现代化学文献检索
数字化图书馆及化学信息数据
库的利用
主讲人: 秦聿昌
2011.9.27
现代化学文献检索
1. 信息与信息资源
2. 信息检索
3. 信息服务
4. 化学文献检索的基础知识
5 . 数字图书馆的利用
1. 信息与信息资源
1. 1 信息
1.1.1 信息的概念
有上百种，尚未形成公认的定义。
哲学角度: 信息是事物存在的方式和运动状态的表现形式。
1.1.2信息的特性
普遍性和客观性；主观性；依附性；可传递性；独立性；时效性；
共享性。
1. 信息与信息资源
1. 1 信息
1.1.3信息的功能
资源功能；
组织管理功能；
中介功能；
消除不确定性功能；
传播功能。
1. 信息与信息资源
1. 1 信息
1.1.4信息的分类
按对象划分；
自然信息、生物信息、机器信息和社会信息。
按性质划分；
语法信息、语义信息和语用信息。
按利用者的角度和过程划分；
实在信息、先验信息和实得信息。
按内容划分；
经济信息、科技信息、政治信息、文化信息、等等…
按作用划分；
有用信息、无用信息和干扰信息。
按流通渠道划分；
正式信息和非正式信息
按记录方式划分。 语音信息、图像信息、文字信息、数字信息、等等…
1. 信息与信息资源
1. 2 信息资源
1.2.1 信息资源的概念
尚未就定义达成一致。
狭义的理解: 信息资源是人类社会经济活动中经过加工处理有序
化并大量积累起来的有用信息的集合。
广义的理解: 信息资源是人类社会信息活动中积累起来的信息、
信息生产者、信息技术等信息活动要素的集合。
1. 信息与信息资源
1. 2 信息资源
1.2.2 科技信息资源
内容范围：科学数据、科技文献、科技成果、等等…
表现形式：印刷版和电子版
特点：增长迅猛、种类繁多、交叉重复、失效加快
1. 信息与信息资源
1. 3 信息资源的类型
1.3.1 按表达方式划分
潜在信息资源和现实信息资源。
潜在信息资源：是指个人在认知和创造过程中储存在大脑中的信息资
源，只能被拥有者利用，不具广泛传播和长久保存的能力，不能被
他人利用，且易于消失，是一种有限再生的信息资源。
现实信息资源：是指将潜在信息资源表达出来后形成的，能够被为他
人利用，具有社会性，通过特定的符号表述和传递，可在特定的社
会条件下广泛地连续往复地被利用，是一种无限再生的信息资源。
1. 信息与信息资源
1. 3 信息资源的类型
1.3.2 按加工深度划分
一次信息资源、二次信息资源和三次信息资源。
一次文献：原始创作。
如：期刊论文、专利说明书、会议论文、手稿、
实验记录、技术档案、信件、等等…
二次文献：对一次文献进行组织、加工、整理、序化后的产物。
如：目录、索引、文摘、指南、等等…
三次文献：对一次文献内容进行分析、研究、加工形成的信息资源。
通常为情报研究的成果。如：综述、述评、情报
研究报告、词典、手册、年鉴、百科全书、等等…
1. 信息与信息资源
1. 3 信息资源的类型
1.3.3 按载体形式划分
印本信息资源；
缩微信息资源；
机读信息资源；
光盘信息资源；
声像信息资源。
1. 信息与信息资源
1. 3 信息资源的类型
1.3.4 按传递范围划分
公开信息资源；
半公开信息资源；
非公开信息资源。
1. 信息与信息资源
1. 3 信息资源的类型
1.3.5 按文献类型划分
图书；
专著、丛书、工具书。
连续出版物；
期刊、报纸、年度出版物。
特种文献；
会议文献、科技报告、学位论文、专利文献、
技术标准、产品目录、政府出版物、技术档
案。
1. 信息与信息资源
1. 4 网络信息资源
1.4.1 网络信息资源的特点
1。数量巨大、增长迅速
2。多样性
3。动态性高、稳定性差
4。时滞短、新颖性强
5。质量参次不齐
6。开放性
7。无序性、非线性
8。共享程度高
9。使用成本低
10。异构性
11。用户类型广
12。互动性强
1. 信息与信息资源
1. 4 网络信息资源
1.4.2 网络信息资源的类型
1。数据库
2。开放获取的信息资源
（Open Access）
a. 开放获取期刊；
如：DOAJ （http://www.doaj.org/）
b.开放获取数据库；
c. 个人网站、网页、等等…
3。博客
4。支持RSS方式获取的资源
阅读器、订阅
5。论坛
BBS，发贴
6。讨论组
聊天室，实时
1. 信息与信息资源
1. 4 网络信息资源
1.4.3 常用的网络信息资源获取途径
1。WWW 方式
2。FTP 方式
3。Telnet 方式
4。BT 方式
6。新闻组
2. 信息检索
2. 1 检索工具
检索工具是用来存储、报道和检索文献线索的工具，具有存储
和检索两个基本功能。
2.1.1 基本原理
应具备的5个条件：
1。有明确的收录范围；
2。有完整明了的文献特征标识，对收录文献的内外部特征有详细的描述；
3。每条款目必须包含多个有检索意义的文献特征标识，并标明供检索用的
标识；
4。全部款目科学的、系统的按照一定的规则组织成一个有机整体；
5。有索引部分，并提供多种必要的检索途径。
2. 信息检索
2. 1 检索工具
