第二组使用GenieⅡ鉴定香蕉穿孔线虫(Radopholus similis) - q

advertisement
Final meeting , Ljubljana (SI) 2013-02-18
Developing quarantine pest detection methods for
use by national plant protection organizations
(NPPO) and inspection services.(Q-Detect)
Chinese Academy of Inspection
and Quarantine
CAIQ as a partner in
Q-Detect Consortium
Work package involved for CAIQ
CAIQ in Q-Detect Consortium
Beneficiary for CAIQ
Roles of CAIQ in Q-Detect
What we have done for
Q-Detect
1、Provision of samples
The CLCuV material provided for PRI
The young leaves of Hibiscus rosa-sinensis about
1.3~1.5g per tube with the obvious symptoms of CuCLV
were selected and freeze-dried by lyophilizer.
A Modified CTAB Method to Extract Total DNA from plant
leaves was used in the experiment.
PCR of the CLCuV
According to the EST segment of CLCuV searching from the NCBI, the
primers were designed ,we can obtain about 1000bp amplicons,shown in
the picture.
M 1 2 3 4
1kbp
Figure. the amplified products in lane 1、2、3、4
Forward primer sequence:ATTATGTCGAAGCGAGCTGC
Reverse primer sequence: AGCTCTGGGAGTGCACAAGT
2、Validation and testing of confirmatory methods
Preliminary Research on the Development of LAMP for the
Detection of CLCuV
Three sets of the primers were designed and the first set of primer
has two Loop B primers.
CLCuV1 FIP
CLCuV1 BIP
CLCuV1 F3
CLCuV1 B3
CLCuV1 Loop B1
CLCuV1 Loop B2
AGGTTTGTCAACAGGTCGTCGGGAATCACACGAATTCGGT
ACGAACCCAGTACAGCAACTTAACGGTTGCATGCCATT
TGGATGGATGAAAATATAAAGACC
ACTCGCATATTGACCACC
AGTCATAGGGACCGTTATCAGG
GGGACCGTTATCAGGTGTTGAGG
CLCuV2 FIP
CLCuV2 BIP
CLCuV2 F3
CLCuV2 B3
CCACGAGTAACATCAGAAATACACAGCCCATGTAAGGTACAGT
GTCGGTTTGACCCATCGTATTGTCATCCATCCATATCTTACCTAA
GCTCCAAAGGGTTGTGAAG
ATTCGTGTGATTCCTGGT
CLCuV3 FIP
CLCuV3 BIP
CLCuV3 F3
CLCuV3 B3
CCACGAGTAACATCAGAAATACACAGGTACAGTCTTTTGAGTCCA
GACCCATCGTATTGGTAAACGTTTGGTCTTTATATTTTCATCCATCC
CAAAGGGTTGTGAAGGCC
ACCGAATTCGTGTGATTCC
Turbidity
To screen the most appropriate primers
0.9
0.8
0.7
0.6
0.5
0.4
0.3
0.2
0.1
0
-0.1 1
NC
PC
P1
P2
P3
LB1
LB2
6 11 16 21 26 31 36 41 46 51 56 61 66 71 76 81 86 91
Time(min)
M
LB2
NC
PC
P1
P2
P3
LB1
To Select the suitable temperature with the appropriate primer
Temperature of LAMP reaction
0.8
0.7
59
60
61
62
63
64
65
66
Turbidimeter
0.6
0.5
0.4
0.3
0.2
0.1
0
-0.1 1 4 7 10 13 16 19 22 25 28 31 34 37 40 43 46 49 52 55 58 61 64 67 70 73 76
Time(min)
62-64℃ is most suitable reaction
temperature range.
