Uploaded by Teddy Hardiansyah

Biokimia metabolisme protein

advertisement
METABOLISME PROTEIN
DOSEN PENGAMPU :
Uswatun Hasanah S, S.Pd., M.Pd
Disusun oleh :
Teddy Hardiansyah
NPM: 71200517003
PROGRAM STUDI PENDIDIKAN KIMIA
FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN
UNIVERSITAS ISLAM SUMATERA UTARA
T.A. 2022-2023
METABOLISME PROTEIN
A. Metabolisme Protein
Menurut Hanum (2018:149) Metabolisme adalah proses kimia yang terjadi di
dalam tubuh makhluk hidup/sel. Metabolisme disebut juga reaksi enzimatis, karena reaksi
metabolisme menggunakan katalisator enzim. Berdasarkan prosesnya metabolisme dibagi
menjadi 2, yaitu:
a. Anabolisme/ Asimilasi/ Sintesis yaitu proses pembentukan molekul yang kompleks
dengan menggunakan energi tinggi.
b. Katabolisme (Dissimilasi) yaitu proses penguraian zat untuk membebaskan energi
kimia yang tersimpan dalam senyawa organik tersebut (Hanum 2018).
Menurut Murray yang dikutip oleh wahjuni (2013: 22) protein dalam sel hidup
terus menerus diperbaharui melalui proses pertukaran protein, yaitu suatu proses
berkesinambungan yang terdiri atas penguraian protein yang sudah ada menjadi asam
amino bebas dan resintesis selanjutnya dari asam-asam amino bebas menjadi protein.
Dalam tubuh sekitar 1-2 % protein mengalami peruraian setiap hari. Sekitar 75- 80 % dari
asam amino yang dibebaskan akan digunakan kembali untuk sintesis protein yang baru.
Nitrogen sisanya akan dikatabolisasi menjadi urea (pada mamalia) dan kerangka karbon
bagi senyawa-senyawa amfibolik (Wahjuni 2013).
Secara umum metabolisme protein dapat dilihat pada Gambar 1. Asam-asam amino
yang berlebih tidak akan disimpan, tetapi diuraikan dengan cepat. Di dalam sel, protein
akan diuraikan menjadi asam-asam amino oleh protease dan peptidase. Protease intrasel
akan memutus ikatan peptida internal protein sehingga terbentuk senyawa peptida.
Selanjutnya, oleh peptidase, peptida tersebut akan diuraikan menjadi asam-asam amino
bebas. Endopeptidase akan memutus ikatan peptida internal sehingga terbentuk peptidapeptida yang lebih pendek, selanjutnya ammopeptidase dan karboksipeptidase akan
membebaskan asam-asam amino masing-masing dalam gugus terminal-N dan -C pada
peptida-peptida tersebut. Penguraian protein seperti yang disebutkan di atas adalah untuk
protein ekstrasel dan intrasel yang mana penguraiannya tidak memerlukan ATP. Untuk
protein yang berusia pendek dan yang abnormal penguraiannya terjadi pada sitosol dan
memerlukan ATP atau ubikuitin. Asam amino yang terbentuk dari katabolisme protein ini
akan dimetabolisasi menjadi ammonia dan kerangka karbon. Selanjutnya kerangka karbon
akan ikut dalam siklus asam sitrat (TCA) dan glukoneogenesis. Sedangkan ammonia akan
mengalami sintesis membentuk urea atau membentuk asam amino baru (Wahjuni 2013).
Gambar 1. Metabolisme Protein Secara Umum
Sumber: (Wahjuni 2013) dan (Universitas Negeri Jakarta 2017)
Dalam proses metabolisme protein ada beberapa reaksi yang sering terjadi seperti
pada gambar 2 dimana proses metobolisme protein dimulai dari proses dekarboksilasi,
proses transaminasi, proses deaminasi, hingga siklus urea.
Gambar 2. Proses Metabolisme Protein (Katabolisme)
Sumber: (Oktasari 2014)
1. Proses Dekarboksilasi
Proses dekarboksilasi merupakan sebuah proses terjadinya reaksi kimia yang
menyebabkan sebuah gugus karboksil (-COOH) terlepas dari senyawa semula menjadi
CO2.