2.1.2 印刷型检索工具
1。目录式检索工具
目录又称书目，是著录一批相关文献并按一定的次序编排而成的一种揭
示与报道文献的工具，它是历史上出现最早的一种检索工具。
2。索引式检索工具
索引是将文献中所涉及的篇名、词语、主题等项目，根据一定的需要，
按照一定的原则和方法排列起来，供读者使用的一种检索工具，在内容
描述和揭示上比目录更为深入。
3。文摘式检索工具
文摘是通过描述文献的外部特征和简明扼要地摘录文献内容要点来报道
文献的一种检索工具，是二次文献的核心。揭示程度最深，一定程度上
可替代原始文献，可供快速阅读。
2. 信息检索
2. 1 检索工具
2.1.3 计算机检索系统
1954年
50年代
60年代
70年代
80年代
90年代后
计算机检索诞生
单元词组配检索
脱机批处理检索及联机检索试验
联机检索
Dialog, STN
联机普及、光盘检索、计算机网络检索
联机检索系统、光盘检索系统和网络检索
系统广泛应用
2. 信息检索
2. 1 检索工具
2.1.4 网络信息检索工具
1。搜索引擎
google， 百度，yahoo
2。主题指南 （Topic Guide）
按分类原则，逐级浏览
3。学科信息门户
CSDL学科信息门户，NSTL热点门户
2. 信息检索
2. 2 检索语言与方法
2.2.1 检索语言
1。定义和作用
一种人工语言，专用于信息检索，实现人机会话功能。
2。类型
文献信息的内容特征
学科类别特征和主题特征
文献信息的外部特征
书名、刊名、题名、著者、单位…
依据某一种检索语言编制索引
分类索引、主题索引、关键词索引、著者索引、
专用索引、引文索引…
2. 信息检索
2. 2 检索语言与方法
2.2.2 检索方法
1。直接检索法
有明确的检索提问
2。多次检索法
针对不太确定的线索或较宏观的概念
3。回溯检索法
了解项目或学科的全过程
4。跟踪检索法
了解项目或学科的最新进展
5。综合检索法
2. 信息检索
2. 3 检索策略与步骤
2.3.1 检索策略
检索前的思考：
1。明确待查目的，要查什么，做什么用；
2。是否以掌握一定的线索；
3。时间范围的考虑；
4。地域范围的考虑；
5。查哪类文献；
6。用什么工具、资源最有效；
7。手工检索还是计算机检索；
8。用什么检索途径（功能）检索；
9。用什么方法进行检索；
10。检索设想是否与有关专家商讨过。
2. 信息检索
2. 3 检索策略与步骤
2.3.1 检索策略
检索策略是指导检索者实施检索过程的整体方案，检索的每一个
环节中都蕴涵着对检索策略的贯彻和执行。
1。检索策略的制定原则
a. 明确信息需求
普查型、攻关型和探索型
制定策略的前提
普查型、攻关型和探索型
b. 明确已有条件
制定策略的参照
要对拥有的信息资源有清醒的认识
2. 信息检索
2. 3 检索策略与步骤
2.3.1 检索策略
2。常用的几种检索策略
a. 最专指面优先策略
专指度较高
b. 最低登录量面优先策略
登录量，是指一个索引词在标引中的使用次数。
c. 积木型策略
分解成若干主题概念
d. 引文珠形增长策略
以一个较核心或较专指的主题概念开始检索，分析获得的
检索结果，从中选择更多相关的检索词补充到检索式中再
检索，循环至满意。
2. 信息检索
2. 3 检索策略与步骤
2.3.1 检索策略
2。常用的几种检索策略
e. 逐次分馏策略
检索时首先建立较大的初始资源集，如利用一个较宽泛的检
索词，然后利用各种缩检策略逐步缩小检索结果的命中范围，直
至获得满足用户需要的检索结果为止。
注意：不要彼此孤立，要互相结合。
2. 信息检索
2. 3 检索策略与步骤
2.3.1 检索策略
3。检索策略的修正方法
目的：改善检索结果，提高用户满足率。
扩检和缩检
2. 信息检索
2. 3 检索策略与步骤
2.3.1 检索策略
3。检索策略的修正方法
扩检：
降低检索词专指度；调节检索词的网罗度；族性检索；截词
检索；增加检索途径；取消过严的限制符；调整位置算符；换用
更大检索系统。
缩检：
提高检索词专指度；用逻辑“与”；用逻辑“非”；限制检
索字段；调整位置算符；利用文献外表特征；加权检索。
2. 信息检索
2. 3 检索策略与步骤
2.3.2 检索步骤
1。分析检索课题，明确检索需求；
2。选择检索工具或检索系统；
3。确定检索途径与检索方法；
4。选择合适的检索词；
5。构造检索式；
6。实施检索；
7。评价检索结果，调整检索策略，改善检索结果。
2. 信息检索
2. 4 计算机信息检索
2.4.1 计算机信息检索原理
计算机信息检索是用计算机代替人工检索的匹配过程。
2. 信息检索
2. 4 计算机信息检索
2.4.2 计算机信息检索发展概况
脱机检索阶段（1954-1964） 批处理检索
联机检索阶段（1965-1972）
国际联机检索阶段（1972- ）
光盘检索阶段（1985- ）
网络化检索阶段（90年代初- ）
2. 信息检索
2. 4 计算机信息检索
2.4.3 计算机信息检索技术
KWIC, 化学结构式检索
2.5 知名检索平台