Finally,we chose 63 ℃ as the reaction
temperature。
M
66
59
60
61
62
63
64
65
3、Training Course, Tibet Building, Beijing, 16-18,1, 2013
The training course for the detection and identification of species on-site
Trainees in the
Course
序号
姓 名
性别
1
楼军文
女
2
万本屹
男
3
张
立
男
4
薛达元
男
5
罗述金
女
6
吕学农
男
7
王欣月
女
8
夏云成
男
9
渠开山
男
10
郑春生
男
11
廖
男
芳
12
刘曼玉
女
13
褚
栋
男
14
王建昌
男
“物种资源现场查验鉴定技术应用培训班”通讯录
序号
1
2
3
4
5
6
姓 名
楼军文
万本屹
张 立
薛达元
罗述金
吕学农
性别
女
男
男
男
女
男
单位
国家质检总局动植司
国家质检总局动植司
中国检科院
中央民族大学
北京大学
新疆检验检疫局
职务/职称
处长
副处长
副院长
教授
教授
7
王欣月
女
北京检验检疫局动植处
科长
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
夏云成
渠开山
郑春生
廖 芳
刘曼玉
褚 栋
王建昌
蒋 丹
刘淑艳
王 耀
刘金华
徐 颖
王 珏
贾 琴
薛华杰
林颖峥
伏建国
许萍萍
刘晓宇
武 扬
男
男
男
男
女
男
男
女
女
男
男
女
女
女
男
女
男
女
女
男
首都机场检验检疫局旅检处
首都机场检验检疫局旅检处
北京检验检疫局技术中心
天津局
天津局
河北局植检处
河北出入境检验检疫局技术中心
辽宁出入境检验检疫局技术中心
辽宁出入境检验检疫局技术中心
辽宁出入境检验检疫局
吉林出入境检验检疫局
上海铁路检验检疫局
外高检验检疫局
机场检验检疫局
上海局动植物与食品检验检疫中心
上海局动植物与食品检验检疫中心
江苏局
南京出入境检验检疫局
南京出入境检验检疫局
浙江局动植处
副处长
科长
农艺师
高级农艺师
科员
副科长
28
王栋梁
男
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
张明哲
张吉红
王 旭
宫文妮
李 振
周卫川
许新军
杨 斌
李 林
尹伟力
盛存波
韩 英
宋 南
李 萌
柏建山
赵菊鹏
王新国
男
女
男
女
男
男
男
男
男
男
男
男
男
男
男
女
男
46
谭章龙
47
王照金
48
蒋
49
联系方式
62752307
18999916990
58619025
邮箱
xuedayuan@hotmail.com
Luo.Shujin@pku.edu.cn
lvxuenong@126.com
Wangxy@bjciq.gov.cn
副科长
副科长
科长
58648124
58648029
58648822
13752253690
13821082527
18632166836
18632166991
18604099925
13700080757
15998520339
18686427214
13482525736
13671743218
15921364759
13916174869
18817449520
13776649379
13512510382
13951876372
15868189568
Xiaych@bjciq.gov.cn
Quksh@bjciq.gov.cn
Zhengchsh@bjciq.gov.cn
liaof@tjciq.gov.cn
liumy@tjciq.gov.cn
chudong321321@163.com
jianchangwang1225@126.com
jiangdan66@163.com
liushuyan05@163.com
15998520339@126.com
liujinhua02@163.com
Idxuying@gmail.com
andy-wjue@163.com
jiaq@shciq.gov.cn
xuehj@shciq.gov.cn
1072166009@qq.com
fujg@jsciq.gov.cn
xupp@jsciq.gov.cn
liuxy@jsciq.gov.cn
wuy@ziq.gov.cn
浙江局杭州机场办
主任科员
13625811589
wangdl@ziq.gov.cn
浙江局技术中心
宁波检验检疫局
秦皇岛检验检疫局
无锡出入境检验检疫局
芜湖出入境检验检疫局
福建出入境检验检疫局技术中心
青岛局
青岛机场检疫局
烟台局
烟台局
龙口检验检疫局
河南检验检疫局植检处
河南检验检疫局技术中心
洛阳检验检疫局
广州机场出入境检验检疫局
广东检验检疫技术中心植检室
黄埔出入境检验检疫局
高级工程师
高级兽医师
副主任科员
科员
科员
研究员
副科长
副主任科员
副科长
博士/农艺师
博士/农艺师
工程师
高级农艺师
高级农艺师
zhangmz@ziq.gov.cn
zhjhw@yahoo.com.cn
wangxuciq@163.com
Gongwn@jsciq.gov.cn
lizhenowen@sina.com
wczhou@163.com
ponymani@163.com
yangbinqingdao@sina.com
lin_li@189.cn
vi123vi@163.com
shengcunbo@163.com
Ying965335@163.com
songnan1980@163.com
limengjeff@126.com
bjslinyi@sina.com
zhaojp@iqtc.cn
wangxinguo99@163.com
男
汕尾出入境检验检疫局
兽医师
13656655958
13056772005
15303358077
15052429536
18055336592
13959137811
13012470321
13793215625
