 1218 (2011) 6756 – 6762--Archivo pdf en

Transparente Virtual .

3 ‐ In cell NMR (Lisandro Gonzalez ‐ lgonzalez@ibr-conicet.gov.ar)

Macromolecular NMR spectroscopy for the non-spectroscopist. FEBS

Journal 278 (2011) 687

–703. ---

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In ‐ cell NMR for protein ‐ protein interactions (STINT ‐ NMR). D. S. Burz, K.

Dutta, D. Cowburn & A. Shekhtman. NATURE PROTOCOLS VOL.1

NO.1 |2006| 146 ‐ 152--Archivo pdf en Transparente Virtual .

Mapping structural interactions using in ‐ cell NMR spectroscopy

(STINT ‐ NMR). D. S. Burz, K. Dutta, D. Cowburn & A. Shekhtman.

NATURE METHODS VOL.3 NO.2 |2006| ‐ 91 ‐ 93--Archivo pdf en

Transparente Virtual .

Looking into live cells with in-cell NMR spectroscopy. P. Selenko, G.

Wagner. Journal of Structural Biology 158 (2007) 244

–253---

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BIOFÍSICA 2015

4 ‐ Single Molecule (Ana Bortolotti ‐ abortolotti@fbioyf.unr.edu.ar)

 “Single-Biomolecule Kinetics: The Art of Studying a Single Enzyme”. V. I.

Claessen, H. Engelkamp, P. C.M. Christianen, J. C. Maan, R. J.M. Nolte,

K. Blank, and A. E. Rowan. Annu. Rev. Anal. Chem. 2010. 3:319 –40.---

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 “Dissecting the multistep reaction pathway of an RNA enzyme by single ‐ molecule kinetic‘‘fingerprinting’’. S. Liu, G. Bokinsky, N. G. Walter, and X. Zhuang. PNAS. 2007 vol. 104 no. 31, 12634

–12639.---

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 “Single-molecule super-resolution imaging in bacteria”. DI Cattoni, JB

Fiche and M No llmann. Current Opinion in Microbiology 2012, 15:758

763.-- Archivo pdf en Transparente Virtual .

 “Single-Molecule Fluorescence Imaging in Living Cells”. T. Xia, N. Li, and

X. Fang. Annu. Rev. Phys. Chem. 2013. 64:459 –80.-- Archivo pdf en

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5 ‐ Citometría de Flujo (Julia Cricco ‐ jcricco@ fbioyf.unr.edu.ar)

Flow cytometry based assays for the measurement of apoptosisassociated mitochondrial membrane depolarisation and cytochrome c release (2013). M. E. Christensen, E. S. Jansen, W. Sanchez, N. J.

Waterhouse. Methods 61, 138 –145--Archivo pdf en Transparente Virtual.

Flow cytometric characterization of marine microbes. T. W. Petersen, C. B.

Harrison, D. N. Horner, G. van den Engh (2012) Methods 57: 350 –358 ---

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Photoacoustic flow cytometry. (2012). E. I. Galanzha and V. P. Zharov

Methods 57: 280

–296---

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6 ‐ Calorimetría (Rocío Meini ‐ meini@ibr-conicet.gov.ar)

Methods in Molecular Biophysics (Serdyuk

– Zaccai – Zaccai). Cap. C3

(pag. 221 ‐ 233)--Impreso en Cátedra.

Isothermal Titration Calorimetry of Protein ‐ Protein Interactions. Michael M.

Pierce, C. S. Raman, and Barry T. N all. METHODS 19, 213Ð221 (1999)---

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Thermodynamics of Cooperative DNA Recognition at a Replication Origin and Transcription Regulatory Site. M. Dellarole, I. E. Sanchez and G. de

Prat Gay. Biochemistry 2010, 49, 10277

–10286---

Archivo pdf en

Transparente Virtual.

BIOFÍSICA 2015

7 ‐ DIGE (Anabella Lodeyro ‐ lodeyro@ibr-conicet.gov.ar)

The development of the DIGE system: 2D fluorescence difference gel analysis technology. Marouga, R; David, S and Hawkins, E. (2005). Anal

Bioanal Chem 382: 669

–678---

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2D-DIGE: Comparative Proteomics of Cellular Signalling Pathways. N. B.

Larbi and C. Jefferies. Methods in Molecular Biology (2009). Toll-Like

Receptors, vol. 517, Cap 8, 105-132--Archivo pdf en Transparente

Virtual.

Light Induced Changes in Protein Expression and Uniform Regulation of

Transcription in the Thylakoid Lumen of Arabidopsis thaliana. Granlund I,

Hall M, Kieselbach T, Schro¨der WP (2009). PLoS ONE 4(5): e5649. doi:10.1371/journal.pone.0005649--Archivo pdf en Transparente Virtual.

8 ‐ SPR (Cecilia Garófalo ‐ cgarofalo@fbioyf.unr.edu.ar)

Methods in Molecular Biophysics (Serdyuk – Zaccai – Zaccai). Cap. C4

(pag. 234 ‐ 246)--Impreso en Cátedra .

CHAPTER 1 ‐ Introduction to Surface Plasmon Resonance (A. TUDOS and

R. SCHASFOORT) ---Archivo pdf en Transparente Virtual.

Surface Plasmon Resonance: A Versatile Technique for Biosensor

Applications (2015). H. H. Nguyen, J. Park, S. Kang and M. Kim.

Sensors ,

15 , 10481-10510; -- Archivo pdf en Transparente Virtual.

9- Microscopía de Fluorescencia (Leticia Llarrull - llarrull@ibrconicet.gov.ar)

Methods in Molecular Biophysics (Serdyuk – Zaccai – Zaccai). Cap. F3

(pag. 658- 682).--Impreso en Cátedra .

FRET in Cell Biology: Still Shining in the Age of Super-Resolution? (2011).

H. E. Grecco and P. J. Verveer. ChemPhysChem 12, 484

– 490---

Archivo pdf en Transparente Virtual.

Imaging Protein States in Cells. H. E. Grecco and P. I. H. Bastiaens

(2010) – Chapter 6: 95-117--Archivo pdf en Transparente Virtual.

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