Dialog, STN, CrossFire, SciFinder
3. 信息服务
信息服务是用户查找、获取和利用信息资源的主要途径，也是连
接拥户与信息资源的主要手段和方式。
3. 1 数字图书馆
3.1.1 数字图书馆的定义
数字图书馆，又称电子图书馆、虚拟图书馆、网上图书馆、没有
围墙的图书馆、未来的图书馆等等。
不同国家、不同个人、不同角度认识有不同的含义。
共同点：来自于传统图书馆，支持普遍存取、分布管理、集成化
信息服务的信息系统，融合了传统图书馆、档案馆、博物馆的某
些功能，是一种新型的图书馆形态。
3. 信息服务
3. 1 数字图书馆
3.1.2 数字图书馆的特征
1。信息资源的数字化；
2。信息资源高度共享；
3。服务内容丰富新颖；
4。服务手段方便快捷。
超越：服务对象、馆藏的性质、存在方式、利用方式。
3. 信息服务
3. 1 数字图书馆
3.1.3 国外数字图书馆的发展现状
3.1.4 我国数字图书馆的发展现状
3. 信息服务
3. 2 文献传递服务
3.2.1 馆际互借与文献传递
1。馆际互借
2。文献传递 （DDS）
中科院系统的文献传递 服务系统
http://union.csdl.ac.cn/
3. 信息服务
3. 2 文献传递服务
3.2.2 文献传递的作用
1。解决了非本地电子资源或传统的印本文献资源的利用问题；
2。加快了文献信息的资源共享；
3。使文献资源得到充分利用；
4。给文献资源缺乏的中小型图书馆带来生机；
5。缓解了经费紧张，书价上涨的矛盾；
6。缓解了出版物激增与馆藏减少的矛盾。
3. 信息服务
3. 2 文献传递服务
3.2.3 文献传递的模式
1。集中式；
NSTL
2。分布式；
CSDL，CALIS
3. 信息服务
3. 3 信息检索服务
3.3.1 定题检索
又称SDI服务
3.3.2 科技查新服务
我国科技信息服务的一个特色。
3.3.3 科技论文评价服务
引用、收录检索。
SIC, EI, ISTP…
3.3.4 情报研究服务
委托或自选
3. 信息服务
3. 4 数字参考咨询
由图书馆参考咨询演变而来。
中科院国家科学图书馆参考咨询系统 http:/dref.csdl.ac.cn/
3. 5 学科信息门户
是一种专业性网站，为研究人员、教师和研究生提供高质量的、
经过筛选和定期更新的学科信息目录和入口。
中科院国家科学图书馆学科信息门户
化学学科信息门户
ChIN
http://chemport.ipe.ac.cn/
3. 信息服务
3. 6 分布移动用户认证服务
是指通过计算机网络安全技术、系统政策等手段对物理上分散的
用户进行可信任的身份识别，进而根据用户身份信息提供有差别
的信息资源授权和服务，是一种分布式的网络信息服务方式。
中科院国家科学图书馆移动检索系统
CSDL “随易通”
https://q.csdl.ac.cn/
用户分：普通用户和授权用户（持E-key）
CSDL “随易通”的特点：统一认证和单点登录；安全的用户
认证手段；灵活的资源授权方式；通过代理访问资源；提供安全
策略保证合理使用资源。
4. 化学文献检索的基础知识
 文献性质
一次文献、二次文献、三次文献、
零次文献
 文献类型
期刊、图书、专利、科技报告、
会议文献、学位论文、技术标准、
产品资料、电子出版物
4. 化学文献检索的基础知识
 文献需求
情报性、调研性、工作性、查证性、
竞争性
 检索工具
检索性刊物、参考工具书、数据库
4. 化学文献检索的基础知识
 科研人员常用的掌握文献信息的方法
1）熟练掌握几种检索工具；
SciFinder、Reaxys、WoS等
2）确定随时浏览的十多种核心期刊；
权威刊
JACS, Angw Chem, Acc Chem Res ...
专业刊
JOC, OL, TL ...
消息刊
C&E News, SynFacts ...
科普刊
Nature, Science ...
3 ）阅读文献时注意参考文献的引证
4. 化学文献检索的基础知识
 化学文献总览
化学核心期刊
化学核心参考工具书
化学专业出版社
 期刊评介术语
影响因子、立即因子、半衰期
 论文评介术语
被引次数、相关文献数、参考文献数
4. 化学文献检索的基础知识
 文献资料获取的要素
出版物名称、编著者和出版者
图书和期刊的区分
包括其他文献类型的识别，如：专利、标准等
目录的选用
缩写表达的认识
eg. ditto, ibid
开放链接 (OpenURL,DOI)
eg. http://pubs.acs.org/OrgLett
10.1021/ol101432m
（http://www.doi.org/）
科研评价数据库
SCI; Ei; ISTP
4. 化学文献检索的基础知识
著名的国际联机检索系统
Dialog
STN
 知名的化学专业数据库
CA，SciFinder，CCD，Merck Index，
Beilstein，Gmelin，Web of Science
(SCI)，RTECS，ChemInfo，WPI
(Derwent)，ACD，Ei，UMI，PQDD-B，…