18905356633
15966463378
18953526559
13803996112
13733188976
15978629195
13798197690
13660536301
13560480886
13927978822
男
广东云浮出入境检验检疫局
科员
寒
女
麦向真
女
南海检验检疫局
珠海检验检疫局(拱北办)
高工
工程师
主任科员
高级工程师
科员
副主任科员
主任科员
农艺师
兽医师
18023368030
tanzl@sw.gdciq.gov.cn
wangzj@yf.gdciq.gov.cn
13078181102
jiangh@nh.gdciq.gov.cn
主任科员(农艺师)
13823098331
cnmxz@21cn.com
科员
13075608993
niweihunan@163.com
珠海出入境检验检疫局技术中心
海口机场出入境检验检疫局
海口机场出入境检验检疫局
重庆江北机场出入境检验检疫局
四川检验检疫局植检处
四川检验检疫局技术中心
四川检验检疫局陆运办
四川检验检疫局机场办
云南出入境检验检疫局技术中心
检验员
副科
科员
科员
18688151812
13876987291
15008976018
13983715060
15388153253
15982007446
15882326467
18224045624
qyb19860224@163.com
173683674@qq.com
elvalove2007@163.com
ronda.baoyun.54@163.com
chuanjinwu@163.com
sbl0218@qq.com
ilmj1314@qq.com
zhangli1985424@126.com
农艺师
13700631406
yueliangliang@126.com
新疆局植检处
新疆局技术中心
新疆阿拉山口出入境检验检疫局
喀什出入境检验检疫局
伊犁出入境检验检疫局综合技术服务中心
伊犁出入境检验检疫局都拉塔办事处
科员
初级农艺师
科员
中级
农艺师
科员
13659933046
13899927245
18997769691
18999090550
18999397048
18099511260
18999391602
Wendyyu816@163.com
110983128@qq.com
42606440@qq.com
1120277255@qq.com
Qianyike123@126.com
zkk8-511@163.com
副科长(农艺师)
13771859550
wxy8032@163.com
副科长
助理农艺师
科长
副科长
农艺师
研究员
研究员
13424307071
13418560528
13973197571
13877061883
13978751780
13701285600
13366307040
15201209401
15210508956
18505110080
13810925425
shisi-bihua@qq.com
pg0101@126.com
zhanglei@hnciq.gov.cn
zhoug@gxciq.gov.cn
405992479@qq.com
limf9@sina.com
chk@163.com
sydef1016@yahoo.com.cn
zhaozhu-100@163.com
15057520@qq.com
xujin1199@sina.com
xiongyufen@126.com
珠海检验检疫局(横琴局)
50
倪
伟
男
51
52
53
54
55
56
57
58
权永兵
吕 微
张 特
包 贇
吴传金
邵宝林
鲁 昕
张 笠
男
女
女
女
男
男
女
男
59
岳亮亮
男
60
61
62
63
64
65
王小玉
李亚伟
邵振宗
尹梦亭
乾义柯
邹克坤
女
男
男
女
男
男
66
郭志君
男
67
万晓泳
男
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
朱锦锋
潘 广
张 磊
周 纲
白华菊
李明福
陈 克
宋 云
赵 竹
张 健
许 瑾
男
男
男
男
女
男
男
女
女
男
女
深圳局(罗湖)
深圳局动植中心
湖南局植检处
东兴检验检疫局
凭祥检验检疫局
中国检科院
中国检科院
中国检科院
中国检科院
中国检科院
中国检科院
79
熊玉芬
男
中国检科院
15210211104
80
王仁睿
女
中国检科院
15201085210
霍尔果斯局
苏州出入境检验检疫局邮件办
农艺师
农艺师
主任科员
gzjdit@126.com
woshiarui1129@yahoo.com.cn
第一组 使用GenieⅡ鉴定南美斑潜蝇(Liriomyza huidobrensis)
试验指导:宋 云
A组: 伏建国(组长)、薛华杰、张吉红、邹克坤、郭志军、邵振宗、王栋梁、
许萍萍、张笠、刘晓宇
B 组:张明哲(组长)、鲁昕、吕学农、王欣月、褚栋、王建昌、蒋丹、刘
淑艳、王耀、李亚伟、谭章龙
第二组 使用GenieⅡ鉴定香蕉穿孔线虫(Radopholus similis)
指导老师:丁小兰:
A组: 岳亮亮(组长)、邵宝林、刘曼玉、廖芳、许新军、杨斌、宫文妮、李
振、吕微、张特
B 组:周卫川(组长)、渠开山、王小玉、林颖峥、徐颖、麦向真、倪伟、
权永兵、王旭、谭波
第三组 使用浊度仪鉴定香蕉穿孔线虫(Radopholus similis)
指导老师:熊玉芬:
A组: 李林(组长)、尹伟力、郑春生、乾义柯、夏云成、刘金华、盛存波、
柏建山、王新国、包贇
B 组:武扬(组长)、吴传金、侯保宁、尹梦亭、王珏、贾琴、韩英、宋南、
李萌、蒋寒、王照金
What we do next step
Extension and application of the new
techniques from Q-detect
Promote new project cooperation
Welcome to Beijing for ICPP2013 !
Download