Gambar 3. Siklus Dekarboksilasi Protein
Sumber: (Putra 2018)
Pada gambar 3 siklus dekarboksilasi dimana asam piruvat (yang beratom C3)
menjadi senyawa baru yakni asetil koenzim-A (yang beratom C2) reaksi ini disebut
dengan dekarboksilasi oksidatif, dimana sebagai tahap awal memesuki siklus krebs.
Enzim yang berperan dalam reaksi dekarboksilasi, ialah: Dekarboksilase,
dekarboksiliase, dehidrogenas, dihidrlipoil transasetilase (Putra 2018).
Gambar 4. Siklus Krebs pada Dekarboksilasi Protein
Sumber: (Putra 2018)
2. Proses Transminasi
Menurut Hanum (2018:155) Transaminasi adalah proses perubahan asam
amino menjadi jenis asam amino lain. Sedangkan menurut Wahjuni (2013:26)
Transamini adalah pemindahan gugus asam α-amino pada glutamat, proses ini
merupakan reaksi pertama dari proses katabolisme. Reaksi ini diawali oleh enzim
transaminase. Enzim ini mempunyai gugus prostetik piridoksal phospat (bentuk aktif
B6). Umumnya, piridoksal fosfat berikatan kovalen dengan situs aktif enzim melalui
ikatan imin (basa schift), yaitu pada gugus amina E dari residu lisin transaminase.
Reaksi-reaksi yang dikatalisis transaminase mempunyai konstanta kesetimbangan 1,0
karenanya reaksinya adalah bolak-balik. Gugus prostetik piridoksal fosfat berfungsi
sebagai pengangkut sementara (intermediate carrier) bagi gugus amino pada situs aktif
transaminase (Wahjuni 2013).
Proses transaminasi didahului oleh perubahan asam amino menjadi bentuk
asam keto, secara skematik digambarkan sebagai berikut:
Senyawa ini mengalami transformasi antara bentuk aldehid (piridoksal fosfat)
yang dapat menerima gugus amino dengan bentuk transaminasinya, yaitu piridoksamin
fosfat yang dapat memberikan gugusaminonya kepada suatu asam keto-α. Piridoksal
fosfat terikat pada transaminase pada situs aktifnya melalui ikatan kovalen dalam
bentuk kimina (basa schiff) dengan gugus amino E dari residu lisin. Pada reaksi
transaminasi ini gugus amino- α dari asam amino akan dialihkan ke asam keto- α
glutarat. Hasilnya adalah asam keto- α glutarat akan mendapat gugus amino menjadi
Lglutamat, sedang asam amino yang kehilangan gugus aminonya menjadi suatu asam
keto- α yang bersesuaian. Keadaan yang sama juga terjadi pada transaminasi gugus
amino dari alanin ke α-keto glutarat, reaksi ini menghasilkan L-glutamat dan pruvat.
Jadi, setiap enzim transaminase bersifat spesifi k untuk satu pasangan asam α -amino
dan asam α-keto. Reaksi transaminasi itu terbukti terjadi hampir pada semua asam
amino kecuali lisin, treonin, prolin dan hidroksi prolin (Wahjuni 2013).
Transaminasi terjadi pada berbagai jaringan. Selain itu, transaminasi juga
terjadi di dalam sirkulasi darah akibat adanya kerusakan pada jaringan karena proses
patologik, sebagai contoh SGOT (serum glutamic-oxaloacetic transaminase) yang
meningkat akibat infark miokard (kerusakan otot jantung karena adanya sumbatan
pembuluh darah yang mensuplai kebutuhan otot jantung) (Hanum 2018).