4. 化学文献检索的基础知识

互联网上信息资源
搜索引擎：Google Scholor
免费资源：Organic Syntheses,
Heterocycles Database
全文电子期刊：
ACS，RSC，ScienceDirect，
Wiley Online Library，SpringerLink，
Thieme，重庆维普，清华同方，…
4. 化学文献检索的基础知识

合理使用数据库资源
知识产权
学术研究、个人需求、非盈利性、许可范围
恶意（过量）下载
a. 某时间段、某领域、某类型文献数据记录
b. 某期或多期中大部份全文
c. 利用下载工具，如Netants等
d. 显著超出正常阅读速度，如短时间内多窗
口同时下载全文等
4. 化学文献检索的基础知识
 查阅化学文献与化学工作者的关系
1）调查研究，立足创新
2）拓宽知识面，改善知识结构
3）启迪创造性思维
4）提高自学和独立工作能力
4. 化学文献检索的基础知识

专利文献的结构和特点
1）专利说明书的组成
标头部分；正文部分；权限部分。
2）专利的分类体系
国际专利分类表（IPC）
3）专利的国别及代码
US, WO, EP, CN, DE, DD, GB, JP…
4）检索工具
德温特（Derwent）专利索引、国家专利局网站
5）专利说明书的获得
一般为免费
5. 数字化图书馆及
化学信息数据库的利用
有机所图书馆书刊目录检索
 图书馆信息资源简介
 中科院文献传递服务系统
 SciFinder
 Beilstein CrossFire
 Combined Chemical Dictionary
 Web of Science
 Pharmaprojects
 ACD、MerckIndex、RTECS

图书馆目录
 书名目录
 作者目录
 分类目录
 主题目录
图书馆目录
 图书目录
 期刊目录
图书馆目录
 新书目录
 电子版期刊目录
 电子版图书目录
图书馆目录
 卡片目录
 书本目录
 机读目录
图书馆目录
 联机公共目录
OPAC (Online Public Access Catalog)
 WebPAC
图书馆实用
 书刊存放位置
书架号
 书刊获取标识
索书号、登录号
 书刊排列顺序
从左到右、从上到下
有机所图书馆书刊目录检索
 硬件: 上网PC (可上Internet或SIOC局域网)
 软件: 网页浏览器 IE 或 Netscape
 网址:
http://lib.sioc.ac.cn/
网上图书馆目录查询







中科院上海文献情报中心
http://www.slas.ac.cn/
中科院文献情报中心
http://www.las.ac.cn/
上海图书馆
http://www.libnet.sh.cn/
北京图书馆
http://nlc.nlc.gov.cn/
清华大学图书馆
http://www.lib.tsinghua.edu.cn/
北京大学图书馆
http://www.lib.pku.edu.cn/
上海交通大学图书馆
http://www.lib.sjtu.edu.cn/
中科院文献传递服务系统
为方便中国科学院和国内外各界用户获
取全文文献，国家科学图书馆总馆（中科
院文献情报中心）文献供应中心依托中科
院内、院外丰富的文献资源和国内外图书
馆高效的协作网络提供远程全文文献的快
速查询、获取和传递服务。
中科院文献传递服务系统
使用步骤:
1. 联系本单位图书馆注册
2. 在您注册的电子邮箱中接收注册审批通知
3. 按注册审批通知提示在本单位图书馆交纳予付款
4. 单位图书馆为您建立予付款帐户并开通服务
5. 用注册帐号登录服务系统提交全文传递请求
6. 用户按自己选择的方式接收传递的文献，其费用服务
系统自动扣除并通知用户。
中科院文献传递服务系统
系统网址:
http://dds.las.ac.cn/Reader/query.jsp
2010学生公用帐号：lib2010
密码：lib2010
申请单填写注意事项:
1. 书刊名称
2. 出版年份
3. 卷期号码
4. 起始页码
* 尽可能提供详尽信息，方便图书馆员找到你所需文献。
图书馆信息资源简介
化学专业信息数据库
 中外专利文献数据库
 ACS, RSC,Elsevier,Wiley网络版电子全文期刊
 清华同方中文期刊题录和全文数据库
 重庆维普中文科技期刊全文数据库
 各类光盘数据库
 有机所论文数据库
 有机所学位论文数据库

有机所数据库使用方式

B/S浏览服务器方式
1。利用网页浏览器
2。利用IE作为客户端检索软件，并安装Citrix Web插件。

C/S客户服务器方式
1。安装Citrix客户端软件
2。安装数据库检索软件

代理服务器方式
1。http代理
2。socket代理

Citrix Program Neighborhood
SciFinder； CrossFire
proxy.sioc.ac.cn 8080
mainarray.sioc.ac.cn 8080
sfs.sioc.ac.cn 1080
PC单机方式
分别安装数据库检索软件和数据 (Databank文件服务器)
有机所数据库（光盘）检索系统
应用平台：LAN 、 Internet 和 终端服务
 使用环境：PC 机、网络
 用户权限：SIOC院区、注册
 URL: http://202.127.145.151/siocldb

有机所图书馆常用数据库
 1. 化学专业数据库
SciFinder
MDL CrossFire Beilstein Database
MDL CrossFire Gmelin Database
ISI / ChemPrep (1990-2001)
MDL Reaction Database
Derwent Journal of Synthetic Methods
(1975-1997)
InfoChem / ChemReact 41 & Synthesis
Tree Search (1975-1990)
有机所图书馆常用数据库
 2. 文摘索引数据库
CAonCD (1977- )
ISI / Web of Science (1991- )
Ei Compendex (1970- )
MEDLINE (1966- )
Cambridge Scientific Abstracts (1962- )
中国专利文献数据库 (1985.04- )
中国化学文献数据库 (1983- )
中国药学文摘库 (1985- )
有机所图书馆常用数据库
 3. 参考工具数据库（辞典、大全、手册等）
The Combined Chemical Dictionary on DVD
The Merck Index on CD-ROM
CRC Handbook of Chemistry and Physics
U.S. Pharmacopeia / National Formulary
NIOSH Registry of Toxic Effects of Chemical Substances
American Drug Index
World Drug Index
The e-Pesticide Manual
Organic-Chemical Drugs and Their Synonyms
Properties of Organic Solvents
Polymers : A Property Database
有机所图书馆常用数据库
 4. 化学产品目录数据库
MDL Available Chemical Directory
MDL Screening Compounds Directory
PJB Pharmaprojects
PJB AGROProjects
Sigma-Aldrich Chemical Directory
有机所图书馆常用数据库
 5. 图书馆馆藏目录
有机所图书馆馆藏书刊目录
全国期刊联合目录
中科院国家科学图书馆馆藏目录
上海生命科学图书馆馆藏目录
上海图书馆馆藏目录
有机所图书馆常用数据库
 6. 电子期刊全文数据库
ACS 美国化学会 (自创刊号)
RSC 英国皇家化学会 (自创刊号)
Wiley Online Library (部分创刊号)
Elsevier's ScienceDirect (1995- )
Springer SpringerLink (1998- )
Thieme (自创刊号)
Nature
Science
重庆维普中文科技期刊全文数据库 (1989- )
清华同方中文期刊全文数据库 (1994- )
有机所图书馆常用数据库

