Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey Campus Puebla Probabilidad y estadística Profesor: Julio César Ramírez San Juan Proyecto final Resistencia bacteriana de Escherichia coli y Pseudomonas aeruginosa en extractos naturales y antibióticos. Andrea Rivera Ahumada A01324157 Carlos Joaquín Pérez Guzmán A00819997 Emilio García Pinedo A01730387 6 de mayo de 2019 Enero-Mayo 2019 Introducción Según la Organización Mundial de la Salud, “Al tomar antibióticos que no necesitamos estamos acelerando la aparición de resistencia a ellos” (s.f.) En otras palabras, esto significa que la efectividad de los medicamentos cada vez es menor en menos tiempo. Gracias a la capacidad mutagénica de los microorganismos, estos tienen a generar enfermedades con sintomatología prolongada por mayor tiempo, eleva los índices de mortalidad y los costos aumentan. (Instituto de Salud Pública, s.f.). Los remedios caseros se han utilizado para combatir signos y síntomas de enfermedades. Este tipo de conocimiento ha sido transmitido de generación en generación y han logrado sustituir a los fármacos y/o antibióticos en algunos casos. Sin embargo, existen diferentes posturas en las cuales se discute si los remedios caseros son efectivos o no. En un estudio realizado por Felicity Bishop, profesora asociada de Psicología de la Salud en la Universidad de Southampton, demostró que los remedios tienen el efecto placebo, es decir, aunque carezcan de acción curativa, producen un efecto terapéutico si el paciente los usa convencido de que es un medicamento eficaz (Brown, 2018). En internet, existe un gran número de páginas web de carácter no científico recomiendan plantas y forma de preparación distinta. Un ejemplo de estas es la página de Psicología y mente. Un punto a favor es a pesar de que tiene referencias bibliográficas, el autor no es especialista en el tema. Por ello, este trabajo se centra en probar la efectividad de los remedios propuestos por la web. Las plantas propuestas son: Mentha piperita (menta), Zingiber officinale (jengibre), Mentha spicata (hierbabuena), Thymus vulgaris (tomillo), Allium sativum (ajo) y Chamaemelum nobile (manzanilla). Estas plantas fueron escogidas debido a que estas tienen propiedades que ayudan a contrarrestar síntomas y signos que ocasionan las bacterias que se mencionan a continuación. Para probar la sensibilidad o el grado de resistencia de Escherichia coli 25922 y Pseudomonas aeruginosa 77853 en este trabajo fue necesario usar la técnica in vitro de antibiograma. En la medida de lo posible, estas intentarán reproducir condiciones fisiológicas del humano así como también favorecer el crecimiento bacteriano. Este tipo de técnica se utiliza en cuatro situaciones particulares. La primera es cuando difícilmente se puede prever la sensibilidad de un microorganismo ante un agente antimicrobiano. La segunda es necesaria para aquellos microorganismos con gran capacidad mutagénica, ya que estos se necesitan mantener en constante observación para posteriormente informar la comunidad médica sobre aquellas enfermedades que hayan desarrollado una resistencia. La siguiente situación está vinculada con enfermedades que pueden poner en riesgo la vida del paciente y se necesite un tratamiento específico, un ejemplo es la meningitis. La último situación es para aquellas enfermedades que muestren resistencia a los antibióticos que normalmente se usa para su tratamiento (Negroni, 2009). El concepto básico de antibiograma es la difusión de las partículas del agente microbiano, generando así una zona radial de inhibición de crecimiento bacteriano. En este se coloca sensidiscos, también llamados discos de difusión, en un medio inoculado con microorganismos. El tamaño del halo de inhibición dependerá más de la tasa de difusión que de la sensibilidad del antibiótico (Sumbali & Mehrotra, 2009 ). Para explicarlo de forma gráfica, se debe suponer que el antibiótico aplicado en el disco es un punto negro sólido, el cual, se irá degradando de color de forma radial conforme al moviendo a lo largo del medio como se representa en la figura 1. Figura 1. Representación de la difusión del antibiótico a lo largo del tiempo en un agar. Ahora bien, la resistencia del microorganismo es un mecanismo de adaptación (Sprenger, 2015). Por lo tanto, las cepas más adaptadas/resistentes podrán crecer más cerca de donde originalmente se colocó el antibiótico. En la figura 2, se puede apreciar de forma más detallada la explicación anterior. Figura 2. Representación del crecimiento bacteriano según su resistencia. Para los datos que se generarán en este proyecto usaremos conceptos de probabilidad y estadística para describirlos y analizarlos. Para la descripción se usarán datos como la media y la desviación estándar, con el fin de saber el comportamiento de los antibióticos con las bacterias utilizadas. El coeficiente de correlación es una medida de regresión que pretende cuantificar el grado de variación conjunta entre dos variables, si se