Tujuan utama dari reaksi transaminase itu adalah untuk mengumpulkan semua
nitrogen dari asam amino dalam bentuk satu-satunya senyawa, yaitu glutamat. Hal ini
sangat penting karena L-glutamat merupakan satu-satunya asam amino dalam jaringan
mamalia yang menyalami deaminasi oksidatif dengan kecepatan cukup tinggi. Jadi,
pembentukan ammonia dari gugus α -amino terutama terjadi lewat konversi menjadi
nitrogen α - amino pada α -glutamat
Gambar 5. Contok reaksi Transminase Protein
Sumber: (Universitas Negeri Jakarta 2017)
Gambar 6. Siklus/Mekanisme Tranminasi Protein
Sumber: (Wahjuni 2013)
3. Proses Deaminasi.
Deaminasi oksidatif adalah proses pemecahan (hidrolisis) asam amino menjadi
asam keto dan ammonia (NH4+), secara skematik digambarkan sebagai berikut
Deaminasi menghasilkan 2 senyawa penting yaitu senyawa nitrogen dan nonnitrogen:
1. Senyawa nonnitrogen yang mengandung gugus C, H, dan O selanjutnya diubah
menjadi asetil Co-A untuk sumber energi melalui jalur siklus Kreb’s atau
disimpan dalam bentuk glikogen.
2. Senyawa nitrogen dikeluarkan lewat urin setelah diubah lebih dahulu menjadi
ureum. Proses deaminasi kebanyakan terjadi di hati, oleh karena itu pada
gangguan fungsi hati (liver) kadar NH3 meningkat. Pengeluaran (ekskresi) urea
melalui ginjal dikeluarkan bersama urin. (Hanum 2018).
Gambar 7. Reaksi Deaminasi
Sumber: (Universitas Negeri Jakarta 2017)
Pada reaksi ini terdapat dua jalur yaitu yang bersifat oksidatif dan non-oksidatif.
Pada reaksi deaminasi oksidatif L-Glutamat yang mengandung gugus amino pada reaksi
tranamiase akan melepaskan gugus aminonya melalui reaksi deaminasi oksdatif.
Reaksinya berlangsung dalam dua tahap yaitu dehidrogenasi dan hidrolisis (Makmur
2019).
Gambar 8. proses reaksi/mekanisme deaminasi oksidatif
Sumber: (Makmur 2019)
Sedangkan pada reaksi deaminasi non-oksidatif merupakan penghilangan gugus
amino dari asal asam amino serin yang dikatalis oleh enzim serindehidratase. Contohnya
ialah perubahan L-serin menjadi asam piruvat yang dikatalisa oleh serin dehidratase
(Makmur 2019).
Gambar 9. proses reaksi/mekanisme deaminasi nonoksidatif
Sumber: (Makmur 2019)
4. Siklus Urea
Dari uraian tentang metabolisme asam amino telah diketahui bahwa NH3 dapat
dilepaskan dari asam amino melalui reaksi transaminasi dan deaminasi. Pada reaksi
transaminasi gugus –NH2 yang dilepaskan diterima oleh suatu asam keto, sehingga
terbentuk asam amino baru dan asam keto lain, sedangkan pada reaksi deaminasi,
gugus NH2 dilepaskan dalam bentuk amonia yang kemudian dikeluarkan dari dalam
tubuh dalam bentuk urea dalam urine. Amonia dengan kadar yang tinggi merupakan
racun bagi tubuh manusia (Poedjadi 1996).
Hans Krebs dan Kurt Henseleit pada tahun 1932 mengemukakan serangkaian
reaksi kimia tentang pembentukan urea. Mereka berpendapat bahwa urea terbentuk
dari amonia dan karbondioksida melaui serangkaian reaksi kimia yang berupa siklus,
yang mereka namakan siklus urea. Pembentukan urea ini terutama berlangsung di
dalam hati. Urea merupakan suatu senyawa yang mudaj larut dalam air, bersifat netral,
terdapat dalam urine yang dikeluarkan dari dalam tubuh (Poedjadi 1996).
Biosintesis urea terdiri atas beberapa tahap reaksi yang merupakan suatu siklus,
sebagai berikut (Poedjadi 1996).