7. MDL 系列专业数据库
CSD (Cambridge Structural Database System)
RTECS (Registry of Toxic Effects of Chemical Substances)
MDL Available Chemical Directory (Suppliers)
MDL Screening Compounds Directory (Suppliers)
MDL Comprehensive Medicinal Chemistry
MDL Metabolite Database
MDL Drug Data Report 3D
MDL Reaction Database
(ORGSYN, CHC, RLSM, CIRX, SPOR)
MDL Toxicity Databse
有机所图书馆常用数据库
 8. ISI 系列数据库
ISI Web of Science (1991- )
ISI BIOSIS Previews
ISI Proceedings
ISI Derwent Innovations Index
ISI MEDLINE
ISI INSPEC
ISI Journal Citation Reports
ISI Essential Science Indicators
ISI Current Contents Connect
重点数据库介绍
 SciFinder 和 SciFinder Scholar
 CrossFire
 ISI Web of Knowledge
 CCD
 Merck Index
 Pharmaprojects
 Science of Synthesis 及 Houben-Weyl 系列
Beilstein CrossFire 数据库
 Beilstein 是高质量有机化学的代名词
 Gmelin是高质量化学数据的代名词
 CrossFire简介
 数据库的检索
CrossFire system
Beilstein & Gmelin
 a complete chemical information system
 Client/Server system
 provides a new way of handling chemical
information
 Substances (Structures and Properties),
Reactions or Citations and provides hyperlinks
between the different forms

The Database Contents
literature data 1779 - 1959, more than 1.1 million
compounds (Beilstein, Basic Series - Suppl. IV )
 literature data 1960 - 1979, ca. 3 million
compounds (Beilstein, Suppl. V )
 literature data >1979, ca. 5 million compounds,
include Pharmacological and Ecological Data,
well abstracted
 The yearly growth: ca. 250.000 structures,
220.000 reactions and 40.000 citations

The Database Statistics（BS0604）
 No. of Compounds: 9,780,073
 No. of Reactions: 10,207,254
 No. of Citations: 2,049,077
 Size of Database: 59,033,490,791 byte
SciFinder vs CrossFire
SciFinder
CAplus/Registry
Since
# of Substances
# of Structures
# of Reactions
References
Patent coverage
Factual data
Update
CrossFire
Beilstein
Gmelin
17711772-1975
8,000,000 1,400,000
8,000,000 1,400,000
5,000,000
n.a.
?
?
no
no
35,000,000
yes
1957
31,000,000
18,000,000
4,000,000
20,000,000
yes
Avail. via
CAplus
daily
Quarterly?
closed
SciFinder vs CrossFire
Registry file of SciFinder is the biggest
compilation of organic, inorganic and
organometallic compounds in the world
 Registry is updated daily
 Registry substances come from >8000 journals,
while Beilstein covers only 100+ organic journals
(now 180)
 Registry contains a lot of substances from
patents which CrossFire almost doesn’t
 Gmelin was not updated since around 1990

Beilstein CrossFire 特点
 化合物和反应数量丰富
 最全面、不可替代的有机化学数据库
 数据经深加工、高整合
 可免看原文了解主要概况
 提供权威的实验数据
 检索功能强大
 应用领域广泛（尤受制药研发推崇）
CrossFire 检索平台
 Beilstein
 Gmelin
 Patent Chemistry
从有机化学、药物、染料、生命科学等相关专利文献中收集数
据和信息，补充Beilstein的不足，使用户获得的数据来源更趋广
泛和完善。
专利文献
41万篇 (1978年以后世界、欧洲专利和1976
年以后美国专利)
化合物
341万个
反应
422万个
CrossFire 化合物1300万个 + 反应1400万个
DiscoveryGate检索平台
是MDL新一代基于互联网Web服务的化学综合
信息检索系统
 数据库主要内容

Compounds, Reactions & Bibliographic Information
Beilstein、Gmelin、Patent Chemistry
Bioactivity Information
Comprehensive Medicinal Chemistry 、Drug Data Report 、Metabolite
Database 、Toxicity Database、National Cancer Institute Database
Sourcing & Logistics Information
Available Chemical Directory 、Screening Compounds Directory
Synthetic Methodology Information
ChemInform Reaction Library 、Derwent Journal of Synthetic Methods、
ORGSYN Database 、Reference Library of Synthetic Methodology、SolidPhase Organic Reactions