representan en un diagrama de dispersión los valores que toman dos variables, el coeficiente de correlación señala lo bien o mal que el conjunto de puntos representados se aproxima a una recta. También se calculará la probabilidad de que al tomar un antibiótico al azar, este tenga un efecto positivo para erradicar el crecimiento bacteriano. Materiales y métodos Como primer paso fue necesario elaborar extracciones líquido-líquido de los remedios escogidos. Posteriormente se tomaron y cortaron dientes de ajo. Luego se cortaron las flores de la manzanilla, mientras que el jengibre se cortó en rodajas. Se tomaron únicamente las hojas del tomillo, hierbabuena y menta. Después se colocaron en agua previamente calentada con una temperatura entre 90-100ºC durante 15 minutos para obtener los extractos. Para el proceso de esterilización se utilizó una membrana de 0.22 ul. Por otro lado, también se prepararon soluciones de estreptomicina, kanamicina, gentamicina y ampicilina con concentraciones de 100 ug/mL, 50 ug/mL, 80 ug/mL y 100 ug/mL respectivamente. El siguiente paso fue elaborar medio agar nutritivo con una concentración de 23 g/L. Se dejó esterilizando 15 minutos a 121ºC y 15 psia. Se vertió el medio en placas petri en zona de esterilidad y se dejó enfriar por unos cuantos minutos. Posteriormente, se tomaron 200 ul de dos soluciones con caldo nutritivo; una sembrada con E. coli y la otra con P. aeruginosa. Después se colocó el volumen pipeteado en placas petri y rápidamente fueron sembradas mediante el método de siembra masiva. En total, se cultivaron cuatro placas con inóculo de E. coli y el mismo número de placas con P. aeruginosa. Segundos después se colocaron discos de difusión estériles. En ellos se les añadió 15 ul del agente antimicrobiano. Para finalizar, se dejaron incubando las placas a 37ºC durante 24 horas. Al finalizar el periodo de incubación, se midió el diámetro del halo de inhibición. Figura 3. Extractos preparados Figura 4. Colocación de discos Figura 5. Medición de halos de inhibición Resultados y discusión Resultados de los extractos naturales Figura 6. Medición por triplicado de 6 extractos naturales en E. coli. Figura 7. Medición por triplicado de 6 extractos naturales en P. aeruginosa. Con los resultados obtenidos, se puede observar que las dos bacterias utilizadas en el experimento son resistentes a los extractos naturales, ya que no se formó un halo de inhibición en los tres ensayos. Ahora bien, los extractos se realizaron como una persona normalmente lo haría en su hogar. Sin embargo, en la literatura se encontró que en todos las extracciones se realizaron con etanol o metanol cercano al 100% y no con agua (Azuero, 2016; Castillo, 2017; ,Guevara 2012). Esto se debe que el etanol y el metanol son compuestos no polares, en consecuencia puede arrastrar compuestos no polares e incluso los compuestos polares que se encuentran dentro de las plantas (Azuero, 2016). En cambio, el agua únicamente arrastra compuestos altamente polares (Pasto & Johnson, 2003). Por lo tanto, se puede concluir que los compuestos con efecto antimicrobiano son no polares y únicamente serán arrastrados por de la misma especie. Resultados de los antibióticos Figura 8. Medición por cuadruplicado de 4 antibióticos en E. coli. Figura 9. Medición por cuadruplicado de 4 antibióticos en P. aeruginosa. Gráfica 1. Promedio del diámetro del halo de inhibición en E. coli. Antibióticos Estreptomicina Desviación 2.88 Gentamicina Kanamicina Ampicilina 1.65 2.03 1.86 Tabla 1. Desviación estándar del halo de inhibición en E. coli. Gráfica 2. Promedio del diámetro del halo de inhibición en P. aeruginosa. Antibióticos Estreptomicina Desviación 1.04 Gentamicina Kanamicina Ampicilina 1.10 2.18 1.16 Tabla 2. Desviación estándar del halo de inhibición en P. aeruginosa. Escherichia coli Antibiótico Resistente (mm) Intermedio (mm) Sensible (mm) Estreptomicina <=11 12-14 >=15 Gentamicina <=12 13-14 >=15 Kanamicina <=13 14-17 >=18 Ampicilina <=13 14-16 >=17 Tabla 3. Susceptibilidad antibiótica de E. coli (Cockerill et al., 2013). Escherichia coli Antibiótico Resistente (mm) Intermedio (mm) Sensible (mm) Estreptomicina 24.82 Gentamicina 13.885 Kanamicina 25.465 Ampicilina 23.3 Tabla 4. Susceptibilidad antibiótica de las mediciones promediadas del halo de inhibición para 4 antibióticos en E. coli. Pseudomonas aeruginosa Antibiótico Resistente (mm) Intermedio (mm) Sensible (mm) Estreptomicina 14 15-20 >21 Gentamicina 12 13-14 >15 Kanamicina 13>= 14-16 =>17 Ampicilina <13 14-17 >17 Tabla 5. Susceptibilidad antibiótica de P. aeruginosa ( Reynolds, 2019). Pseudomonas aeruginosa Antibiótico Resistente (mm) Intermedio (mm) Estreptomicina Gentamicina 28.035 9.31 Kanamicina Ampicilina Sensible (mm) 16 9.505 Tabla 6. Susceptibilidad antibiótica de las mediciones promediadas del halo de inhibición para 4 antibióticos en P. aeruginosa. De acuerdo a los resultados obtenidos en los cuatro antibióticos utilizados, se puede observar que a diferencia de los