Gambar 10. Siklus pembentukan Urea; (1) Karbamoilase fosfat Sintetase; (2) Ornitin
karbamoilasa; angininosuksinat sintetase; (40 anginino suksinase; (5) arginase.
Sumber: (Poedjadi 1996).
1. Sintesis Karbamil Fosfat
Dalam reaksi pembentukan karbamil fosfat ini, satu mol amonia bereaksi
dengan satu mol karbondioksida dengan bantuan enzim karbamilfosfat sintetase.
Reaksi ini membutuhkan energi, karenanya reaksi ini melibatkan dua mol ATP yang
diubah menjadi ADP. Disamping ini sebagai kofaktor dibutuhkan Mg ++ dan N-asetilglutamat (Poedjadi 1996).
Gambar 11. Mekanisme Sintesis Karbamil Fosfat
Sumber: (Poedjadi 1996)
2. Pembentukan Stirulin
Karbamil fosfat yang terbentuk bereaksi dengan ornitin membentuk sitrulin.
Dalam reaksi ini, bagian karbamil bergabung dengan ornitin dan memisahkan gugus
fosfat. Sebagai katalis pada pembentukan sitrulin adalah ornitin transkarbamilase yang
terdapat pada bagian mitokondria sel hati (Poedjadi 1996).
Gambar 12, Mekanisme Pembentukan Stirulin
Sumber: (Poedjadi 1996)
3. Pembentukan Asam Argininosuksinat
Selanjutnya sitrulin bereaksi dengan asam aspartat membentuk asam
argininosuksinat. Reaksi ini berlangsung dengan bantuan enzim argininosuksinat
sintetase. Dalam reaksi tersebut ATP merupakan sumber energi dengan jalan
melepaskan gugus fosfat dan berubah menjadi AMP (Poedjadi 1996).
Gambar 13. Mekanisme Pembentukan Asam Argininosusinat
Sumber: (Poedjadi 1996)
4. Penguraian Asam Argininosuksinat
Dalam reaksi ini asam argininosuksinatdiuraikan menjadi arginin dan asam
fumarat. Reaksi ini berlangsung dengan bantuan enzim argininosuksinase, suatu enzim
yang terdapat di dalam hati dan ginjal (Poedjadi 1996).
Gambar 14. Mekanisme Penguraian Asam Argininosusinat
Sumber: (Poedjadi 1996)
5. Penguraian Arginin
Reaksi terakhir ini melengkapai tahap reaksi pada siklus urea. Dalam reaksi ini,
arginin diuraikan menjadi urea dan ornitin. Enzim yang bekerja sebagai katalis dalam
reaksi penguraian ini ialah arginase yang terdapat dalam hati. Ornitin yang terbentuk
dalam reaksi hidrolisis ini bereaksi kembali dengan karbamilfosfat untuk membentuk
sitrulin. Demikian seterusnya reaksi berlangsung secara berulang-ulang sehingga
merupakan suatu siklus. Adapun urea yang terbentuk dikeluarkan dari tubuh melalui
urine. (Poedjadi 1996)
Gambar 15. Penguraian Arginin
Sumber: (Poedjadi 1996)
Reaksi keseluruhan siklus urea ini ialah sebagai berikut:
2NH3 + CO2 + 3ATP + 2H2O
Urea + 2 ADP + AMP + 2Pi + Ppi
Gambar 16. Reaksi Keseluruhan Siklus Urea
Sumber: (Poedjadi 1996) dan (poetry 2016)
Oleh karena pirofosfat yang terbentuk dalam reakis ini (PPi) terhidrolisis lebih
lanjut menjadi fosfat, maka pembentukan satu molekul urea membutuhkan empat
ikatan fosfat berenergi tinggi. Proses kimia dalam siklus urea ini terjadi dalam hati
karena enzim-enzim yang bekerja sebagai katalis terutama terdapat pada mitokondria
dalam sel hati.
B. Kesimpulan
Metabolisme adalah proses kimia yang terjadi di dalam tubuh makhluk hidup/sel.