数据库网址
http://www.discoverygate.com/
Reaxys检索平台

Reaxys是一个全新的辅助化学研发的在线解决方案，它将著名的
CrossFire Beilstein、Gmelin、Patent Chemistry 数据库进行
整合，并新增更多强大功能。

主要特点
1. 基于网络访问，直观的、向导式的新界面，任何水平的化学工作者均可轻松使
用。
2. 上亿条深入的、经实验验证的数据；内容经科学家们精心筛选，并进行深入索
引新的数据可视化、分析及合成设计工具；从检索结果到决策辅助，从多步反应
研究、反向合成分析到合成路线设计，均可实现无缝对接。
3. 帮助您识别有前景的新项目、终止无效的先导化合物，设计经济、高产率的合
成路线，最大限度节省时间和成本。

数据库网址
http://www.reaxys.com/
MDL CrossFire Commander 7.0
 Getting Startet
 Search
 Search Result
 Display Hits
 Print and Export
 Settings
Commander 7.0 的快速入门
 CrossFire数据库的三元素
Substance、Reaction、Citation
 认识 CrossFire 和 Autonom 图标
 选择数据库
 学会 Query Builder 的使用
 选定化学结构编辑软件
 执行检索和显示结果
Query Biulder的使用
 Text Search
all text fields
bibliographic fields
Search Option
Substances
Reactions
Citations
Antimalaria 抗疟疾
Query Biulder的使用
 Field Search
Basic Indexes
Bibliographic Information
Substance Identification
Chemical Properties
Physical Properties
Pharmacological & Ecological Data
Query Biulder的使用

Structure Search
as Structure
as reactant
as product
as reagent

(cont.)
O
N
O
N
Search Options
Free Site: hetero atom / all atom / 指定
Allow: addl. ring / isotopes / charges / radicals…
Search AS
Stereo
检索实例
 TS
Cancer Treatment; Antimalaria;
Kitchen, D.A.
 FS
 SS
RN: 35682-44-1
bp=150
O
N
N
N
O
结构编辑器的使用
 ISIS/Draw和CrossFire Structure Editor
 认识窗口及图标
 画原子
 画键
 画环
 设置原子、键的属性
 设置化学反应式
检索结果 (Search Result)
 Citation Result
 Substance Result
 Reaction Result
Hyperlinks功能
Original Document功能
Find similar reactions功能
结果显示 （Display Hits）
 结果浏览
Overview
Grid View / List View (Detail View)
Tree View
 显示方式 （View Menu）
Short Display / Full Display 显示格式切换
Include Structures
结构图嵌入
Include Field Availability
Reaction View
结果显示 （Display Hits）
 显示方式 （View icon）
All Field / Identification / User View / User Define
 结果处理 （Fact Copy）
set Report Title
define Report file
copy fact to Report (html)
copy fact to Word
 结果打印
化合物的自动命名
 启动 AutoNom
 输入化合物结构
 执行命名
ISI Web of Science
 SCI的基本概念和选刊标准
 利用Web
of Science评估个人和机构研
究业绩
 利用Web
of Science促进科学研究
ISI Web of Science（SCI）的历史





Dr. Eugene Garfield 1955年在 Science 发表论文提出将引
文索引作为一种新的文献检索与分类工具
• 将一篇文献作为检索字段从而跟踪一个Idea的发展
过程
1958 创建 Institute for Scientific Information (ISI)
1963年出版 Science Citation Index
1973年出版 Social Sciences Citation Index
1978年出版Arts & Humanities Citation Index
引文索引（一）：收录最重要的学术期刊

“一个有效的索引必须严格限制它的收录范围，
基本上应只收集对研究者有用的信息”。
-Eugene Garfield, Ph. D.

“布拉德福-加菲尔德法则”(学术信息的20-80
规律）: 20%的期刊汇集了足够的信息以全面反
映科技的最新最重要的成果与进展
引文索引 （二）：引文信息与引文检索
Cited Work
被引用的各种文献
类型：
期刊文献
 学术著作
专
利
 会议文献
 技术报告

文献的相互引证----学术研究之间的交流与
联系：

学科上的相关性
– 理论与方法：借鉴与利用
– 技术与手段：应用与发展

横向上的对应性
– 实验或方法：互相参照与借鉴
– 结果与讨论：比较与应用

纵向上的继承性
– 课题的基础与起源
– 发展与进步
– 反引：学术争鸣
系统严谨的选刊标准与过程
• 基本的期刊出版标准
•
编辑和评委的意见
•
国际性与区域代表性
•
引文分析
每一本期刊都根据其在所属学科领域的影响而挑选
数十年一惯严格的选刊构成ISI Web of Science的基础
Science Citation Index Expanded (SCIE)
150 多个学科领域
自然科学、工程技术、生物医学等所有科技领
域
每周收录19,000多篇文献，423,000篇参考文献
2009年当前收录近7,346多种期刊
Cover-to-Cover 收录期刊每一期每一篇文献
SCIE 学科范围
Engineering/Computing/Technology
• 1,100 多种权威期刊
• IEEE，AIAA，ICE 等著名研究机构出版的所有出版
期刊
• 涵盖工程技术领域的所有学科及相关学科：
航天工程技术；人工智能、机器人与自动控制；
化学工程；土木工程；计算机工程、技术与应用；
电子与电器工程；工程管理；工程数学；环境工
程/能源；地址/石油/采矿工程；信息技术与通讯
工程；仪表仪器/测量； 材料科学与工程；机械
工程；合金学；核工程；光学与声学等。
SCIE 学科范围

Material Science:
• 300 多种材料科学权威期刊
• 化学、物理、工程领域内的相关期刊(1,400)