extractos naturales, si existe susceptibilidad a los medicamentos por parte de las bacterias. En un antibiograma, existen parámetros que determinan si una bacteria susceptible a los antibióticos. Los valores en las tablas 3 y 5, se muestran los parámetros, es decir, los rangos de diámetro de los halos de inhibición para determinar si la bacteria es resistente o sensible, obtenidos de diferentes estudios. Por otro lado, las tablas 4 y 6 indican los valores promediados de las mediciones. Ahora bien, en el artículo de Cantón et al., se puede encontrar que realizó ensayos con diferentes concentraciones y determinó el diámetro del halo de inhibición de cepas de E. coli sensibles, intermedias y resistentes. Al calcular la correlación ambas variables se concluyó que la relación entre ellas es inexistentes, es decir, el diámetro no es dependiente de la concentración o viceversa. Coeficiente de correlación El siguiente apartado se muestran los gráficos y el resultado del coeficiente de correlación para las concentraciones y el tamaño del halo de inhibición para considera a E. coli como resistente, intermedio o sensible al antibiótico. En el primer gráfico se observan los valores de la cantidad de antibiótico en los discos en µg, en los siguientes 3 se ven los valores del diámetro para considerarse sensible, intermedio y resistente. Y por último el coeficiente de correlación relacionando la concentración con cada uno de los diámetros de resistente, intermedia y sensible. Estos valores de los coeficientes de correlación son cercanos a cero lo que indica que entre la concentración y el diámetro de inhibición es muy poca la relación que tienen. Se concluye que la concentración no es determinante para erradicar la enfermedad sino el antibiótico mismo y sus propiedades; por ejemplo, el espectro de acción o el mecanismo de acción. Gráfica 3. Cantidad de antibiótico en cada disco. Gráfica 4. Diámetro de inhibición de E. coli. Sensible. Gráfica 5. Diámetro de inhibición de E. coli. Intermedio. Gráfica 6. Diámetro de inhibición de E. coli. Resistente. Gráfica 7. Coeficiente de correlación entre concentración y diámetro. Probabilidad de consumir un antibiótico y que este sea efectivo Es posible utilizar una distribución binomial como herramienta para lograr calcular el éxito de probabilidad de la ingesta de un antibiótico al azar y que este muestre una actividad antimicrobiana. De acuerdo con la tabla 4 se obtuvieron tres casos donde la E. coli se mostró sensible y en solo un caso mostró resistencia intermedia. De igual modo, en la tabla 6 mostró una resistencia a dos antibióticos, una resistencia intermedias y un sensibilidad a un antibiótico. Se determinó únicamente como caso de éxito en aquellos escenarios donde la bacteria se mostrará sensible al antimicrobiano. Por otro lado, cualquier otro escenario se consideró como fracaso. Los resultados se muestran a continuación. Ecuación de Distribución Binomial P (y) = (nCy)p y q n−y E. coli Cálculo Resultado P. aeruginosa P (y) = (4C3)0.75 3 0.25 4−3 P (y) = (4C1)0.25 1 0.75 4−1 P (y) = 0.4218 P (y) = 0.4218 Tabla 7. Resultados de cálculo de probabilidad con distribución binomial. Como se muestra en los resultados, la probabilidad de consumir cualquiera de los antibióticos utilizados y que se erradique una de estas bacterias, es la misma. Conclusión El uso masivo de los antibióticos durante los últimos años está ejerciendo presión al cambio a las bacterias, provocando, resistencias a varios antibióticos. Resultando que tratamientos que en un principio eran eficaces ahora resulten inofensivos para el patógeno. Es importante mencionar que la resistencia a los antibióticos e algo inevitable, pero, con el uso indebido y abusivo de estos provoca un aceleramiento a este proceso. Para prevenir y controlar la propagación de resistencias a los antibióticos la población puede tomar antibióticos únicamente cuando los prescriba un profesional, prevenir infecciones teniendo una higiene suficiente. Claro está no es solo trabajo de la población en general, se puede apoyar esta prevención con leyes, profesionales de salud y con el sector agrícola. Por todo lo anterior, en este estudio se exhorta al lector a tomar medicamentos de forma responsable para evitar el daño a la ecología del ambiente que rodea al individuo como señala el Instituto de Salud Pública (s.f.). Referencias Azuero, A., Jaramillo Jaramillo, C., San Martin, D., & D'Armas Regnault, H. (2016). Análisis del efecto antimicrobiano de doce plantas medicinales de uso ancestral en Ecuador / Analysis of antimicrobial effect of twelve medicinal plants of ancient use in Ecuador. Ciencia Unemi, 9(20), 11-18. Bernal, M., & Guzmán, M. (1984). El antibiograma de discos. Normalización de la técnica de Kirby-Bauer. Biomédica, 4(3-4), 112-121. Brown, J. (2018). ¿Funcionan contra el resfriado los remedios caseros como la sopa de pollo o el jugo de naranja? Esto es lo que dice la ciencia. BBC. 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