Metabolisme disebut juga reaksi enzimatis, karena reaksi metabolisme menggunakan
katalisator enzim. Berdasarkan prosesnya metabolisme dibagi menjadi 2, yaitu:
1) Anabolisme/ Asimilasi/ Sintesis yaitu proses pembentukan molekul yang kompleks
dengan menggunakan energi tinggi.
2) Katabolisme (Dissimilasi) yaitu proses penguraian zat untuk membebaskan energi
kimia yang tersimpan dalam senyawa organik tersebut
Metabolisme protein adalah yaitu suatu proses berkesinambungan yang terdiri atas
penguraian protein yang sudah ada menjadi asam amino bebas dan resintesis selanjutnya
dari asam-asam amino bebas menjadi protein. Dalam tubuh sekitar 1-2 % protein
mengalami peruraian setiap hari. Sekitar 75- 80 % dari asam amino yang dibebaskan akan
digunakan kembali untuk sintesis protein yang baru. Nitrogen sisanya akan dikatabolisasi
menjadi urea (pada mamalia) dan kerangka karbon bagi senyawa-senyawa amfibolik
dimana Asam-asam amino yang berlebih tidak akan disimpan, tetapi diuraikan dengan
cepat. Di dalam sel, protein akan diuraikan menjadi asam-asam amino oleh protease dan
peptidase. Protease intrasel akan memutus ikatan peptida internal protein sehingga
terbentuk senyawa peptida. Selanjutnya, oleh peptidase, peptida tersebut akan diuraikan
menjadi asam-asam amino bebas. Endopeptidase akan memutus ikatan peptida internal
sehingga terbentuk peptida-peptida yang lebih pendek, selanjutnya ammopeptidase dan
karboksipeptidase akan membebaskan asam-asam amino masing-masing dalam gugus
terminal-N dan -C pada peptida-peptida tersebut. Penguraian protein seperti yang
disebutkan di atas adalah untuk protein ekstrasel dan intrasel yang mana penguraiannya
tidak memerlukan ATP. Untuk protein yang berusia pendek dan yang abnormal
penguraiannya terjadi pada sitosol dan memerlukan ATP atau ubikuitin. Asam amino yang
terbentuk dari katabolisme protein ini akan dimetabolisasi menjadi ammonia dan kerangka
karbon. Selanjutnya kerangka karbon akan ikut dalam siklus asam sitrat (TCA) dan
glukoneogenesis. Sedangkan ammonia akan mengalami sintesis membentuk urea atau
membentuk asam amino baru.
Dalam proses metabolisme protein ada beberapa mekanisme yang sering terjadi
pada metobolisme protein dimulai dari proses dekarboksilasi, proses transaminasi, proses
deaminasi, hingga siklus urea
C. Referensi
Hanum, Galuh Ratna. 2018. BUKU AJAR BIOKIMIA DASAR Edisi Revisi. Sidoarjo:
UMSIDA Press.
Makmur, Indra. 2019. “Katabolisme Protein.” Slide Player. Diambil 5 Maret 2023
(https://slideplayer.info/slide/13816526).
Oktasari, yona. 2014. “Metabolisme Protein Transminasi dan Deaminasi.” slidehare.
Diambil 2 Maret 2023 (https://www.slideshare.net/lingAkhirudin/metabolismeprotein-transminasi-dan-deaminasi).
Poedjadi, Anna. 1996. Dasar - Dasar Biokimia. Jakarta: UI Press.
Poetry, wita. 2016. “Metabolisme Protein.” Slide Player. Diambil 31 Maret 2023
(https://slideplayer.info/slide/2780457).
Putra, Ade. 2018. “Metabolisme Protein.” slidehare. Diambil 2 Maret 2023
(ttps://www.slideshare.net/lingAkhirudin/metabolisme-protein-5-120236112).
Universitas Negeri Jakarta. 2017. “Metabolisme Protein.” slidehare. Diambil 4 Maret
2023 (https://www.slideshare.net/lingAkhirudin/metabolisme-protein).
Wahjuni, Sri. 2013. Metabolisme Kimia. diedit oleh Jiwa Atmaja. Denpasar: Udayana
University Press.
Download