Chemical Science:
• 480多种最重要的化学期刊
• 其它各种相关交叉学科的期刊
生物化学、分子生物学、化学工程、地球化
学、材料科学、药物学与药理学、原子及分
子物理学、光谱学……
ISI Web of Science 中的中国期刊
ISI covers 159 journals whose country of publication is China, 2009
• SCIExpanded:
117 Journals （大陆）
13 Journals （香港）
29 Journals （台湾）
• SSCI和A&HCI
16 Journals
Chinese journal coverage: nearly doubled since 1997
引文索引的今天 …
ISI Web of Science
Science Citation Index Expanded, 6,381种
Social Sciences Citation Index, 1,802种
Arts & Humanities Citation Index, 1,136种
Current Chemical Reactions, 75万条化学反应
IndexChemicus, 150万个化合物
SCI 在学术评估中的应用
 个人论文在SCI中的收录
 机构论文在SCI中的收录
 个人论文的被引用情况
利用Web of Science, 促进科学研究
 Web of Science不仅仅是一个个人或者研
究机构的学术评估工具, 它最重要的价值
体现在对科学研究的促进作用上
普通检索









这篇论文的主要内容是什么？
有没有关于这一课题的综述？
还有谁在从事这方面的研究？
创始于这个研究机构的某项研究工作有没有研究论文
发表？
这个研究人员写过哪些论文并发表在该领域的权威性
刊物里？
这个研究机构或大学最近发表了哪些文章？
这个研究涉及了哪些研究领域?
这个领域的研究通常都发表在哪些杂志上?
……
分析检索结果

分析检索结果有助于从宏观上把握您检索的课题的情况,并且轻易地
将您需要的文献显示出来

Web of Science数据库中可以对检索结果按照以下方式进行分析：
按照作者分析：了解某个研究的核心研究人员是谁；
按照国家和地区分析：了解核心研究国是哪里；
按照文献类型分析: 了解该研究通常以什么途径发表；
按照机构名称分析：了解有哪些机构在从事这项研究
按照语种分析：了解该研究是以什么语种发表的；
按照出版年分析：了解该研究的发展趋势；
按照期刊标题分析：了解该研究通常发表在哪些期刊上；
按照学科分类分析：了解该研究涉及了哪些研究领域
Web of Science不仅是评估工具,
更重要的是,它可以帮助科学研
究人员解决科学研究过程中许
多问题.
 第二部分:
引文检索的应用
Citation Index 能够解决哪些问题？
Citation Index 的功能独特，检索者可以发挥其丰富的想象力，籍此
解决许多问题：
•这篇论文有没有被别人引用过？
•这一理论有没有得到进一步的证实？
•这项研究的最新进展和延伸？
•这个方法有没有得到改进？
•这个老化合物有没有新的合成方法?
•这种药物有没有临床试验?
•这个概念是如何提出来的?
•对于某个问题后来有没有勘误和修正说明?
•这个理论或概念有没有应用到新的领域中去?
Chemistry的内容
Chemistry是专门为满足化学与药学研究人员的
需求所设计的数据库。收集了全球核心化学期
刊和发明专利的所有最新发现或改进的有机合
成方法，提供最翔实的化学反应综述和详尽的
实验细节，提供化合物的化学结构和相关性质，
包括制备与合成方法。
 ISI Chemistry是一个事实型的化学数据库。
 目前Index Chemicus(IC)和Current Chemical
Reactions (CCR)集成在Web of Science数据库
中，可以提供引文方式的检索途径。

Current Chemical Reactions
CCR可以跟踪最新的合成技术，包括了摘自39
个权威出版机构的一流期刊和专利的单步和多
步的新合成方法。每一种方法都提供了完整地
反应流程，同时伴有详细精确的图形来代表每
个反映步骤。
 CCR提供了从1986-2002年之间的60多万个反应。
月更新3000多条记录。
 该数据库还包括来自享有极高声望的国家研究
所 de la Propriete Industrielle的14万多条反应纪
录，数据可回溯至18世纪。

Index Chemicus

IC主要聚焦新化合物的快讯报道，包括了来自
国际一流期刊报道的新型有机合成反应的结构
与评论数据。除此以外，数据库中的很多全记
录展示了从最初原材料到最终产品的整个反应
流程。IC是揭示生物活性化合物和自然产品的
有关最新信息的重要资源。
Searching Example
 General Search
SIOC 2006
 Cited Ref Search
Lu XY* 2006
 Structure Search
Refine 和 Analyze 功能的使用
The Combined Chemical
Dictionary on DVD v15:1
 Dictionary of Organic Compounds
（280,000）
俗称: Heilbron
 Dictionary of Natural Products （200,000）
 Dictionary of Inorganic and Organometallic
Compounds （100,000）
 Dictionary of Durgs （45,000）
 Dictionary of Analytical Reagents （17,000）
The Combined Chemical
Dictionary on DVD
 Over 527,000 compounds
 full text retrieval
 exact structure searching
 substructure searching
 IUPAC Nomenclature
The Combined Chemical
Dictionary on DVD











Names and synonyms
Molecular formulae
Structure diagrams
CAS Registry Numbers
Physical properties
Accurate mass
UV spectra
Percentage composition
Biological sources
Therapeutic and other uses
Key literature citations
Searching Example
Chemical Name:
Hexaamide, caffeine
 MF: C6H5BrClN
 Exact Structure Search
 Substructure Search
 CAS RN: 17155-31-6
 Melting Point, Boiling Point
 RTECS

O
Pharmaprojects
Pharmaprojects is the leading source of global
business intelligence on drugs in R&D and
provides users with a comprehensive view of
product development
 Pharmaprojects monitors every significant new
drug currently under development, tracking all
new drug candidates under active international
R&D - approximately 6,000 at any one time.

Pharmaprojects

Pharmaprojects contains details on over 26,000
new drug candidates which have been
investigated since 1980, including those
currently in research and those whose
development has been discontinued.
How can help your business
Track who is developing what, where, when, how
and for what!
 Analyze your market of interest using any
combination of 60 search criteria
 Monitor your close competitors
 Discover licensing opportunities and comarketing partners
 Identify early leads and search for similar
chemical structures

Database Content
more than 26,000 developmental drugs and
pharmaceutical formulations investigated since
1980
 over 6,000 of these are undergoing Active
development
 20,000 or so are classified by Pharmaprojects
either as Ceased or Fully Launched.
 presented in the form of Product Profiles,
organized under 10 main headings

Searching Example
 Tree Searh
 Browse Search
O
O
 Structure Searh
CAS Number: 185243-69-0
Drug Name: Tamiflu, Panzem, ruprintrivir, caffeine
Company: ASTRA, Pfizer
Originator: China
Market Rating: China+over US$10000M
Novelty Rating: Leading Compound
The Merck Index on CD-ROM
version 13:2
 More than 10,000 monographs
 Covering natural products,
environmentally important compounds,
biological and agricultural compounds,
commercial and labortory chemicals
 To provide text and structure searching
Searching Example
 Compound Searh
Tamiflu, AG-1749
 Name Reaction
Diels-Alder Reaction
Huang-Minlon Reaction
Haworth Phenanthrene Synthesis
 Tables
Science of Synthesis
1.
2.
3.
4.
5.
简称SoS
It is a highly organized and authoritative treatise on
organic synthetic methods.
Extensive review chapters are written by recognized
experts, and contain full experimental procedures and
background information.
Its goal is to provide a direct path through the mass
of primary literature to the pertinent data on a
comprehensive range of organic reactions.
Each volume covers a specific class of compound.
Volumes are organized into Categories, which are in
turn broken down into narrower specialty volumes.
Thieme began publication of SoS in 2000, and it is
planned to occupy 49 volumes by its completion. About
six new volumes are published each year.
How does it relate to SciFinder Scholar
and Beilstein (MDL) Crossfire?
1. Science of Synthesis is a self-contained reference work,
analogous to a treatise or encyclopedia, that is highly
proscribed and planned and written by experts. By
contrast, Chemical Abstracts (via SciFinder Scholar) is
an open-ended bibliographic index to the entire chemical
literature, broadly defined. Beilstein (via MDL
Crossfire) is a database of organic compounds and
reactions derived from a selected subset of the chemical
journal literature. Neither SciFinder or Beilstein
contains authored, textual descriptions of synthetic
procedures, though they provide plentiful links to the
primary literature on these topics.
How does it relate to SciFinder Scholar
and Beilstein (MDL) Crossfire?
2. Science of Synthesis complements these two important
tools and should be used in conjunction with them.
Unlike SciFinder or Beilstein, it is browsable by a
hierarchical table of contents as well as searchable by
structure and keyword. A chemist looking for background
information on the present knowledge of a type of
synthetic method or class of compounds would want to
start in SoS and follow up with searches for
structures/reactions and/or keywords in SciFinder
Scholar, and for structures/reactions in Beilstein.
Science of Synthesis chapters provide numerous
references to the journal literature, but these are
selective, not comprehensive.
Methoden der Organischen
Chemie (Houben-Weyl)

Science of Synthesis的前身

Methoden der Organischen Chemie (Methods of Organic Chemistry,
often called Houben-Weyl) is a standard reference work for chemists
engaged in organic synthesis. In volumes on compound classes,
including all Supplemental volumes, preparative methods are treated
comprehensively and critically. Tables of examples compare the most
important methods and show their scope. Detailed experimental
procedures are given for the best methods. The reactivity and further
reactions of each compound class are also presented. The extensive
use of formula schemes help make the German-language volumes
more readily understandable to non-German readers.

分类组织架构
http://www.indiana.edu/~cheminfo/h-wguide.html
Methoden der Organischen
Chemie (Houben-Weyl)

The 4th Edition began publication in 1952. The base set of 16
volumes (in 70 parts) was completed in 1987, and covers the full
range of organic synthetic topics.

In 1982 a Supplemental series began (the E-volumes), which gives
further and updated information on topics covered in the base set, as
well as new areas not covered earlier. The E-series is scheduled for
completion in 1999; volumes appear irregularly and out of order.

All volumes are in German until 1990, after which they were
published in English. Houben-Weyl is a textual source, and has no
online or electronic equivalent.
Why should you use Houben-Weyl?
1.
H-W offers a valuable and unique addition to standard synthetic reference
sources. Unlike the Beilstein handbook or database, extensive experimental
detail is provided for products and reactions; results and data are critically
assessed by experts.
2.
Extensive literature references are also given.
3.
Standard English-language sources, such as Organic Syntheses, Organic
Reactions, Reagents for Organic Synthesis, etc., while somewhat easier to use,
are not nearly as extensive or exhaustive as H-W.
4.
Houben-Weyl's German language, complex arrangement, and lack of
comprehensive indexes are obstacles to its effective use. But organic chemists
who take the time to learn its layout will find it very useful as a tool to survey
synthetic methodologies restrospectively without consulting multiple volumes
of other handbooks or Chemical Abstracts, and often without having to locate
the original journal articles.